基因總覽
SPP1（secreted phosphoprotein 1）是蛋白質編碼基因，其產物 Osteopontin 屬於 osteopontin family。蛋白質全長為 314 個胺基酸，序列具有 N 端訊號胜肽，並含有一段註記為無序區域的序列，以及細胞附著位點。來源將 Osteopontin 描述為骨中非膠原蛋白，並指出它可緊密結合 hydroxyapatite；其在礦化基質中的角色及與細胞—基質互動的關係，則以可能性描述。除此之外，來源也將它列為參與免疫細胞激素調節的 cytokine。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000395080 ★ | 87,975,714–87,983,411 | 7 |
| ENST00000237623 | 87,975,667–87,983,529 | 6 |
| ENST00000682655 | 87,975,667–87,981,991 | 6 |
| ENST00000360804 | 87,975,667–87,983,529 | 6 |
| ENST00000882522 | 87,975,667–87,983,529 | 7 |
| ENST00000882523 | 87,975,667–87,983,529 | 7 |
| ENST00000882525 | 87,975,667–87,983,529 | 6 |
| ENST00000920430 | 87,975,667–87,983,529 | 7 |
| ENST00001140463 | 87,975,667–87,983,529 | 7 |
| ENST00000508233 | 87,975,714–87,982,896 | 5 |
| ENST00000882524 | 87,975,714–87,983,529 | 5 |
| ENST00000942420 | 87,975,714–87,983,529 | 5 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
在骨組織中，Osteopontin 是一種非膠原蛋白，可與 hydroxyapatite 緊密結合。來源指出它似乎是礦化基質的組成部分，並可能在細胞與基質互動中具有重要作用；這些描述帶有推測性，不能據此將其作用表述為已確立的機制。
Osteopontin 也具有 cytokine 作用，參與調節免疫相關細胞激素的生成。來源指出，它可促進 interferon-gamma 與 interleukin-12 的產生，同時降低 interleukin-10 的產生。這些方向性描述提供了其免疫調節作用的概況，但來源未進一步說明相關細胞、作用條件或分子機制。
此外，來源將 Osteopontin 列為導向 type I immunity 路徑中不可或缺的因子。此處所述的功能與其調節多種細胞激素生成相連，但資料未提供更細節的路徑步驟。上述骨基質與免疫功能均依據所提供的註解整理；骨基質相關描述含有「可能」的限定，免疫功能則未在來源中附帶具體實驗情境。
Promoter 與基因調控
>SPP1 ENST00000395080 GRCh38 chr4:87974714-87975814 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTGCAAAATTTCCTTATTGATGCATACAATTTAAAGATCTTACGTCTACTCTCATTTTAATAACCTGTTC TTTTAAAGGACATTACAATTCGTGACTGCCTGCCCCTCTTAAAAATTTCATAATAGTTAACACACATATA GTCCTTAAGATACGCAGAGCATTTGCATCTAATATGTGCTAAGCATTGCTAGTTTAACATACTAATTCAT TTAAACCCCTCAAAAACCCCATGACCTAGGTAATAGTATTGCATTTCATGGATGAGGGAACAAGGATAGG TAGGCTGGGCGATTTGCCCAAGGTTGCACAGGTCAGCAGTGACACAGCGGAATTCAGAACCACGGTCTGG CTCCTGAAGCAGCCCTCTCAAGCAGTCATCCTGCTCTCAGTCAGAAACTGCTTTACTTCTGCAACATCTA GAATAAATTACCATTCTTCTATTTCATATAGAATTTTATATTTTAATGTCACTAGTGCCATTTGTCTAAG TAACAAGCTACTGCATACTCGAAATCACAAAGCTAAGCTTGAGTAGTAAAGGACAGAGGCAAGTTTTCTG AACTCCTTGCAGGCTTGAACAATAGCCTTCTGGCTCTTCAATAAGTACAATCATACAGGCAAGAGTGGTT GCAGATATTACCTTTATGTTACTTAAACCGAAAGAAACAAAAATCCATTCTATTTAATTTTACATTAATG TTTTTCCCTACTTTCTCCCTTTTTCATGGGATCCCTAAGTGCTCTTCCTGGATGCTGAATGCCCATCCCG TAAATGAAAAAGCTAGTTAATGATATTGTACATAAGTAATGTTTTAACTGTAGATTGTGTGTGTGCGTTT TTGTTTTTTTTTGTTTTAACCACAAAACCAGAGGGGGAAGTGTGGGAGCAGGTGGGCTGGGCAGTGGCAG AAAACCTCATGACACAATCTCTCCGCCTCCCTGTGTTGGTGGAGGATGTCTGCAGCAGCATTTAAATTCT GGGAGGGCTTGGTTGTCAGCAGCAGCAGGAGGAGGCAGAGCACAGCATCGTCGGGACCAGACTCGTCTCA GGCCAGTTGCAGCCTTCTCAGCCAAACGCCGACCAAGGTACAGCTTCAGTT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPP1_1 ↗ | 4:87,975,714 | 正股 | 87,975,665–87,975,724 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR4_939WR9 · enhancer · 87973227–87973712 · regulatory
ENSR4_939WRD · promoter · 87973713–87974012 · regulatory
ENSR4_5QNNN2 · CTCF_binding_site · 87973768–87973789 · regulatory
ENSR4_BMGDX · promoter · 87975177–87975839 · regulatory
ENSR4_5QNNZN · CTCF_binding_site · 87975643–87975664 · regulatory
