基因總覽
SPRY2 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 sprouty RTK signaling antagonist 2。其產物 Protein sprouty homolog 2 屬於 sprouty 家族,長 315 個胺基酸。蛋白質包含 SPR 結構域;序列中有兩段被註記為無序區,分別位於第 1–39 與第 51–140 個胺基酸。來源亦標示其部分區域與 CAV1、TESK1 的互動有關。這些家族與結構特徵提供 SPRY2 的基本辨識,至於其訊號調控作用,則由下方功能說明整理。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000377104 ★ | 80,335,976–80,341,126 | 2 |
| ENST00000909621 | 80,335,518–80,339,341 | 2 |
| ENST00000909620 | 80,335,518–80,341,454 | 2 |
| ENST00000919046 | 80,335,518–80,339,617 | 2 |
| ENST00000377102 | 80,335,518–80,341,165 | 2 |
| ENST00000919045 | 80,335,518–80,341,454 | 3 |
| ENST00000919044 | 80,335,518–80,340,725 | 2 |
| ENST00000919041 | 80,335,518–80,341,454 | 3 |
| ENST00000919040 | 80,335,518–80,341,329 | 2 |
| ENST00000909617 | 80,335,518–80,342,954 | 2 |
| ENST00000909616 | 80,335,518–80,342,983 | 2 |
| ENST00000919043 | 80,335,518–80,341,165 | 2 |
顯示 12/21 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SPRY2 可拮抗 fibroblast growth factor(FGF)訊號路徑。依序列相似性推定的資料,這項作用與抑制 FGF 介導的 ERK1/2 磷酸化有關;此證據屬 By similarity,並非此處所列的直接實驗證實。透過這項路徑調節,SPRY2 被認為可拮抗 FGF 誘導的視網膜晶狀體纖維分化;來源也指出,它可能抑制肢芽向外生長,並可能負向調節呼吸器官形成。後兩項發育作用同樣標示為 By similarity,應保留其推定性質。
在視網膜晶狀體上皮細胞中,SPRY2 可抑制 TGFB 誘導的上皮—間質轉化;來源將此作用標為 By similarity。這表示它與特定細胞情境下的轉化反應調節相關,但現有資料沒有進一步交代其分子步驟或作用條件,因此不宜延伸為更廣泛的細胞命運主張。
SPRY2 也與 EGFR 的泛素化調控有關。來源指出,它會抑制 CBL/C-CBL 介導的 EGFR 泛素化,這項功能有 PubMed 文獻支持。此處所述的是對 CBL/C-CBL 調控作用的抑制;資料未提供 EGFR 後續命運或訊號變化的細節,因此不能據此補述其他下游結果。
整體而言,來源呈現的 SPRY2 功能包括對 FGF 路徑相關反應的拮抗、對 TGFB 誘導的上皮—間質轉化的抑制,以及對 CBL/C-CBL 介導 EGFR 泛素化的抑制。這些作用所依據的證據層級不同:前兩類發育與細胞反應為相似性推定,EGFR 泛素化調控則有文獻支持。
Promoter 與基因調控
>SPRY2 ENST00000377104 GRCh38 chr13:80341026-80342126 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TAGCTACTGCATGAAGCAAAATAGTAAGGAAGCTCTTCAAAAAGCCTCCATTCATAGATAACCCCCCTTA AAAATGAAATTCTAATAAACGGAAAAACTACAAGTCGACACAATCAAAAGCAAATCCCAGCAAGAGCAGA AGGTACTTGAAACTCGAATCTGCATTCCGTTCCTCCCGTACAAGGCTCGGAGGTGGGGGAGGCGGTTTGT GCTGGTGCCTGGTGTATAATCGGGTTAATCCAGTAGACAAAGAATAAACCAATAGCCCTCCCACCTCACT TCCCGCTCCCCTTCCCCTCCCCCTTCTTCTCCCCCCGCCCCAGCCCCCGTCACCCGCTCCGCAAAGGGGA ACAGAAAAGGGGAGAGGTAGACTTGAAATGGATTCTGGATAAAGTCTTAAAACCTGCAACTTGTTTTTCA TGCTAACACTGCGTGGCCCAGATTAGTCTTAAATGTTCATTCCCCTTTCCTGGTGGCAAGGAGAAAGTTC CCTAAGTCAGCTCGAGCCTCTGGCTCGTCCTCATTGCCTCTGGGCAAACCTTAAGGTCAGTGTTTCCTTG AAACTAGATAAACTGACCCTGCAGTGCCCAGCCCGGCCCCGCGGGCGCCCCGCGTGACGGCGCTCGGGCG GCAGGACCGGCCTGGGGACGCGCGGGGCGGCGCGGTTGCCCTTTTGAATGCCTCCTGCGGCTCGGAGCGC TGGCGGGCGCTGGAGTGTGAGTGAATGTAGCCCCGCGGAGCCAATGAGCTGGGACCGGATGCGATATATC CTCTGGGACAACAACTGCTCTGTTCCGCCTCGGATCCACATGACGCCATTTACTGCTGCCGCGGCCGCCG CAGAGCTCCCTGCCTCCTCCGGAAAGGCGAGGGCGCAGGCCAACGGCGAGCCCCCCCCGGGCGGGCCCCA GACCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGCACCCACCGCCCCCGCCTCGGCCTCGCT GCCTCGCCTCCACAACGCCCAGTCTGCACCGCCGAGAGCTGCGCGCCGCAGCGCTAGCGGAGGAGAGGGG CCGGCGGAGCGCGCAGCGCCCAGGCCCCCGCGCCCGCCCGGCCCGGCCCGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPRY2_1 ↗ | 13:80,341,126 | 負股 | 80,341,116–80,341,175 |
