基因總覽
SREBF2 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 sterol regulatory element binding transcription factor 2，產物屬於 SREBP 家族。其前驅蛋白 Sterol regulatory element-binding protein 2 是多次穿膜蛋白，嵌於內質網膜；經加工後可形成具轉錄因子功能的片段。蛋白質含有 bHLH 結構域及 leucine-zipper 區域，並具有轉錄活化區。這些結構特色與其作為膽固醇生合成相關基因調控因子的角色相符。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000361204 ★ | 41,833,105–41,907,305 | 19 |
| ENST00000873311 | 41,833,099–41,907,308 | 14 |
| ENST00000873312 | 41,833,099–41,907,308 | 18 |
| ENST00000873313 | 41,833,099–41,907,308 | 17 |
| ENST00000873314 | 41,833,099–41,907,308 | 19 |
| ENST00000873315 | 41,833,099–41,907,308 | 18 |
| ENST00000873316 | 41,833,099–41,907,308 | 19 |
| ENST00000873317 | 41,833,099–41,907,308 | 6 |
| ENST00000873318 | 41,833,099–41,907,308 | 18 |
| ENST00000925848 | 41,833,099–41,907,308 | 15 |
| ENST00000925849 | 41,833,099–41,907,308 | 19 |
| ENST00000925850 | 41,833,099–41,907,308 | 17 |
顯示 12/24 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SREBF2 的主要功能是調控膽固醇生合成相關基因的表現。其前驅蛋白嵌於內質網膜；當固醇濃度偏低時，前驅蛋白會進行加工，釋出可作為轉錄因子的片段。這個片段轉位至細胞核後，促進膽固醇生合成相關基因的轉錄，使固醇狀態能與膽固醇合成途徑的基因表現相連結。
在 DNA 序列辨識方面，SREBP2 可結合 sterol regulatory element 1（SRE-1），也能辨識 E-box motif，具有雙重序列辨識特性。藉由結合這些調控序列，轉錄因子形式可調節膽固醇合成途徑相關基因的轉錄。來源支持其參與此類基因表現調控，但未列出各個標的基因或其下游效應，因此不宜據此延伸到特定生理結果。
Promoter 與基因調控
>SREBF2 ENST00000361204 GRCh38 chr22:41832105-41833205 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTTTTATCAATATATTGTGAACGCCTTTTCTTGCTAATAAATATACATTTGTGTGCGTAATTTTTAATGA TCCCATGGTATTCCATCGTGTGGATGTAATTTACATATTCATTTCCTTATTCTCACTTCTTCCTAGTTAC AGCACTTCTTTAAGCACTTGTAATTTTTATTCCTTTGGATAAATTCCTAGAAGTTTACAACACGACCAGC TGCAAGATGGGGCAGTGAGGTGCTTGAAGGAGTGGGTGGGCTGCACTTCAGAATCCCGGTGGAACTTTTT CAAAAAACTCGTGCCCGGGGCCCCCCTCTCAGGAGGCCGTCGGTGGGCCTGGGCACTGGCGTGGTTTTCA GGTCCTCAGTGGTTCCGAGGTGCCAGAGATTGAGGACCACTGGAGTAAGCGCGAGGTCACGGCGGGTGCA AAGCAGAAGACGTAAAATCCTGACCGCCCTGGGACAATCTGCAACCTTGTCAAGCCTCCGTGCCCGCCTT TGTAAGGAGGCTGGGAGAAGCGGGACTTGGATGACCCGGACTCCCGTCCCGAGCGCTGGGGTCCAGGTTT GACTCCGCTGGCTTTCTCAGGCGGGCAGGGCGGGGGTAGGCAGCTGGGAAGATGACGTAATGTGCTCCCA GCCAGGCCTGGAGGCGGCCAGCGGTCGCAGGTGGAGGGTGGCCTGTTAACCCTTCACTCCCAGGCCAGTG GACGGACTTGCGTGTGGCGCAGATCCAACGGAGAAGGCAGCGGCTCCTTTAAACAAGGCGGAGAAGGTTA AGATGATGACCGGACGGCTACTCCAGGCATTCGCTCCGAGGCCGCGGGGGGAGGGACCTCACTATGCAAA TCTGAGCTGCTGATCGATGACGCGCCATCACCCCACGCACCGCTTCGCTCGCCCATTGGCTGAGATGAGC CTGGTCCCATTGACAACAAACAGGGGGGCGCGCGGCCTGGAGGCGGGGCCGCAGGGGGCGCGGGCTGGGG CGGGGGAATCCCGCCCCGCCCTTTCTGTGCGGCGCCCGGGCGCAACGCAAACATGGCGGCGGGTGGCACC CGTCGGTGAGGCGGTGCCGGGCGGGGGTTGTCGGGTGTCATGGGCGGTGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SREBF2_1 ↗ | 22:41,833,111 | 正股 | 41,833,062–41,833,121 |
| SREBF2_2 ↗ | 22:41,833,250 | 正股 | 41,833,201–41,833,260 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR22_9LL9P · enhancer · 41830229–41830579 · regulatory
ENSR22_8387L3 · enhancer · 41831471–41831614 · regulatory
ENSR22_BBB68 · promoter · 41832615–41833514 · regulatory
ENSR22_C6647 · enhancer · 41833515–41834654 · regulatory
ENSR22_9LLBZ · promoter · 41834655–41834998 · regulatory
· motif · 41829495–41829517 · motif
· motif · 41829495–41829517 · motif
· motif · 41832354–41832369 · motif