ENSR4_84KSNN · enhancer · 87978755–87979001 · regulatory
· motif · 87973770–87973786 · motif
· motif · 87975570–87975578 · motif
· motif · 87975570–87975585 · motif
· motif · 87975570–87975587 · motif
· motif · 87975645–87975661 · motif
· motif · 87978904–87978918 · motif
· motif · 87978904–87978918 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：314 aa
Osteopontin 全長 314 個胺基酸，N 端第 1–16 位為訊號胜肽；第 41–290 位註記為無序區域。第 159–161 位具有細胞附著位點。此蛋白質屬於 osteopontin family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Osteopontin 被註記為分泌型蛋白質。 來源未提供其定位隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- BAG6P46379-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM20CQ8IXL6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- GET3O43681 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEOX2P50222 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NCS1P62166 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SGTAO43765 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- SGTBQ96EQ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
Osteopontin 可透過 N 端與 integrin ITGA9:ITGB1 互作。來源描述的是蛋白質互作，未進一步說明其是否形成更大的複合體或互作的功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Osteopontin 是骨中的主要非膠原蛋白，能與 hydroxyapatite 緊密結合；來源指出它似乎是礦化基質的組成部分，並可能對細胞與基質之間的互動具有重要作用。 | 推論支持 | 證據與來源Major non-collagenous bone protein that binds tightly to hydroxyapatite. Appears to form an integral part of the mineralized matrix. Probably important to cell-matrix interaction |
| 功能 | Osteopontin 具有 cytokine 作用，參與增強 interferon-gamma 與 interleukin-12 的生成，並降低 interleukin-10 的生成；來源指出它是導向 type I immunity 的路徑中不可或缺的因子。 | 推論支持 | 證據與來源Acts as a cytokine involved in enhancing production of interferon-gamma and interleukin-12 and reducing production of interleukin-10 and is essential in the pathway that leads to type I immunity |
| 交互作用 | Osteopontin 透過其 N 端與 integrin ITGA9:ITGB1 互作；來源未進一步說明此互作的功能後果或是否涉及其他複合體。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGCAGCAGGAGGAGGCAGAGCACAGCATCGTCGGGACCAG40ACTCGTCTCAGGCCAGTTGCAGCCTTCTCAGCCAAACGCC80GACCAAGGAAAACTCACTACCATGAGAATTGCAGTGATTT120GCTTTTGCCTCCTAGGCATCACCTGTGCCATACCAGTTAA160ACAGGCTGATTCTGGAAGTTCTGAGGAAAAGCAGCTTTAC200AACAAATACCCAGATGCTGTGGCCACATGGCTAAACCCTG240ACCCATCTCAGAAGCAGAATCTCCTAGCCCCACAGAATGC280TGTGTCCTCTGAAGAAACCAATGACTTTAAACAAGAGACC320CTTCCAAGTAAGTCCAACGAAAGCCATGACCACATGGATG360ATATGGATGATGAAGATGATGATGACCATGTGGACAGCCA400GGACTCCATTGACTCGAACGACTCTGATGATGTAGATGAC440ACTGATGATTCTCACCAGTCTGATGAGTCTCACCATTCTG480ATGAATCTGATGAACTGGTCACTGATTTTCCCACGGACCT520GCCAGCAACCGAAGTTTTCACTCCAGTTGTCCCCACAGTA560GACACATATGATGGCCGAGGTGATAGTGTGGTTTATGGAC600TGAGGTCAAAATCTAAGAAGTTTCGCAGACCTGACATCCA640GTACCCTGATGCTACAGACGAGGACATCACCTCACACATG680GAAAGCGAGGAGTTGAATGGTGCATACAAGGCCATCCCCG720TTGCCCAGGACCTGAACGCGCCTTCTGATTGGGACAGCCG760TGGGAAGGACAGTTATGAAACGAGTCAGCTGGATGACCAG800AGTGCTGAAACCCACAGCCACAAGCAGTCCAGATTATATA840AGCGGAAAGCCAATGATGAGAGCAATGAGCATTCCGATGT880GATTGATAGTCAGGAACTTTCCAAAGTCAGCCGTGAATTC920CACAGCCATGAATTTCACAGCCATGAAGATATGCTGGTTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。