| SPRY2_2 ↗ | 13:80,341,332 | 負股 | 80,341,322–80,341,381 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR13_C9Z8K · enhancer · 80338377–80339648 · regulatory
ENSR13_84CQXW · promoter · 80339649–80339801 · regulatory
ENSR13_C9Z8M · enhancer · 80339802–80341115 · regulatory
ENSR13_5NW7NQ · CTCF_binding_site · 80339844–80339865 · regulatory
ENSR13_936TZW · promoter · 80341116–80341488 · regulatory
ENSR13_D5ZLW · enhancer · 80341489–80343866 · regulatory
ENSR13_5NW88G · CTCF_binding_site · 80343021–80343042 · regulatory
ENSR13_5NW89S · CTCF_binding_site · 80343315–80343336 · regulatory
· motif · 80337166–80337178 · motif
· motif · 80338937–80338950 · motif
· motif · 80338937–80338950 · motif
· motif · 80338938–80338951 · motif
· motif · 80338938–80338951 · motif
· motif · 80339162–80339174 · motif
· motif · 80339164–80339171 · motif
· motif · 80339207–80339216 · motif
· motif · 80339222–80339244 · motif
· motif · 80339222–80339244 · motif
· motif · 80339286–80339299 · motif
· motif · 80339697–80339712 · motif
· motif · 80339846–80339862 · motif
· motif · 80339954–80339971 · motif
· motif · 80340096–80340108 · motif
· motif · 80340184–80340199 · motif
· motif · 80341010–80341023 · motif
· motif · 80341043–80341056 · motif
· motif · 80341156–80341169 · motif
· motif · 80341171–80341184 · motif
· motif · 80341250–80341263 · motif
· motif · 80341284–80341301 · motif
· motif · 80341306–80341316 · motif
· motif · 80341306–80341319 · motif
· motif · 80341306–80341319 · motif
· motif · 80341347–80341360 · motif
· motif · 80341364–80341373 · motif
· motif · 80341511–80341527 · motif
· motif · 80341522–80341535 · motif
· motif · 80342737–80342745 · motif
· motif · 80342783–80342796 · motif
· motif · 80342783–80342796 · motif
· motif · 80343023–80343039 · motif
· motif · 80343267–80343283 · motif
· motif · 80343267–80343283 · motif
· motif · 80343317–80343333 · motif
· motif · 80343324–80343334 · motif
· motif · 80344831–80344843 · motif
· motif · 80345866–80345881 · motif
· motif · 80346080–80346089 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:315 aa
Protein sprouty homolog 2 長 315 個胺基酸,屬於 sprouty 家族,含有第 177–291 個胺基酸構成的 SPR 結構域。第 1–39 與第 51–140 個胺基酸區段被註記為無序區。第 118–315 個胺基酸區域與 CAV1 互動所需,第 178–315 個胺基酸區域則與 TESK1 互動所需。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SPRY2 位於細胞質與細胞骨架,也可見於細胞突起的膜皺褶。 未受刺激時,它與微管相關;細胞受到 EGF 刺激後,則轉移至膜皺褶。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Cell projection, ruffle membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 59 個夥伴
- AQP1P29972 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATRIPQ8WXE1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CATSPER1Q8NEC5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CBLP22681 · UniProt INTERACTION · 17 experiments
