基因總覽
SRD5A2 是蛋白質編碼基因,產物 steroid 5 alpha-reductase 2 屬於 steroid 5-alpha reductase 家族。此蛋白質是多次跨膜蛋白,具有四段螺旋跨膜區域。它參與類固醇代謝,可作用於 testosterone 及其他類固醇。其基因產物的基本特色,是以膜蛋白形式執行類固醇轉化反應。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000622030 ★ | 31,522,480–31,580,938 | 5 |
| ENST00000882642 | 31,522,480–31,580,943 | 6 |
| ENST00000882643 | 31,522,480–31,580,943 | 4 |
| ENST00001006329 | 31,522,480–31,580,943 | 5 |
| ENST00001006330 | 31,522,480–31,580,943 | 3 |
| ENST00001006331 | 31,522,480–31,580,943 | 5 |
| ENST00001144796 | 31,522,480–31,580,943 | 5 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
steroid 5 alpha-reductase 2 催化多種 3-oxo 類固醇的不可逆、立體專一性還原反應,作用於碳 4 與碳 5 之間的雙鍵,產生相應的 5alpha-dihydro-3-oxo 類固醇。來源所列的反應式也包括 3-oxo-5alpha-steroid 與 NADP(+) 轉換為 3-oxo-Delta(4)-steroid、NADPH 和 H(+);另列出 17beta-hydroxy-5alpha-androstan-3-one 與 NADP(+) 轉換為 testosterone、NADPH 和 H(+)。這些反應描述了相關類固醇之間的轉換方向與輔因子變化。
此蛋白質可將 testosterone 轉化為 5-alpha-dihydrotestosterone(DHT)。DHT 是前列腺中活性最高的雄性激素,也是促進 androgen receptor(AR)轉錄活化的優先配體。因此,testosterone 轉化為 DHT 是發育期間雄性性分化的重要步驟,SRD5A2 所參與的反應也與雄性激素生理密切相關。
其作用底物不限於 testosterone,亦可作用於 progesterone,產生具有不同功能的代謝物。來源列出的另一反應為 5alpha-pregnane-3,20-dione 與 NADP(+) 轉換為 progesterone、NADPH 和 H(+)。因此,SRD5A2 涉及多種類固醇的代謝,而非只參與單一雄性激素的生成;其主要生物學意義則包括雄性性分化及雄性激素相關生理。
Promoter 與基因調控
>SRD5A2 ENST00000622030 GRCh38 chr2:31580838-31581938 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GAAGAGGTAGAAGACGGAGGGGCTGGAGGATAACATAAAGGTGGGAAACGGAAGAGAGAAAGAACCGCGT CTGCGTGTATGACGGCTAGACAGGAGTTCAGAGAACAGCGGGGTCGCCAGGCCACCACCTGATGGGCCAC GGCTCATTGGCTCTAGGAGCTGGGAAAGGGCATCCCAGGAAAGAAGCCCTAGACTTTAGCCTGAGTCTGG GCCACTCTAGGGGACCGGGAGTGGGGTGGCGGGAGAGGACGCGCAGAATCTCGACTTCTGGCCCCAATCT GTGCATGATCACCCGAGCTCAGCGGACGCTCCTCTCTGACCCAGGCAGGCGGCTCAGGGACGCGTGCGGG GATGCAGAGAGAAACCGCTGAGGAATTAGGGCCGGGAGAGACTGGTACCTGCCGGGGGCGTGTGGTGGGG CAGAGCTGGCACTGATGCTGAGAGTGGCTAAGGAGCGCGGCGCCCCAGAGCAGAAGGGCTGGCAGACGCT CAGAGAGCCAGGATGGTTCAGGGTCCAAGGAAGGTCCTATGTTGGGTGGGAGCTGTGAGGGAGTGAAAGT GCATGAGGAACCGGAGGAGATGGAAAGACCTTGGCTTGGGTGTTCGAGGGTGGGACTGCGTGGTGACCGA CGGCACAGAGGGTGTGTGTTGGGGCGGAAGAACCACCCCAGCTGAATCGTCCCCGTGGGGTTTTCTTCCC GTGTCTTAGTTCCAGAAGTATGCGCATCAGACGCTAATAGTTGAGGAACAAGTCATGGAAGGACAGCCTA AGCGGGAGGTGAATGTAAAGCCGTGGAGAGGGCGGGCGAACTAAGAAGGCCTTCGTTCTCCTCCGGCCAC CGCGGCTGCATCCTTGAGAAAGGGGTATTGCTGCGAACCGCGCCAGGGCTGGACGCGGCGAGGTGGGAGG CAGGATGGAGGGGCGGGAGCCAAGGCCGAGGGGGCGGACACGGGTGGCGTCTGGCGCTCCATAAAGGGGT TGCGGGGGCCGCGCTCTCTTCTGGGAGGGCAGCGGCCACCGGCGAGGAACACGGCGCGATGCAGGTTCAG TGCCAGCAGAGCCCAGTGCTGGCAGGCAGCGCCACTTTGGTCGCCCTTGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SRD5A2_1 ↗ | 2:31,580,936 | 負股 | 31,580,926–31,580,985 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_8X3W3 · promoter · 31580928–31581128 · regulatory
