基因總覽
SRP14（signal recognition particle 14）是人類的蛋白質編碼基因，產物屬於 SRP14 family。其蛋白質是 signal recognition particle（SRP）中的一個次單元；SRP 本身是由 RNA 與蛋白質組成的核糖核蛋白複合體。SRP14 與 SRP9 共同形成異二聚體，並與 SRP RNA 的 Alu 區段一同構成 SRP 的延伸停滯結構域。這些組成特徵使 SRP14 成為 SRP RNA 結合與複合體功能的一部分。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000267884 ★ | 40,035,690–40,039,181 | 5 |
| ENST00000558720 | 40,032,985–40,039,050 | 4 |
| ENST00000560773 | 40,032,985–40,039,156 | 4 |
| ENST00000922619 | 40,032,985–40,039,186 | 5 |
| ENST00000983766 | 40,032,985–40,039,186 | 5 |
| ENST00001090775 | 40,032,985–40,039,186 | 4 |
| ENST00001132241 | 40,032,985–40,039,186 | 5 |
| ENST00000922618 | 40,034,494–40,039,186 | 3 |
| ENST00001076608 | 40,035,740–40,039,186 | 4 |
| ENST00001076622 | 40,036,038–40,039,186 | 4 |
| ENST00001090774 | 40,036,038–40,039,186 | 4 |
| ENST00001090773 | 40,036,041–40,039,186 | 4 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SRP14 是 signal recognition particle（SRP）複合體的組成蛋白。SRP 是核糖核蛋白複合體，參與分泌蛋白與膜蛋白在翻譯進行中的定位，將這些蛋白質導向內質網。SRP14 的功能因此與蛋白質合成過程中的靶向運送相關。
在 SRP 中，SRP14 與 SRP9 共同構成延伸停滯結構域的一部分；SRP RNA 的 Alu 區段也參與此結構域。此組成關係將 SRP14、SRP9 與 SRP RNA 的特定區段連結於 SRP 的延伸停滯功能架構中。現有資料未進一步說明該結構域如何調節翻譯延伸，因此不宜據此延伸其作用細節。
SRP9 與 SRP14 形成的複合體是 SRP RNA 結合所必需的。這項需求說明兩種蛋白質的組合不僅是 SRP 的結構成分，也與 SRP RNA 的結合能力有關。SRP14 所參與的 RNA 結合及延伸停滯結構域，均置於 SRP 執行共轉譯靶向的整體脈絡之中；資料未提供其他獨立於 SRP 的功能主張。
Promoter 與基因調控
>SRP14 ENST00000267884 GRCh38 chr15:40039081-40040181 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACCTCTACAACCGTGCCTGGCACAGACTGAGAGGCACTCAGCGAAAACCTCTTGTGTGGTGGAATGCTTG ACTTTATAGAGGGCCCAGGGTTCAAGTTGGCTAGTGGCAGAGAGGGCTTACAACCTAGTTCTCCTGACTA ATCAGAGGTAGAACTAAAGACTGGGCTCCAGCCCCTCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACG GAGTCTCGCTCTGTCTTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTG GGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGATTACAGGTGCCCGCCACCACGCCCGGC TAACTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGCGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACC TCGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCCAGC CCTTCTGGCTAGAGCTGCAGGTCAGCGTTTAGGGAGAGTTTAAAGGATCTCTACAGGAACTTATAATGAC AATAATGAAAAGAACAATAGCTGATACCTACTGAACACGCTCTATGTGCCAGGCACTGTTCTACGTATTT AATCTGAGTTTCATTTACGCTTCACGACCACACTGCGCGGTAGATACTATCATTACCCTTACTTTATGGA TAAGGAAACTGAGTCACTGAGTTGTTAGGTTACCTGCCCAGCATACAGCTGAATATAAATCGTACGCTGC TATCAAAACTTTCTTTTGCTCTCACTCCGTCACACTGGCTGGGGTGAGACGATTTCTCGCATGTGACGAC CCAGGACAGCCCCAGCGCCTCCGGGTCACAGGCCCCCGGACGTCCCAGGGCGCGGGCGCTAGGCGGGCGG GGAGGGGGGAGGGCGCAGGCCGGGATTGGTGGAAGAGAAGAGATTGGTGGAAGACAATGGAAGTCTAGTA GCGGAAGTCCCGCCCAGCCTAGGCCGAACTTCCGGCTCTCACTGCTAGGGGCTTAAGCGGAGGGAGTCGA GCCAGCGTCGCCGCGATGGTGTTGTTGGAGAGCGAGCAGGTATGGCTAGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SRP14_1 ↗ | 15:40,039,147 | 負股 | 40,039,137–40,039,196 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_5CF9DT · CTCF_binding_site · 40039017–40039038 · regulatory
ENSR15_9KW4F · promoter · 40039040–40039344 · regulatory
ENSR15_C5Z9F · enhancer · 40039345–40040660 · regulatory
· motif · 40039019–40039035 · motif
· motif · 40039164–40039175 · motif
· motif · 40039164–40039175 · motif
· motif · 40039166–40039175 · motif
· motif · 40039193–40039202 · motif
· motif · 40039193–40039204 · motif
