基因總覽
SRSF4（serine and arginine rich splicing factor 4）是蛋白質編碼基因，產物屬於 SR 剪接因子家族。其蛋白質長 494 個胺基酸，包含兩個 RNA recognition motif（RRM），並有多段被註記為無序的區域。這些資料勾勒出 SRSF4 的家族歸屬與基本分子特徵；其參與前體 mRNA 剪接的作用則見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000373795 ★ | 29,147,743–29,181,900 | 6 |
| ENST00000870271 | 29,147,743–29,181,922 | 3 |
| ENST00000870272 | 29,147,743–29,181,922 | 6 |
| ENST00000870273 | 29,147,743–29,181,922 | 5 |
| ENST00000969505 | 29,147,743–29,181,922 | 6 |
| ENST00001143671 | 29,147,743–29,181,922 | 6 |
| ENST00001009584 | 29,147,747–29,181,922 | 6 |
| ENST00000870274 | 29,147,853–29,181,922 | 6 |
| ENST00000466448 | 29,148,671–29,181,882 | 5 |
| ENST00001109207 | 29,160,045–29,181,922 | 4 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SRSF4 參與前體 mRNA（pre-mRNA）剪接，並在此過程中影響替代剪接位點的選擇。替代剪接位點的選用會決定前體 mRNA 的哪些區段納入剪接產物；來源指出 SRSF4 在這項選擇過程中具有作用，但未進一步交代其調控方式或作用條件。
在特定剪接事件中，SRSF4 會抑制 MAPT/Tau exon 10 的剪接。這項作用描述的是對該外顯子剪接的抑制，來源未提供其影響幅度、調控條件或下游結果，因此不宜延伸推論其對 MAPT/Tau 產物或相關生物學過程的影響。
Promoter 與基因調控
>SRSF4 ENST00000373795 GRCh38 chr1:29181800-29182900 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATCCTTGAGATGGGTATACATTATTCTAATTTTACAGGTTAGAAAATAGACTGGATAGGCCAGGCGCAGT GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCTGGAGTTTGAG ACCTGCCTGGCCAATATGGTGAAACTTCCTCTCTCCTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGGGGCGG GCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGC AGTGAGCTGAGGTCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACCGAGCGAAACTCGTCTCAAAAAAAAAAAA ATAGGTTGGATTGTGGTCAAGTAATTTACTCGGCGTCATGCCTAGTCTAGCTCCAAAGCTCCAGCCTTCT CCGCTTCTCACACTGCTTCTATTTAAGCAGTGTCCTCTTAAAAATAATACTGGTCTCATTTATTGGGCAC TTGATATGACAAAACTACTAAGTGCTTTATGTACGTATTCTCATATAATTCTCAAGACAACTCTGGAAGG TAGGAACTACTCTCCCCCTTTTACAGAAAAGATAAAGGAGGGTCCGAGACATCGCGCGTAACAAGCCCAA GGTCACGGGTACACAATCGTTTGGAAGCTAGGTTTGATTCCAAAGCTCCAGCTCCGAAATCCAAACCACA CCCGGTTCAAAGGACAAAAGCACAAACGCTCGCTCGCTGGGCTCTAGGAGGTGCGGACACTTCCGGGGGA GGGGCGAAGCCAGCTGGCTGCGGAAGGCGGTGCAGGAACCCCTTTGGCGAGCTCGCGCGAGGACGTGCCG CAGCGCCGCCTGTCGATCACCTTGCCCCGCCGCACGTCGGCGCGCCCCCGGGCAAGCTCCTCCCCCAGTC CTGGCCGAGCGGGAAGCGAACGCGCGCTCTCTCCGGTTACCTTCCGCCTCGGGGAAGGGCGGGGGAAGTG GAAGCGCGCGCTCGCGAGCTGCGTGCTCGCGTACGTCGCCGGGGTTCGGCTGCGTCCGTCCCGCCGCCCG CCCGTTGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCCGTGCTCTCGCTTTGCCCGCCGCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SRSF4_1 ↗ | 1:29,181,898 | 負股 | 29,181,888–29,181,947 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_9FKNC · enhancer · 29176567–29176928 · regulatory
ENSR1_73PBPX · enhancer · 29177183–29177286 · regulatory
ENSR1_8T6DC · enhancer · 29177794–29177973 · regulatory
ENSR1_B7RCM · enhancer · 29179597–29180335 · regulatory
ENSR1_C4W6W · enhancer · 29180647–29181889 · regulatory
ENSR1_9FKPW · promoter · 29181890–29182390 · regulatory
ENSR1_58TBR4 · CTCF_binding_site · 29182041–29182062 · regulatory
ENSR1_B7RDL · enhancer · 29186220–29187130 · regulatory
· motif · 29177860–29177875 · motif
· motif · 29177860–29177875 · motif
· motif · 29179780–29179795 · motif
· motif · 29180968–29180983 · motif
· motif · 29180975–29180983 · motif
· motif · 29181117–29181128 · motif
· motif · 29181312–29181321 · motif
· motif · 29181465–29181476 · motif
· motif · 29181465–29181476 · motif
· motif · 29181517–29181527 · motif
· motif · 29181754–29181768 · motif