· motif · 31577235–31577249 · motif
· motif · 31577235–31577249 · motif
· motif · 31577331–31577345 · motif
· motif · 31577331–31577345 · motif
· motif · 31577338–31577349 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:254 aa
steroid 5 alpha-reductase 2 長 254 個胺基酸,屬於 steroid 5-alpha reductase 家族。序列註解列出四段螺旋跨膜區域,分別位於第 8–28、72–92、146–166 與 206–226 個胺基酸位置。
蛋白質三維結構
細胞內定位
steroid 5 alpha-reductase 2 位於微粒體膜與內質網膜,並被註記為多次跨膜蛋白。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Microsome membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- CLPTM1O96005 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GNMTQ14749 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
SRD5A2 的變異會造成 pseudovaginal perineoscrotal hypospadias(PPSH)。46,XY 個體出生時可能有外生殖器不明確,包括會陰下裂與盲端會陰囊袋,並於青春期出現男性化;其特徵亦包括類似陰道的盲端會陰開口,以及尿道開口於會陰的嚴重下裂陰莖。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | steroid 5 alpha-reductase 2 以不可逆且具立體專一性的方式還原多種 3-oxo 類固醇碳 4 與碳 5 之間的雙鍵,生成 5alpha-dihydro-3-oxo 形式。它也將 testosterone 轉為 DHT;DHT 是前列腺中活性最高的雄性激素,且是促進 AR 轉錄活化的優先配體,因此此反應是發育期雄性性分化的重要步驟。該蛋白亦可作用於 progesterone 等其他類固醇。 | 含實驗來源 | 證據與來源Catalyzes the irreversible stereospecific reduction of the delta 4,5 bond (double bond between carbons 4 and 5) of various 3-oxo steroids (3-keto steroids) producing their 5alpha dihydro-3-oxo forms. Converts testosterone into 5-alpha-dihydrotestosterone (DHT), the most active androgen in the prostate, as it is the preferred ligand for androgen receptor (AR) transactivation, making this reaction a key step in male sexual differentiation during development. Besides testosterone, it can also act on other steroids, including progesterone, producing metabolites with diverse roles. Hence, it plays a central role in sexual differentiation and androgen physiology PMID 10898110 ↗ · PMID 23685396 ↗ |
| 分子活性 | a 3-oxo-5alpha-steroid + NADP(+) = a 3-oxo-Delta(4)-steroid + NADPH + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源a 3-oxo-5alpha-steroid + NADP(+) = a 3-oxo-Delta(4)-steroid + NADPH + H(+) PMID 10898110 ↗ · PMID 23685396 ↗ |
| 分子活性 | 17beta-hydroxy-5alpha-androstan-3-one + NADP(+) = testosterone + NADPH + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源17beta-hydroxy-5alpha-androstan-3-one + NADP(+) = testosterone + NADPH + H(+) PMID 10898110 ↗ · PMID 23685396 ↗ |
