演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SRD5A2

steroid 5 alpha-reductase 2

SRD5A2 編碼 steroid 5 alpha-reductase 2,屬於 steroid 5-alpha reductase 家族;其催化反應與雄性性分化及雄性激素生理有關。

Homo sapiens2p23.1UniProt P31213
OFFICIAL SYMBOL
SRD5A2
CHROMOSOME
2
UNIPROT
P31213
PDB / ALPHAFOLD
7BW1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SRD5A2 是蛋白質編碼基因,產物 steroid 5 alpha-reductase 2 屬於 steroid 5-alpha reductase 家族。此蛋白質是多次跨膜蛋白,具有四段螺旋跨膜區域。它參與類固醇代謝,可作用於 testosterone 及其他類固醇。其基因產物的基本特色,是以膜蛋白形式執行類固醇轉化反應。

Official symbol
SRD5A2
Gene name
steroid 5 alpha-reductase 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11285
UniProt
P31213
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22p23.1
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegSRD5A2pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr2:31,522,480–31,580,943
Gene span
58,464 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000622030 ★31,522,480–31,580,9385
ENST0000088264231,522,480–31,580,9436
ENST0000088264331,522,480–31,580,9434
ENST0000100632931,522,480–31,580,9435
ENST0000100633031,522,480–31,580,9433
ENST0000100633131,522,480–31,580,9435
ENST0000114479631,522,480–31,580,9435

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

steroid 5 alpha-reductase 2 催化多種 3-oxo 類固醇的不可逆、立體專一性還原反應,作用於碳 4 與碳 5 之間的雙鍵,產生相應的 5alpha-dihydro-3-oxo 類固醇。來源所列的反應式也包括 3-oxo-5alpha-steroid 與 NADP(+) 轉換為 3-oxo-Delta(4)-steroid、NADPH 和 H(+);另列出 17beta-hydroxy-5alpha-androstan-3-one 與 NADP(+) 轉換為 testosterone、NADPH 和 H(+)。這些反應描述了相關類固醇之間的轉換方向與輔因子變化。

此蛋白質可將 testosterone 轉化為 5-alpha-dihydrotestosterone(DHT)。DHT 是前列腺中活性最高的雄性激素,也是促進 androgen receptor(AR)轉錄活化的優先配體。因此,testosterone 轉化為 DHT 是發育期間雄性性分化的重要步驟,SRD5A2 所參與的反應也與雄性激素生理密切相關。

其作用底物不限於 testosterone,亦可作用於 progesterone,產生具有不同功能的代謝物。來源列出的另一反應為 5alpha-pregnane-3,20-dione 與 NADP(+) 轉換為 progesterone、NADPH 和 H(+)。因此,SRD5A2 涉及多種類固醇的代謝,而非只參與單一雄性激素的生成;其主要生物學意義則包括雄性性分化及雄性激素相關生理。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 31580938 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SRD5A2 ENST00000622030 GRCh38 chr2:31580838-31581938 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GAAGAGGTAGAAGACGGAGGGGCTGGAGGATAACATAAAGGTGGGAAACGGAAGAGAGAAAGAACCGCGT
CTGCGTGTATGACGGCTAGACAGGAGTTCAGAGAACAGCGGGGTCGCCAGGCCACCACCTGATGGGCCAC
GGCTCATTGGCTCTAGGAGCTGGGAAAGGGCATCCCAGGAAAGAAGCCCTAGACTTTAGCCTGAGTCTGG
GCCACTCTAGGGGACCGGGAGTGGGGTGGCGGGAGAGGACGCGCAGAATCTCGACTTCTGGCCCCAATCT
GTGCATGATCACCCGAGCTCAGCGGACGCTCCTCTCTGACCCAGGCAGGCGGCTCAGGGACGCGTGCGGG
GATGCAGAGAGAAACCGCTGAGGAATTAGGGCCGGGAGAGACTGGTACCTGCCGGGGGCGTGTGGTGGGG
CAGAGCTGGCACTGATGCTGAGAGTGGCTAAGGAGCGCGGCGCCCCAGAGCAGAAGGGCTGGCAGACGCT
CAGAGAGCCAGGATGGTTCAGGGTCCAAGGAAGGTCCTATGTTGGGTGGGAGCTGTGAGGGAGTGAAAGT
GCATGAGGAACCGGAGGAGATGGAAAGACCTTGGCTTGGGTGTTCGAGGGTGGGACTGCGTGGTGACCGA
CGGCACAGAGGGTGTGTGTTGGGGCGGAAGAACCACCCCAGCTGAATCGTCCCCGTGGGGTTTTCTTCCC
GTGTCTTAGTTCCAGAAGTATGCGCATCAGACGCTAATAGTTGAGGAACAAGTCATGGAAGGACAGCCTA
AGCGGGAGGTGAATGTAAAGCCGTGGAGAGGGCGGGCGAACTAAGAAGGCCTTCGTTCTCCTCCGGCCAC
CGCGGCTGCATCCTTGAGAAAGGGGTATTGCTGCGAACCGCGCCAGGGCTGGACGCGGCGAGGTGGGAGG
CAGGATGGAGGGGCGGGAGCCAAGGCCGAGGGGGCGGACACGGGTGGCGTCTGGCGCTCCATAAAGGGGT
TGCGGGGGCCGCGCTCTCTTCTGGGAGGGCAGCGGCCACCGGCGAGGAACACGGCGCGATGCAGGTTCAG
TGCCAGCAGAGCCCAGTGCTGGCAGGCAGCGCCACTTTGGTCGCCCTTGGG
SRD5A2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SRD5A2_1 ↗2:31,580,936負股31,580,926–31,580,985

