基因總覽
SRP19 的正式名稱為 signal recognition particle 19，屬於蛋白質編碼基因，產物屬 SRP19 family。它是 signal recognition particle（SRP）這種核糖核蛋白複合體的蛋白質成員；該複合體包含 7SL RNA 與多個蛋白質亞基。SRP19 的基本角色與 SRP 的組成及組裝相關。現有資料將其與 7SL RNA 的直接結合，以及協助 SRP54 接入 SRP 複合體的功能，標示為依相似性推定。蛋白質序列長 144 個胺基酸，後段註解有一段無序區。來源未提供更多可用於描述其家族結構或其他結構特色的資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000505459 ★ | 112,861,287–112,869,788 | 5 |
| ENST00000503445 | 112,861,188–112,891,637 | 5 |
| ENST00000282999 | 112,861,188–112,867,935 | 5 |
| ENST00000391338 | 112,861,188–112,895,707 | 5 |
| ENST00000515463 | 112,861,188–112,867,771 | 4 |
| ENST00000621420 | 112,861,188–112,868,392 | 4 |
| ENST00000445150 | 112,861,188–112,865,219 | 4 |
| ENST00000937586 | 112,861,188–112,870,044 | 5 |
| ENST00001047968 | 112,861,188–112,870,019 | 5 |
| ENST00001080110 | 112,861,188–112,895,707 | 4 |
| ENST00001100109 | 112,861,188–112,895,707 | 3 |
| ENST00001100111 | 112,861,188–112,867,908 | 4 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SRP19 是 signal recognition particle（SRP）複合體的組成成員。SRP 是由 RNA 與蛋白質構成的核糖核蛋白複合體，參與分泌蛋白及膜蛋白在翻譯進行期間被送往內質網的過程。資料將此功能標示為依相似性推定，因此不宜視為此處所提供的直接實驗證明。
在分子層級上，SRP19 被註解為可直接結合 7SL RNA；此外，它也協助 SRP54 與 SRP 複合體結合。這些作用同樣標示為依相似性推定。依據現有描述，SRP19 與 RNA 的結合，以及它對 SRP54 複合體結合的協助，都是其參與 SRP 組成的相關特性；來源並未進一步說明其作用步驟、條件或具體分子機制。
SRP 複合體所參與的共翻譯靶向，連結蛋白質合成中的分泌蛋白與膜蛋白，及其前往內質網的過程。SRP19 的功能敘述因此將其定位為該複合體的組成與結合相關成員，而非單獨執行靶向的因子。現有資料未提供更多可據以描述其對靶向效率或其他生物學結果影響的細節。
Promoter 與基因調控
>SRP19 ENST00000505459 GRCh38 chr5:112860287-112861387 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TATTGCAAAAATTACCAAATGTGACACAAAGTATACGCTGCTGGAAAAATGGCACCAAGCAACTTCTTTC AGGCGGATTTGCCAAAAACCTTCCATTTGTAAAAAGGCAGTATCTACTCGCAGCAGCAAGTGAAGTGCAA TAATGAAGTATGCCTGTAGTGATGGCACATGGTATCCTTCAGAAGTTTTAAAAGGTGAATAGTTTTGTTT CGTTTTTCCTAGACGGAGTCTTGCTCTGTTACGCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGC AACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTG CCACCACACTCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACGGGGTTTCAGCATGTTGGCCAGGCTGCTCTC CAACTCCTGACCTCATGATCCACCTGCCTCAGTCTCCCAAAGTGCTGGGATACAGGCGTGAGCCACCGCA CCCGGCCTAAAAGGTGAATAGCTAAGTTTCTAACGCAGAGCACACTGAAACACAACGTCTATAACTTTGC TAGTTCTACCACTACAAAAATCCATTTTGCCAAACTGAAAGCAAGCTCTAGAGCCCAGGAACGGAGAAAA ATTAAACGTAAGGAGTATTTCCTTCCCTGTCTAACATATATTTGCATCCTGAACCACACAGATTCCCCTC GTGGCACAGTCTTCGCCCCTTAACAGAGAGTAGCTAGTACCACCCATACTCGCTGAGAAACTGGAAACGA GGGAGGGTCGAAGTTAAACCCTTTTTAGTGGCGGTGCATGCGCCCCACATGGTCTTCCCGGCTTGGGAAA GGAATGAGAAGCTTTCATGATTCTCTCGCGAGAAGGGAAGTCTTCATGCCACGTCAGAGACTAGAGATCC TGGCGCCGAGCGACAGGTGCCGGAACAAACAGGCGATGAGAAATCGCGGACGCGGAACCATTTCTTGGGC AGGACTTCCGGCGGAAAAGCGGGCTGTCTCGGAAACTCAGAGCCGGGTTCCTCCCGGGTTTCTGCCGGGT TTCTCCCTGCGGCTCCTGGGTTGTTGAGACTCTTGTGAAGATGGCTTGCGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SRP19_1 ↗ | 5:112,861,305 | 正股 | 112,861,256–112,861,315 |
| SRP19_2 ↗ | 5:112,862,350 | 正股 | 112,862,301–112,862,360 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_BSDQ9 · promoter · 112860698–112861342 · regulatory
ENSR5_CF7D7 · enhancer · 112861343–112862454 · regulatory
· motif · 112860631–112860646 · motif
· motif · 112861120–112861140 · motif
· motif · 112861269–112861278 · motif
· motif · 112861271–112861282 · motif
· motif · 112861272–112861283 · motif
· motif · 112861413–112861422 · motif