| 分子活性 | 5alpha-pregnane-3,20-dione + NADP(+) = progesterone + NADPH + H(+) | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | steroid 5 alpha-reductase 2 被註記為多次跨膜蛋白,定位於微粒體膜及內質網膜。 | 推論支持 | 證據與來源Microsome membrane / Multi-pass membrane protein; Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein |
| 疾病關聯 | SRD5A2 變異會造成 pseudovaginal perineoscrotal hypospadias(PPSH)。46,XY 個體出生時可能有外生殖器不明確,包括會陰下裂和盲端會陰囊袋,並在青春期出現男性化;疾病特徵還包括類似陰道的盲端會陰開口,以及尿道開口於會陰的嚴重下裂陰莖。 | 含實驗來源 | 證據與來源Pseudovaginal perineoscrotal hypospadias PPSH A form of male pseudohermaphroditism in which 46,XY males show ambiguous genitalia at birth, including perineal hypospadias and a blind perineal pouch, and develop masculinization at puberty. The name of the disorder stems from the finding of a blind-ending perineal opening resembling a vagina and a severely hypospadiac penis with the urethra opening onto the perineum. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 264600 PMID 10718838 ↗ · PMID 10898110 ↗ · PMID 10999800 ↗ · PMID 12843198 ↗ · PMID 15064320 ↗ · PMID 1522235 ↗ · PMID 15528927 ↗ · PMID 15770495 ↗ · PMID 16098368 ↗ · PMID 16181229 ↗ · PMID 7554313 ↗ · PMID 8626825 ↗ · PMID 8768837 ↗ · PMID 9208814 ↗ · PMID 9745434 ↗ · PMID 9843052 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTGGGAGGGCAGCGGCCACCGGCGAGGAACACGGCGCGAT40GCAGGTTCAGTGCCAGCAGAGCCCAGTGCTGGCAGGCAGC80GCCACTTTGGTCGCCCTTGGGGCACTGGCCTTGTACGTCG120CGAAGCCCTCCGGCTACGGGAAGCACACGGAGAGCCTGAA160GCCGGCGGCTACCCGCCTGCCAGCCCGCGCCGCCTGGTTC200CTGCAGGAGCTGCCTTCCTTCGCGGTGCCCGCGGGGATCC240TCGCCCGGCAGCCCCTCTCCCTCTTCGGGCCACCTGGGAC280GGTACTTCTGGGCCTCTTCTGCCTACATTACTTCCACAGG320ACATTTGTGTACTCACTGCTCAATCGAGGGAGGCCTTATC360CAGCTATACTCATTCTCAGAGGCACTGCCTTCTGCACTGG400AAATGGAGTCCTTCAAGGCTACTATCTGATTTACTGTGCT440GAATACCCTGATGGGTGGTACACAGACATACGGTTTAGCT480TGGGTGTCTTCTTATTTATTTTGGGAATGGGAATAAACAT520TCATAGTGACTATATATTGCGCCAGCTCAGGAAGCCTGGA560GAAATCAGCTACAGGATTCCACAAGGTGGCTTGTTTACGT600ATGTTTCTGGAGCCAATTTCCTCGGTGAGATCATTGAATG640GATCGGCTATGCCCTGGCCACTTGGTCCCTCCCAGCACTT680GCATTTGCATTTTTCTCACTTTGTTTCCTTGGGCTGCGAG720CTTTTCACCACCATAGGTTCTACCTCAAGATGTTTGAGGA760CTACCCCAAATCTCGGAAAGCCCTTATTCCATTCATCTTT800TAAAGGAACCAAATTAAAAAGGAGCAGAGCTCCCACAATG840CTGATGAAAACTGTCAAGCTGCTGAAACTGTAATTTTCAT880GATATAATAGTCCCGTATATATGTAATAGTAGGTCTCCTG920GCGTTCTGCCAGCTGGCCTGGGGATTCTGAGTGGTGTCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。