基因總覽
SRMS 是蛋白質編碼基因，其正式名稱為 src-related kinase lacking C-terminal regulatory tyrosine and N-terminal myristylation sites。其產物 Tyrosine-protein kinase Srms 為非受體型酪胺酸蛋白激酶，歸屬於蛋白激酶超家族中的酪胺酸蛋白激酶家族及 SRC 次家族。蛋白質序列包含 SH3、SH2 與蛋白激酶結構域，呈現由訊號辨識相關區域與激酶區域組成的架構。這些基本特徵界定了 SRMS 蛋白質的家族分類與分子性質；其底物及磷酸化作用詳述於功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000217188 ★ | 63,538,489–63,547,749 | 8 |
| ENST00001132818 | 63,538,489–63,547,752 | 8 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SRMS 是非受體型酪胺酸蛋白激酶，可將磷酸基加到蛋白質的酪胺酸殘基上。其反應以 ATP 為磷酸基來源，產生磷酸化蛋白質、ADP 與氫離子，屬於蛋白質酪胺酸磷酸化作用。
已報告的底物包括 DOK1、KHDRBS1/SAM68 與 VIM；SRMS 可磷酸化這些蛋白質的酪胺酸殘基。其中 KHDRBS1/SAM68 的磷酸化具有 EGF 依賴性，表示此作用在 EGF 條件下發生，來源未進一步說明其他條件或其下游結果。
SRMS 也可磷酸化 OTUB1，並促進 RPTOR 去泛素化。這項結果將 SRMS 的激酶作用連結至 RPTOR 的去泛素化調節；來源未提供足以延伸說明其後續生物學效應的資訊。上述資料支持 SRMS 具有多種蛋白質底物，但未據此推定其在其他生物過程中的作用。
Promoter 與基因調控
>SRMS ENST00000217188 GRCh38 chr20:63547649-63548749 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAAGGGGCGTGAGGCTCCCTGAAGGCCACCCAGGTGCGGAAGGGGCTGCTGGGGGAGGCCGGCAGGAGGA GTGAGAGACTGCAGATGGCCTCACCCCACCCCCGTGCCTCAGGACCCAGAGGGGAGGTGGGAGGAGTGAG AGACTGCAGATGGCCCCCACCCCACCCCACTCAGGACCCGGAGGGGATGTGGGAGGAGAGAGAGACTGCA GATGGCCACCACCCCATCCTCCTGCCTCAGGACCCTGTACCGTGCTGCTGGGTTTTGCTGGGATTTGCTC CCCCAGTCCTGCCCCGATCTGGGGACCTACCTGAGCGGGCAGAGTTTGCTTCAGCATGCGGGGGCTTGGC GCTGTCCAGGGAGAGGGTGGGAGGTCCCCAGCCAGGGACTCACCCGCCGCCCCTTCTCCGTGTGCTCATC CCCCTGAACTGGGGCCAGGCGTCCGCAGCCTCCACTTCCCCGCAGTGGCCTTTGGGTATGGCCTGGGCAT TGACTGACTCAGAAGCCGGTCATCGGGCAGCATGGGGCATCTGGGTGCCTGGCCTGCGGCCGAGCTCCCT GCAATCAGCATCTCGTTTTACTGCATGAAAGCCGGGGTGCTGAGAGCCCCCTCACTCGCCTGTCCTCAGA ATTTACTGCAGAGGCCGGAGGCTCGGCACCTGGTGCAGGGTTAATGATGTTAAAATATCTGGCCAACACT TAAATAAGCAGGCAATTTTTCACCTGAGTGCAGCTCAGGCTTGGCAACCACTGCAGGTGCTGAACAGCAG CGCTTCTCCGTGGAACCCCCACTTCTCCGTGGGCACGGGCGGCTGTTGGACTGTGGTGCCCTTGGGCATG GGCCAGGCCTGACTGGGCAGAGCCATTCCGCCTGCCTGGGCCTTGCAGAGGGCGGGAGAGAGGCTGGCCC TGCCCACCCCGCCCTCCTCGGGCCCCTCCTGGAGCCCGCCCCCGCCCCAGCCCAAGCTGCCCTCTGCCGT CGGGTTGGGGAGGGGACGGTGCACTCCAGACGCCAAGGAGGTCGAGGACAGGAGGTGCTGTCGGTGTGCC TGAGGCAGGGGGTCCGCCCTGCGCCCCACCCAGCCCCAACGCCAGCCCGGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SRMS_1 ↗ | 20:63,547,747 | 負股 | 63,547,737–63,547,796 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_9X7ZC · promoter · 63542921–63543421 · regulatory
ENSR20_C8B8P · enhancer · 63544306–63546342 · regulatory
ENSR20_9X82L · enhancer · 63547463–63547738 · regulatory
ENSR20_9X82P · promoter · 63547739–63548239 · regulatory
ENSR20_9X83N · enhancer · 63551198–63551518 · regulatory
ENSR20_9X845 · promoter · 63552530–63553030 · regulatory
· motif · 63542749–63542762 · motif
· motif · 63542749–63542762 · motif
· motif · 63542855–63542872 · motif
· motif · 63542938–63542947 · motif
· motif · 63543219–63543232 · motif
· motif · 63543219–63543232 · motif
· motif · 63543780–63543800 · motif
· motif · 63544167–63544179 · motif
· motif · 63544169–63544182 · motif
· motif · 63544264–63544278 · motif
· motif · 63544328–63544335 · motif
· motif · 63544456–63544471 · motif
