基因總覽
SRM 是蛋白質編碼基因，其產物為 spermidine synthase，屬於 spermidine/spermine synthase family。這種酵素參與多胺生合成，負責 spermidine 生合成途徑中的一個反應步驟。現有資料未提供其更詳細的結構或其他基本性質，因此不進一步推定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000376957 ★ | 11,054,589–11,060,018 | 8 |
| ENST00000882301 | 11,054,589–11,060,078 | 8 |
| ENST00000923261 | 11,054,589–11,060,078 | 7 |
| ENST00000979995 | 11,054,589–11,060,078 | 8 |
| ENST00000979996 | 11,054,589–11,060,078 | 7 |
| ENST00001036259 | 11,054,589–11,060,078 | 6 |
| ENST00001036260 | 11,054,589–11,060,078 | 8 |
| ENST00001036261 | 11,054,589–11,060,078 | 8 |
| ENST00001144563 | 11,054,589–11,060,078 | 8 |
| ENST00000882302 | 11,054,592–11,060,078 | 8 |
| ENST00000490101 | 11,054,664–11,055,820 | 2 |
| ENST00000465788 | 11,056,011–11,058,873 | 3 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
spermidine synthase 催化 putrescine 與 decarboxylated S-adenosylmethionine（dcSAM）生成 spermidine。此反應屬於胺類與多胺生合成中的 spermidine 生合成步驟，資料將其列為由 putrescine 生成 spermidine 的單一步驟。
在底物選擇上，酵素明顯偏好 putrescine；對 1,3-diaminopropane 的活性很低，對 spermidine 本身的活性則極低。這些差異描述了其對不同胺類化合物的催化能力，不應將低活性理解為與 putrescine 相同程度的底物利用。
Promoter 與基因調控
>SRM ENST00000376957 GRCh38 chr1:11059918-11061018 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCCAGGTGGAGGCTGCAAAACGTGTCAAAACCATCCCTGACATAATGTCAAGAGTAGCTTATACTAGTTT CATCTTCCTTCCTTGGCATTCGAACTGCGTGTGGAACAATTAGCATTTAATATTTGGTAATTAGCATGCT TAATGTGATTCTGAGAAGTTCTTTGACATTCTCATAAAAACAGCACATTCCCACCCACCCTTCAAAGAGC AAGACCCAGTTTGTCAAGAAAAATTGCGTGCCAGTCTTTTCTGGTGCTGAATATGTATGTTCTGGGCCTC TTCCTGGACACTGCTGGTAAATTTAGAAACTCGTTTAGAAAAGCACTTCTCTCGTATTCAACAGCCTATA GGCTCATGGCGCAGAATCTAAGGGAAAATGGCTAAATCCAGCTTGTGAATTCGCGGGCTGTGATGATTCT TTCCAAGTAAATAAAAACCCTCGGTTCGCCCCGACGAGCCACATAATCTGTTCAAATCCAACAAGGAACC AGATTTTGGACGCAAAGAAGGATACGTTCTACTCGCCCCGTGCAACAACGTAAACCACTGTAGCCACCCG CTCCCGTGTCTCCAGCCCAAAGGCTGACTCTCCAGTCCGCACGTCGCAGCGCTCTTGCCCTCCACACCAA GCCCGAGTCCCGCAGCCCCTCGAGGCCCTCGGTGCCTCCCAACCCCGAGAAGGAAGCGGGGGCCGGTGGT GCACCGCCCCGGCTGCTTGGGGCGGAGGAAGGACCCGGACCCCTTCCGCCGGCCCAGCCCGCCCCGGAAC CCGACCCGGCCGCCCGGCCCCGGCCGGGCCCCACGTGGCCCCTGGAGCGGGCCGCACTACCCTGCTGCCG CCGACGGACGGCGCGCCACAGCCACTCTGCGCCGCTCTGCGAGCCGGTGGCCAATGAGCGCCAGGCGAGG CCGCTTTGCCATTGGCGAGCGCGGGCTCCGCCCCCGCCGGCAGGCCCCGCCCCGCGCCCGGGTTAGGTTG CGGCGCGGGCGGCGGGCGGAGCTGGTCCCGTTGTGCTGCGGCGCCGCGCGGCCTGCAGTCCCGGGCCCGC GCCCCGCGCCGCCCGCCCGCCCGCCATGGAGCCCGGCCCCGACGGCCCCGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SRM_1 ↗ | 1:11,060,018 | 負股 | 11,060,008–11,060,067 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_96DJ9 · promoter · 11060008–11060310 · regulatory
ENSR1_C34M5 · enhancer · 11060311–11061477 · regulatory
ENSR1_54L8LD · CTCF_binding_site · 11061004–11061025 · regulatory
ENSR1_B479D · enhancer · 11061718–11062248 · regulatory
ENSR1_54L8QF · CTCF_binding_site · 11061870–11061891 · regulatory
ENSR1_54L8RP · CTCF_binding_site · 11062155–11062176 · regulatory
ENSR1_B479K · enhancer · 11062968–11063483 · regulatory
ENSR1_54L94X · CTCF_binding_site · 11063929–11063950 · regulatory
ENSR1_96DKF · enhancer · 11063993–11064252 · regulatory
ENSR1_54L95M · CTCF_binding_site · 11064085–11064106 · regulatory
· motif · 11059470–11059479 · motif
· motif · 11059470–11059479 · motif
· motif · 11059560–11059569 · motif
· motif · 11059560–11059569 · motif
· motif · 11059758–11059773 · motif
· motif · 11059768–11059785 · motif
· motif · 11059831–11059840 · motif
· motif · 11059940–11059950 · motif
