演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SPP2SPP24

secreted phosphoprotein 2

SPP2(secreted phosphoprotein 2)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 SPP2 family,具有訊號胜肽,並被註記為分泌型蛋白質。

Homo sapiens2q37.1UniProt Q13103
OFFICIAL SYMBOL
SPP2
CHROMOSOME
2
UNIPROT
Q13103
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SPP2 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 secreted phosphoprotein 2。其蛋白質產物屬於 SPP2 family,長度為 211 個胺基酸;序列前端第 1 至 29 個胺基酸被註記為訊號胜肽。這項序列特徵與其分泌型定位註記相符。現有資料將 SPP2 與骨骼周轉的一個面向連結,但未提供更細的作用機制或相關生物學條件。

Official symbol
SPP2
Gene name
secreted phosphoprotein 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11256
UniProt
Q13103
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SPP24

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q37.1
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegSPP2pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr2:234,050,617–234,108,287
Gene span
57,671 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000168148 ★234,050,702–234,077,1348
ENST00000373368234,050,617–234,077,1308
ENST00000874733234,050,617–234,079,3448
ENST00000874734234,050,617–234,079,3448
ENST00000874735234,050,617–234,079,2528
ENST00000874736234,050,617–234,077,1328
ENST00000874737234,050,617–234,079,3387
ENST00000874738234,050,617–234,079,3386
ENST00000874739234,050,617–234,074,9998
ENST00000874740234,050,617–234,075,0008
ENST00000874741234,050,617–234,074,9808
ENST00000874742234,050,617–234,074,9997

顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SPP2 的功能註記指出,它可能協調骨骼周轉(bone turnover)的某個面向。此描述保留了不確定性:目前資料僅支持「可能」參與協調,沒有指出其作用方向,也沒有界定所涉及的骨骼周轉環節。

因此,現有資訊可將 SPP2 與骨骼周轉的調節聯繫起來,但不能據此推定它會促進或抑制骨骼形成、分解或其他特定過程。資料亦未說明其分子作用方式、作用對象或調控條件,故無法進一步描述具體機制或其生物學後果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 234050702 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SPP2 ENST00000168148 GRCh38 chr2:234049702-234050802 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGTGGGGGGCTGGGGGAGGGATAGTATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATGATGGGTTGATGGGTGCAGC
AAACAACCATGGCACATGTATACCTATGTAACAAACCTGAAGGTTCTGCACATGTGCCCCAGAACTTAAA
GTATATATTTAAAAAATCTCTCTTTTTCTTTCCCTCTATATTTTGGTTCTCCTTTCTGGAGAACCCTGAC
TAAGAACACACCTGACCTCTAACCATTTATGCCTATTTTATAGATGAGAAAATTGAGGTTCAGAGGTGTT
GAGTGCCATGCCCAAGGGGATACTCCTGGTACATGGTAGAGCCAAGATCTCAGTCCAGGTCTTTCTGAGA
CAAAACACAGCTTCTTATGCGTGAAATCCACAAATAAGAACACAATGACCTACATACAACACAAACTGTA
CTTCCAATTAAGTAGTTCTCCTTTTTAATCATTCAAAAACTACCTTGGGATCTTACAGTGCATGGGAATC
ATCAATATGTAAATACCTTATTATCCAGGTGATGTGCAAAAGTGTCCAGTAGCACAGAAGATTGGTTAAT
AGGATGGTGTGTCCCAGCTTTTTACTGCACTTGTACTTGCTTCGAATATTTAGGACCCCTATATAAAATT
ATCTTCTCCAAAGTCATAATTTCCAAGAAGATCTTATACCCACACTATTTTCATAAGTAGTCAACTGCAA
GATCTTTAGAACCATGAGGGGATCTCAATACACAACAATTTAAGATTAACCATTTTGTTGAATGTAAGAT
TATATCCCCTCCAAAGAATGAAATTAAAATAGAGAAAAATAAACAGCACACGTGGAATCCTGAGCCTCTT
GATGCCTTTTGCCTTGGGCTAAAGTTCTCTTGTGAGTTGTAAACTTCAAAAGTGTCCTCAAACTGGAACC
TTTCCATAGGAAAAGTCAGCAGAAAATATTGACCCCAGGATCAATTGTTTCTGTTTAAGTTACAGATTGC
TGCAGTCAAAATAAGCAGCCAGTGTTTGATAAAGACAGCTCCTCTTAGGAAGAACTGTCATCCCCAAACA
CATAGAGAGACACTCTCTGTCTCTCGATTACAATCATGATTTCCAGAATGG
SPP2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SPP2_1 ↗2:234,050,741正股234,050,692–234,050,751

