基因總覽
SPP2 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 secreted phosphoprotein 2。其蛋白質產物屬於 SPP2 family,長度為 211 個胺基酸;序列前端第 1 至 29 個胺基酸被註記為訊號胜肽。這項序列特徵與其分泌型定位註記相符。現有資料將 SPP2 與骨骼周轉的一個面向連結,但未提供更細的作用機制或相關生物學條件。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000168148 ★ | 234,050,702–234,077,134 | 8 |
| ENST00000373368 | 234,050,617–234,077,130 | 8 |
| ENST00000874733 | 234,050,617–234,079,344 | 8 |
| ENST00000874734 | 234,050,617–234,079,344 | 8 |
| ENST00000874735 | 234,050,617–234,079,252 | 8 |
| ENST00000874736 | 234,050,617–234,077,132 | 8 |
| ENST00000874737 | 234,050,617–234,079,338 | 7 |
| ENST00000874738 | 234,050,617–234,079,338 | 6 |
| ENST00000874739 | 234,050,617–234,074,999 | 8 |
| ENST00000874740 | 234,050,617–234,075,000 | 8 |
| ENST00000874741 | 234,050,617–234,074,980 | 8 |
| ENST00000874742 | 234,050,617–234,074,999 | 7 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SPP2 的功能註記指出,它可能協調骨骼周轉(bone turnover)的某個面向。此描述保留了不確定性:目前資料僅支持「可能」參與協調,沒有指出其作用方向,也沒有界定所涉及的骨骼周轉環節。
因此,現有資訊可將 SPP2 與骨骼周轉的調節聯繫起來,但不能據此推定它會促進或抑制骨骼形成、分解或其他特定過程。資料亦未說明其分子作用方式、作用對象或調控條件,故無法進一步描述具體機制或其生物學後果。
Promoter 與基因調控
>SPP2 ENST00000168148 GRCh38 chr2:234049702-234050802 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGTGGGGGGCTGGGGGAGGGATAGTATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATGATGGGTTGATGGGTGCAGC AAACAACCATGGCACATGTATACCTATGTAACAAACCTGAAGGTTCTGCACATGTGCCCCAGAACTTAAA GTATATATTTAAAAAATCTCTCTTTTTCTTTCCCTCTATATTTTGGTTCTCCTTTCTGGAGAACCCTGAC TAAGAACACACCTGACCTCTAACCATTTATGCCTATTTTATAGATGAGAAAATTGAGGTTCAGAGGTGTT GAGTGCCATGCCCAAGGGGATACTCCTGGTACATGGTAGAGCCAAGATCTCAGTCCAGGTCTTTCTGAGA CAAAACACAGCTTCTTATGCGTGAAATCCACAAATAAGAACACAATGACCTACATACAACACAAACTGTA CTTCCAATTAAGTAGTTCTCCTTTTTAATCATTCAAAAACTACCTTGGGATCTTACAGTGCATGGGAATC ATCAATATGTAAATACCTTATTATCCAGGTGATGTGCAAAAGTGTCCAGTAGCACAGAAGATTGGTTAAT AGGATGGTGTGTCCCAGCTTTTTACTGCACTTGTACTTGCTTCGAATATTTAGGACCCCTATATAAAATT ATCTTCTCCAAAGTCATAATTTCCAAGAAGATCTTATACCCACACTATTTTCATAAGTAGTCAACTGCAA GATCTTTAGAACCATGAGGGGATCTCAATACACAACAATTTAAGATTAACCATTTTGTTGAATGTAAGAT TATATCCCCTCCAAAGAATGAAATTAAAATAGAGAAAAATAAACAGCACACGTGGAATCCTGAGCCTCTT GATGCCTTTTGCCTTGGGCTAAAGTTCTCTTGTGAGTTGTAAACTTCAAAAGTGTCCTCAAACTGGAACC TTTCCATAGGAAAAGTCAGCAGAAAATATTGACCCCAGGATCAATTGTTTCTGTTTAAGTTACAGATTGC TGCAGTCAAAATAAGCAGCCAGTGTTTGATAAAGACAGCTCCTCTTAGGAAGAACTGTCATCCCCAAACA CATAGAGAGACACTCTCTGTCTCTCGATTACAATCATGATTTCCAGAATGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPP2_1 ↗ | 2:234,050,741 | 正股 | 234,050,692–234,050,751 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 234050556–234050571 · motif
· motif · 234050556–234050571 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:211 aa
SPP2 蛋白質長 211 個胺基酸,屬於 SPP2 family。其第 1 至 29 個胺基酸區段註記為訊號胜肽;來源未提供其他功能區域或結構特徵的描述。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SPP2 的定位註記為分泌型。 現有資料未提供其定位隨條件改變的情形、異構型差異或動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGTGTTTGATAAAGACAGCTCCTCTTAGGAAGAACTGTCA40TCCCCAAACACATAGAGAGACACTCTCTGTCTCTCGATTA80CAATCATGATTTCCAGAATGGAGAAGATGACGATGATGAT120GAAGATATTGATTATGTTTGCTCTTGGAATGAACTACTGG160TCTTGCTCAGGTTTCCCAGTGTACGACTACGATCCATCCT200CCTTAAGGGATGCCCTCAGTGCCTCTGTGGTAAAAGTGAA240TTCCCAGTCACTGAGTCCGTATCTGTTTCGGGCATTCAGA280AGCTCATTAAAAAGAGTTGAGGTCCTAGATGAGAACAACT320TGGTCATGAATTTAGAGTTCAGCATCCGGGAGACTACATG360CAGGAAGGATTCTGGAGAAGATCCCGCTACATGTGCCTTC400CAGAGGGACTACTATGTGTCCACAGCTGTTTGCAGAAGCA440CCGTGAAGGTATCTGCCCAGCAGGTGCAGGGCGTGCATGC480TCGCTGCAGCTGGTCCTCCTCCACGTCTGAGTCTTACAGC520AGCGAAGAGATGATTTTTGGGGACATGTTGGGATCTCATA560AATGGAGAAACAATTATCTATTTGGTCTCATTTCAGACGA600GTCCATAAGTGAACAATTTTATGATCGGTCACTTGGGATC640ATGAGAAGGGTATTGCCTCCTGGAAACAGAAGGTACCCAA680ACCACCGGCACAGAGCAAGAATAAATACTGACTTTGAGTA720ACGGCCTTGAGGTGTCCCTCGCCCTTTTGGTTTGTTCAAG760GAGCTGCTGCTTTGCATAGCTGCTCTAGTGTCTGGTATCA800TCGGATCTGGTTTTGAATAATTCCCAGGAGTCCTGGGTCC840CTGGCCTCCAAAGCTGGAATGTGAACGCATGCCACGGTGG880TCTGACCCTCACACTCCTTTTCTCTTAACAGCAAAATGCA920ATGGAAGGAAGAAAAGTTCCAACAAAGAATGATTTTGTGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。