· motif · 63544473–63544488 · motif
· motif · 63544880–63544892 · motif
· motif · 63544882–63544889 · motif
· motif · 63545300–63545314 · motif
· motif · 63545584–63545599 · motif
· motif · 63545589–63545601 · motif
· motif · 63545931–63545938 · motif
· motif · 63545931–63545944 · motif
· motif · 63546361–63546368 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：488 aa
Tyrosine-protein kinase Srms 長 488 個胺基酸，屬蛋白激酶超家族中的酪胺酸蛋白激酶家族及 SRC 次家族。其 SH3 結構域位於第 51–112 個胺基酸，SH2 結構域位於第 120–212 個胺基酸；蛋白激酶結構域涵蓋第 230–488 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SRMS 位於細胞質，並可定位於點狀的細胞質結構。 來源未指出這種定位是否會隨條件改變，也未提供異構型間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- DOK1Q99704 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- NCK2O43639 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SRMS 透過 SH2 與 SH3 結構域和 DOK1 互作；另有與 KHDRBS1/SAM68 及 VIM 互作的報告。這些資料描述的是蛋白質互作，未指出相關複合體的組成，也不應與 SRMS 磷酸化這些蛋白質的功能關係混為一談。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SRMS 是非受體型酪胺酸蛋白激酶，可磷酸化 DOK1、KHDRBS1/SAM68 與 VIM 的酪胺酸殘基；其中 KHDRBS1/SAM68 的磷酸化依賴 EGF。SRMS 也會磷酸化 OTUB1，並促進 RPTOR 去泛素化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Non-receptor tyrosine-protein kinase which phosphorylates DOK1 on tyrosine residues. Also phosphorylates KHDRBS1/SAM68 and VIM on tyrosine residues. Phosphorylation of KHDRBS1 is EGF-dependent. Phosphorylates OTUB1, promoting deubiquitination of RPTOR PMID 23822091 ↗ · PMID 29496907 ↗ · PMID 35927303 ↗ |
| 分子活性 | L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+) PMID 23822091 ↗ · PMID 29496907 ↗ · PMID 35927303 ↗ |
| 交互作用 | SRMS 透過 SH2 與 SH3 結構域和 DOK1 互作，並且也與 KHDRBS1/SAM68 及 VIM 互作。此處描述蛋白質互作，未提供複合體組成等進一步資訊。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts (via the SH2 and SH3 domains) with DOK1. Interacts with KHDRBS1/SAM68 and VIM PMID 23822091 ↗ · PMID 29496907 ↗ |
| 細胞定位 | SRMS 位於細胞質，並定位於點狀的細胞質結構；來源未說明定位變化的條件或不同異構型的定位差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCACTCCAGACGCCAAGGAGGTCGAGGACAGGAGGTGCTG40TCGGTGTGCCTGAGGCAGGGGGTCCGCCCTGCGCCCCACC80CAGCCCCAACGCCAGCCCGGACGCCGGTGGGAACCGTGTG120CCTCCTGGATCCAGGGGACCTCTGAGTGACCGCAGGGCCG160GGGTCCCCTGTCACCCCACGGCCAGGGCAGGGAGCGCTGG200ACACCGGGTCCCACCGGCCCTGCCAGTTCCTCTTCCGGGC240TCGCGGGCTCCCATGGCCCTCGGGCCCAGCGTGGTGACCC280CGGGGGATGGAGCCGTTCCTCAGGAGGCGGCTGGCCTTCC320TGTCCTTCTTCTGGGACAAGATCTGGCCGGCGGGCGGCGA360GCCGGACCATGGCACCCCCGGGTCCCTGGACCCCAACACT400GACCCAGTGCCCACGCTCCCCGCCGAGCCTTGCAGCCCCT440TCCCTCAGCTCTTCCTTGCGCTCTATGACTTCACGGCGCG480GTGTGGCGGGGAGCTGAGTGTCCGCCGCGGGGACAGGCTC520TGTGCCCTCGAAGAGGGGGGCGGCTACATCTTCGCACGCA560GGCTTTCGGGCCAGCCCAGCGCCGGGCTCGTGCCCATCAC600CCACGTGGCCAAGGCTTCTCCTGAGACGCTCTCAGACCAA640CCCTGGTACTTTAGCGGGGTCAGTCGGACCCAGGCACAGC680AGCTGCTCCTCTCCCCACCCAACGAACCAGGGGCCTTCCT720CATCCGGCCCAGCGAGAGCAGCCTCGGGGGCTACTCACTG760TCAGTCCGGGCCCAGGCCAAGGTCTGCCACTACCGGGTCT800CCATGGCAGCTGATGGCAGCCTCTACCTGCAGAAGGGACG840GCTCTTTCCCGGCCTGGAGGAGCTGCTCACCTACTACAAG880GCCAACTGGAAGCTGATCCAGAACCCCCTGCTGCAGCCCT920GCATGCCCCAGAAGGCCCCGAGGCAGGACGTGTGGGAGCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。