演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SPTB

spectrin beta, erythrocytic

SPTB 編碼 spectrin beta, erythrocytic,屬於 spectrin 家族,是紅血球細胞膜下細胞骨架網絡的重要組成成分。

Homo sapiens14q23.3UniProt P11277
OFFICIAL SYMBOL
SPTB
CHROMOSOME
14
UNIPROT
P11277
PDB / ALPHAFOLD
3KBT
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SPTB 是蛋白質編碼基因,其產物 spectrin beta, erythrocytic 屬於 spectrin 家族。這種蛋白質是紅血球細胞膜下細胞骨架網絡的主要成分之一,並與 alpha 鏈共同形成由不同鏈組成的 spectrin 結構。蛋白質序列具有多個 Spectrin 重複區,另含 Calponin-homology (CH) 結構域及 Actin-binding 區域,呈現此家族蛋白質的重複模組與結合區域特色。

Official symbol
SPTB
Gene name
spectrin beta, erythrocytic
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11274
UniProt
P11277
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1414q23.3
chr14 · 107,043,718 bp · GRCh38chr14p13 · 1–3600000 · gvarchr14p12 · 3600001–8000000 · stalkchr14p11.2 · 8000001–16100000 · gvarchr14p11.1 · 16100001–17200000 · acenchr14q11.1 · 17200001–18200000 · acenchr14q11.2 · 18200001–24100000 · gnegchr14q12 · 24100001–32900000 · gpos100chr14q13.1 · 32900001–34800000 · gnegchr14q13.2 · 34800001–36100000 · gpos50chr14q13.3 · 36100001–37400000 · gnegchr14q21.1 · 37400001–43000000 · gpos100chr14q21.2 · 43000001–46700000 · gnegchr14q21.3 · 46700001–50400000 · gpos100chr14q22.1 · 50400001–53600000 · gnegchr14q22.2 · 53600001–55000000 · gpos25chr14q22.3 · 55000001–57600000 · gnegchr14q23.1 · 57600001–61600000 · gpos75chr14q23.2 · 61600001–64300000 · gnegchr14q23.3 · 64300001–67400000 · gpos50chr14q24.1 · 67400001–69800000 · gnegchr14q24.2 · 69800001–73300000 · gpos50chr14q24.3 · 73300001–78800000 · gnegchr14q31.1 · 78800001–83100000 · gpos100chr14q31.2 · 83100001–84400000 · gnegchr14q31.3 · 84400001–89300000 · gpos100chr14q32.11 · 89300001–91400000 · gnegchr14q32.12 · 91400001–94200000 · gpos25chr14q32.13 · 94200001–95800000 · gnegchr14q32.2 · 95800001–100900000 · gpos50chr14q32.31 · 100900001–102700000 · gnegchr14q32.32 · 102700001–103500000 · gpos50chr14q32.33 · 103500001–107043718 · gnegSPTBpq1 bp107,043,718 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr14:64,746,283–64,880,019
Gene span
133,737 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000644917 ★64,746,283–64,879,90736
ENST0000038972264,746,283–64,823,38435
ENST0000090273364,746,283–64,880,01935
ENST0000096138064,746,283–64,880,01937
ENST0000096138164,746,283–64,841,97736
ENST0000096138264,746,283–64,826,96336
ENST0000105570564,746,283–64,880,01935
ENST0000055393864,748,937–64,782,55018
ENST0000038972064,766,399–64,879,90732

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

在紅血球中,spectrin beta, erythrocytic 是細胞膜下細胞骨架網絡的主要組成成分。此網絡位於紅血球質膜內側,構成膜下的細胞骨架架構;spectrin 因而參與形成支撐紅血球細胞膜的超級結構。

這種架構由不同源的 alpha 與 beta 鏈組成。兩種鏈聚集後可形成二聚體、四聚體及更高階聚合物,使 spectrin 能組成多層次的細胞骨架結構。SPTB 編碼的 beta 鏈是其中一種組成鏈,其作用不是單獨構成網絡,而是與 alpha 鏈共同參與這些複合組裝形式。

spectrin 亦與 band 4.1 和 actin 結合,形成紅血球質膜下的細胞骨架超級結構。這些分子間的關聯將 spectrin 網絡與 actin 及 band 4.1 納入同一膜下架構,支持細胞骨架結構的形成。來源描述的是其組成與結構關係,未進一步界定各成分在此網絡中的具體分工。