· motif · 41832714–41832727 · motif
· motif · 41832714–41832727 · motif
· motif · 41832746–41832761 · motif
· motif · 41832772–41832787 · motif
· motif · 41832781–41832794 · motif
· motif · 41832921–41832931 · motif
· motif · 41832935–41832948 · motif
· motif · 41832970–41832981 · motif
· motif · 41833053–41833063 · motif
· motif · 41833068–41833078 · motif
· motif · 41833097–41833107 · motif
· motif · 41833135–41833145 · motif
· motif · 41833212–41833225 · motif
· motif · 41833365–41833378 · motif
· motif · 41833379–41833392 · motif
· motif · 41833506–41833515 · motif
· motif · 41833631–41833644 · motif
· motif · 41833698–41833715 · motif
· motif · 41833741–41833754 · motif
· motif · 41833743–41833752 · motif
· motif · 41834128–41834145 · motif
· motif · 41837340–41837352 · motif
· motif · 41837342–41837349 · motif
· motif · 41837342–41837357 · motif
· motif · 41837589–41837601 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1141 aa
Sterol regulatory element-binding protein 2 長 1141 個胺基酸，屬於 SREBP family。其 bHLH 結構域位於胺基酸 330–380，鄰接 380–401 的 leucine-zipper 區域。蛋白質含兩段跨膜螺旋，分別位於 480–500 與 534–554；N 端另有酸性轉錄活化區，並有一段註解為不規則區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
前驅蛋白位於內質網膜；高固醇時 SCAP-SREBP 留在內質網，低固醇則促進其進入 COPII-coated vesicles 並運送至高基氏體加工。 加工後的轉錄因子形式進入細胞核，此過程需要 importin-beta；bHLH 結構域二聚化是 importin-beta 依賴性核輸入的前提。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- CREBBPQ92793 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FHL2Q14192 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- HLA-DPA1P20036 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HNF4AP41235 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MED15Q96RN5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NFYCQ13952-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SP1P08047 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TP53P04637 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SREBP2 與 SCAP 在內質網膜及高基氏體形成緊密的 SCAP-SREBP 複合體。低膽固醇條件下，SREBP2 與 PAQR3 的互作會將此複合體錨定於高基氏體；SREBP2 也透過 C 端區域與 RNF139 互作。另有相似性推論指出，SREBP2 可形成同源二聚體，且可溶性轉錄因子片段需與另一個 bHLH 蛋白二聚化，才能有效結合 DNA；與 LMNA 的互作同樣依相似性推論。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Sterol regulatory element-binding protein 2 的前驅形式嵌在內質網膜中。固醇濃度偏低會促進此形式加工，釋出可轉位至細胞核的轉錄因子形式，進而活化膽固醇生合成相關基因的轉錄。 | 含實驗來源 | 證據與來源Precursor of the transcription factor form (Processed sterol regulatory element-binding protein 2), which is embedded in the endoplasmic reticulum membrane. Low sterol concentrations promote processing of this form, releasing the transcription factor form that translocates into the nucleus and activates transcription of genes involved in cholesterol biosynthesis PMID 32322062 ↗ |
| 功能 | SREBP2 是調控膽固醇生合成相關基因表現的重要轉錄因子，可結合 sterol regulatory element 1（SRE-1）及 E-box motif，具有雙重序列辨識特性，並調節膽固醇合成途徑相關基因的轉錄。 | 含實驗來源 | 證據與來源Key transcription factor that regulates expression of genes involved in cholesterol biosynthesis. Binds to the sterol regulatory element 1 (SRE-1) (5'-ATCACCCCAC-3'). Has dual sequence specificity binding to both an E-box motif (5'-ATCACGTGA-3') and to SRE-1 (5'-ATCACCCCAC-3'). Regulates transcription of genes related to cholesterol synthesis pathway PMID 12177166 ↗ · PMID 32322062 ↗ · PMID 7903453 ↗ |