· motif · 11060323–11060336 · motif
· motif · 11060460–11060477 · motif
· motif · 11060934–11060954 · motif
· motif · 11060988–11061000 · motif
· motif · 11061006–11061022 · motif
· motif · 11061178–11061193 · motif
· motif · 11061178–11061193 · motif
· motif · 11061235–11061250 · motif
· motif · 11061241–11061253 · motif
· motif · 11061243–11061250 · motif
· motif · 11061243–11061258 · motif
· motif · 11061872–11061888 · motif
· motif · 11062157–11062173 · motif
· motif · 11063048–11063064 · motif
· motif · 11063048–11063064 · motif
· motif · 11063057–11063066 · motif
· motif · 11063057–11063066 · motif
· motif · 11063067–11063083 · motif
· motif · 11063067–11063083 · motif
· motif · 11063106–11063114 · motif
· motif · 11063147–11063155 · motif
· motif · 11063225–11063240 · motif
· motif · 11063931–11063947 · motif
· motif · 11064087–11064103 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：302 aa
spermidine synthase 長 302 個胺基酸，屬於 spermidine/spermine synthase family。其序列第 18 至 253 位註解為 PABS domain。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- TERF1P54274 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
資料指出，spermidine synthase 可形成同源二聚體或同源四聚體；未提供其他結合夥伴或複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | spermidine synthase 催化 putrescine 與 decarboxylated S-adenosylmethionine（dcSAM）生成 spermidine。酵素對 putrescine 有強烈偏好，對 1,3-diaminopropane 的活性很低，對 spermidine 本身的活性則極低。 | 含實驗來源 | 證據與來源Catalyzes the production of spermidine from putrescine and decarboxylated S-adenosylmethionine (dcSAM). Has a strong preference for putrescine as substrate, and has very low activity towards 1,3-diaminopropane. Has extremely low activity towards spermidine PMID 17585781 ↗ |
| 分子活性 | S-adenosyl 3-(methylsulfanyl)propylamine + putrescine = S-methyl-5'-thioadenosine + spermidine + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源S-adenosyl 3-(methylsulfanyl)propylamine + putrescine = S-methyl-5'-thioadenosine + spermidine + H(+) PMID 17585781 ↗ |
| 分子活性 | 此反應歸屬於胺類與多胺生合成，具體位於 spermidine 生合成途徑，描述由 putrescine 生成 spermidine 的步驟；資料將此途徑列為單一步驟。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Amine and polyamine biosynthesis; spermidine biosynthesis; spermidine from putrescine: step 1/1 |
| 交互作用 | spermidine synthase 的亞基組成可為同源二聚體或同源四聚體；此描述指出其可能形成的同源組裝狀態，未列出其他蛋白質夥伴。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCTGGTCCCGTTGTGCTGCGGCGCCGCGCGGCCTGCAGTC40CCGGGCCCGCGCCCCGCGCCGCCCGCCCGCCCGCCATGGA80GCCCGGCCCCGACGGCCCCGCCGCCTCCGGCCCCGCCGCC120ATCCGCGAGGGCTGGTTCCGCGAGACCTGCAGCCTGTGGC160CCGGCCAGGCCCTGTCACTGCAGGTGGAGCAGCTGCTCCA200CCACCGGCGCTCGCGCTACCAGGACATCCTCGTCTTCCGC240AGTAAGACCTATGGCAACGTGCTGGTGTTGGACGGTGTCA280TCCAGTGCACGGAGAGAGACGAGTTCTCCTACCAGGAGAT320GATCGCCAACCTGCCTCTCTGCAGCCACCCCAACCCGCGA360AAGGTGCTGATCATCGGGGGCGGAGATGGAGGTGTCCTGC400GGGAGGTGGTGAAGCACCCCTCCGTGGAGTCCGTGGTCCA440GTGTGAGATCGACGAGGATGTCATCCAAGTCTCCAAGAAG480TTCCTGCCAGGCATGGCCATTGGCTACTCTAGCTCGAAGC520TGACCCTACATGTGGGTGACGGTTTTGAGTTCATGAAACA560GAATCAGGATGCCTTCGACGTGATCATCACTGACTCCTCA600GACCCCATGGGCCCCGCCGAAAGTCTCTTCAAGGAGTCCT640ATTACCAGCTCATGAAGACAGCCCTCAAGGAAGATGGTGT680CCTCTGCTGCCAGGGCGAGTGCCAGTGGCTGCACCTGGAC720CTCATCAAGGAGATGCGGCAGTTCTGCCAGTCCCTGTTCC760CCGTGGTGGCCTATGCCTACTGCACCATCCCCACCTACCC800CAGCGGCCAGATCGGCTTCATGCTGTGCAGCAAGAACCCG840AGCACGAACTTCCAGGAGCCGGTGCAGCCGCTGACACAGC880AGCAGGTGGCGCAGATGCAGCTGAAGTACTACAACTCCGA920CGTGCACCGCGCCGCCTTTGTGCTGCCCGAGTTTGCCCGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。