基因總覽
SRSF5（serine and arginine rich splicing factor 5）是由蛋白質編碼基因 SRSF5 產生的剪接因子，屬於 SR 剪接因子家族。現有資料將它描述為參與 RNA 剪接的蛋白質，並指出其具有兩個 RNA recognition motif（RRM）結構域；這些結構特徵構成其蛋白質基本樣貌。其剪接相關角色包括參與構成型剪接，以及調節替代剪接位點的選擇；具體作用方式見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000557154 ★ | 69,767,142–69,772,005 | 8 |
| ENST00000553521 | 69,726,822–69,772,026 | 9 |
| ENST00000880757 | 69,726,822–69,773,904 | 9 |
| ENST00000553635 | 69,767,074–69,772,026 | 8 |
| ENST00000880758 | 69,767,074–69,772,026 | 8 |
| ENST00000880759 | 69,767,074–69,773,904 | 8 |
| ENST00000880760 | 69,767,074–69,772,026 | 8 |
| ENST00000880762 | 69,767,074–69,772,026 | 5 |
| ENST00000921621 | 69,767,074–69,772,026 | 8 |
| ENST00000921629 | 69,767,074–69,772,026 | 7 |
| ENST00000921636 | 69,767,074–69,772,026 | 9 |
| ENST00000960938 | 69,767,074–69,773,904 | 7 |
顯示 12/46 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SRSF5 參與前體 mRNA 的構成型剪接。構成型剪接是 RNA 剪接過程的一種形式；資料指出 SRSF5 在此過程中扮演角色，但未提供其作用步驟、特定 RNA 靶點或實驗條件，因此不宜進一步推定其分子機制。
除了參與構成型剪接，SRSF5 也能調節替代剪接位點的選擇。替代剪接涉及不同剪接位點的選用；來源支持 SRSF5 可影響這項選擇，但沒有指出它促進或抑制哪一個特定位點，也未說明調節幅度或依賴條件。這表示其剪接功能涵蓋基本剪接過程及剪接位點選擇的調節，但現有資料不足以描述其對特定轉錄本或下游生物學結果的影響。
Promoter 與基因調控
>SRSF5 ENST00000557154 GRCh38 chr14:69766142-69767242 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACCATTTGGACTTAAAAGCAGCTTGAGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA GGCCGAGACGGGCCGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCCGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTC TACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGTGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCGCAGCTACTCGGGAGGCTGA GGCAGAAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCCCAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAG AGCAAGACTGTCTCAAAAAAAACAACAAAAAACAGCTTGAAACCTCTTCCAGCCACTCTCCCAGAGTGAC GGACATGCAGAAATCTGTATTCCAGCCTCAATTCAAGACAGCCTTCTAGCTGCAGTCCCATTTTCAACAT TTCATCAGTGAAAATCCTTTCATTTAAAAAATACTTCAGTGCCTTAGTCTTCTCACCACAACAAAACCAC ACAGCTGTGGCATGGTTGAAAAAAGAACTCGAACATCTAGGAGCTCCCTGCTTTGAGGGCAAATTTAAAT TGCAAGCAGCAAGAGCTAAGGAAAGGCCAGGTATTTCTGCAAAGCTAAGTTTCTCCTAATTAGTAATCTT CTGGGTGTCTAAGAAAAACTTTAGATACAAGAAGGGTTGCCACTTTTCTCAGGAGACTCTTCTGGGAGAG ATGATGATGAACCGAACGCCAAGGACTTAGCAGGGGCGAACGACGTCAACAGATGTCCCTCCAGACTCCG GCACCAGCCGGCCGAGCCCAAACGAGTTCTCGCCCCCGACCCCACCCACCGCGGGAGCAGGGTTCGGTCA CTCGCAGTGTCAGAGAGGCCCACATCCTCCTAAATTTCCGGCCCTCCCAAAACTTCCGTCTTCCCTAGGT CCAACGGGGTGGACCCAAGGCCCAGGGGCGTCCCCGGAAGTGACGTAGGACGCGCCCTCCATTTTGTGGA GCGCCAGAGCTGCTAAGTGCGTCAGTTGTGGAGTGGCGTAGACGAGTTAAGTCCTGGTCTGCGTGGAGGT CGACGACTCCGTCGCAGACTACGGACCTGTCTGGGTCTCAGCCGCCAAAGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SRSF5_1 ↗ | 14:69,767,142 | 正股 | 69,767,093–69,767,152 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_BHSSK · promoter · 69766603–69767167 · regulatory
ENSR14_932NNF · promoter · 69767450–69767950 · regulatory
ENSR14_932NP2 · enhancer · 69769569–69769995 · regulatory
· motif · 69766099–69766114 · motif
· motif · 69766625–69766633 · motif
· motif · 69767014–69767023 · motif
· motif · 69767032–69767043 · motif
· motif · 69767032–69767043 · motif
· motif · 69767032–69767045 · motif