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 234050556–234050571 · motif

· motif · 234050556–234050571 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:211 aa

1 aa211 aa訊號胜肽
依 Q13103 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SPP2 蛋白質長 211 個胺基酸,屬於 SPP2 family。其第 1 至 29 個胺基酸區段註記為訊號胜肽;來源未提供其他功能區域或結構特徵的描述。

訊號胜肽1–29 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q13103…

AlphaFold · Q13103

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

SPP2 的定位註記為分泌型。 現有資料未提供其定位隨條件改變的情形、異構型差異或動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SPP24SPP2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SPP2 可能協調骨骼周轉中的某個面向。此敘述保留可能性,未指明作用方向、所涉環節或具體機制。推論支持
證據與來源

Could coordinate an aspect of bone turnover

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted資料庫紀錄
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000168148 · 1,021 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTGTTTGATAAAGACAGCTCCTCTTAGGAAGAACTGTCA40
41TCCCCAAACACATAGAGAGACACTCTCTGTCTCTCGATTA80
81CAATCATGATTTCCAGAATGGAGAAGATGACGATGATGAT120
121GAAGATATTGATTATGTTTGCTCTTGGAATGAACTACTGG160
161TCTTGCTCAGGTTTCCCAGTGTACGACTACGATCCATCCT200
201CCTTAAGGGATGCCCTCAGTGCCTCTGTGGTAAAAGTGAA240
241TTCCCAGTCACTGAGTCCGTATCTGTTTCGGGCATTCAGA280
281AGCTCATTAAAAAGAGTTGAGGTCCTAGATGAGAACAACT320
321TGGTCATGAATTTAGAGTTCAGCATCCGGGAGACTACATG360
361CAGGAAGGATTCTGGAGAAGATCCCGCTACATGTGCCTTC400
401CAGAGGGACTACTATGTGTCCACAGCTGTTTGCAGAAGCA440
441CCGTGAAGGTATCTGCCCAGCAGGTGCAGGGCGTGCATGC480
481TCGCTGCAGCTGGTCCTCCTCCACGTCTGAGTCTTACAGC520
521AGCGAAGAGATGATTTTTGGGGACATGTTGGGATCTCATA560
561AATGGAGAAACAATTATCTATTTGGTCTCATTTCAGACGA600
601GTCCATAAGTGAACAATTTTATGATCGGTCACTTGGGATC640
641ATGAGAAGGGTATTGCCTCCTGGAAACAGAAGGTACCCAA680
681ACCACCGGCACAGAGCAAGAATAAATACTGACTTTGAGTA720
721ACGGCCTTGAGGTGTCCCTCGCCCTTTTGGTTTGTTCAAG760
761GAGCTGCTGCTTTGCATAGCTGCTCTAGTGTCTGGTATCA800
801TCGGATCTGGTTTTGAATAATTCCCAGGAGTCCTGGGTCC840
841CTGGCCTCCAAAGCTGGAATGTGAACGCATGCCACGGTGG880
881TCTGACCCTCACACTCCTTTTCTCTTAACAGCAAAATGCA920
921ATGGAAGGAAGAAAAGTTCCAACAAAGAATGATTTTGTGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。