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_8X3W3 · promoter · 31580928–31581128 · regulatory

· motif · 31577235–31577249 · motif

· motif · 31577235–31577249 · motif

· motif · 31577331–31577345 · motif

· motif · 31577331–31577345 · motif

· motif · 31577338–31577349 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:254 aa

1 aa254 aa跨膜區
依 P31213 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

steroid 5 alpha-reductase 2 長 254 個胺基酸,屬於 steroid 5-alpha reductase 家族。序列註解列出四段螺旋跨膜區域,分別位於第 8–28、72–92、146–166 與 206–226 個胺基酸位置。

跨膜區Helical8–28 aa
跨膜區Helical72–92 aa
跨膜區Helical146–166 aa
跨膜區Helical206–226 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7BW1…

PDB · 7BW1

X-ray · 2.80 A · A=1-254

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Microsome membrane;Endoplasmic reticulum membrane

steroid 5 alpha-reductase 2 位於微粒體膜與內質網膜,並被註記為多次跨膜蛋白。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Microsome membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SRD5A2SRD5A2CLPTM1CYSRT1GNMT
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SRD5A2 的變異會造成 pseudovaginal perineoscrotal hypospadias(PPSH)。46,XY 個體出生時可能有外生殖器不明確,包括會陰下裂與盲端會陰囊袋,並於青春期出現男性化;其特徵亦包括類似陰道的盲端會陰開口,以及尿道開口於會陰的嚴重下裂陰莖。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能steroid 5 alpha-reductase 2 以不可逆且具立體專一性的方式還原多種 3-oxo 類固醇碳 4 與碳 5 之間的雙鍵,生成 5alpha-dihydro-3-oxo 形式。它也將 testosterone 轉為 DHT;DHT 是前列腺中活性最高的雄性激素,且是促進 AR 轉錄活化的優先配體,因此此反應是發育期雄性性分化的重要步驟。該蛋白亦可作用於 progesterone 等其他類固醇。含實驗來源
證據與來源

Catalyzes the irreversible stereospecific reduction of the delta 4,5 bond (double bond between carbons 4 and 5) of various 3-oxo steroids (3-keto steroids) producing their 5alpha dihydro-3-oxo forms. Converts testosterone into 5-alpha-dihydrotestosterone (DHT), the most active androgen in the prostate, as it is the preferred ligand for androgen receptor (AR) transactivation, making this reaction a key step in male sexual differentiation during development. Besides testosterone, it can also act on other steroids, including progesterone, producing metabolites with diverse roles. Hence, it plays a central role in sexual differentiation and androgen physiology

PMID 10898110 ↗ · PMID 23685396 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性a 3-oxo-5alpha-steroid + NADP(+) = a 3-oxo-Delta(4)-steroid + NADPH + H(+)含實驗來源
證據與來源

a 3-oxo-5alpha-steroid + NADP(+) = a 3-oxo-Delta(4)-steroid + NADPH + H(+)

PMID 10898110 ↗ · PMID 23685396 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性17beta-hydroxy-5alpha-androstan-3-one + NADP(+) = testosterone + NADPH + H(+)含實驗來源
證據與來源