· motif · 40039218–40039229 · motif
· motif · 40039236–40039247 · motif
· motif · 40039569–40039591 · motif
· motif · 40039569–40039591 · motif
· motif · 40040863–40040876 · motif
· motif · 40040863–40040876 · motif
· motif · 40040979–40040992 · motif
· motif · 40041063–40041078 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：136 aa
SRP14 蛋白質長 136 個胺基酸，屬於 SRP14 family。序列第 116 至 136 位被註記為無序區域；此區域的註解來自 MobiDB-lite。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SRP14 的細胞內定位註記為細胞質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- DDX31Q9H8H2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EAF1Q96JC9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPANXN2Q5MJ10 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SRP9P49458 · UniProt INTERACTION · 12 experiments · 2 筆來源紀錄
SRP14 與 SRP9 形成異二聚體，並以此異二聚體形式結合 RNA；此結合描述標示為依相似性推定。SRP14 也屬於 SRP 複合體，該複合體包含一個 300 個核苷酸的 7SL RNA 分子及 SRP72、SRP68、SRP54、SRP19、SRP14、SRP9 六種蛋白質次單元。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SRP14 是核糖核蛋白複合體 SRP 的組成部分；SRP 參與分泌蛋白與膜蛋白在翻譯進行中的內質網靶向。SRP9、SRP14 與 SRP RNA 的 Alu 區段共同構成 SRP 的延伸停滯結構域；SRP9 與 SRP14 形成的複合體則是 SRP RNA 結合所必需的。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the signal recognition particle (SRP) complex, a ribonucleoprotein complex that mediates the cotranslational targeting of secretory and membrane proteins to the endoplasmic reticulum (ER). SRP9 together with SRP14 and the Alu portion of the SRP RNA, constitutes the elongation arrest domain of SRP. The complex of SRP9 and SRP14 is required for SRP RNA binding PMID 11089964 ↗ |
| 交互作用 | SRP14 與 SRP9 形成異二聚體，並以異二聚體形式結合 RNA；此互作資訊標示為依相似性推定。SRP14 也是 SRP 複合體的次單元之一；該複合體由一個 300 個核苷酸的 7SL RNA 分子及 SRP72、SRP68、SRP54、SRP19、SRP14、SRP9 六種蛋白質次單元組成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterodimer with SRP9; binds RNA as heterodimer (By similarity). Component of a signal recognition particle (SRP) complex that consists of a 7SL RNA molecule of 300 nucleotides and six protein subunits: SRP72, SRP68, SRP54, SRP19, SRP14 and SRP9 PMID 11089964 ↗ |
| 細胞定位 | SRP14 的定位註記為細胞質。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGGCCGAACTTCCGGCTCTCACTGCTAGGGGCTTAAGCGG40AGGGAGTCGAGCCAGCGTCGCCGCGATGGTGTTGTTGGAG80AGCGAGCAGTTCCTGACGGAGCTGACCAGACTTTTCCAGA120AGTGCCGGACGTCGGGCAGCGTCTATATCACCTTGAAGAA160GTATGACGGTCGAACCAAACCCATTCCAAAGAAGGGTACT200GTGGAGGGCTTTGAGCCCGCAGACAACAAGTGTCTGTTAA240GAGCTACCGATGGGAAGAAGAAGATCAGCACTGTGGTGAG280CTCCAAGGAAGTGAATAAGTTTCAGATGGCTTATTCAAAC320CTCCTTAGAGCTAACATGGATGGGCTGAAGAAGAGAGACA360AAAAGAACAAAACTAAGAAGACCAAAGCAGCAGCAGCAGC400AGCAGCAGCAGCACCTGCCGCAGCAGCAACAGCACCAACA440ACAGCAGCAACAACAGCAGCAACAGCAGCACAGTAAAGGG480CATACATTTCCTGCTTTCACCAATTAACCACTGAATTGCT520ATTTTTTCCTTTTGGCCAGATAGCTAGGTTTCTGGTTCCC560CCACAGTAGGTGTTTTCACATAAGATTAGGGTCCTTTTGG600AAAGAATAGTTGCAGTGTTTATAGGATAGTTGTGGTAAGA640ATCTAGTTTATTTTGCATTTGGCTAATTGGTCTGTGCTGC680ATGGTTATATACTCCTGGATTATAGATTAAAAGTCTCTGT720AGACATCTCTGTGAAGAGCAAGCTATCATTAAACATGTCT760GTTTATCAGCACTGTCTCTTTATTCCTTTCCCAACCCATT800TTAATAGTTCTGGCAATAACTACTAAATCTAGAATGATGT840GATTAATGAATAGGCTTTAGCTCTATAATATCTTCTAGGT880TATTAGAATTGAAACCTGACAGTTTTATAAAAAGTCATGT920TATCTCATGAGCTGCTTCCCACCTGGCTGTATAATTTTAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。