· motif · 112861469–112861478 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：144 aa
SRP19 屬於 SRP19 family，蛋白質長 144 個胺基酸。序列第 117 至 144 位被註解為無序區；此區域資訊來自預測性資料庫註解。來源未列出其他結構域或功能區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SRP19 的定位資料包括細胞質，以及細胞核內的核仁與核質。 雖然 SRP 複合體在細胞質中作用，複合體至少部分會在細胞核及／或核仁組裝。 SRP19 進入細胞核可能由 IPO8/Imp8 與 TPNO1/Trn 介導。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- SRP68Q9UHB9 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
SRP19 是由 300 個核苷酸的 7SL RNA 與 SRP72、SRP68、SRP54、SRP19、SRP14、SRP9 六種蛋白質亞基組成的 SRP 複合體成員。另有資料記載 SRP19 與 IPO5、IPO7、IPO8、KPNB1 及 TNPO1 互作；其中與 IPO8、TNPO1 的互作可能參與 SRP19 進入細胞核，屬可能的功能關係描述。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SRP19 是參與分泌蛋白與膜蛋白共翻譯靶向至內質網的 SRP 核糖核蛋白複合體成員。它可直接結合 7SL RNA，並協助 SRP54 與 SRP 複合體結合；上述功能均標示為依相似性推定。 | 推論支持 | 證據與來源Component of the signal recognition particle (SRP) complex, a ribonucleoprotein complex that mediates the cotranslational targeting of secretory and membrane proteins to the endoplasmic reticulum (ER) (By similarity). Binds directly to 7SL RNA (By similarity). Mediates binding of SRP54 to the SRP complex (By similarity) |
| 交互作用 | SRP 複合體由一個 300 個核苷酸的 7SL RNA 分子及 SRP72、SRP68、SRP54、SRP19、SRP14、SRP9 六個蛋白質亞基組成。SRP19 也與 IPO5、IPO7、IPO8、KPNB1、TNPO1 互作；與 IPO8、TNPO1 的互作可能參與其進入細胞核。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of a signal recognition particle complex that consists of a 7SL RNA molecule of 300 nucleotides and 6 protein subunits: SRP72, SRP68, SRP54, SRP19, SRP14 and SRP9. Interacts with IPO5, IPO7, IPO8, KPNB1 and TNPO1. Interactions with IPO8 and TNPO1 may be involved in SRP19 import into the nucleus PMID 11682607 ↗ · PMID 12244299 ↗ · PMID 20179341 ↗ |
| 細胞定位 | SRP19 位於細胞質、細胞核核仁及核質。SRP 複合體在細胞質中作用，但至少部分會於細胞核及／或核仁組裝；SRP19 進入細胞核可能由 IPO8/Imp8 與 TPNO1/Trn 介導。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus, nucleolus; Nucleus, nucleoplasm; Although the signal recognition particle complex acts in the cytoplasm, it assembles at least in part in the nucleus and/or the nucleolus. SRP19 nuclear import may be mediated by IPO8/Imp8 and TPNO1/Trn PMID 10618370 ↗ · PMID 11682607 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGGCTGTCTCGGAAACTCAGAGCCGGGTTCCTCCCGGGTT40TCTGCCGGGTTTCTCCCTGCGGCTCCTGGGTTGTTGAGAC80TCTTGTGAAGATGGCTTGCGCTGCCGCGCGGTCCCCGGCC120GACCAGGACAGGTTTATTTGTATCTATCCTGCTTATTTAA160ATAATAAGAAGACCATCGCAGAGGGAAGGCGAATCCCCAT200AAGTAAGGCTGTTGAAAATCCTACAGCTACAGAGATTCAA240GATGTATGTTCAGCAGTTGGACTTAACGTATTTCTTGAGA280AAAATAAAATGTACTCTAGAGAATGGAATCGTGATGTCCA320ATACAGAGGCAGAGTCCGGGTCCAGCTCAAACAGGAAGAT360GGGAGCCTCTGCCTTGTACAGTTCCCATCACGTAAGTCAG400TAATGTTGTATGCAGCAGAAATGATACCTAAACTAAAAAC440AAGGACACAAAAAACAGGAGGTGCTGACCAAAGTCTTCAA480CAAGGAGAGGGAAGTAAAAAAGGGAAAGGAAAGAAAAAGA520AGTAACCTAGTATCAGCATCAAGTATGTGGTACTACTGTA560AGAGACATGAATGGAGACTTCTAATTTGTATCGGAGGGAA600ACAGAAGCTTTTTGTTTGCATCATTTAACTGAACTGTGAA640CCCTTGTGCCTCTCATCTTTATCATCGGAGTTGACAGTGA680AACAAATTTACATCAGAAGTTTGCATCTCGCGTATATGCC720GTATAAAAGAATTTTTTTGTCTTTCAATGCAGTTTTTTGG760AAGAAAATATTTTTAAATGGACAATGGACTGTACAATAAG800TTACTTGAAATAAGTTGTTTCAGATAAATTTCAATTAGAT840TTAAAATAAACATTTTGTCCACCTTTTAAGTTAATGAAAT880AAAATTTGAAACTGACTTTTGCAGCTTTTGCTTATATACT920AATGCTAGGAGAGGAGGGATAATTAAGAATAAAATATGTA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。