基因總覽
SPOCK3 是蛋白質編碼基因，其產物為 Testican-3，屬於 SPARC/osteonectin, CWCV, and Kazal-like domains proteoglycan 家族。這是一種分泌型蛋白質，含有 Kazal-like 與 Thyroglobulin type-1 結構域；其序列末端另有一段被註記為無序區域。現有資料指出它可能參與神經生成的不同階段，並可能影響細胞外基質相關的蛋白質加工。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000357545 ★ | 166,733,384–167,234,494 | 11 |
| ENST00000357154 | 166,733,384–167,234,604 | 12 |
| ENST00000504953 | 166,733,384–167,234,796 | 11 |
| ENST00000511531 | 166,733,384–167,234,796 | 12 |
| ENST00000506886 | 166,733,384–167,234,796 | 12 |
| ENST00000535728 | 166,733,384–167,102,557 | 10 |
| ENST00000510741 | 166,733,384–167,234,604 | 10 |
| ENST00000502330 | 166,733,384–167,234,604 | 12 |
| ENST00000512681 | 166,733,384–167,234,604 | 8 |
| ENST00000511269 | 166,733,384–167,234,343 | 10 |
| ENST00000421836 | 166,733,384–167,234,590 | 12 |
| ENST00000541354 | 166,733,384–167,234,426 | 10 |
顯示 12/24 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SPOCK3 的產物 Testican-3 可能參與神經生成的多個階段。現有資料未細分這些階段，也未說明其參與方式，因此目前只能概括描述其與神經生成過程的可能關聯。
在基質金屬蛋白酶調控方面，Testican-3 可抑制 pro-matrix metalloproteinase 2（MMP-2）的加工。此加工由 MT1-MMP 與 MT3-MMP 進行；來源所述的抑制作用，特指這兩種酶對 MMP-2 前驅物的處理，並未提供其他基質金屬蛋白酶或底物的相關作用資訊。
資料另指出，Testican-3 可能干擾腫瘤侵入。這項描述為可能性，來源未交代相關腫瘤類型、實驗系統或具體作用機制，也未將此效果確立為 MMP-2 加工受到抑制的直接結果。因此，腫瘤侵入與前述酶加工調控應視為來源分別提出的功能線索，不宜推定兩者之間具有已證實的因果關係。
Promoter 與基因調控
>SPOCK3 ENST00000357545 GRCh38 chr4:167234394-167235494 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGGGGCTAATTACTGATTTCCTTCCAGTTTATTTAGAATATGTAGAAACGACATGGAAAGCCAAATATTT TGTCATAAATGGAAGTTTGGAATACAAAATTGGTGTTCGGGCTTCAAAACTGTCTTATTTTGCAGGAGGG AGACAGTAGGCTTTTAAAGTTTCCGATTCAGGTTCTACGTTCTAAAATAAAGCTGCCAGGGAGTTTTTAT AAAGGGAAAAATGCAGCTACAGTATGTAGGAGATATAGGTGTTCTCAAACGCCCTACCTCGTTATGCTTC TGTCTCTCAAAACAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACAAAGGAAAAGAAAAAAAG AAACTGCAACCTTTAACATGAAAGTTTGCTGTCGGTAGTAATCCAGAAGCTCACAGCAAACTTTAAATTT TCTGAAATTAAACAGATCTCCCAAGACCTTGTGGATAGATGGCCTTTCTTTAGGGAGGAGCTGAGTTCAG GAGCTTTACAGGGTAGGAAGTCCAGGTATTCTTATTTATTAATGCATAAAGTTTTCCTCAGATCTTGTTT CTCACGTCTGCCTGACAACCCTGGAAATTGTGGAGCAGAGGCAACTGCGAGAGATAGTACACTTTGTGTT AAATCCAGGAGCAGAGAATGAGCAGGCTGTCTCGCGAACATGAGAACCTCTTCTGGAGGGGAGAGGTTAC AAAGCAGATAAGGATTCCTAGGCTAGGAGCTACCTCGTCCTCTGGCTCCAGCCAAGCGTCCTATCCGGAG CCAACTGTAGCTGGGATCCAGCGAGAGGAAGGTGGGATAGGAGGAGGTGGAAGAGGAAAAAAACGGAGGT CGGGGAGGGAGGGGGAACGGAGGGGAGTAAGCTGGAGATCCGCGCGCGAAGGGAGGGTGGAGATGGGGGG AGCGCGCCGGGCGCAGGGAGCTGAGTGGACGGCTCGAGACGGCGGCGCGTGCAGCAGCTCCAGAAAGCAG CGAGTTGGCAGAGCAGGGCTGCATTTCCAGCAGGAGCTGCGAGCACAGTGCTGGCTCACAACAAGGTGAT GTGCCAGGAAGCGGTTTTGTGCCCGCTCGGGCTGCTGCGGCTGGGGCTTGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPOCK3_1 ↗ | 4:167,234,494 | 負股 | 167,234,484–167,234,543 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR4_53GC376 · CTCF_binding_site · 167233709–167233730 · regulatory