因此,SPTB 的功能重點在於提供紅血球膜下細胞骨架網絡的 beta 鏈成分,並參與 spectrin 多聚組裝及與 actin、band 4.1 共同形成的膜下超級結構。這些描述指出其對紅血球細胞骨架架構的貢獻;來源未提供更細部的分子調控機制或其他細胞類型中的功能資訊。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 64879907 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SPTB ENST00000644917 GRCh38 chr14:64879807-64880907 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGACCTTGATCGTTAGAAAGTCAAGAAAATGTACTGCCTTGCAAGCTGCCGGTGTTCTATTGAGTTTCTC
TCCGGGGGCAACTCGGAGATGCCTTTTTGGCACCATCGGTTCTAGTATTTCCTCTGGCCTGCTGCGCCGC
GCCTCATCCAGGCTTGTAGTGAGGCACCCCCACTCGCCCGGAGACCCGGGCCGGCCAGGAGGTGCCAGTG
GGCAGGTGTGGCAGCCTGCCTGTTGATTACAGTCCCTACAATGTGCGAGCTCCTTGGGACTGCAGGCTGC
GCGCCGCCAGCTTTGCCTGGTTCGTCCTGATTACACTAGGTTTTCGGGCAGAAACAGCGACACTGAGCTC
GGGCTGGGGGTGGGGCCCTCGGGCCCAGTGCCCGCCCCCTGCCCTCCCACCGCCAGCCGAGAGAAGCCCG
CCCGGGAGCGCGCTTTCTAATGCACCAGCCCCCGGGAACAATCTGTCCCTCCCAAACCCGCCACGGCGGG
GGTTCACCTCCCGGGTACCCGCCGCGCCCACCCTATGGCCTAAATGTCTTTTCATATATTTTAAAAACTG
AACTGTGTGCAGTGGGGATGCAGGGCGGGAAAGGCTGGAGGGCTCATTTTCGCCACCAGGCTTGCCTCTC
CGGGCGCACGAATTAGGCCCGAGCTAGAGTCCAACCCCCTTCCCGCCTCAGGGGGCTCGGGGTGGCGCGG
GGTTAGGGGCAATGAACGACGATGGAGGCGCCCCAGGCTCAGCGGCGGGCGGGGAGGCAGAGGCGGGTTC
CAGGAGCCGGGCTGAGGCCCGGCAGGTGCCCCCAGGCGCGGAGGCTGATTGGCAGGTGCGTGAGTGGGTG
GGGAAGGCGGGGGCTGGGCTTGGCGCTGCGGGAGGCTGCGGCCCCGCCTCCCCGCCCCCGCCGCGGGACT
ATCTGGTCCCGGCAGCAGCGATGTCCCCCGGCAGGAATGTCCCTCCTCAGATAATGTTATTTATATCTCT
GGGCGGGTCCGCGGCTCGGCAGCACCAGGCGCCCGGCGGCCGCTGTGCCAGGAGCCCCGCGCTGCCCTCC
TCCCCCTGCGCCGCCGCCGCCGCCACCCCCGGGCTCGGGGTGGCCCCCGCT
SPTB 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SPTB_1 ↗14:64,879,907負股64,879,897–64,879,956

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR14_C8FS8 · enhancer · 64878868–64879896 · regulatory

ENSR14_83WHLB · promoter · 64879897–64880147 · regulatory

ENSR14_BGTMM · enhancer · 64880148–64881056 · regulatory

· motif · 64875644–64875650 · motif

· motif · 64877587–64877598 · motif

· motif · 64880004–64880017 · motif

· motif · 64880051–64880064 · motif

· motif · 64880066–64880079 · motif

· motif · 64880070–64880083 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:2137 aa

1 aa2137 aa結構域功能區域重複區
依 P11277 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

spectrin beta, erythrocytic 長 2,137 個胺基酸,屬於 spectrin 家族。其序列包含 17 個 Spectrin 重複區,以及兩個 Calponin-homology (CH) 結構域。N 端第 2–275 位為 Actin-binding 區域;蛋白質兩端另各有一段被註記為無序區,分別位於第 1–30 位與第 2,074–2,117 位。

結構域Calponin-homology (CH) 154–158 aa
結構域Calponin-homology (CH) 2173–278 aa
重複區Spectrin 1303–411 aa
重複區Spectrin 2423–525 aa
重複區Spectrin 3529–635 aa
重複區Spectrin 4638–741 aa
重複區Spectrin 5744–846 aa
重複區Spectrin 6851–950 aa
重複區Spectrin 7956–1058 aa
重複區Spectrin 81062–1165 aa
重複區Spectrin 91170–1257 aa
重複區Spectrin 101275–1375 aa
重複區Spectrin 111389–1465 aa
重複區Spectrin 121481–1582 aa
重複區Spectrin 131585–1688 aa
重複區Spectrin 141690–1793 aa
重複區Spectrin 151797–1899 aa
重複區Spectrin 161906–2006 aa
重複區Spectrin 172013–2075 aa
功能區域Disordered1–30 aa
功能區域Actin-binding2–275 aa
功能區域Disordered2074–2117 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3KBT…

PDB · 3KBT

X-ray · 2.75 A · A/B=1583-1906

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton;Cytoplasm, cell cortex

SPTB 蛋白質定位於細胞質中的細胞骨架及細胞皮質。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SPTBSPTBAPPSNAPINSPTA1Csrp3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

spectrin 的 alpha 與 beta 鏈為不同源鏈,可聚集形成二聚體、四聚體及更高階聚合物。另有資料記載 spectrin 與 BCAM 互作;該資料未說明互作形式或功能結果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SPTB 變異與遺傳性橢圓形紅血球症第 3 型(Elliptocytosis 3)相關。此病為不連鎖於 Rhesus 的遺傳性橢圓形紅血球症,可能呈自體顯性或自體隱性遺傳,患者可有程度不一的溶血性貧血及橢圓形或卵形紅血球。