| 交互作用 | SREBP2 與 SCAP 在內質網膜和高基氏體形成緊密複合體。低膽固醇時，SREBP2 與 PAQR3 的互作會使 SCAP-SREBP 複合體錨定於高基氏體；SREBP2 亦透過 C 端區域與 RNF139 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms a tight complex with SCAP, the SCAP-SREBP complex, in the endoplasmic reticulum membrane and the Golgi apparatus. Interacts with PAQR3; the interaction anchors the SCAP-SREBP complex to the Golgi apparatus in low cholesterol conditions. Interacts (via C-terminal domain) with RNF139 PMID 19706601 ↗ · PMID 26311497 ↗ · PMID 32322062 ↗ |
| 交互作用 | 相似性推論指出，SREBP2 可形成同源二聚體；可溶性轉錄因子片段若要有效結合 DNA，需與另一個 bHLH 蛋白二聚化。SREBP2 與 LMNA 的互作亦屬相似性推論。 | 推論支持 | 證據與來源Homodimer; efficient DNA binding of the soluble transcription factor fragment requires dimerization with another bHLH protein (By similarity). Interacts with LMNA (By similarity) |
| 細胞定位 | SREBP2 前驅蛋白位於內質網膜、高基氏體膜及 COPII-coated vesicle 膜。高固醇時 SCAP-SREBP 留在內質網；低固醇會促進其被募集至 COPII-coated vesicles，並運送至高基氏體加工。 | 含實驗來源 | 證據與來源Sterol regulatory element-binding protein 2; Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein; Golgi apparatus membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasmic vesicle, COPII-coated vesicle membrane / Multi-pass membrane protein; At high sterol concentrations, the SCAP-SREBP is retained in the endoplasmic reticulum. Low sterol concentrations promote recruitment into COPII-coated vesicles and transport of the SCAP-SREBP to the Golgi, where it is processed PMID 12202038 ↗ · PMID 26311497 ↗ · PMID 28849786 ↗ |
| 細胞定位 | 加工後的 Sterol regulatory element-binding protein 2 位於細胞核，並在 importin-beta 協助下輸入細胞核。bHLH 結構域二聚化是此 importin-beta 依賴性核輸入的前提。 | 含實驗來源 | 證據與來源Processed sterol regulatory element-binding protein 2; Nucleus; Transported into the nucleus with the help of importin-beta. Dimerization of the bHLH domain is a prerequisite for importin beta-dependent nuclear import PMID 11477106 ↗ · PMID 32322062 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTTTCTGTGCGGCGCCCGGGCGCAACGCAAACATGGCGGC40GGGTGGCACCCGTCGGTGAGGCGGTGCCGGGCGGGGGTTG80TCGGGTGTCATGGGCGGTGGCGACGGCACCGCCCCCGCGT120CTCCCTGAGCGGGACGGCAGGGGGGGCTTCTGCGCTGAGC160CGGGCGATGGACGACAGCGGCGAGCTGGGTGGTCTGGAGA200CCATGGAGACCCTCACGGAGCTGGGCGACGAGCTGACCCT240GGGAGACATCGACGAGATGCTGCAATTTGTCAGTAATCAA280GTGGGAGAGTTCCCTGACTTGTTTTCAGAACAGCTGTGTA320GCTCCTTTCCTGGCAGTGGTGGTAGTGGTAGCAGCAGCGG360CAGCAGTGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAATGGCAGGGGC400AGCAGCAGCGGAGCTGTGGACCCTTCAGTGCAACGGTCAT440TCACCCAGGTCACATTACCTTCCTTCTCTCCCTCGGCGGC480CTCCCCACAGGCTCCAACTCTGCAAGTCAAGGTTTCTCCC520ACCTCAGTTCCCACCACACCCAGGGCAACTCCTATTCTTC560AGCCCCGCCCCCAGCCCCAGCCTCAACCTCAAACTCAGCT600GCAACAACAGACGGTAATGATCACGCCAACATTCAGCACC640ACTCCGCAGACGAGGATCATCCAGCAGCCTTTGATATACC680AGAATGCAGCTACTAGCTTTCAAGTCCTTCAGCCTCAAGT720CCAAAGCCTGGTGACATCCTCCCAGGTACAGCCGGTCACC760ATTCAGCAGCAGGTGCAGACAGTACAGGCCCAGCGGGTGC800TGACACAAACGGCCAATGGCACGCTGCAGACCCTTGCCCC840GGCTACGGTGCAGACAGTTGCTGCGCCACAGGTGCAGCAG880GTCCCGGTCCTGGTCCAGCCTCAGATCATCAAGACAGATT920CCCTTGTTTTGACCACACTGAAGACAGATGGCAGCCCTGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。