17beta-hydroxy-5alpha-androstan-3-one + NADP(+) = testosterone + NADPH + H(+)

PMID 10898110 ↗ · PMID 23685396 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性5alpha-pregnane-3,20-dione + NADP(+) = progesterone + NADPH + H(+)含實驗來源
證據與來源

5alpha-pregnane-3,20-dione + NADP(+) = progesterone + NADPH + H(+)

PMID 10898110 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位steroid 5 alpha-reductase 2 被註記為多次跨膜蛋白,定位於微粒體膜及內質網膜。推論支持
證據與來源

Microsome membrane / Multi-pass membrane protein; Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯SRD5A2 變異會造成 pseudovaginal perineoscrotal hypospadias(PPSH)。46,XY 個體出生時可能有外生殖器不明確,包括會陰下裂和盲端會陰囊袋,並在青春期出現男性化;疾病特徵還包括類似陰道的盲端會陰開口,以及尿道開口於會陰的嚴重下裂陰莖。含實驗來源
證據與來源

Pseudovaginal perineoscrotal hypospadias PPSH A form of male pseudohermaphroditism in which 46,XY males show ambiguous genitalia at birth, including perineal hypospadias and a blind perineal pouch, and develop masculinization at puberty. The name of the disorder stems from the finding of a blind-ending perineal opening resembling a vagina and a severely hypospadiac penis with the urethra opening onto the perineum. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 264600

PMID 10718838 ↗ · PMID 10898110 ↗ · PMID 10999800 ↗ · PMID 12843198 ↗ · PMID 15064320 ↗ · PMID 1522235 ↗ · PMID 15528927 ↗ · PMID 15770495 ↗ · PMID 16098368 ↗ · PMID 16181229 ↗ · PMID 7554313 ↗ · PMID 8626825 ↗ · PMID 8768837 ↗ · PMID 9208814 ↗ · PMID 9745434 ↗ · PMID 9843052 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000622030 · 4,519 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTGGGAGGGCAGCGGCCACCGGCGAGGAACACGGCGCGAT40
41GCAGGTTCAGTGCCAGCAGAGCCCAGTGCTGGCAGGCAGC80
81GCCACTTTGGTCGCCCTTGGGGCACTGGCCTTGTACGTCG120
121CGAAGCCCTCCGGCTACGGGAAGCACACGGAGAGCCTGAA160
161GCCGGCGGCTACCCGCCTGCCAGCCCGCGCCGCCTGGTTC200
201CTGCAGGAGCTGCCTTCCTTCGCGGTGCCCGCGGGGATCC240
241TCGCCCGGCAGCCCCTCTCCCTCTTCGGGCCACCTGGGAC280
281GGTACTTCTGGGCCTCTTCTGCCTACATTACTTCCACAGG320
321ACATTTGTGTACTCACTGCTCAATCGAGGGAGGCCTTATC360
361CAGCTATACTCATTCTCAGAGGCACTGCCTTCTGCACTGG400
401AAATGGAGTCCTTCAAGGCTACTATCTGATTTACTGTGCT440
441GAATACCCTGATGGGTGGTACACAGACATACGGTTTAGCT480
481TGGGTGTCTTCTTATTTATTTTGGGAATGGGAATAAACAT520
521TCATAGTGACTATATATTGCGCCAGCTCAGGAAGCCTGGA560
561GAAATCAGCTACAGGATTCCACAAGGTGGCTTGTTTACGT600
601ATGTTTCTGGAGCCAATTTCCTCGGTGAGATCATTGAATG640
641GATCGGCTATGCCCTGGCCACTTGGTCCCTCCCAGCACTT680
681GCATTTGCATTTTTCTCACTTTGTTTCCTTGGGCTGCGAG720
721CTTTTCACCACCATAGGTTCTACCTCAAGATGTTTGAGGA760
761CTACCCCAAATCTCGGAAAGCCCTTATTCCATTCATCTTT800
801TAAAGGAACCAAATTAAAAAGGAGCAGAGCTCCCACAATG840
841CTGATGAAAACTGTCAAGCTGCTGAAACTGTAATTTTCAT880
881GATATAATAGTCCCGTATATATGTAATAGTAGGTCTCCTG920
921GCGTTCTGCCAGCTGGCCTGGGGATTCTGAGTGGTGTCTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。