基因總覽
SRPRA（正式名稱為 SRP receptor subunit alpha）是蛋白質編碼基因，其產物為 signal recognition particle receptor（SR）的組成部分。SR 與 signal recognition particle（SRP）共同參與新生分泌蛋白的定位；SRPRA 也可與 SRP 複合體的 SRP54 形成依賴 GTP 的複合體。現有資料指出，SRPRA 屬於 GTP-binding SRP family，並含有 NG domain。這些資訊勾勒出其作為受體次單元的基本性質；其在蛋白質運送過程中的作用方式見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000332118 ★ | 126,262,938–126,268,895 | 14 |
| ENST00001109611 | 126,255,132–126,268,982 | 14 |
| ENST00001114375 | 126,255,132–126,268,982 | 13 |
| ENST00001114376 | 126,257,622–126,268,982 | 14 |
| ENST00001109612 | 126,260,397–126,268,982 | 12 |
| ENST00000942969 | 126,262,912–126,268,982 | 14 |
| ENST00001046687 | 126,262,934–126,268,982 | 14 |
| ENST00000891649 | 126,262,938–126,268,982 | 14 |
| ENST00001140993 | 126,262,938–126,268,982 | 14 |
| ENST00000891650 | 126,262,943–126,268,982 | 14 |
| ENST00000532259 | 126,263,474–126,268,982 | 13 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SRPRA 是 signal recognition particle receptor（SR）的組成部分，與 signal recognition particle（SRP）協同參與新生分泌蛋白的正確定位，使這些蛋白質被導向內質網膜系統。這項作用與蛋白質仍在合成中的運送過程相連，並非單由 SRPRA 完成，而是涉及 SRP 複合體及其受體的協同作用。
在分子層次上，SRPRA 可與 SRP 複合體次單元 SRP54 形成依賴 GTP 的複合體。這項交互作用為 SRP 與受體之間的辨識及協同運作提供了關聯；來源並未進一步描述各步驟的詳細分子機制。
SRP receptor 的緊密化，以及 GTPase 的構形重排，會推動 SRP 介導的共轉譯蛋白質轉位進入內質網。換言之，受體複合體的狀態變化與新生蛋白質在合成期間跨入內質網的過程相連。這些資料支持 SRPRA 參與將新生分泌蛋白送往內質網的功能，但沒有指出其單獨足以完成轉位。
Promoter 與基因調控
>SRPRA ENST00000332118 GRCh38 chr11:126268795-126269895 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCTGCCTCAGCCTCCCGAGTACCTGGGATTACAGGAGCCCACCACCACACCTAGCTAATTTTTGTATTTT TAGTAGAGACGGTGTTTCACCATGTTGGTCAGGTTGCTCTCGAACTCTTGAGCTCAGGTGATCCACCCGC CTCGACCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCCCCGCGCCCGGCCTCTATCCAGTCTTGAACTGGCCTACT GTCTATTGAAATTTTCCCTCTCTAGGTACACTCTAGCCATTTTCCAGAACATTCACTGAATCCCGTCTTC TCTTCACTCCTTTACCGCAACAGCACTAAGTACAGCATCCTGAACACGGGCAGGACTTAATGCACATCTG TGCCACCGATTATCAATCAGTCTGACTGTAAGCTTAAATGGAGAATGATGTGAGACCTGCCACCTGAAAA GGGCCGCCTTGGGAGCCATACACCTGCACAGCCCCTACAAGCTCTGGTAGGTAAGCTAACCCCCTTCCCC AAGCCGACCCACTGTCCTGCCAGTGTGGGCCATGGTTTCGGGTCCTGAAGGACACACAGTCGGAGGTTGG GGACAACCCAGAACCACAATACCCTCTGTCGTCCTCAACTTTACCCAGAGAAAAGCCTCCTCTGCGCGTG CCTGGCCTCCGGGTCAAGAGGCCCCGGCCCATGCCGTGCGGCAGAACCCTCCGAATCATAACCCCTCTGA GCCCGGACCCTCTGAAAGCTGCACTGCTGCCTCGCTATTATCGCAGCCGTCACTGCTCCGCGCCAAACGC CATTCAGACGAGCGCGCCAATTGGCCAGCGGCCCTCAGGGCTCTGCCCCGCCCAATGCTCTAGGTGGCCG TCTCCCCGTGACCTCTCCTGGAGCCCCACCCAGGCCCGCTCCCACCCGCCATTGGCTGGCCTTGCGATAC GTCAGTCCTGCGCGCCCCCGGGCGGAGATGGGGAGGGCACCCGGCGTTCTGAGCGGAAGTACGGTTGAGC CGATTTCCGGGGCCACTGGTGTGACGTGTCCCGCGCTTGGCGCAGCAGGAAGCGGCGGCGAACGCGGCCT GAATTCCCGGCGCCGGCCCCAGCTCCTCTGCCGCTGCCGCCATGCTCGACT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SRPRA_1 ↗ | 11:126,268,895 | 負股 | 126,268,885–126,268,944 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_534NTK4 · CTCF_binding_site · 126266052–126266073 · regulatory
