基因總覽
SRA1（steroid receptor RNA activator 1）是位於人類第 5 號染色體、屬於蛋白質編碼基因的基因。其產物包括具功能性轉錄共活化作用的 SRA1 RNA；資料亦註明其屬於 SRA1 family，並提供一種長 224 個胺基酸的蛋白質序列註解。SRA1 的特色在於其 RNA 產物可參與轉錄調控，並非僅以蛋白質作為功能形式；現有資料指出的主要作用對象為類固醇受體。這些資訊界定了 SRA1 的基本性質，但不代表已涵蓋其所有產物或功能。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000336283 ★ | 140,550,068–140,557,473 | 5 |
| ENST00001114475 | 140,536,450–140,557,920 | 5 |
| ENST00001127912 | 140,536,450–140,557,920 | 3 |
| ENST00000602657 | 140,537,340–140,551,128 | 3 |
| ENST00000919851 | 140,550,068–140,557,920 | 5 |
| ENST00001019733 | 140,550,069–140,557,920 | 5 |
| ENST00000919852 | 140,550,469–140,557,920 | 5 |
| ENST00000919853 | 140,550,472–140,557,920 | 4 |
| ENST00000955074 | 140,550,498–140,557,920 | 5 |
| ENST00000973698 | 140,550,503–140,557,920 | 5 |
| ENST00001127913 | 140,556,940–140,557,920 | 2 |
| ENST00001111284 | 140,556,947–140,557,920 | 2 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SRA1 RNA 可作為轉錄共活化因子，選擇性增強類固醇受體介導的轉錄活化。其作用可透過兩種不同條件發生：在不依賴配體的情況下，SRA1 RNA 透過涉及類固醇受體調節性 N 端區域 AF-1 的機制促進轉錄活化；在依賴配體的情況下，則可透過類固醇結合區域 AF-2 介導類固醇受體的轉錄共活化。這顯示其共活化作用與受體不同功能區域及配體條件相關。
來源亦指出，SRA1 與細胞增殖和分化的增強相關，並可在體內促進細胞凋亡。這些生物學結果涉及不同的細胞行為；現有敘述未進一步說明各作用發生的細胞類型、條件或彼此間的關係，因此不宜將其歸結為單一的細胞命運效果。
SRA1 可能參與腫瘤形成，但來源將此描述為可能性，未將其界定為確立的因果作用。整體而言，現有功能資料支持 SRA1 RNA 可依配體條件及類固醇受體區域參與轉錄共活化，並與多項細胞層級結果相關；至於這些作用如何連結，資料未提供更進一步的機制說明。
Promoter 與基因調控
>SRA1 ENST00000336283 GRCh38 chr5:140557373-140558473 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTCCGATCCTTGTCCACCGTCTATTTATTGCCCAATTTATTGTTTATACGGATGACTGGGAGGCACTGCA CCACAACGTAGGACCCTGGCTCCCCTTTCCTTGGGTCCTTGTGTTCCTTGCCCCTGTCCAACCCTGGACA GTTGGCTCTACCTCAGTAACACTTTATAGCAAAATCAGTGCAAATAAAAATCCCTCAGTGACCTCACTGG ATGTGAGTATATTGGGCCTGGGACAGGGCTGGGGGCTAACACCCTGTGTGAGATGAGTGTCTTTGTGTCT GTGCTTGATGTTGGTGGCTCTCTGTAGTCACATGACAGCATGGGTGTGATGGAGATCTGACTTCATTCAA CAAACATATTTTCTAAGGAGTTCCCTGTGCCAGGCACTAAGCTGGGCACTGGGAATGTAATAAAATAGTC AAGGTCCCACCTTCTAAGACTGTCCGACAGGGAAACGAACAAGAGTCAAATAAGGCAGAAGATGTGATGT AATACACCTACGAAATCTCAGAGGGTTGTAGGGTCGTGGGAGCTCAAGTGAGACACTTAACCTGGCCTGA GACATTCCAGAAGGCCTCCTGAAGAACTGACATCTGAACTGAGAACTGAAGGAAGATGAGTACTAGTGAG GCTACCGGACGTGAATGTGGAGATTGTGCAGGGCAATGCAAGAGGAGGCTGTAGAAGTCAACCTGGCTAG ATCACAGCGGGGTGTATGTGGGGCAGGAGCTTCTTTGTTTGAATTTGCTCCTGAGAGGATGAGGCCTCCT AGAGCACTGGCTCCTGGACAGCAACCTCCTTTGGTGCCTTGTGACCAGGGCCCTGATGGTTCATTAGATG GAGCCTTCGAGTCTTAGGGAGTTGCCGCAGGGTCCCCACAGCGGCTCCCGACGGTTGTGAACCAGCATCC ATCCTCCACGGATTCCGGCAACCCGCCTGGCCCTGGACGTGTCTCAACTGGCCCGCGTGAGGGGCCGCCC CGGAAATGACGCGCTGCCCCGCTGGCCAAGCGGAAGTGGAGATGGCGGAGCTGTACGTGAAGCCGGGTGA GCGCAGCCGGCGGGCTAGGGCACTAGGTTGTCGCCCCGGCCTAGGCTGGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SRA1_1 ↗ | 5:140,557,456 | 負股 | 140,557,446–140,557,505 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_865KK3 · enhancer · 140553750–140553990 · regulatory
ENSR5_5383LJT · CTCF_binding_site · 140554402–140554423 · regulatory
ENSR5_943R9Q · enhancer · 140554501–140554839 · regulatory
ENSR5_6LJBJK · promoter · 140557463–140557525 · regulatory
ENSR5_B32W6C · enhancer · 140557526–140558384 · regulatory
ENSR5_5383M4R · CTCF_binding_site · 140557627–140557648 · regulatory
ENSR5_5383MKG · CTCF_binding_site · 140560360–140560381 · regulatory
ENSR5_5383MLM · CTCF_binding_site · 140560619–140560640 · regulatory
· motif · 140554404–140554420 · motif
· motif · 140554723–140554729 · motif
