演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SPRR1A

small proline rich protein 1A

SPRR1A 編碼 small proline rich protein 1A,屬於 cornifin(SPRR)家族,參與角質形成細胞不溶性包膜的形成。

Homo sapiens1q21.3UniProt P35321
OFFICIAL SYMBOL
SPRR1A
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P35321
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SPRR1A 是蛋白質編碼基因,產物為 small proline rich protein 1A,屬於 cornifin(SPRR)家族。來源將其描述為角質形成細胞的包膜蛋白,並指出它在細胞質中出現,之後參與形成位於質膜下方的不溶性包膜。

Official symbol
SPRR1A
Gene name
small proline rich protein 1A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11259
UniProt
P35321
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q21.3
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegSPRR1Apq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:152,984,081–152,985,814
Gene span
1,734 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000368762 ★152,984,081–152,985,8142
ENST00000696219152,984,081–152,985,8132

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

small proline rich protein 1A 是角質形成細胞的交聯包膜蛋白。它最初出現在細胞質中,之後由 transglutaminase 交聯至膜蛋白,最終形成位於質膜下方的不溶性包膜。來源描述的功能重點,是蛋白質由細胞質中的初始狀態轉變為與膜蛋白交聯的包膜組成部分;資料未進一步說明其參與交聯的具體分子步驟或其他生物學作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 152984081 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SPRR1A ENST00000368762 GRCh38 chr1:152983081-152984181 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGAACAGCTCTGACCCTCGGAAAGCCCCCAGGAGATACAGACCCAGAAGGAGGAGGAAAACCTTGCAGCC
AGCAGGATCTCTAGGTATTGGGGCTGGAGCTGGCAGTGGGCAAAAGTGGAGAAGGATTCAGCATTGAGGA
CCCCATGGATGGGCTGCAGGGAGGCAGGTAGAAAAGGCTTTTGGGTTTTCAGGTGGGGGGCAGTCTAGCC
TGATCAGAAAGGAGGAAAAGGCCAGGGCCAGATGTCTGGGTGGAGTGAAGGGAAAAAGTGATCCCAGAAG
AAGGATTAGCCCCTGAAAGTCCCTGAAGTAGGAGAAGGGTAAAGGTGTGGTTGGTGAAGGAAAGCAGGTT
TTCCCAGATTAGCAACCAGTCAGGGGGAGGAAGGTGAGAGTGGGAGAGTCATAAGTAAATTATTCTGAAT
GTGTGTAGTTTAATGGAATTGGGAAAAAGATGGGGGAAATGGATGGAAGGGTCTTGGACTCTGAGACAAG
GGGTCTATAATCAGTCCATTTCATTATTTCTAGCTTCCACCTTCACCAAGGCAGACAAGGAGGGCCCACC
TCAGCTCCTCTGCTCCCCCTCCCTTTCCCACCTATTCATGTGTGCAAGAGTGCCCTGTCCCACAGAACAC
GGGGAACAACCATCTCAATGACAAGGACAGCAGGTGGCAAGGCCTCAACAGGACTCAGATGTCCCCCCAG
GGTTAACTCATGAAACCCTCCATGAAGCCTGCTGCTCACCCCTCCCTCAAGGCAAGCCCTGCACCTGGGT
CTGAGGATGAGGGTGGCAGTGAAAATTAGGCCAGTGACATCATTTTCAGCCAGCCAGTGCCAAAAAATAT
CAGGTGGTGTTCATCAAAAAAGCTGAGCCAACCGGTGATGAGGATGGTAGTGTGAGTCATGTGTGACAGG
TGAGGAATGAAAACAGAGTGCCCGAGAGCTTCTATTTCCTTGAGGCAGGGCTCATTCATCTTATAAAAGC
CAGCTGGCCATTGCCTTCACACCAAACCCAAGGGACCACACAGCCCATTCTGCTCCGTATACCAGGTAAG
TCTCTGATTGCAACAAACTGGCAATTCTAGTGTACTTTTTCATTATTAGAA
SPRR1A 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_948PH7 · promoter · 152983810–152984098 · regulatory

