基因總覽
SPON2 是蛋白質編碼基因，其產物 spondin 2 為細胞黏附蛋白。來源資料指出，這種蛋白與胚胎海馬神經元的黏附及突出生長有關，也能直接結合細菌及其成分。它在細胞外基質中具有辨識微生物病原體的作用；此項免疫功能註記為依相似性推定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000290902 ★ | 1,166,932–1,172,583 | 6 |
| ENST00000431380 | 1,166,928–1,173,520 | 7 |
| ENST00000617421 | 1,166,928–1,208,962 | 8 |
| ENST00000889071 | 1,166,928–1,205,135 | 9 |
| ENST00000960395 | 1,166,928–1,172,849 | 6 |
| ENST00000960396 | 1,166,928–1,172,849 | 3 |
| ENST00000960397 | 1,166,928–1,172,849 | 6 |
| ENST00000982930 | 1,166,928–1,172,849 | 7 |
| ENST00001044171 | 1,166,928–1,172,849 | 5 |
| ENST00001134583 | 1,166,928–1,172,849 | 6 |
| ENST00001044172 | 1,166,935–1,172,849 | 7 |
| ENST00000503765 | 1,171,381–1,173,211 | 4 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
spondin 2 具有細胞黏附相關功能，能促進胚胎海馬神經元黏附及突出生長。來源未進一步說明此作用的分子機制或實驗條件，因此可確定的描述限於其與上述神經元特性的關聯。
在先天免疫方面，spondin 2 可直接結合細菌及其成分，並能結合細菌脂多醣（LPS）。它也可作為調理素，促進巨噬細胞對細菌的吞噬。這些描述指出，spondin 2 能連結對細菌的辨識與巨噬細胞吞噬作用；來源並未提供更細的結合或吞噬機制。
來源另將 spondin 2 描述為先天免疫反應啟動所必需，並指出它是細胞外基質中一種獨特的微生物病原體模式識別分子。不過，這些免疫功能標示為依相似性推定，應保留其推論性質，不宜視為已由此資料直接證實。
Promoter 與基因調控
>SPON2 ENST00000290902 GRCh38 chr4:1172483-1173583 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCGCTCTGTTTCCAGATCCCATGACTGGGGACCTATAAATATTTTCCTGACATGGAGCAGGATCAACTTC AGCATCTGTTAGCTTCATCCCAAAGGCAGGGAAGCCTAGAGCCCCTGGGAGGGCTCTGCACCGCACACAC CGCCGGCCTGCAGCCCCAGCCCTGTGCGGGGTCCTGGGGAGGGGGGCCCCCTTTCTGTGGCTCTTCCTGA CTCCCTGCGCGTTCCACCCCAGACCCTCAGCCCACTCTGACCTCCCTCCAGGAGGGATGGCTTGCAAATG CCCTCTGGCCACAGTGCAGACCGCTAGGCTGTTCTGTGCAGCTTTAGGCCATGCCAGGAAAGAGACTTAA AGCCAGGGCCCCAAAGGCCAGGGATGCCTGCGCCGGGAGCCAGGAGCTTCCCCAGCCACTTCCAGCATGT AGACTGAAGTCAGGCCACGCACAGGGCTCTCCAGGTCACACCCTGCGCAAGAAGGTGTAGCACGCTGGCT CTAATTTCGAGAAGGTGAAAACAAGAGCCCCTCTGCCCCCACGCCCTGAGCTTTCCCGAAAGGCTTGGGG CAAAGAACTCCCCTCAGTGGCACCTAGGGAGGCACCAGGAAGGCGCTTGTTGGAACGGGAGAGAAACGGG GAGAGGGAGGAGGACAGGGGGGAGGGGAGGAGGGGAGGGGAGGAGGGGAGGGGAGGAGGGGAGGGGAGGG GAAGGGAGGGGACAGGGAGGGGAGGGGAGGGATAGGACAGACAGACAAAGAAAGGGGTGCGGCAGCACTG CCAGGGGAAGAGGGTGATCCGACCCGGGGAAGGTCGCTGGGCAGGGCGAGTTGGGAAAGCGGCAGCCCCC GCCGCCCCCGCAGCCCCTTCTCCTCCTTTCTCCCACGTCCTATCTGCCTCTCGCTGGAGGCCAGGCCGTG CAGCATCGAAGACAGGAGGAACTGGAGCCTCATTGGCCGGCCCGGGGCGCCGGCCTCGGGCTTAAATAGG AGCTCCGGGCTCTGGCTGGGACCCGACCGCTGCCGGCCGCGCTCCCGCTGCTCCTGCCGGGTGAGTACTG CGTGCCCCCGGGACACCCAGAGAGGGCCCGGGCCTCCTGCACTTTCCCCGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPON2_1 ↗ | 4:1,172,583 | 負股 | 1,172,573–1,172,632 |
| SPON2_2 ↗ | 4:1,172,805 | 負股 | 1,172,795–1,172,854 |
| SPON2_3 ↗ | 4:1,201,430 | 負股 | 1,201,420–1,201,479 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR4_9GHS · promoter · 1167288–1167788 · regulatory
ENSR4_C55J · enhancer · 1167789–1169178 · regulatory
ENSR4_59F99 · CTCF_binding_site · 1167963–1167984 · regulatory
ENSR4_59FSF · CTCF_binding_site · 1171234–1171255 · regulatory
ENSR4_59FTS · CTCF_binding_site · 1171540–1171561 · regulatory
ENSR4_59FW6 · CTCF_binding_site · 1171613–1171634 · regulatory
ENSR4_9GKC · promoter · 1172573–1173073 · regulatory
ENSR4_9GKJ · promoter · 1173201–1173701 · regulatory
ENSR4_B8BC · enhancer · 1177132–1177938 · regulatory