ENSR11_93T576 · promoter · 126268885–126269164 · regulatory
ENSR11_534NW3J · CTCF_binding_site · 126268957–126268978 · regulatory
ENSR11_534NW3W · CTCF_binding_site · 126269031–126269052 · regulatory
ENSR11_534NW55 · CTCF_binding_site · 126269300–126269321 · regulatory
· motif · 126265935–126265943 · motif
· motif · 126266054–126266070 · motif
· motif · 126267902–126267915 · motif
· motif · 126267902–126267915 · motif
· motif · 126268560–126268576 · motif
· motif · 126268792–126268808 · motif
· motif · 126268846–126268863 · motif
· motif · 126268905–126268914 · motif
· motif · 126268925–126268934 · motif
· motif · 126268925–126268936 · motif
· motif · 126268925–126268936 · motif
· motif · 126268959–126268975 · motif
· motif · 126269002–126269012 · motif
· motif · 126269033–126269049 · motif
· motif · 126269039–126269051 · motif
· motif · 126269071–126269081 · motif
· motif · 126269241–126269256 · motif
· motif · 126269302–126269318 · motif
· motif · 126269483–126269496 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：638 aa
SRP receptor subunit alpha 長 638 個胺基酸，屬於 GTP-binding SRP family。其序列註解包含位於第 132–244 與第 283–316 個胺基酸的無序區域，以及位於第 419–636 個胺基酸的 NG domain。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SRPRA 被註記為位於內質網膜的周邊膜蛋白，位置在膜的細胞質側。 其膜錨定方式被認為可能涉及與 SR-beta 的交互作用；SR-beta 含有跨膜區域。 此定位描述包括推測性質，並非對錨定機制的確證。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- SRP54P61011 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
SRPRA 與 SRPRB 形成異源二聚體，並與 SRP 複合體次單元 SRP54 互作。感染相關資料另指出，SRPRA 可能與 Zika virus 的兩種 NS4A 蛋白株，以及 Dengue virus DENV2 16681 的 NS4A 互作；這些關係以可能互作描述。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SRPRA 是 signal recognition particle receptor（SR）的組成部分，並與 SRP 複合體協同，使新生分泌蛋白正確定位至內質網膜系統。它可與 SRP 次單元 SRP54 形成依賴 GTP 的複合體；SR receptor 的緊密化及 GTPase 構形重排，則推動 SRP 介導的共轉譯蛋白質轉位進入內質網。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the signal recognition particle (SRP) complex receptor (SR). Ensures, in conjunction with the SRP complex, the correct targeting of the nascent secretory proteins to the endoplasmic reticulum membrane system. Forms a guanosine 5'-triphosphate (GTP)-dependent complex with the SRP subunit SRP54. SRP receptor compaction and GTPase rearrangement drive SRP-mediated cotranslational protein translocation into the ER PMID 16439358 ↗ · PMID 16675701 ↗ · PMID 34020957 ↗ |
