基因總覽
SPRR3(small proline rich protein 3)是蛋白質編碼基因,產物屬於 cornifin(SPRR)家族。其蛋白質長 169 個胺基酸,序列中包含約 14 個串聯重複區,每個重複單位約 8 個胺基酸;另有註記指出蛋白質部分區段呈無序特性。這些資料提供其家族歸屬與序列組成的基本描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000295367 ★ | 153,001,749–153,003,856 | 2 |
| ENST00000331860 | 153,001,743–153,003,856 | 3 |
| ENST00001098340 | 153,001,743–153,003,859 | 2 |
| ENST00001098341 | 153,001,743–153,003,856 | 2 |
| ENST00001098342 | 153,001,743–153,003,856 | 3 |
| ENST00001098343 | 153,001,743–153,003,856 | 2 |
| ENST00001143227 | 153,001,743–153,003,856 | 2 |
| ENST00000443178 | 153,001,751–153,003,496 | 3 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SPRR3 的蛋白質產物與角質形成細胞的交聯包膜相關,來源將其描述為該包膜的交聯蛋白。現有資料未進一步說明交聯的分子方式、作用對象或其對細胞包膜形成的具體影響,因此不宜據此延伸出更詳細的機制。
Promoter 與基因調控
>SPRR3 ENST00000295367 GRCh38 chr1:153000749-153001849 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTCCTTTCTCCCTTCCATGAACCTACAGCTCTATTCAGGAGAACAATGACTGTCCATTGACTTAACACCC ATGATAACCAGGCACTGTGTGACGCTGAAGTAGAACAAGGGGCTTTCAGAACCTGGTGGAAGGAGCTGGG CATCAGGTTCAAGGGAGTAACACAGTCGTGGAACATTGGGAAAGGAGGAGCTATTCACATGCCTGAGATG TAAGGATGTCTGGATTTTCCAAGGGCCGCGTCTAGTAAGAGAGTGTGTATTGAGGGCAACTCTGAGTTAG TGACTTGAGGTTCATCCTGTAGTGATCAGAGGAAATGGCTGGTGTATGAACCTAGGGAATCAGCACGCTC CTCTTCCTATGTCACTCCTGGAGAAGAAAGATACCACAAGAGGCAGGGTCTTCAGGGCTGAGCCACAATG TCACACAGATCCAGTCAATCCTGCCTGTCCATCTCAATGACATCTACTATCCCTGATCAACACGGCACCT TAAGGCGCCCTTCACAGTGAAAGCAACTTATTTCCAAAGCAGGCATTTTGCCTTCCATTGCTCCTCCCAG GTCCAAATCCAGTAAGAGACTGAAAATCAGATGATTCACTTATTCTGCACCATCCCCATGGCCTCGCAGA ACCAGAAATGCCTATTGTTATTTCCATGTCCACTTCAACCATGAGGAAGCCCAATAGGACTAATCTGGCT AAAGATTAGGGCCCAGGCCAAGAGGCCTGGCTCGTTCTAGTCCTAGGAGCATGGTACTTCCTCCTAATTT AATCCATTGCCATTCAAGAAGACCTTTGCCCACAGCAACCACACCACAAAGGGTGGACAGTGAGTCAGGC CCAGGTGACATCACTGTCAGAGCTTAAGTGACAAAAAATGTTAAGCCAGAGATACTTATCACAAAAGCTG GAATGAAGTTAGAGCAGTCTTTTAAAAAATCCAATTTTCTTAAGGCAGGGCTCATTTTCTATATAAATAC CAGCTAACAAGAGACTCTTCACCAGATCCCAGAGGCTGAACACCTCGACCTTCTCTGCACAGCAGGTGAG TCTCCGCATTAGGAACACCTTAATATTCTCCAATAGTTTCTTTATTTTGAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPRR3_1 ↗ | 1:153,001,749 | 正股 | 153,001,700–153,001,759 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
SPRR3 的調控資訊與表皮角質形成細胞的鱗狀分化時期相關;資料未進一步說明表現變化的方向或調控機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:169 aa
SPRR3 蛋白質長 169 個胺基酸,屬於 cornifin(SPRR)家族。其序列註記包含 14 個約 8 個胺基酸的串聯重複區,位於第 43 至 154 個胺基酸;第 1 至 57 位及第 150 至 169 位另被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SPRR3 的細胞內定位註記為細胞質;資料未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- JOSD2Q8TAC2 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SPRR3 蛋白質被描述為角質形成細胞交聯包膜的組成相關蛋白。這筆註記未提供更細的作用機制、參與條件或實驗系統,因此僅能概述其與該包膜交聯的關聯。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | SPRR3 的定位資料將其標示於細胞質。這項註記沒有提供特定細胞狀態、條件、異構型或定位變動資訊,故不據此推定其他細胞區室中的分布。 | 資料庫紀錄 | |
| 調控 | SPRR3 的調控註記涉及表皮角質形成細胞的鱗狀分化過程。資料沒有指出表現量上升或下降,也未提供調控因子或具體機制,因此僅保留其與此分化階段的關聯。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ACCAGATCCCAGAGGCTGAACACCTCGACCTTCTCTGCAC40AGCAGGTCCAGCATCCTTTGAAGCATGAGTTCTTACCAGC80AGAAGCAGACCTTTACCCCACCACCTCAGCTTCAACAGCA120GCAGGTGAAACAACCCAGCCAGCCTCCACCTCAGGAAATA160TTTGTTCCCACAACCAAGGAGCCATGCCACTCAAAGGTTC200CACAACCTGGAAACACAAAGATTCCAGAGCCAGGCTGTAC240CAAGGTCCCTGAGCCAGGCTGTACCAAGGTCCCTGAGCCA280GGCTGTACCAAGGTCCCTGAGCCAGGTTGTACCAAGGTCC320CTGAGCCAGGCTGTACCAAGGTCCCTGAGCCAGGTTGTAC360CAAGGTCCCTGAGCCAGGCTACACCAAGGTCCCTGAACCA400GGCAGCATCAAGGTCCCTGACCAAGGCTTCATCAAGTTTC440CTGAGCCAGGTGCCATCAAAGTTCCTGAGCAAGGATACAC480CAAAGTTCCTGTGCCAGGCTACACAAAGCTACCAGAGCCA520TGTCCTTCAACGGTCACTCCAGGCCCAGCTCAGCAGAAGA560CCAAGCAGAAGTAATTTGGTGCACAGACAAGCCCTTGAGA600AGCCAACCACCAGATGCTGGACACCCTCTTCCCATCTGTT640TCTGTGTCTTAATTGTCTGTAGACCTTGTAATCAGCACAT680TGTCACCCCAAGCCATAGTCTCTCTCTTATTTGTATCCTA720AAAATACGTACTATAAAGCTTTTGTTCACACACACTCTGA760AGAATCCTGTAAGCCCCTGAATTAAGCAGAAAGTCTTCAT800GGCTTTTCTGGTCTTCGGCTGCTCAGGGTTCATCTGAAGA840TTCGAATGAAAAGAAATGCATGTTTCCTGCTCTTCCCTCA880TTAAATTGCTTTTAATTCCA900cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。