· motif · 152986791–152986802 · motif

在表皮角質形成細胞進行鱗狀分化期間,SPRR1A 受到相關調控;來源未提供調控方式或變化方向的細節。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:89 aa

1 aa89 aa功能區域重複區
依 P35321 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

small proline rich protein 1A 長 89 個胺基酸,屬於 cornifin(SPRR)家族。其序列包含兩段約 12 個胺基酸的重複區,以及一段由六個約 8 個胺基酸串聯重複構成的區域。資料亦將第 1–29 與第 68–89 個胺基酸區段註記為無序區。

重複區13–14 aa
重複區218–29 aa
重複區131–38 aa
重複區239–46 aa
重複區347–54 aa
重複區455–62 aa
重複區563–70 aa
重複區671–78 aa
功能區域Disordered1–29 aa
功能區域2 X 12 AA approximate repeats3–29 aa
功能區域6 X 8 AA approximate tandem repeats31–78 aa
功能區域Disordered68–89 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P35321…

AlphaFold · P35321

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

small proline rich protein 1A 的來源定位記錄為細胞質;功能描述亦指出它最初出現在細胞質中。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SPRR1ASPRR1AGLIS1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能small proline rich protein 1A 是角質形成細胞的交聯包膜蛋白。它先出現在細胞質,之後由 transglutaminase 與膜蛋白交聯,形成位於質膜下方的不溶性包膜。資料庫紀錄
證據與來源

Cross-linked envelope protein of keratinocytes. It is a keratinocyte protein that first appears in the cell cytosol, but ultimately becomes cross-linked to membrane proteins by transglutaminase. All that results in the formation of an insoluble envelope beneath the plasma membrane

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位small proline rich protein 1A 的細胞內定位記錄為細胞質;此項資料只指出其定位,未提供其他條件或細胞內位置的描述。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasm

開啟資料庫紀錄 ↗

調控在表皮角質形成細胞進行鱗狀分化期間,SPRR1A 與此分化階段相關。來源未說明其表現量的變化方向,也未提供更具體的調控機制。資料庫紀錄
證據與來源

During squamous differentiation of epidermal keratinocytes

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000368762 · 648 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACCAAACCCAAGGGACCACACAGCCCATTCTGCTCCGTAT40
41ACCAGAAAAAAACACATTTGAAGCATGAATTCTCAGCAGC80
81AGAAGCAGCCTTGCACCCCACCCCCTCAGCCTCAGCAGCA120
121GCAGGTGAAACAACCTTGCCAGCCTCCACCCCAGGAACCA160
161TGCATCCCCAAAACCAAGGAGCCCTGCCACCCCAAGGTGC200
201CTGAGCCCTGCCACCCCAAAGTGCCTGAGCCCTGCCAGCC240
241CAAGGTTCCAGAGCCCTGCCAGCCCAAGGTGCCTGAGCCC280
281TGCCCTTCAACGGTCACTCCAGCACCAGCCCAGCAGAAGA320
321CCAAGCAGAAGTAATGTGGTCCACAGCCATGCCCTTGAGG360
361AGCTGGCCACTGGATACTGAACACCCTACTCCATTCTGCT400
401TATGAATCCCATTTGCCTATTGACCCTGCAGTTAGCATGC440
441TGTCACCCTGAATCATAATCGCTCCTTTGCACCTCTAAAA480
481AGATGTCCCTTACCCTCATTCTGGAGGGCTCCTGAGCCTC520
521TGCGTAAGGCTGAACGTCTCACTGACTGAGCTAGTCTTCT560
561TGTTGCTCGGGTGCATTTGAGGATGGATTTGGGGAAGGAT600
601CAAGTGAACCATCCCTAGTCTTCCTTCAATAAATAACTTT640
641TAACTCCA648

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。