演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SPRYD7CLLD6

SPRY domain containing 7

SPRYD7 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens13q14.2UniProt Q5W111
OFFICIAL SYMBOL
SPRYD7
CHROMOSOME
13
UNIPROT
Q5W111
PDB / ALPHAFOLD
7CCB
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SPRYD7 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 SPRY domain containing 7。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 13q14.2。

Official symbol
SPRYD7
Gene name
SPRY domain containing 7
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14297
UniProt
Q5W111
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CLLD6C13orf1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1313q14.2
chr13 · 114,364,328 bp · GRCh38chr13p13 · 1–4600000 · gvarchr13p12 · 4600001–10100000 · stalkchr13p11.2 · 10100001–16500000 · gvarchr13p11.1 · 16500001–17700000 · acenchr13q11 · 17700001–18900000 · acenchr13q12.11 · 18900001–22600000 · gnegchr13q12.12 · 22600001–24900000 · gpos25chr13q12.13 · 24900001–27200000 · gnegchr13q12.2 · 27200001–28300000 · gpos25chr13q12.3 · 28300001–31600000 · gnegchr13q13.1 · 31600001–33400000 · gpos50chr13q13.2 · 33400001–34900000 · gnegchr13q13.3 · 34900001–39500000 · gpos75chr13q14.11 · 39500001–44600000 · gnegchr13q14.12 · 44600001–45200000 · gpos25chr13q14.13 · 45200001–46700000 · gnegchr13q14.2 · 46700001–50300000 · gpos50chr13q14.3 · 50300001–54700000 · gnegchr13q21.1 · 54700001–59000000 · gpos100chr13q21.2 · 59000001–61800000 · gnegchr13q21.31 · 61800001–65200000 · gpos75chr13q21.32 · 65200001–68100000 · gnegchr13q21.33 · 68100001–72800000 · gpos100chr13q22.1 · 72800001–74900000 · gnegchr13q22.2 · 74900001–76700000 · gpos50chr13q22.3 · 76700001–78500000 · gnegchr13q31.1 · 78500001–87100000 · gpos100chr13q31.2 · 87100001–89400000 · gnegchr13q31.3 · 89400001–94400000 · gpos100chr13q32.1 · 94400001–97500000 · gnegchr13q32.2 · 97500001–98700000 · gpos25chr13q32.3 · 98700001–101100000 · gnegchr13q33.1 · 101100001–104200000 · gpos100chr13q33.2 · 104200001–106400000 · gnegchr13q33.3 · 106400001–109600000 · gpos100chr13q34 · 109600001–114364328 · gnegSPRYD7pq1 bp114,364,328 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr13:49,912,702–49,936,513
Gene span
23,812 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000361840 ★49,912,702–49,936,3405
ENST0000037819549,912,702–49,936,5134
ENST0000088138349,912,702–49,936,5136
ENST0000088138449,912,702–49,936,5135
ENST0000088138549,912,702–49,936,5136
ENST0000088138649,912,702–49,936,5133
ENST0000088138749,912,702–49,936,5135
ENST0000088138849,912,702–49,936,5137
ENST0000088138949,912,702–49,936,5135
ENST0000091701649,912,702–49,936,5135
ENST0000091701749,912,702–49,936,5136
ENST0000094679549,912,702–49,936,5135

顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 49936340 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SPRYD7 ENST00000361840 GRCh38 chr13:49936240-49937340 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCTGAAGATG
TAAAATCTACCACGGAAGGATGATCTAAGTGGGGAAGGAGATGACAGGTGACAGCCTCCCGTGTGGAAGC
AGAAAGTAGCGGACGGTAGGAGCCGAAGGCTTCCCTCGGGACCCAGCAGACTTCCCGCAGCCTCCTGGGT
TCCCGTCACATTCCTCGGAACCCTCAGTGCACCAGACAGGGGGAGCTTGGAAGAGGCAGGTCAAGAATCG
CCCCCGACCCCGCCCCAGCGTTCTGCTCCCAGGGCGGCCTCCCACGCGCCCCGGACCACGCAGCCCGATG
GGCCAGGTAGGGCGCGTCTCTGCACCGAAAATGCATTAGGGCCCGCGTGAGCCCCGGTGAACATCCACAG
TGCAGTCACTAACAGGCATTACTCCTGGGGCCCACGTGAGTCTATTTAGCATGTGAGGGAAACCAGCCAC
GGCAGGGAGACTGGGGCTCTCCGTGGTGGCAAAGCCTGCTCAACCTGGGCCCGCGGAGGGAAAACTCGGA
AGTCATTTCCATTAGCTCCCCTTCCCCCAAACTGATTCGCTTCTGTCAATCCATCCCTAGAAATAATGTC
GAGGCCGGGACCAAGGGGTGCTGCGTTTTAAAAATTCTGCATAGGAAAACCCCTGGAAGTACTGAGGGAC
AGACAGCCCCACTCACCTGTCAGCCCTGGGGGCGTGCGCGAAACCGCCCAAGGAGAAAAAACCAGCTGGT
GCGCAGGCGCACGCCGTCCCACATCCGCAGGCCCGCAACGCCACGCCCCCTGCCACGCCTCCGCGCGCCA
CTAGCCCCACCCGTCTCCCCGGCCCAGCCCGGCCGCTCGCCCTGTCCGGTCTCTCCCCGGCCCCTTGATT
CTCCGCGTCTTCCTCGCAGGCCAGCCTAAGCTCAGCCTGCATTGCGCCCTCCCGGCCTAGGGTGTCGCTG
TACCGGCCTCCGAGCTCCACATAGACAAGTCCGGACCTCGGGCGGGGGCAGGAGACGGAGCTGAGCGGCG
GGGGGCAGTGTCGCCTCGGTCTAGGGACGGCGGCGGAGTCGGTGGTCCCTG
SPRYD7 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SPRYD7_1 ↗13:49,936,308負股49,936,298–49,936,357