· motif · 29181915–29181929 · motif
· motif · 29181938–29181952 · motif
· motif · 29181995–29182005 · motif
· motif · 29182012–29182022 · motif
· motif · 29182043–29182059 · motif
· motif · 29182126–29182136 · motif
· motif · 29182132–29182143 · motif
· motif · 29182134–29182143 · motif
· motif · 29182146–29182155 · motif
· motif · 29182183–29182198 · motif
· motif · 29182184–29182198 · motif
· motif · 29182185–29182198 · motif
· motif · 29182200–29182208 · motif
· motif · 29182262–29182274 · motif
· motif · 29183464–29183473 · motif
· motif · 29186161–29186174 · motif
· motif · 29186161–29186175 · motif
· motif · 29186161–29186176 · motif
· motif · 29186161–29186176 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：494 aa
SRSF4 蛋白質長 494 個胺基酸，屬於 SR 剪接因子家族。序列註解包含兩個 RNA recognition motif（RRM）：RRM 1 位於第 2–72 個胺基酸，RRM 2 位於第 104–177 個胺基酸；另有第 72–95 及第 169–494 個胺基酸區段被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SRSF4 被記錄位於細胞核斑點（nucleus speckle）。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- JPH3Q8WXH2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RNPS1Q15287 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SRRM2Q9UQ35 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SRSF6Q13247 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TRA2BP62995 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- UBE2IQ7KZS0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SRSF4 與 SRSF5、SNRNP70、SNRPA1、SRRM1 及 SRRM2 一同出現在前體 mRNA 剪接複合體中；此外，來源另記載 SRSF4 與 PNN 互作。前者為複合體共存資訊，後者為互作記錄，來源未進一步說明其結合方式或功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SRSF4 參與前體 mRNA 剪接時替代剪接位點的選擇，並抑制 MAPT/Tau exon 10 的剪接。來源未說明這些作用的條件、調控方式或下游影響。 | 含實驗來源 | 證據與來源Plays a role in alternative splice site selection during pre-mRNA splicing. Represses the splicing of MAPT/Tau exon 10 PMID 15009664 ↗ |
| 交互作用 | SRSF4 與 SRSF5、SNRNP70、SNRPA1、SRRM1 及 SRRM2 一同出現在前體 mRNA 剪接複合體中；另有與 PNN 互作的記錄。來源未說明複合體組成或互作的功能後果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Found in a pre-mRNA splicing complex with SRSF4/SFRS4, SRSF5/SFRS5, SNRNP70, SNRPA1, SRRM1 and SRRM2. Interacts with PNN PMID 14578391 ↗ · PMID 9531537 ↗ |
| 細胞定位 | SRSF4 的定位記錄為細胞核斑點；來源未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCGTGCTCGCGTACGTCGCCGGGGTTCGGCTGCGTCCGTC40CCGCCGCCCGCCCGTTGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCCGTG80CTCTCGCTTTGCCCGCCGCCGCCTAAGGGGGGCTGGGGCC120GGGGCCAGCCATCACTGCCGTTGCCGGGATGCCGCGGGTG160TACATCGGCCGCCTGAGCTACCAGGCCCGGGAGCGCGATG200TGGAGCGCTTCTTTAAGGGCTACGGGAAGATCCTGGAGGT240GGATCTGAAGAACGGATATGGTTTTGTGGAGTTTGATGAT280CTGCGTGATGCAGATGATGCTGTTTATGAACTGAATGGCA320AAGACCTTTGTGGTGAGCGAGTAATTGTTGAGCATGCCCG360CGGCCCACGGCGAGATGGCAGTTACGGTTCTGGACGCAGT400GGATATGGTTATAGAAGAAGTGGCCGAGATAAATATGGCC440CTCCTACTCGCACAGAGTACAGACTTATTGTGGAGAATTT480GTCAAGTCGGTGCAGCTGGCAAGACCTAAAGGATTATATG520CGTCAGGCAGGAGAAGTGACTTATGCAGATGCTCACAAGG560GACGCAAAAATGAAGGGGTGATTGAATTTGTATCTTATTC600TGATATGAAAAGAGCTTTGGAAAAGTTGGATGGAACTGAA640GTCAATGGGAGAAAAATCAGATTAGTTGAAGACAAGCCAG680GTTCCAGACGACGCCGGTCCTACTCCAGAAGCCGGAGTCA720TTCAAGGTCTCGCTCTCGAAGCAGACATTCCCGTAAGAGC760AGAAGCCGAAGTGGCAGCAGCAAAAGCAGTCATTCTAAGA800GTAGATCTCGGTCCAGGTCGGGCTCCCGCTCCCGGAGCAA840GAGCCGGAGCCGGAGCCAGAGTCGGAGCCGGAGCAAGAAA880GAGAAAAGCAGGAGCCCCAGCAAGGAAAAGAGCCGCAGCC920GCAGCCATAGCGCTGGCAAGAGCCGCAGCAAGAGCAAAGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。