· motif · 69767082–69767093 · motif
· motif · 69767082–69767093 · motif
· motif · 69767084–69767093 · motif
· motif · 69767430–69767443 · motif
· motif · 69767583–69767600 · motif
· motif · 69767591–69767598 · motif
· motif · 69767672–69767682 · motif
· motif · 69767685–69767700 · motif
· motif · 69767714–69767725 · motif
· motif · 69767714–69767725 · motif
· motif · 69767776–69767786 · motif
· motif · 69767882–69767893 · motif
· motif · 69767882–69767893 · motif
· motif · 69767907–69767924 · motif
· motif · 69767909–69767924 · motif
· motif · 69767916–69767924 · motif
· motif · 69767916–69767933 · motif
· motif · 69767925–69767940 · motif
· motif · 69768271–69768286 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：272 aa
SRSF5 蛋白質長 272 個胺基酸，屬於 SR 剪接因子家族。其序列含兩個 RNA recognition motif（RRM）：RRM 1 位於第 4–74 個胺基酸，RRM 2 位於第 108–181 個胺基酸。資料另將第 73–105 與第 174–272 個胺基酸區段註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
現有資料未提供其在不同條件下的定位變化或異構型間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- SRPK2P78362 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ZRSR2Q15696 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SRSF5 被記錄於含 SRSF4/SFRS4、SNRNP70、SNRPA1、SRRM1 與 SRRM2 的前體 mRNA 剪接複合體中。另有依相似性推定的互作：SRSF5 透過 RS domain 與 PHF5A 的 N-terminus 互作；此項互作的證據性質為 By similarity。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SRSF5 參與構成型剪接，並能調節替代剪接位點的選擇。資料未進一步指出其調節方向、特定剪接位點或作用條件。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Plays a role in constitutive splicing and can modulate the selection of alternative splice sites |
| 交互作用 | SRSF5 透過 RS domain 與 PHF5A 的 N-terminus 互作，此關係屬於依相似性推定。另有資料記錄 SRSF5 與 SRSF4/SFRS4、SNRNP70、SNRPA1、SRRM1 及 SRRM2 同處於前體 mRNA 剪接複合體中。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts (via RS domain) with PHF5A (via N-terminus) (By similarity). Found in a pre-mRNA splicing complex with SRSF4/SFRS4, SRSF5/SFRS5, SNRNP70, SNRPA1, SRRM1 and SRRM2 PMID 9531537 ↗ |
| 細胞定位 | SRSF5 定位於細胞核；此項資料未提供其他定位條件或變化。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GTCAGTTGTGGAGTGGCGTAGACGAGTTAAGTCCTGGTCT40GCGTGGAGGTCGACGACTCCGTCGCAGACTACGGACCTGT80CTGGGTCTCAGCCGCCAAAGACCCCGTCCGGTAGGAAGTA120CTAGCCGGACATCATGAGTGGCTGTCGGGTATTCATCGGG160AGACTAAATCCAGCGGCCAGGGAGAAGGACGTGGAAAGAT200TCTTCAAGGGATATGGACGGATAAGAGATATTGATCTGAA240AAGAGGCTTTGGTTTTGTGGAATTTGAGGATCCAAGGGAT280GCAGATGATGCTGTGTATGAGCTTGATGGAAAAGAACTCT320GTAGTGAAAGGGTTACTATTGAACATGCTAGGGCTCGGTC360ACGAGGTGGAAGAGGTAGAGGACGATACTCTGACCGTTTT400AGTAGTCGCAGACCTCGAAATGATAGACGAAATGCTCCAC440CTGTAAGAACAGAAAATCGTCTTATAGTTGAGAATTTATC480CTCAAGAGTCAGCTGGCAGGATCTCAAAGATTTCATGAGA520CAAGCTGGGGAAGTAACGTTTGCGGATGCACACCGACCTA560AATTAAATGAAGGGGTGGTTGAGTTTGCCTCTTATGGTGA600CTTAAAGAATGCTATTGAAAAACTTTCTGGAAAGGAAATA640AATGGGAGAAAAATAAAATTAATTGAAGGCAGCAAAAGGC680ACAGTAGGTCAAGAAGCAGGTCTCGATCCCGGACCAGAAG720TTCCTCTAGGTCTCGTAGCCGATCCCGTTCCCGTAGTCGC760AAATCTTACAGCCGGTCAAGAAGCAGGAGCAGGAGCCGGA800GCCGGAGCAAGTCCCGTTCTGTTAGTAGGTCTCCCGTGCC840TGAGAAGAGCCAGAAACGTGGTTCTTCAAGTAGATCTAAG880TCTCCAGCATCTGTGGATCGCCAGAGGTCCCGGTCCCGAT920CAAGGTCCAGATCAGTTGACAGTGGCAATTAAACTGTAAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。