演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SPRR3

small proline rich protein 3

SPRR3(small proline rich protein 3)是 cornifin(SPRR)家族的蛋白質,與角質形成細胞的交聯包膜相關。

Homo sapiens1q21.3UniProt Q9UBC9
OFFICIAL SYMBOL
SPRR3
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q9UBC9
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SPRR3(small proline rich protein 3)是蛋白質編碼基因,產物屬於 cornifin(SPRR)家族。其蛋白質長 169 個胺基酸,序列中包含約 14 個串聯重複區,每個重複單位約 8 個胺基酸;另有註記指出蛋白質部分區段呈無序特性。這些資料提供其家族歸屬與序列組成的基本描述。

Official symbol
SPRR3
Gene name
small proline rich protein 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11268
UniProt
Q9UBC9
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q21.3
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegSPRR3pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:153,001,743–153,003,859
Gene span
2,117 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000295367 ★153,001,749–153,003,8562
ENST00000331860153,001,743–153,003,8563
ENST00001098340153,001,743–153,003,8592
ENST00001098341153,001,743–153,003,8562
ENST00001098342153,001,743–153,003,8563
ENST00001098343153,001,743–153,003,8562
ENST00001143227153,001,743–153,003,8562
ENST00000443178153,001,751–153,003,4963

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SPRR3 的蛋白質產物與角質形成細胞的交聯包膜相關,來源將其描述為該包膜的交聯蛋白。現有資料未進一步說明交聯的分子方式、作用對象或其對細胞包膜形成的具體影響,因此不宜據此延伸出更詳細的機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 153001749 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SPRR3 ENST00000295367 GRCh38 chr1:153000749-153001849 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTCCTTTCTCCCTTCCATGAACCTACAGCTCTATTCAGGAGAACAATGACTGTCCATTGACTTAACACCC
ATGATAACCAGGCACTGTGTGACGCTGAAGTAGAACAAGGGGCTTTCAGAACCTGGTGGAAGGAGCTGGG
CATCAGGTTCAAGGGAGTAACACAGTCGTGGAACATTGGGAAAGGAGGAGCTATTCACATGCCTGAGATG
TAAGGATGTCTGGATTTTCCAAGGGCCGCGTCTAGTAAGAGAGTGTGTATTGAGGGCAACTCTGAGTTAG
TGACTTGAGGTTCATCCTGTAGTGATCAGAGGAAATGGCTGGTGTATGAACCTAGGGAATCAGCACGCTC
CTCTTCCTATGTCACTCCTGGAGAAGAAAGATACCACAAGAGGCAGGGTCTTCAGGGCTGAGCCACAATG
TCACACAGATCCAGTCAATCCTGCCTGTCCATCTCAATGACATCTACTATCCCTGATCAACACGGCACCT
TAAGGCGCCCTTCACAGTGAAAGCAACTTATTTCCAAAGCAGGCATTTTGCCTTCCATTGCTCCTCCCAG
GTCCAAATCCAGTAAGAGACTGAAAATCAGATGATTCACTTATTCTGCACCATCCCCATGGCCTCGCAGA
ACCAGAAATGCCTATTGTTATTTCCATGTCCACTTCAACCATGAGGAAGCCCAATAGGACTAATCTGGCT
AAAGATTAGGGCCCAGGCCAAGAGGCCTGGCTCGTTCTAGTCCTAGGAGCATGGTACTTCCTCCTAATTT
AATCCATTGCCATTCAAGAAGACCTTTGCCCACAGCAACCACACCACAAAGGGTGGACAGTGAGTCAGGC
CCAGGTGACATCACTGTCAGAGCTTAAGTGACAAAAAATGTTAAGCCAGAGATACTTATCACAAAAGCTG
GAATGAAGTTAGAGCAGTCTTTTAAAAAATCCAATTTTCTTAAGGCAGGGCTCATTTTCTATATAAATAC
CAGCTAACAAGAGACTCTTCACCAGATCCCAGAGGCTGAACACCTCGACCTTCTCTGCACAGCAGGTGAG
TCTCCGCATTAGGAACACCTTAATATTCTCCAATAGTTTCTTTATTTTGAT
SPRR3 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SPRR3_1 ↗1:153,001,749正股153,001,700–153,001,759