SPTB 變異亦與遺傳性球形紅血球症第 2 型(Spherocytosis 2)相關,屬自體顯性形式。此類疾病可見大量形狀異常、通常呈球形的紅血球;臨床表現包括慢性溶血性貧血、黃疸與脾腫大,嚴重程度不一。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Spectrin 是紅血球質膜下細胞骨架網絡的主要組成成分,並與 band 4.1 及 actin 結合,共同形成紅血球質膜下的細胞骨架超級結構。資料庫紀錄
證據與來源

Spectrin is the major constituent of the cytoskeletal network underlying the erythrocyte plasma membrane. It associates with band 4.1 and actin to form the cytoskeletal superstructure of the erythrocyte plasma membrane

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Spectrin 由不同源的 alpha 與 beta 鏈組成,這些鏈可聚集形成二聚體、四聚體及更高階聚合物;另有與 BCAM 互作的記載。含實驗來源
證據與來源

Composed of non-homologous chains, alpha and beta, which aggregate to form dimers, tetramers, and higher polymers. Interacts with BCAM

PMID 15238148 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SPTB 蛋白質定位於細胞質中的細胞骨架及細胞皮質。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton; Cytoplasm, cell cortex

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯SPTB 變異可導致遺傳性橢圓形紅血球症第 3 型;此為不連鎖於 Rhesus 的遺傳性血液疾病,可呈自體顯性或自體隱性遺傳。表現包括程度不一的溶血性貧血,以及橢圓形或卵形紅血球。含實驗來源
證據與來源

Elliptocytosis 3 EL3 A Rhesus-unlinked form of hereditary elliptocytosis, a genetically heterogeneous hematologic disorder characterized by variable hemolytic anemia and elliptical or oval red cell shape. Inheritance can be autosomal dominant or autosomal recessive. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617948

PMID 1975598 ↗ · PMID 7883966 ↗ · PMID 8018926 ↗ · PMID 8226774 ↗ · PMID 9005995 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯SPTB 變異可導致遺傳性球形紅血球症第 2 型,屬自體顯性形式。此類血液疾病的特徵是出現大量形狀異常、通常呈球形的紅血球,臨床表現包括慢性溶血性貧血、黃疸及脾腫大,嚴重程度有所差異。含實驗來源
證據與來源

Spherocytosis 2 SPH2 An autosomal dominant form of hereditary spherocytosis, a group of hematologic disorders characterized by numerous abnormally shaped erythrocytes which are generally spheroidal. Clinical manifestations include chronic hemolytic anemia, jaundice, and splenomegaly, with variable severity. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 616649

PMID 19538529 ↗ · PMID 8102379 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000644917 · 10,177 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCACCAGGCGCCCGGCGGCCGCTGTGCCAGGAGCCCCGC40
41GCTGCCCTCCTCCCCCTGCGCCGCCGCCGCCGCCACCCCC80
81GGGCTCGGGGTGGCCCCCGCTTCAGTCCCAGGGCAGGGAT120
121CCTTCCATGAAGACTGAGGCAGGCGGAGCTGCTAAGAGCC160
161TGCTGACATGACATCGGCCACAGAGTTTGAAAATGTGGGC200
201AACCAGCCACCTTACAGCAGGATCAATGCCCGCTGGGACG240
241CCCCAGACGACGAGCTGGATAATGACAACAGCTCAGCCAG280
281GCTCTTTGAGAGGTCCCGGATAAAGGCCTTGGCAGATGAG320
321CGGGAAGTTGTTCAGAAAAAGACCTTCACGAAATGGGTGA360
361ACTCGCACCTGGCTCGAGTGTCCTGCCGCATCACCGATCT400
401CTACAAGGACCTGCGGGATGGGCGCATGCTCATCAAGCTG440
441CTGGAGGTGCTCTCTGGAGAGATGCTGCCAAAGCCCACCA480
481AGGGGAAGATGCGCATCCACTGCCTGGAGAATGTGGACAA520
521GGCTCTCCAGTTCCTCAAGGAGCAGCGTGTACACCTGGAG560
561AACATGGGCTCCCACGACATTGTAGATGGCAACCACCGCC600
601TGGTCCTGGGCCTCATCTGGACCATCATCCTCCGCTTCCA640
641GATTCAGGACATTGTGGTCCAAACTCAGGAAGGTCGTGAA680
681ACACGCTCAGCCAAGGATGCGTTGCTGTTGTGGTGTCAGA720
721TGAAGACGGCAGGCTACCCTCATGTTAATGTCACCAACTT760
761TACCTCCAGCTGGAAGGATGGCTTGGCCTTTAATGCCCTG800
801ATACACAAGCACCGGCCCGACCTGATCGACTTTGATAAGC840
841TGAAGGACTCCAATGCCCGGCACAACCTGGAGCACGCATT880
881CAATGTGGCTGAGCGCCAGCTGGGCATCATCCCGCTCCTC920
921GACCCCGAAGATGTCTTTACGGAAAACCCTGATGAGAAAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。