基因總覽
SRSF11（serine and arginine rich splicing factor 11）是蛋白質編碼基因，產物屬於 splicing factor SR family。其蛋白質全長 484 個胺基酸，具有 RNA recognition motif（RRM），以及由多個富含精胺酸與絲胺酸的短重複序列構成的區域；序列中另有被註記為無序的區段。這些結構特徵構成此剪接因子的基本分子特性。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000370949 ★ | 70,221,380–70,253,052 | 12 |
| ENST00000370951 | 70,205,670–70,253,052 | 13 |
| ENST00000370950 | 70,205,670–70,253,052 | 13 |
| ENST00000855489 | 70,205,670–70,253,052 | 13 |
| ENST00000855490 | 70,205,670–70,253,052 | 13 |
| ENST00000855491 | 70,205,670–70,253,052 | 13 |
| ENST00000855492 | 70,205,670–70,253,052 | 13 |
| ENST00000915572 | 70,205,670–70,253,052 | 13 |
| ENST00000915574 | 70,205,670–70,253,052 | 13 |
| ENST00000915575 | 70,205,670–70,253,052 | 13 |
| ENST00000915576 | 70,205,670–70,253,052 | 14 |
| ENST00000915577 | 70,205,670–70,253,052 | 13 |
顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SRSF11 的蛋白質可能參與 pre-mRNA 剪接。這項註記指出其可能涉及前體 mRNA 的剪接處理，但未提供更具體的分子步驟、作用條件或功能結果，因此目前不能據此進一步界定它在剪接過程中的確切角色。
Promoter 與基因調控
>SRSF11 ENST00000370949 GRCh38 chr1:70220380-70221480 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCAGATGAGGTTGAAAACAAAAGCAAGGATTTTTTTAATAGTCAAAAGCTTCAAAATTATTTTAAGCAAG AATATGTATGTGAAACAAGTTTTTCTTGAGAAATTGCAGTATTTTCTTTAGAAATATATACTTGAATATA TTTAAGTACTATAAACTGTGTTTCCAAAGTCAGCTATTGTGGAATTGGCTGGGTGCAGTGGCTCACGCGC CTGTAATCCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACCAGAGGTCAGGAGTTGGAGACCAGCCTG GCCAACATGGTGAAACCCCATGTCTACTAAAAATACAAAACTTAGCCTGGCGTCGTGGCAGGCGCCTGTA ATCCCAGCTACTCCCGAGGCCTAGGTAGGAGAATGGCTTGAACAGGGGAAGTGGAGGTTGCAGCGAGCCA AGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGGGCGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGTCATCCATTGT GAATGAATGTACAAAACGCTTATTAATAAGTGTAATATTAAAATATATCTTTTCTGAAAGTTTTAGTGAC AAAACAAATTAGTTACAGATTTAATGTTACCAAAATTCATGTACATTGAAAATTTCGGGACATTTTATAC TGGTGGTGGTGGGGTGGCATCTTAGCTTGGGTTTAAATATCATTAGTAATCGGATAGCTCTGTAGATGAT TATCAGTATATAAAGACATCGTGAGCAGTATTTAATAAGAAGAGTTGCTGAAGTGACTTTTGCAGGAGGA TGAATGCTTTTTTTAAAAAAAAAGTTTATACGTGCCTCTTCGCTCTTCCAAAAAAAAAAGAGAGAAGAAA AAGAAGAATAAAACGAGAGACGAAGGTGGATAACACCTTTCTCTAGACCCCGGTGCCTCTCATTTCTCGG GCTGCAGGCGACGGCTGCTGGGCCTGCGCGGGGTGGAGCCGACGCTGACGCGCCCTGCGCCGCAAAGCAT TGTGGGAGCTCGGGCCCGCTAGTGTCGTGGTTGGAGGCGAGGTGGGGCGGCCGTTTGTTTTCTCGTGGTC TCGAGCTCGCGCGCTCTCATCCCCTCCCCCGCGGCGTGCGGCGGGGCGGAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SRSF11_1 ↗ | 1:70,205,724 | 正股 | 70,205,675–70,205,734 |
| SRSF11_2 ↗ | 1:70,221,477 | 正股 | 70,221,428–70,221,487 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_932TJC · enhancer · 70220093–70220365 · regulatory
ENSR1_932TJJ · enhancer · 70220709–70221012 · regulatory
ENSR1_932TJM · promoter · 70221013–70221406 · regulatory
· motif · 70220144–70220157 · motif
· motif · 70220190–70220203 · motif
· motif · 70221246–70221258 · motif
· motif · 70221308–70221319 · motif
· motif · 70221308–70221319 · motif
· motif · 70221458–70221473 · motif
· motif · 70221745–70221753 · motif
· motif · 70222132–70222140 · motif
· motif · 70222132–70222147 · motif
· motif · 70222436–70222451 · motif
· motif · 70222436–70222451 · motif
