演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SPRR2D

small proline rich protein 2D

SPRR2D 是角質形成細胞的 cornifin(SPRR)家族蛋白,參與細胞膜下不溶性包膜的形成。

Homo sapiens1q21.3UniProt P22532
OFFICIAL SYMBOL
SPRR2D
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P22532
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SPRR2D(small proline rich protein 2D)是蛋白質編碼基因,產物屬於 cornifin(SPRR)家族,與角質形成細胞相關。其蛋白質含有富含脯胺酸的重複序列,家族名稱與這類序列特徵相呼應。來源指出,該蛋白最初位於細胞質,之後參與形成細胞膜下的不溶性包膜;具體交聯過程見功能說明。

Official symbol
SPRR2D
Gene name
small proline rich protein 2D
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11264
UniProt
P22532
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q21.3
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegSPRR2Dpq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:153,039,726–153,066,351
Gene span
26,626 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000360379 ★153,039,732–153,041,1202
ENST00000368758153,039,726–153,041,9312
ENST00000368757153,039,726–153,041,9312
ENST00000368756153,039,726–153,041,9313
ENST00001096735153,039,726–153,066,3512
ENST00001096736153,039,726–153,065,2782
ENST00001096737153,039,726–153,046,3052
ENST00001096738153,039,726–153,046,3053
ENST00001096739153,039,726–153,041,1203
ENST00001096740153,039,726–153,041,1192
ENST00001145413153,039,726–153,041,1202

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SPRR2D 產物是角質形成細胞包膜的交聯蛋白。它先出現在細胞質中,之後由 transglutaminase 促成其與膜蛋白交聯,最終形成位於質膜下方的不溶性包膜。來源未提供其他分子作用或生物學效應的細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 153041120 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SPRR2D ENST00000360379 GRCh38 chr1:153041020-153042120 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AACTTTAAGTGCTCTTACCTTCCTCACTCTGCACACCTACTTCTAATTATTTACATATGATAATGTCTAT
GCAGCTTGTTCTCTATAGGATGTTCACAGGGAACCATATATGCATGGTTCCATACATAGATTTTGAGTCA
ATACTTGTAACTTTAGTTTCCTTCTCTCCATTACTTTTTATAAATAAAAAGGCTGTAGTACACATCCTTG
ATGGCACCAAGTAGCAAACGTGCTGTGGAGACTAGATCTCACTCTCAAATCTGTCCTGGGATGCAAGTGC
CTCTACGAATGTGGTGCAGAAGCTACAAATGTGGTGCAGAAGACAGCTTCAAAGAGGAAAGGAATATAGG
TAAAAATCTGAGGTTTTATCTGAGAAAAAGGTGGCAAAGAAAATTTCAGTCTTGAACAGGGTCAGCAGAT
AGCACAATGTGGTCAGCCTGCAAACCCAGAGGTAAGTATTATTGTCCCCTGTTTATAATCCCAGGGAGGA
GAGGTGACATGCCTGTTGTCATGGAACTTAGCAAAGAAAAAGCTTAGCTCAGGCCTTTGTTAAGTCTCTC
CTTCCTTCTAGCACATTGGCCAACTGTATGAGGAAAGTAGAGGTAGAGTTGGGTTCATGTACAACAATAT
GGCATTCAGCTAGAGTGGATCAGGACAGGAAGTTTTATGACTCAGGGGAGGTAAGATAGGAAGGGATCAT
TGTTCCCAATCAAGAAAGAGAGCCCTTGACAACCGGTTAGAGAATCCCTCCAATTATCTCTCTGACGAAA
GTCACTGAAACTGAGATCTAAGGCAGGTTCTCTGTGACTCATGAGCACTTAACCCAGTGGGGAGATCCCA
GAACAGGATATTTCCTAGTTTGAGAATGCCTCTCATGCCAGATATGGATACATTTGCATTTTACTTTGGA
CATTGCTGGACCAGCCCAGTTTTAGGCAGTTCCACTTCCCACTGGGTGGGGCAGAACGTCCTATAAAGAG
GTTCCCTGCTGCACAACTCTTAAACTCCTGGTACTCTAGCACCGATCTGCTTTGGAGAACCTGGTGAGTG
TGAGTCCTTGAGTTCCTCAGTTCTTTGTGACCTGAAATATTGAATTTAATC
SPRR2D 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SPRR2D_1 ↗1:153,041,119負股153,041,109–153,041,168

