基因總覽
SRP9（signal recognition particle 9）是由 SRP9 基因編碼的蛋白質，屬於 SRP9 family。它是 signal recognition particle（SRP）這種核糖核蛋白複合體的組成成分；SRP 含有 RNA 與多種蛋白質次單元，參與分泌蛋白質及膜蛋白質的共同轉譯定位。SRP9 會與 SRP14 一同構成複合體，其主要特色在於與 SRP RNA 及 SRP 的延伸停滯區域相關。來源未提供 SRP9 本身的序列長度或更細部的結構域資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000304786 ★ | 225,777,826–225,790,464 | 3 |
| ENST00000924809 | 225,777,699–225,790,670 | 4 |
| ENST00000650651 | 225,777,806–225,788,266 | 3 |
| ENST00000366839 | 225,777,806–225,790,466 | 4 |
| ENST00000651761 | 225,777,806–225,790,468 | 3 |
| ENST00000366838 | 225,777,806–225,789,524 | 4 |
| ENST00000861557 | 225,777,806–225,790,670 | 2 |
| ENST00000924808 | 225,777,806–225,790,670 | 3 |
| ENST00000924810 | 225,777,806–225,790,459 | 3 |
| ENST00000976197 | 225,777,806–225,790,670 | 4 |
| ENST00000976198 | 225,777,806–225,790,670 | 3 |
| ENST00000976200 | 225,777,806–225,790,458 | 4 |
顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SRP9 是 signal recognition particle（SRP）的組成成分。SRP 是核糖核蛋白複合體，能介導分泌蛋白質與膜蛋白質在轉譯進行期間被送往內質網（ER）；此功能描述標註為依相似性推定。SRP9 因此參與新生蛋白質共同轉譯定位過程，但來源未提供 SRP9 單獨作用於目標蛋白質或內質網的詳細機制。
SRP9 與 SRP14 及 SRP RNA 的 Alu 區域共同構成 SRP 的延伸停滯區域。這項描述指出，SRP9 的功能位置與正在延長中的蛋白質合成過程相關；來源未進一步說明停滯的調控方式、持續時間或其後續步驟。
SRP9 與 SRP14 形成的複合體是 SRP RNA 結合所必需的，這項功能同樣標註為依相似性推定。換言之，SRP9 的已述角色並非孤立於其他分子，而是與 SRP14 協同，支持 SRP RNA 結合及 SRP 複合體的功能。來源未指出缺少 SRP9 時的實驗結果，因此不宜據此延伸為特定細胞表型或疾病影響。
Promoter 與基因調控
>SRP9 ENST00000304786 GRCh38 chr1:225776826-225777926 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAAGGTGGTCTCCTGTCTTAGGTGACAAGAAAATGTACCTTCTTGCCCTCGTATCTACATGCTCACCTAT ACCCTCACCCGACTTTTCCCTCCTCCTCACCCCATCAAAGGCAATAATGCACCTGTTTTTATTCATCTGG GCCTTTGGTCTTCCCCTTCATATTTCCCGAGACCTCGCTTTCTTCTTTCTCTTGTATTTTTTATTTTTCT ATCTCTTATGTGTCCTTCTCTAAAAGTTATAAACATGCACAAAATCTTTCCATCTCAAAATATAATACCC TTTACCTGGTGTCCCCTGCAGGCCATCTTCTTTATTTATTTACTTTTGCGCCAGCGTCTTCCTCTGAAGC CCAGGCTGGGTGCGTAGCGCGATCATGGCTCACTGCAGCCTCGGACTCCCGGGCTCAAGCGATCCTCCTG CTTGGAGGATCAGATTTTTTATCCTTGCAGAAGTGATAATATGGCTTCTTCCTCATCTCCTAAACACCAG TCATCTGACATACACTGCAGATCTAAAATGGGCCTACGTGTTCTGCCCTTCCTTGCCTACCTGTTGAGCT TGCACCGCTTCTGTGAGTCTCCCCCCACCCACAAGAGATCCTTCTTCCTTCGCGCTCCACTAACCCGACA TAAATGTTTATCATATAAAGTTTTCCGTTGCACTCTTGTGTTTATGTCTCCTGGCTTCTTCACCAAGCTG TGTGACAGCTGGGCCCTGTCGCCTCCTTCCTCGTATATGCAGCGACTATCGCAGAGCCGCTTAATCTTTG TTGAAGGCAGCTGCGGTTCAGCCCTGAGGGCCACGGGACGGACGCCACTCATTCAGCCCTACCGGGGGCG CTGTGGCAGCCGGCATTGGTTGCCGTGCCCTCCGCTTGTCTCGCTCAGCTCTCGAGCCACACGCCCTGGG CTCCGCCCACTCCCTGACAACATCCCTCCTGCCCATTGGGCGAGCATGGACGGGGCTGTCCAATGGAGCG AGGCGTTGGTGCGAGGAGGCGCCGCCATCTTGGGGCTGCTGGGACTCGCGTCGGTTGGCGACTCCCGGAC GTAGGTAGTTTGTTGGGCCGGGTTCTGAGGCCTTGCTTCTCTTTACTTTTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SRP9_1 ↗ | 1:225,777,848 | 正股 | 225,777,799–225,777,858 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