· motif · 140555513–140555521 · motif
· motif · 140557142–140557151 · motif
· motif · 140557287–140557299 · motif
· motif · 140557444–140557454 · motif
· motif · 140557456–140557465 · motif
· motif · 140557456–140557467 · motif
· motif · 140557456–140557467 · motif
· motif · 140557456–140557469 · motif
· motif · 140557486–140557495 · motif
· motif · 140557486–140557497 · motif
· motif · 140557629–140557645 · motif
· motif · 140557978–140557993 · motif
· motif · 140560362–140560378 · motif
· motif · 140560621–140560637 · motif
· motif · 140562233–140562246 · motif
· motif · 140562233–140562247 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：224 aa
SRA1 family 的蛋白質序列長 224 個胺基酸。序列註解將第 1 至 90 個胺基酸及第 201 至 224 個胺基酸標示為無序區域；這些註解描述的是序列特徵，並未提供其具體功能。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SRA1 的定位資料列出細胞核與細胞質。 來源未提供不同定位之間的條件、變化方式或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- HDAC2Q92769 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
SRA1 RNA 存在於含有 NCOA1 的核糖核蛋白複合體，也會在細胞核中與 PUS1、RARG 形成複合體。此外，資料記載 SRA1 與 AR 互作，但未說明此互作是否屬於上述複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SRA1 是具有功能的 RNA，可作為轉錄共活化因子，選擇性增強類固醇受體介導的轉錄活化。不依賴配體時，其作用涉及類固醇受體的調節性 N 端區域 AF-1；依賴配體時，則透過類固醇結合區域 AF-2 促進受體轉錄共活化。SRA1 亦與細胞增殖、分化增強及體內細胞凋亡促進相關，並可能參與腫瘤形成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Functional RNA which acts as a transcriptional coactivator that selectively enhances steroid receptor-mediated transactivation ligand-independently through a mechanism involving the modulating N-terminal domain (AF-1) of steroid receptors. Also mediates transcriptional coactivation of steroid receptors ligand-dependently through the steroid-binding domain (AF-2). Enhances cellular proliferation and differentiation and promotes apoptosis in vivo. May play a role in tumorigenesis PMID 10199399 ↗ · PMID 12943696 ↗ · PMID 14517287 ↗ · PMID 15147866 ↗ · PMID 15351741 ↗ |
| 交互作用 | SRA1 RNA 存在於含有 NCOA1 的核糖核蛋白複合體中，也會在細胞核內與 PUS1、RARG 形成複合體；此外，資料記載 SRA1 與 AR 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源SRA1 RNA exists in a ribonucleoprotein complex containing NCOA1. The RNA also forms a complex with PUS1 and RARG in the nucleus. Interacts with AR PMID 10199399 ↗ |
| 細胞定位 | SRA1 的細胞定位包括細胞核與細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCTGGCCAAGCGGAAGTGGAGATGGCGGAGCTGTACGTGA40AGCCGGGCAACAAGGAACGCGGCTGGAACGACCCGCCGCA80GTTCTCATACGGGCTGCAGACCCAGGCCGGCGGACCCAGG120CGCTCGCTGCTTACCAAGAGGGTCGCCGCACCCCAGGATG160GATCCCCCAGAGTCCCCGCATCAGAGACTTCTCCTGGGCC200TCCCCCAATGGGGCCTCCACCTCCTTCAAGTAAGGCTCCC240AGGTCCCCACCTGTGGGGAGTGGTCCTGCCTCTGGCGTGG280AGCCCACAAGTTTCCCAGTCGAGTCTGAGGCTGTGATGGA320GGATGTGCTGAGACCTTTGGAACAGGCATTGGAAGACTGC360CGTGGCCACACAAGGAAGCAGGTATGTGATGACATCAGCC400GACGCCTGGCACTGCTGCAGGAACAGTGGGCTGGAGGAAA440GTTGTCAATACCTGTAAAGAAGAGAATGGCTCTACTGGTG480CAAGAGCTTTCAAGCCACCGGTGGGACGCAGCAGATGACA520TCCACCGCTCCCTCATGGTTGACCATGTGACTGAGGTCAG560TCAGTGGATGGTAGGAGTTAAAAGATTAATTGCAGAAAAG600AGGAGTCTGTTTTCAGAGGAGGCAGCCAATGAAGAGAAAT640CTGCAGCCACAGCTGAGAAGAACCATACCATACCAGGCTT680CCAGCAGGCTTCATAATCCTCGGTTCCCCAGACTCACCGG720ACACCATCTCCTATGCCTTGGAGACCTTCTGTCACTTGGC760TCCCTTCTTACCACCACCAAGACTGTCCCACTGGGCCTGA800CCCACCTATGAGGGAAGAAGTCCCACCTGGGCCAGAGGGA840GTTCATGTGTTACTCATAACATGCATTTCAATAAAAACAT880CTCTGCGGTGGGCCTTGGGTAGGAGAGATGAACCCTTCCG920GTGCCAAGCTAGTCCCCTCTGGTGTCCTCGACTGCCCTGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。