· motif · 70222438–70222453 · motif
· motif · 70222739–70222752 · motif
· motif · 70222739–70222752 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：484 aa
SRSF11 蛋白質長 484 個胺基酸，含有位於第 33–113 個胺基酸的 RRM。第 247–353 個胺基酸區段包含約 10 組、每組約 8 個胺基酸的重複序列，序列模式為 R-R-S-R-S-R-S-R。資料另將第 1–33 與第 233–484 個胺基酸區段註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SRSF11 位於細胞核，並與 spliceosome components 共定位。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 18 個夥伴
- ARL6IP4Q66PJ3-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- ETS1P14921 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GATCO43716 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- HYIQ5T013 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PUF60Q9UHX1 · UniProt INTERACTION · 8 experiments · 2 筆來源紀錄
- RBM39Q14498 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 3 筆來源紀錄
- SDCBPO00560 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- SREK1Q8WXA9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- TANKQ92844 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- G4XUV3G4XUV3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- ATP5F1DP30049 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DACH1Q9UI36-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DUSP29Q68J44 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PAX6P26367 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SRPK2P78362 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SRRM4A7MD48 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF385CQ66K41-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SRSF11 與 PUF60 有交互作用；現有資料未進一步說明此關係是否代表直接實體結合、共同組成複合體，或僅為功能上的關聯。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SRSF11 可能參與 pre-mRNA 剪接；這項敘述保留可能性的限定，未指出具體作用步驟、條件或剪接結果。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | SRSF11 與 PUF60 有交互作用；此敘述未進一步界定交互作用的性質。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SRSF11 位於細胞核，並與 spliceosome components 共定位。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGTGTCGTGGTTGGAGGCGAGGTGGGGCGGCCGTTTGTTT40TCTCGTGGTCTCGAGCTCGCGCGCTCTCATCCCCTCCCCC80GCGGCGTGCGGCGGGGCGGAGAAACGGCGGCGGCGGCGGC120GGCATCGGCAGCAGTAGCAGAGGCTGTAGCATCGGACACC160CTCCTCTCTCCCGCAATCCGGTTCCTCTTCCCCCTCCTTC200TCACTGTTTGTTGTGTGTTTGATGTGTTAAAGCAGGAGCG240AGAACCCGAGCAGCGCCATGAGCAACACTACCGTCGTCCC280CAGCACTGCAGGTCCGGGCCCCAGCGGCGGGCCCGGTGGC320GGAGGTGGTGGTGGCGGCGGAGGCGGCGGCACCGAGGTAA360TCCAGGTGACTAATGTCTCCCCGAGCGCTAGCTCTGAGCA400GATGCGGACTCTCTTCGGTTTCCTAGGCAAGATCGACGAA440CTGCGCCTCTTCCCGCCGGATGATTCGCCTTTGCCAGTCT480CATCTCGTGTCTGCTTTGTTAAGTTCCATGATCCAGACTC520AGCAGTTGTGGCACAGCATCTGACAAACACTGTATTCGTT560GACAGAGCTTTGATAGTCGTACCATATGCAGAAGGAGTTA600TTCCTGATGAAGCTAAAGCTTTGTCTCTGTTGGCACCAGC640TAATGCAGTGGCAGGTCTTCTGCCTGGTGGTGGACTCCTG680CCTACTCCTAACCCACTTACCCAGATTGGCGCTGTTCCAC720TGGCTGCTTTGGGGGCTCCTACTCTTGATCCTGCCCTTGC760TGCACTTGGGCTTCCTGGAGCAAACTTGAACTCTCAGTCT800CTTGCTGCAGATCAGTTGCTGAAGCTTATGAGTACTGTTG840ATCCCAAGTTGAATCATGTAGCTGCTGGTCTCGTTTCACC880AAGTCTGAAATCGGATACCTCTAGTAAAGAAATAGAGGAA920GCTATGAAAAGAGTACGAGAAGCACAGTCCCTAATTTCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。