SRP9 的定位記載為細胞質。 來源未提供其在不同條件下的定位變化、異構型差異，或進一步區分其在 SRP 複合體中的定位。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- ACTN2P35609 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDHR3Q6ZTQ4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DPP9Q86TI2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RYBPQ8N488 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SRP14P37108 · UniProt INTERACTION · 12 experiments · 2 筆來源紀錄
SRP9 與 SRP14 形成異源二聚體，並以此二聚體形式結合 RNA；這項描述標註為依相似性推定。此外，SRP9 是由 300 個核苷酸的 7SL RNA 與六種蛋白質次單元組成的 SRP 複合體成員，包括 SRP72、SRP68、SRP54、SRP19、SRP14 及 SRP9。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SRP9 是 signal recognition particle（SRP）的組成成分；SRP 為介導分泌蛋白質與膜蛋白質共同轉譯定位至內質網的核糖核蛋白複合體，此功能依相似性推定。SRP9 與 SRP14 及 SRP RNA 的 Alu 區域共同構成 SRP 的延伸停滯區域；SRP9–SRP14 複合體則是 SRP RNA 結合所必需，亦依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the signal recognition particle (SRP) complex, a ribonucleoprotein complex that mediates the cotranslational targeting of secretory and membrane proteins to the endoplasmic reticulum (ER) (By similarity). SRP9 together with SRP14 and the Alu portion of the SRP RNA, constitutes the elongation arrest domain of SRP. The complex of SRP9 and SRP14 is required for SRP RNA binding (By similarity) PMID 11089964 ↗ |
| 交互作用 | SRP9 與 SRP14 形成異源二聚體，並以二聚體形式結合 RNA；此描述依相似性推定。SRP 複合體由一個 300 個核苷酸的 7SL RNA 分子及六種蛋白質次單元組成，分別為 SRP72、SRP68、SRP54、SRP19、SRP14 與 SRP9。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterodimer with SRP14; binds RNA as heterodimer (By similarity). Component of a signal recognition particle complex that consists of a 7SL RNA molecule of 300 nucleotides and six protein subunits: SRP72, SRP68, SRP54, SRP19, SRP14 and SRP9 PMID 11089964 ↗ |
| 細胞定位 | SRP9 的細胞內定位記載為細胞質。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GCCGCCATCTTGGGGCTGCTGGGACTCGCGTCGGTTGGCG40ACTCCCGGACGTAGGTAGTTTGTTGGGCCGGGTTCTGAGG80CCTTGCTTCTCTTTACTTTTCCACTCTAGGCCACGATGCC120GCAGTACCAGACCTGGGAGGAGTTCAGCCGCGCTGCCGAG160AAGCTTTACCTCGCTGACCCTATGAAGGCACGTGTGGTTC200TCAAATATAGGCATTCTGATGGGAACTTGTGTGTTAAAGT240AACAGATGATTTAGTTTGTTTGGTGTATAAAACAGACCAA280GCTCAAGATGTAAAGAAGATTGAGAAATTCCACAGTCAAC320TAATGCGACTTATGGTAGCCAAGGAAGCCCGCAATGTTAC360CATGGAAACTGAGTGAATGGTTTGAAATGAAGACTTTGTC400GTGTACTTAGGAAGTAAATATCTTTTGAATTAGAGAAAGT440GTTGGGACAGAAAGTACTTTATGTAACTAAGTGGGCTGTT480CAGAAGCTTAGAGGTCATTTTTTGTAATTTTCTTTTTAAT520TACTTTAGAGAGCTAGGGATGCAAATGTTTTCAGTTAGAA560AGCCTTTATTTACTTTTGGAAATTGAACAAGAAATGCATC600TGTCTTAGAAACTGGAGATTATTTGATGTTAGGTAAAACA640TGTAATTGTTTCTCTGGCAAATTTGTATCAGTAATTTGAA680AATGAGATATTAGGAAAAACCAATTCTTCTTAAATTTAGT720TCATCTTTCTTTAAAAGAACATTAAATGTAACCATTTTGT760CAGATCCATGTATTTTGGAGCATAAAATGTATGCTGTTGT800GACCAATAAATATAAAATATGGTAATTGGAATTAACTCCA840CACCATAGTATGCATTGTTATACATACTGTGTACCTAATT880ATGTATAGCAGTGTAGTCTCAATTATATCTGAAAGTAATT920GTGACTAACAAGTATGCTTTGCCTTATTTCCACATTTAAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。