- CHRDQ9H2X0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CHRNGP07510-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CREB5Q02930-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EIF4E2O60573 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAIMQ9NVQ4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRS3O43559 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GNEQ9Y223 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GP9P14770 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRAP2O75791 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRB2P62993 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HEXIM2Q96MH2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSD3B7Q9H2F3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-11P60412 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-5P60370 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-9P60411 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP4-11Q9BYQ6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP4-12Q9BQ66 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- KRTAP4-7Q9BYR0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP5-6Q6L8G9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SPRY2 可與 SPRY1 形成異源二聚體,也參與含 GAB1、METTL13 與 SPRY2 的三方複合體,並在該複合體中與 METTL13 互動。它另與 RAF1、GRB2、CBL/C-CBL、PPP2R1A/PP2A-A、PPP2CA/PP2A-C 及 CAV1 互動。TESK1 透過雙方 C 端與 SPRY2 互動;此互動會破壞 SPRY2 與 GRB2 的互動,可能與干擾 SPRY2 的絲胺酸去磷酸化有關。TESK1 也會抑制 SPRY2 與 PPP2CA/PP2A-C 的互動,可能是藉由囊泡隔離 SPRY2。SPRY2 與 PP2A 全酶互動受阻時,PP2A 介導的去磷酸化喪失,並伴隨 SPRY2 與 GRB2 互動喪失。SPRY2 與 CBL/C-CBL 的互動則會抑制 CBL 介導的 EGFR 泛素化。
疾病與遺傳關聯
SPRY2 相關變異與 IgA nephropathy 3(IGAN3)的疾病易感性相關;來源沒有指出這些變異必然造成疾病。IgA 腎病是一種常見的原發性腎小球腎炎,腎切片可見腎小球硬化、間質纖維化,以及含免疫球蛋白 A 與 G 的系膜沉積。疾病可能伴隨腎功能不全並進展至末期腎病;蛋白尿與血尿是其特徵性臨床表現。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SPRY2 可拮抗 FGF 路徑,依相似性推定,此作用涉及抑制 FGF 介導的 ERK1/2 磷酸化,並可能拮抗 FGF 誘導的視網膜晶狀體纖維分化、抑制肢芽向外生長及負向調節呼吸器官形成。它也可能抑制視網膜晶狀體上皮細胞中 TGFB 誘導的上皮—間質轉化;另有文獻支持其抑制 CBL/C-CBL 介導的 EGFR 泛素化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Antagonist of fibroblast growth factor (FGF) pathways via inhibition of FGF-mediated phosphorylation of ERK1/2 (By similarity). Thereby acts as an antagonist of FGF-induced retinal lens fiber differentiation, may inhibit limb bud outgrowth and may negatively modulate respiratory organogenesis (By similarity). Inhibits TGFB-induced epithelial-to-mesenchymal transition in retinal lens epithelial cells (By similarity). Inhibits CBL/C-CBL-mediated EGFR ubiquitination PMID 17974561 ↗ |
| 交互作用 | SPRY2 可與 SPRY1 形成異源二聚體,並參與含 GAB1、METTL13 與 SPRY2 的三方複合體,在其中與 METTL13 互動;另與 RAF1、GRB2、CBL/C-CBL、PPP2R1A/PP2A-A、PPP2CA/PP2A-C 及 CAV1 互動。TESK1 與 SPRY2 的 C 端互動會破壞 SPRY2–GRB2 關係,可能干擾其絲胺酸去磷酸化;TESK1 也會抑制 SPRY2 與 PPP2CA/PP2A-C 的互動,可能經囊泡隔離所致。