基因總覽
SRL 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 sarcalumenin。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 16p13.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000399609 ★ | 4,189,374–4,242,080 | 6 |
| ENST00000537996 | 4,189,369–4,239,743 | 6 |
| ENST00000855673 | 4,189,369–4,242,283 | 5 |
| ENST00000967596 | 4,189,369–4,242,283 | 6 |
| ENST00000967597 | 4,189,369–4,242,283 | 5 |
| ENST00000967598 | 4,189,369–4,242,283 | 6 |
| ENST00000967599 | 4,189,369–4,242,283 | 4 |
| ENST00000967600 | 4,189,369–4,242,283 | 6 |
| ENST00000967601 | 4,189,369–4,242,283 | 4 |
| ENST00000967602 | 4,189,369–4,242,283 | 5 |
| ENST00000967603 | 4,189,369–4,242,283 | 5 |
| ENST00000990818 | 4,189,369–4,242,283 | 7 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SRL ENST00000399609 GRCh38 chr16:4241980-4243080 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CACTGTGCCTGGCCCTGATTTAGTTCCTTTCCTCCAAGGCTGGCTTCTACCTCTTCCCCACACAGTGACA CTGTACCCCGACCAGACAAGCAAGTGTCTGCTTTCCCTTGGCTTCTTACAACTGGCTCTCTGGGCCATCT ACAAAAAATTTTAAAAAATTAGTACAGCATGGTGGCACTACTGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGTTGG GAGGATTGATTGAGCCTGGGAGGTCGAGTGCAGTGAGTGATGATTGTGCCACTGCAGTCCAGCCTGGGTG ACAGAGCGAGATCCTCTATCAAAAACAAATAAACAAAAAAGCACTTTGCAGAGGTGACTGAATGTTCTGG AACCCCTGGGCCATTGGAAATGGATATCTGTTGCTCCATCCTCCAGTTTACACCGTAGCCTCAGCTTGTG TCTCAGTGTGCCCCTCTCCCTCTGGTCTGTGCTCTCTCTCTTCCAGAGGCTGGGAAGGTTGTTCCAGGGC TGCAGCCTTGGACCTCAGAGGTCACATGTTGCGGGTTTGCCGTAGCTGACCACTCTCTAGCATGTGGATC AGTGGCTGTTAAATAGGATTTCTTTTGCGTGGCCTTACAACTTCCTCCTTCCAGTGCAGGCGTGTCAAGG TCCTTAACCTGCCGAGACTTCAGGTCAAGTTATTGCAAGTTCTGGGAAGACTCAGCTTCCCAGCTCCACC GCCTGAGCCCAAGGGATGCTCCATTTTATGCCTGTCACCCACGCCCTGTGACCCATGTCATGTGATCCCA GGGCTGCAGGGGTTCGGGGGAAGAGAATCCAGCCACGGCCCTGCCTTCTGGGGCCTGGCAGCTGGGACAG CAGTGGCGCAGCCTGAGCCTCTGCACAGCCTTCTGGGGTCCGGGCTTCTTCCCCATCACACCCTCCTAGT TGCCCTGGTGACTGTGTGACCCCTCTCCCCCCTCCACCGCCTGCTGCCACGGCCGGCCGTATAAATAGAG GCGAGGAGCAGCTGGGCTCTCTTGGCAGTCACCATGAGGGCGCTGGTCCTGCTCGGCTGCCTCCTGGCCT CGCTCCTGTTCTCAGGACAAGCAGGTAGGGCCCCTCCCAGCATGACCCAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SRL_1 ↗ | 16:4,242,077 | 負股 | 4,242,067–4,242,126 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_85CT8 · enhancer · 4239091–4239282 · regulatory
ENSR16_BSPJ · enhancer · 4240448–4241080 · regulatory
ENSR16_85CWX · promoter · 4242070–4242219 · regulatory
ENSR16_CFD4 · enhancer · 4244450–4245669 · regulatory
ENSR16_93NHT · enhancer · 4246828–4247102 · regulatory
· motif · 4241127–4241141 · motif
· motif · 4241323–4241334 · motif
· motif · 4244473–4244483 · motif
· motif · 4246986–4246995 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：473 aa
Sarcalumenin 長 473 個胺基酸，屬於 TRAFAC 類 dynamin-like GTPase 超家族中的 Dynamin/Fzo/YdjA 家族。其序列包含 1–20 位的訊號序列，以及位於 90–331 位的 Dynamin-type G 結構域；此結構域內另標註 G1、G2、G3、G4 與 G5 motif。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Sarcalumenin 位於肌漿網腔，亦見於肌漿網膜，並被註記為周邊膜蛋白。 它可能透過依賴鈣離子的機制與肌漿網膜結合；此定位關聯帶有可能性，並非確定描述。
未繪示構造：Sarcoplasmic reticulum lumen；Sarcoplasmic reticulum membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- KCNIP3Q9Y2W7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SGTAO43765 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VSNL1P62760 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | Sarcalumenin 位於肌漿網腔，也與肌漿網膜相關，並被分類為周邊膜蛋白。它可能透過依賴鈣離子的機制與肌漿網膜結合，此關聯以可能性描述。 | 推論支持 | 證據與來源Sarcoplasmic reticulum lumen; Sarcoplasmic reticulum membrane / Peripheral membrane protein; May associate with the sarcoplasmic reticulum membrane, via a calcium-dependent mechanism |
核酸與蛋白質序列
CTTGGCAGTCACCATGAGGGCGCTGGTCCTGCTCGGCTGC40CTCCTGGCCTCGCTCCTGTTCTCAGGACAAGCAGAAGAGA80CGGAGGATGCAAATGAAGAAGCCCCATTGAGGGACCGCTC120CCACATCGAGAAGACCCTCATGCTGAATGAGGACAAGCCA160TCCGATGACTACTCTGCGGTGCTGCAGCGGCTTCGGAAGA200TCTACCACTCATCCATCAAGCCTCTGGAGCAGTCCTACAA240GTACAATGAGCTCCGGCAGCATGAGATCACAGATGGAGAG280ATTACCTCCAAGCCCATGGTACTGTTCCTGGGACCGTGGA320GTGTTGGTAAATCTACCATGATAAACTACCTCCTTGGGCT360GGAAAATACTCGCTATCAGCTCTATACAGGCGCTGAACCC400ACCACCTCTGAGTTCACGGTCCTCATGCATGGGCCTAAGC440TGAAAACCATCGAGGGCATCGTCATGGCTGCTGACAGCGC480CCGTTCCTTCTCACCCCTTGAGAAGTTTGGCCAGAATTTC520CTAGAGAAGCTGATTGGCATTGAGGTTCCCCACAAACTTC560TGGAGAGGGTCACTTTTGTGGATACACCAGGCATCATCGA600GAACCGCAAGCAGCAAGAAAGAGGCTACCCCTTCAACGAC640GTGTGCCAGTGGTTCATCGACAGAGCTGACCTCATCTTTG680TCGTCTTTGACCCAACAAAGCTGGATGTGGGTCTAGAGCT720GGAGATGCTCTTCCGCCAGTTGAAGGGGCGTGAATCCCAG760ATAAGGATCATCCTGAACAAGGCTGACAATCTGGCCACCC800AAATGCTCATGCGGGTTTACGGGGCCCTCTTCTGGAGCTT840GGCCCCTCTCATCAATGTCACAGAGCCCCCAAGGGTTTAC880GTCAGCTCCTTCTGGCCACAAGAGTATAAGCCGGACACCC920ATCAGGAACTGTTCCTCCAAGAAGAGATCTCCCTCCTAGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。