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

SPRR3 的調控資訊與表皮角質形成細胞的鱗狀分化時期相關;資料未進一步說明表現變化的方向或調控機制。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:169 aa

1 aa169 aa功能區域重複區
依 Q9UBC9 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SPRR3 蛋白質長 169 個胺基酸,屬於 cornifin(SPRR)家族。其序列註記包含 14 個約 8 個胺基酸的串聯重複區,位於第 43 至 154 個胺基酸;第 1 至 57 位及第 150 至 169 位另被註記為無序區。

重複區143–50 aa
重複區251–58 aa
重複區359–66 aa
重複區467–74 aa
重複區575–82 aa
重複區683–90 aa
重複區791–98 aa
重複區899–106 aa
重複區9107–114 aa
重複區10115–122 aa
重複區11123–130 aa
重複區12131–138 aa
重複區13139–146 aa
重複區14147–154 aa
功能區域Disordered1–57 aa
功能區域14 X 8 AA approximate tandem repeats43–154 aa
功能區域Disordered150–169 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UBC9…

AlphaFold · Q9UBC9

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

SPRR3 的細胞內定位註記為細胞質;資料未提供定位變化的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SPRR3SPRR3JOSD2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SPRR3 蛋白質被描述為角質形成細胞交聯包膜的組成相關蛋白。這筆註記未提供更細的作用機制、參與條件或實驗系統,因此僅能概述其與該包膜交聯的關聯。資料庫紀錄
證據與來源

Cross-linked envelope protein of keratinocytes

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SPRR3 的定位資料將其標示於細胞質。這項註記沒有提供特定細胞狀態、條件、異構型或定位變動資訊,故不據此推定其他細胞區室中的分布。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasm

開啟資料庫紀錄 ↗

調控SPRR3 的調控註記涉及表皮角質形成細胞的鱗狀分化過程。資料沒有指出表現量上升或下降,也未提供調控因子或具體機制,因此僅保留其與此分化階段的關聯。資料庫紀錄
證據與來源

During squamous differentiation of epidermal keratinocytes

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000295367 · 900 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACCAGATCCCAGAGGCTGAACACCTCGACCTTCTCTGCAC40
41AGCAGGTCCAGCATCCTTTGAAGCATGAGTTCTTACCAGC80
81AGAAGCAGACCTTTACCCCACCACCTCAGCTTCAACAGCA120
121GCAGGTGAAACAACCCAGCCAGCCTCCACCTCAGGAAATA160
161TTTGTTCCCACAACCAAGGAGCCATGCCACTCAAAGGTTC200
201CACAACCTGGAAACACAAAGATTCCAGAGCCAGGCTGTAC240
241CAAGGTCCCTGAGCCAGGCTGTACCAAGGTCCCTGAGCCA280
281GGCTGTACCAAGGTCCCTGAGCCAGGTTGTACCAAGGTCC320
321CTGAGCCAGGCTGTACCAAGGTCCCTGAGCCAGGTTGTAC360
361CAAGGTCCCTGAGCCAGGCTACACCAAGGTCCCTGAACCA400
401GGCAGCATCAAGGTCCCTGACCAAGGCTTCATCAAGTTTC440
441CTGAGCCAGGTGCCATCAAAGTTCCTGAGCAAGGATACAC480
481CAAAGTTCCTGTGCCAGGCTACACAAAGCTACCAGAGCCA520
521TGTCCTTCAACGGTCACTCCAGGCCCAGCTCAGCAGAAGA560
561CCAAGCAGAAGTAATTTGGTGCACAGACAAGCCCTTGAGA600
601AGCCAACCACCAGATGCTGGACACCCTCTTCCCATCTGTT640
641TCTGTGTCTTAATTGTCTGTAGACCTTGTAATCAGCACAT680
681TGTCACCCCAAGCCATAGTCTCTCTCTTATTTGTATCCTA720
721AAAATACGTACTATAAAGCTTTTGTTCACACACACTCTGA760
761AGAATCCTGTAAGCCCCTGAATTAAGCAGAAAGTCTTCAT800
801GGCTTTTCTGGTCTTCGGCTGCTCAGGGTTCATCTGAAGA840
841TTCGAATGAAAAGAAATGCATGTTTCCTGCTCTTCCCTCA880
881TTAAATTGCTTTTAATTCCA900

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。