SPR2 與 PP2A 全酶互動受阻會造成 PP2A 介導去磷酸化喪失,並使 SPRY2–GRB2 互動消失;SPRY2 與 CBL/C-CBL 的互動則抑制 CBL 介導的 EGFR 泛素化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms heterodimers with SPRY1 (By similarity). Forms a tripartite complex containing GAB1, METTL13 and SPRY2. Within the complex interacts with METTL13. Interacts with RAF1. Interacts (via C-terminus) with TESK1 (via C-terminus); the interaction disrupts SPRY2 interaction with GRB2, potentially via disruption of SPRY2 serine dephosphorylation. Interacts with PPP2R1A/PP2A-A and PPP2CA/PP2A-C; the interaction with PPP2CA/PP2A-C is inhibited by interaction with TESK1, possibly by vesicular sequestration of SPRY2. Inhibition of the interaction with the serine/threonine-protein phosphatase 2A (PP2A) holoenzyme results in loss of PP2A-mediated dephosphorylation, resulting in the loss of SPRY2 interaction with GRB2. Interacts with GRB2. Interacts with CBL/C-CBL; the interaction inhibits CBL-mediated ubiquitination of EGFR. Interacts (via C-terminus) with CAV1 (via C-terminus) PMID 12717443 ↗ · PMID 16877379 ↗ · PMID 17974561 ↗ · PMID 29408807 ↗ |
| 細胞定位 | SPRY2 位於細胞質、細胞骨架及細胞突起膜皺褶;未受刺激時與微管相關,細胞受 EGF 刺激後會轉移至膜皺褶。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm, cytoskeleton; Cell projection, ruffle membrane; Associated with microtubules in unstimulated cells but is translocated to the membrane ruffles in cells stimulated with EGF (epidermal growth factor) PMID 10887178 ↗ |
| 疾病關聯 | SPRY2 所代表基因的變異與 IgA nephropathy 3(IGAN3)疾病易感性相關,並非來源所述的確定因果關係。此病為常見原發性腎小球腎炎,腎切片可見腎小球硬化、間質纖維化及系膜 IgA、IgG 沉積;可能伴隨腎功能不全並進展至末期腎病,蛋白尿與血尿是特徵性表現。 | 含實驗來源 | 證據與來源IgA nephropathy 3 IGAN3 A form of IgA nephropathy, a common primary glomerulonephritis characterized by glomerular sclerosis, interstitial fibrosis, and mesangial glomerular deposits of immunoglobulin A and immunoglobulin G visible on renal biopsies. IgA nephropathy is associated with renal insufficiency that can progress to end-stage renal disease. Proteinuria and hematuria are characteristic clinical presentations. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 616818 PMID 25782674 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTCTGCACCGCCGAGAGCTGCGCGCCGCAGCGCTAGCGG40AGGAGAGGGGCCGGCGGAGCGCGCAGCGCCCAGGCCCCCG80CGCCCGCCCGGCCCGGCCCGGCCCGCGCCCCCGCGCCGCC120TCCGCTACGACGCGGCCCCGGCCGCACCACTTGGCGATCT160GGCTTTAGGTTCTCCGTAAGGCCGTTTTCTTTTCCCATTC200GCTCATCTGCCAGGAAAAGGGACTTGCCGTTGGCGCTTCG240GCCTCTTGTTCATTGAGAAAAAAGAGGAAATACTCCGCGT280GCGCTTGTAGAAGGGGAGTCGTCTCCAGCTCCGAACCCCG320GAGTGTTCATCAGCGGGGAATCTGGCTCCGAATTCTCTTT360TTTTCTCCCGCCGATTGCTCGGAAGTTGGTCTAAAGCAGA400GGTTGGAAAGAAAGGAAAAAAGTTTGCATCGAGACTGGAT440TTATTTGCACATCGCAGAAAGAAGAGAATCCAAGGGAGAG480GGGTTGGTGCAAAGCCGCGATCACGGAGTTCAGATGTGTT520CTAAGCCTGCTGGAGTGACCACACTTCCAAGACCTGATGG560AGGCCAGAGCTCAGAGTGGCAACGGGTCGCAGCCCTTGCT600GCAGACGCCCCGTGACGGTGGCAGACAGCGTGGGGAGCCC640GACCCCAGAGACGCCCTCACCCAGCAGGTACATGTCTTGT680CTCTGGATCAGATCAGAGCCATCCGAAACACCAATGAGTA720CACAGAGGGGCCTACTGTCGTCCCAAGACCTGGGCTCAAG760CCTGCTCCTCGCCCCTCCACTCAGCACAAACACGAGAGAC800TCCACGGTCTGCCTGAGCACCGCCAGCCTCCTAGGCTCCA840GCACTCGCAGGTCCATTCTTCTGCACGAGCCCCTCTGTCC880AGATCCATAAGCACGGTCAGCTCAGGGTCGCGGAGCAGTA920CGAGGACAAGTACCAGCAGCAGCTCCTCTGAACAGAGACT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。