ENSR4_53GC38T · CTCF_binding_site · 167234075–167234096 · regulatory
ENSR4_B3874S · promoter · 167234256–167235087 · regulatory
· motif · 167233711–167233727 · motif
· motif · 167234077–167234093 · motif
· motif · 167236183–167236195 · motif
· motif · 167236186–167236193 · motif
· motif · 167236186–167236201 · motif
· motif · 167236193–167236208 · motif
· motif · 167236198–167236210 · motif
· motif · 167236201–167236208 · motif
· motif · 167236391–167236406 · motif
· motif · 167236392–167236405 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：436 aa
Testican-3 長 436 個胺基酸。其 N 端第 1–21 位為訊號肽；第 133–185 位含 Kazal-like 結構域，第 314–380 位含 Thyroglobulin type-1 結構域。第 393–436 位則被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Testican-3 被註記為分泌蛋白，位於細胞外空間與細胞外基質。 來源未提供其定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SPOCK3 產物可能參與神經生成的不同階段；它可抑制 MT1-MMP 與 MT3-MMP 對 pro-matrix metalloproteinase 2（MMP-2）的加工。此外，該蛋白質可能干擾腫瘤侵入，但來源未說明此作用的機制或其與 MMP-2 加工調控的關係。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源May participate in diverse steps of neurogenesis. Inhibits the processing of pro-matrix metalloproteinase 2 (MMP-2) by MT1-MMP and MT3-MMP. May interfere with tumor invasion |
| 細胞定位 | SPOCK3 產物為分泌型蛋白質，定位於細胞外空間及細胞外基質。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GCATTTCCAGCAGGAGCTGCGAGCACAGTGCTGGCTCACA40ACAAGATGCTCAAGGTGTCAGCCGTACTGTGTGTGTGTGC80AGCCGCTTGGTGCAGTCAGTCTCTCGCAGCTGCCGCGGCG120GTGGCTGCAGCCGGGGGGCGGTCGGACGGCGGTAATTTTC160TGGATGATAAACAATGGCTCACCACAATCTCTCAGTATGA200CAAGGAAGTCGGACAGTGGAACAAATTCCGAGACGATGAT240TATTTCCGCACTTGGAGTCCAGGAAAACCCTTCGATCAGG280CTTTAGATCCAGCTAAGGATCCATGCTTAAAGATGAAATG320TAGTCGCCATAAAGTATGCATTGCTCAAGATTCTCAGACT360GCAGTCTGCATTAGTCACCGGAGGCTTACACACAGGATGA400AAGAAGCAGGAGTAGACCATAGGCAGTGGAGGGGTCCCAT440ATTATCCACCTGCAAGCAGTGCCCAGTGGTCTATCCCAGC480CCTGTTTGTGGTTCAGATGGTCATACCTACTCTTTTCAGT520GCAAACTAGAATATCAGGCATGTGTCTTAGGAAAACAGAT560CTCAGTCAAATGTGAAGGACATTGCCCATGTCCTTCAGAT600AAGCCCACCAGTACAAGCAGAAATGTTAAGAGAGCATGCA640GTGACCTGGAGTTCAGGGAAGTGGCAAACAGATTGCGGGA680CTGGTTCAAGGCCCTTCATGAAAGTGGAAGTCAAAACAAG720AAGACAAAAACATTGCTGAGGCCTGAGAGAAGCAGATTCG760ATACCAGCATCTTGCCAATTTGCAAGGACTCACTTGGCTG800GATGTTTAACAGACTTGATACAAACTATGACCTGCTATTG840GACCAGTCAGAGCTCAGAAGCATTTACCTTGATAAGAATG880AACAGTGTACCAAGGCATTCTTCAATTCTTGTGACACATA920CAAGGACAGTTTAATATCTAATAATGAGTGGTGCTACTGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。