| 交互作用 | SRPRA 與 SRPRB 形成異源二聚體，並與 signal recognition particle（SRP）複合體次單元 SRP54 互作。資料分別記載這兩種關係，但未在此處提供更進一步的互作條件或功能後果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterodimer with SRPRB. Interacts with the signal recognition particle (SRP) complex subunit SRP54 PMID 16439358 ↗ · PMID 34020957 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染相關情境中，SRPRA 可能與 Zika virus Mr-766 株的非結構蛋白 4A（NS4A）互作，也可能與 Zika virus French Polynesia 10087PF/2013 株的 NS4A 互作；來源以可能互作表述。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) May interact with Zika virus strain Mr-766 non-structural protein 4A/NS4A. May interact with Zika virus French Polynesia 10087PF/2013 non-structural protein 4A/NS4A PMID 30550790 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染相關情境中，SRPRA 可能與 Dengue virus DENV2 16681 的非結構蛋白 4A（NS4A）互作。這項互作關係以可能性描述，未提供其他條件或功能結果。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) May interact with Dengue virus DENV2 16681 non-structural protein 4A/NS4A PMID 30550790 ↗ |
| 細胞定位 | SRPRA 被註記為位於內質網膜細胞質側的周邊膜蛋白。其膜錨定被認為可能透過與 SR-beta 交互作用而形成；SR-beta 含有實際的跨膜區域，因此此錨定方式仍屬推測。 | 推論支持 | 證據與來源Endoplasmic reticulum membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side; Thought to be anchored in the membrane through an interaction with SR-beta, which contains a bona fide transmembrane domain |
核酸與蛋白質序列
GTGACGTGTCCCGCGCTTGGCGCAGCAGGAAGCGGCGGCG40AACGCGGCCTGAATTCCCGGCGCCGGCCCCAGCTCCTCTG80CCGCTGCCGCCATGCTCGACTTCTTCACCATTTTCTCCAA120GGGCGGGCTTGTGCTCTGGTGCTTCCAGGGCGTTAGCGAC160TCATGCACCGGACCCGTTAACGCGTTGATTCGTTCCGTGC200TGCTGCAGGAACGGGGAGGTAACAACTCCTTCACCCATGA240GGCACTCACACTCAAGTATAAACTGGACAACCAGTTTGAG280CTGGTGTTTGTGGTTGGTTTTCAGAAGATCCTGACACTGA320CATATGTAGACAAATTGATAGATGACGTGCATCGGCTGTT360TCGGGACAAGTACCGCACAGAGATCCAACAGCAAAGTGCT400TTAAGTTTATTAAATGGCACTTTTGATTTCCAAAATGACT440TCCTGCGGCTCCTTCGTGAAGCAGAGGAGAGCAGTAAGAT480CCGTGCTCCCACTACCATGAAGAAATTTGAAGATTCTGAA520AAGGCCAAGAAACCTGTGAGGTCCATGATTGAGACACGGG560GGGAAAAGCCCAAGGAAAAAGCAAAGAATAGCAAAAAAAA600GGGGGCCAAGAAGGAAGGTTCTGATGGTCCTTTGGCTACC640AGCAAACCAGTCCCTGCAGAAAAGTCAGGTCTTCCAGTGG680GTCCTGAGAACGGAGTAGAACTTTCCAAAGAGGAGCTGAT720CCGCAGGAAGCGCGAGGAGTTCATTCAGAAGCATGGGAGG760GGTATGGAGAAGTCCAACAAGTCCACGAAGTCAGATGCTC800CAAAGGAGAAGGGCAAAAAAGCACCCCGGGTGTGGGAACT840GGGTGGCTGTGCTAACAAAGAAGTGTTGGATTACAGTACT880CCCACCACCAATGGAACCCCTGAGGCTGCCTTGTCTGAGG920ACATCAACCTGATTCGAGGGACTGGGTCTGGGGGGCAGCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。