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_948Q4R · promoter · 153041110–153041513 · regulatory

· motif · 153042462–153042468 · motif

SPRR2D 與表皮角質形成細胞的鱗狀分化相關;來源未提供更具體的調控方式或條件。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:72 aa

1 aa72 aa功能區域重複區
依 P22532 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SPRR2D 蛋白長 72 個胺基酸,屬於 cornifin(SPRR)家族。第 21–47 位胺基酸區段含三個串聯重複,每個重複為 9 個胺基酸;第 1–20 位及第 33–72 位區段被註記為無序區。

重複區121–29 aa
重複區230–38 aa
重複區339–47 aa
功能區域Disordered1–20 aa
功能區域3 X 9 AA tandem repeats of P-K-C-P-[EQ]-P-C-P-[PS]21–47 aa
功能區域Disordered33–72 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P22532…

AlphaFold · P22532

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

SPRR2D 的細胞內定位記載為細胞質;來源未提供定位變化或異構型差異資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SPRR2DSPRR2D
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SPRR2D 產物是角質形成細胞包膜的交聯蛋白。它最初位於細胞質,之後由 transglutaminase 促成其與膜蛋白交聯,形成質膜下方的不溶性包膜。資料庫紀錄
證據與來源

Cross-linked envelope protein of keratinocytes. It is a keratinocyte protein that first appears in the cell cytosol, but ultimately becomes cross-linked to membrane proteins by transglutaminase. All that results in the formation of an insoluble envelope beneath the plasma membrane

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SPRR2D 的細胞內定位記載為細胞質。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasm

開啟資料庫紀錄 ↗

調控SPRR2D 與表皮角質形成細胞的鱗狀分化相關;來源未說明更具體的調控方式。資料庫紀錄
證據與來源

During squamous differentiation of epidermal keratinocytes

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000360379 · 677 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1TAAACTCCTGGTACTCTAGCACCGATCTGCTTTGGAGAAC40
41CTGATCCTGAGACTCCAGCAGGATGTCTTATCAACAGCAG80
81CAGTGCAAGCAGCCCTGCCAGCCACCTCCTGTGTGCCCCA120
121CGCCAAAGTGCCCAGAGCCATGTCCACCCCCGAAGTGCCC160
161TGAGCCCTGCCCATCACCAAAGTGTCCACAGCCCTGCCCA200
201CCTCAGCAGTGCCAGCAGAAATATCCTCCTGTGACACCTT240
241CCCCACCCTGCCAGCCAAAGTGTCCACCCAAGAGCAAGTA280
281ACAGCTTCAGGATTCATCAGGAGCATGAGAGGATAAGGAT320
321AATTGGCTCACCTCGTTCCACAGCTCCACTTGCATCTTCT360
361CACCAAAGCCTTCCATGGATGCACAGGGAGCTTCTTTCTC400
401CTTAACCTGTGGCCTGCCTGTGATGATCTGTGACAGCAAA440
441AGATTCCCTTTCTGAGGCTGCCATACTGCCACTGTCCAGG480
481TGGAGCTAAGAAAAGGAAGTCCTCAGCTGTGCCAGCTCCC520
521AGAGCTTCGGAAGAAAGAGCAGCAGCTCTCTCCCTGGGAA560
561CCATCAGACAATTCTGTTGATGTGTTCTGTGTCTGTCTGT600
601CACCTGGTCATGAGCTTCTACCACCTTTGCAATTGTCATT640
641TATCTTTCACTCCCTGAATAAAGTATCTATGCATATA677

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。