· motif · 1167686–1167697 · motif
· motif · 1167941–1167954 · motif
· motif · 1167952–1167965 · motif
· motif · 1167952–1167965 · motif
· motif · 1167965–1167981 · motif
· motif · 1169791–1169804 · motif
· motif · 1171236–1171252 · motif
· motif · 1171542–1171558 · motif
· motif · 1171615–1171631 · motif
· motif · 1173827–1173837 · motif
· motif · 1176883–1176895 · motif
· motif · 1176956–1176963 · motif
· motif · 1177093–1177105 · motif
· motif · 1177095–1177102 · motif
· motif · 1177403–1177411 · motif
· motif · 1177444–1177454 · motif
· motif · 1177483–1177493 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：331 aa
spondin 2 長 331 個胺基酸。其序列包含位於第 1 至 26 位的訊號胜肽；Spondin 結構域位於第 31 至 221 位，TSP type-1 結構域則位於第 277 至 331 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
spondin 2 為分泌蛋白，定位於細胞外空間及細胞外基質。 來源未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- ATN1Q86V38 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KLK6Q92876 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT31Q15323 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- PLEKHF2Q9H8W4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
spondin 2 以單體形式存在，並與 integrin 互作。來源未指出兩者是否形成更大的複合體，也未說明此互作的功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | spondin 2 是細胞黏附蛋白，可促進胚胎海馬神經元的黏附與突出生長。它能直接結合細菌及其成分，包括細菌脂多醣（LPS），並作為調理素促進巨噬細胞吞噬細菌。來源依相似性推定，它對先天免疫反應啟動具有必要性，並在細胞外基質中辨識微生物病原體。 | 推論支持 | 證據與來源Cell adhesion protein that promotes adhesion and outgrowth of hippocampal embryonic neurons. Binds directly to bacteria and their components and functions as an opsonin for macrophage phagocytosis of bacteria. Essential in the initiation of the innate immune response and represents a unique pattern-recognition molecule in the ECM for microbial pathogens (By similarity). Binds bacterial lipopolysaccharide (LPS) |
| 交互作用 | spondin 2 以單體形式存在，並與 integrin 互作。這筆資料未說明互作的分子細節、條件或功能後果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | spondin 2 是分泌蛋白，位於細胞外空間及細胞外基質。這筆資料未提供定位改變的條件或異構型差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACCCGACCGCTGCCGGCCGCGCTCCCGCTGCTCCTGCCGG40GTGATGGAAAACCCCAGCCCGGCCGCCGCCCTGGGCAAGG80CCCTCTGCGCTCTCCTCCTGGCCACTCTCGGCGCCGCCGG120CCAGCCTCTTGGGGGAGAGTCCATCTGTTCCGCCAGAGCC160CTGGCCAAATACAGCATCACCTTCACGGGCAAGTGGAGCC200AGACGGCCTTCCCCAAGCAGTACCCCCTGTTCCGCCCCCC240TGCGCAGTGGTCTTCGCTGCTGGGGGCCGCGCATAGCTCC280GACTACAGCATGTGGAGGAAGAACCAGTACGTCAGTAACG320GGCTGCGCGACTTTGCGGAGCGCGGCGAGGCCTGGGCGCT360GATGAAGGAGATCGAGGCGGCGGGGGAGGCGCTGCAGAGC400GTGCACGCGGTGTTTTCGGCGCCCGCCGTCCCCAGCGGCA440CCGGGCAGACGTCGGCGGAGCTGGAGGTGCAGCGCAGGCA480CTCGCTGGTCTCGTTTGTGGTGCGCATCGTGCCCAGCCCC520GACTGGTTCGTGGGCGTGGACAGCCTGGACCTGTGCGACG560GGGACCGTTGGCGGGAACAGGCGGCGCTGGACCTGTACCC600CTACGACGCCGGGACGGACAGCGGCTTCACCTTCTCCTCC640CCCAACTTCGCCACCATCCCGCAGGACACGGTGACCGAGA680TAACGTCCTCCTCTCCCAGCCACCCGGCCAACTCCTTCTA720CTACCCGCGGCTGAAGGCCCTGCCTCCCATCGCCAGGGTG760ACACTGGTGCGGCTGCGACAGAGCCCCAGGGCCTTCATCC800CTCCCGCCCCAGTCCTGCCCAGCAGGGACAATGAGATTGT840AGACAGCGCCTCAGTTCCAGAAACGCCGCTGGACTGCGAG880GTCTCCCTGTGGTCGTCCTGGGGACTGTGCGGAGGCCACT920GTGGGAGGCTCGGGACCAAGAGCAGGACTCGCTACGTCCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。