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR13_83GMBD · promoter · 49936330–49936555 · regulatory

ENSR13_BCWKN · enhancer · 49936556–49937353 · regulatory

ENSR13_9PS6R · enhancer · 49938312–49938723 · regulatory

· motif · 49936046–49936061 · motif

· motif · 49936048–49936061 · motif

· motif · 49936051–49936063 · motif

· motif · 49936203–49936218 · motif

· motif · 49936203–49936220 · motif

· motif · 49936309–49936322 · motif

· motif · 49936504–49936517 · motif

· motif · 49936560–49936571 · motif

· motif · 49936560–49936571 · motif

· motif · 49936601–49936612 · motif

· motif · 49936749–49936760 · motif

· motif · 49936750–49936761 · motif

· motif · 49936777–49936788 · motif

· motif · 49936883–49936899 · motif

· motif · 49936883–49936899 · motif

· motif · 49937011–49937024 · motif

· motif · 49937039–49937052 · motif

· motif · 49937158–49937171 · motif

· motif · 49937158–49937171 · motif

· motif · 49937217–49937230 · motif

· motif · 49937343–49937355 · motif

· motif · 49937345–49937352 · motif

· motif · 49937345–49937360 · motif

· motif · 49938073–49938095 · motif

· motif · 49938447–49938460 · motif

· motif · 49938657–49938670 · motif

· motif · 49938692–49938707 · motif

· motif · 49938792–49938807 · motif

· motif · 49939100–49939115 · motif

· motif · 49939100–49939115 · motif

· motif · 49939101–49939115 · motif

· motif · 49939102–49939115 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:196 aa

1 aa196 aa結構域
依 Q5W111 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SPRYD7 的蛋白質長 196 個胺基酸。其第 2 至 184 位胺基酸標註有 B30.2/SPRY 結構域;此區域註解依 PROSITE-ProRule 提供。

結構域B30.2/SPRY2–184 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7CCB…

PDB · 7CCB

X-ray · 1.62 A · A/B=15-191

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 20 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CLLD6SPRYD7CAMK2BNHERF4TRIP13VAC14AGXTAQP1CASP6CCKFGFR3GRIN2CGSNHEMK1HIP1NTAQ1OTX1POGZPRPF40ARANTLX3Q9Y649
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 20 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

0 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 0 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000361840 · 3,057 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ATAGACAAGTCCGGACCTCGGGCGGGGGCAGGAGACGGAG40
41CTGAGCGGCGGGGGGCAGTGTCGCCTCGGTCTAGGGACGG80
81CGGCGGAGTCGGTGGTCCCTGCGCGATGGCCACCTCGGTG120
121TTGTGCTGCCTGCGGTGCTGCAGAGACGGGGGGACTGGCC160
161ACATCCCTCTGAAGGAGATGCCGGCCGTGCAGCTGGACAC200
201GCAGCACATGGGAACAGATGTTGTTATTGTAAAGAATGGA240
241AGAAGAATATGTGGAACAGGAGGTTGTTTAGCCAGCGCAC280
281CTTTACATCAAAACAAAAGCTATTTTGAATTCAAAATCCA320
321GTCCACAGGAATCTGGGGTATTGGTGTTGCAACTCAGAAG360
361GTTAACTTGAATCAGATTCCTCTTGGCCGAGATATGCACA400
401GTCTGGTGATGAGAAATGATGGAGCCCTTTACCACAACAA440
441TGAAGAGAAAAATAGGCTGCCAGCAAACAGTCTTCCGCAG480
481GAAGGAGATGTGGTGGGTATTACTTATGACCATGTCGAAT520
521TAAATGTATACTTGAATGGAAAAAACATGCATTGTCCAGC560
561ATCAGGTATACGAGGGACAGTGTATCCAGTTGTTTATGTT600
601GATGACAGTGCAATTTTGGATTGCCAGTTCAGTGAGTTTT640
641ATCATACGCCTCCACCTGGTTTTGAAAAAATATTATTTGA680
681ACAGCAAATCTTCTGAATGTATTTGTTTTTAAAACTTGTA720
721TTTCTGCACTGTTAAAAAATGTTCATCATTTAATAAAACT760
761TTACCTGGCCTATAGATGAAAATATATTCTTAAAAATATG800
801CTTGTTGATGCTGTCTAAGGAACCAATGTATTCAGTATAC840
841CACCCTGAAGTTGTGATTTAAAATACTTTATGTTTTGTGA880
881AATGAAAATAAGCATTTGGGCAGTTTATTTAATTCTTATT920
921TAAATAAATAGAATTATGGGTTTAATTAACAGTATAACAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。