基因總覽
SPOCK1 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1。其產物含有 Kazal-like 與 Thyroglobulin type-1 結構域，並具有 N 端訊號序列；這些序列特徵構成其基本分子描述。來源資料將其定位為分泌至細胞外空間及細胞外基質的蛋白質。其可能參與的細胞互動與神經相關作用，詳見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000394945 ★ | 136,975,298–137,499,326 | 11 |
| ENST00001133213 | 136,975,298–137,499,336 | 11 |
| ENST00000510689 | 136,992,554–137,499,299 | 6 |
| ENST00000505690 | 137,112,492–137,498,594 | 4 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SPOCK1 的產物可能參與細胞與細胞之間，以及細胞與細胞外基質之間的互動。現有資料未進一步說明它在這些互動中的具體分子作用方式，因此不宜據此推定其結合對象或作用機制。
在中樞神經系統中，SPOCK1 可能對多種神經機制有所貢獻。來源未指出涉及哪些特定神經過程，也未提供作用條件或實驗情境；因此，這項描述代表可能的功能關聯，不能視為已確立的單一機制或特定生理結果。
Promoter 與基因調控
>SPOCK1 ENST00000394945 GRCh38 chr5:137499226-137500326 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTTATGCAGCCAAAAAATACATGAAAAAATGCTCATCATCACT GGCCATCAGAGCAATGCAAATCAAAACCACTATGAGATATCATCTCACACCAGTTAGAATGGCAATCATT AAAAAGTCAGGAAACAACAGGTGCTGGAGAGGATGTGGAGAAATAGGAACACTTTTACACTGTTGGTGGG ACTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGGATCTAGAACTAGAAATACC ATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGACTATAAATCATGCTGCTATAAAGCCACA TGCACACGTATGTGTATTGCGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCATCAA TGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAAGGATGA GTTCATGTCCTTTGTAGGGACGTGGATGAAATTGGAAACCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAA AAAACCAAACACCGCATATTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACATGGACACAGGAAGG GGAATATCACACTCTGGGGACTGTGGTGGGGTGGGGGGAGTGGGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCT AATGCTAGATGACGAGTTAGTGGGTGCAGCGCACCAGCATGGCACATGTATACATATGTAACTAACCTGC ACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATTAAAAAAAAAAATAGAAGTAAATTAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAGATGTGAATGACCACGTTCCGGGCTGGGGCGGCCGGGCTGTCGGGCAGGCAGCGC GCGGCCACCAGGGGGCGCCAGAGCCTTGGCTCGCGCGCTCGGCCTCCTCCGCCCGCGGACGCCGCGCCCG AGCCAGCGAGCGAGCAGAGCACATCGCTGCGGGCTCACAAAGCGGCCAGACGCTCGGCGGCGGCGTGTGG CAGGAGCGCAGGGGCGCGAGCCGGCGATCAGCCTTCCCGGCGACCGTGCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPOCK1_1 ↗ | 5:137,499,326 | 負股 | 137,499,316–137,499,375 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_863634 · enhancer · 137497000–137497188 · regulatory
ENSR5_86363C · enhancer · 137497450–137497646 · regulatory
ENSR5_537C7DQ · CTCF_binding_site · 137497545–137497566 · regulatory
ENSR5_86364F · promoter · 137499316–137499514 · regulatory
ENSR5_537C7PB · CTCF_binding_site · 137499396–137499417 · regulatory
· motif · 137497547–137497563 · motif
· motif · 137499398–137499414 · motif
· motif · 137500806–137500820 · motif
· motif · 137500806–137500820 · motif
· motif · 137500813–137500824 · motif
· motif · 137502180–137502193 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：439 aa
Protein SPOCK 長 439 個胺基酸，N 端第 1–21 位為訊號序列。第 130–182 位含 Kazal-like 結構域，第 310–376 位含 Thyroglobulin type-1 結構域；第 415–439 位則註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SPOCK1 的產物被註記為分泌蛋白，位於細胞外空間及細胞外基質。 來源沒有提供定位改變的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- BCL2L13Q9BXK5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CREB3L1Q96BA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SPOCK1 可能參與細胞與細胞之間、以及細胞與細胞外基質之間的互動；此外，它可能對中樞神經系統中的多種神經機制有所貢獻。來源未進一步指出具體作用方式或所涉神經機制。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源May play a role in cell-cell and cell-matrix interactions. May contribute to various neuronal mechanisms in the central nervous system |
| 細胞定位 | SPOCK1 的產物註記為分泌至細胞外空間，並位於細胞外基質。這項定位描述未提供特定條件、細胞類型或定位變化資訊。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ACATCGCTGCGGGCTCACAAAGCGGCCAGACGCTCGGCGG40CGGCGTGTGGCAGGAGCGCAGGGGCGCGAGCCGGCGATCA80GCCTTCCCGGCGACCGTGCCGCGGGAGCTCGAGCAACTCG120GACTAGGGGACCCGGGCCGGCCCCCAAGATGCCGGCGATC160GCGGTGTTGGCGGCGGCCGCCGCGGCGTGGTGCTTCCTCC200AAGTCGAGAGCCGGCACCTGGACGCGCTCGCCGGAGGCGC240GGGCCCCAACCACGGCAATTTCCTAGACAATGACCAGTGG280CTGAGCACCGTCTCCCAGTACGACCGGGACAAGTACTGGA320ACCGCTTTCGAGACGATGATTATTTCAGAAACTGGAATCC360CAACAAGCCCTTTGACCAAGCCCTGGACCCATCCAAGGAC400CCCTGCCTGAAGGTAAAATGCAGCCCTCACAAAGTGTGTG440TGACCCAGGACTACCAGACCGCCCTGTGTGTCAGCCGCAA480GCACCTGCTCCCCAGGCAAAAGAAGGGGAACGTGGCCCAG520AAACACTGGGTTGGACCTTCGAATTTGGTCAAGTGCAAGC560CCTGTCCCGTGGCACAGTCAGCCATGGTCTGCGGCTCAGA600TGGCCACTCCTACACATCCAAGTGCAAATTGGAGTTCCAT640GCTTGTTCTACTGGCAAAAGCCTCGCCACCCTCTGTGATG680GGCCCTGTCCCTGTCTCCCAGAGCCTGAGCCACCAAAGCA720CAAGGCAGAAAGGAGTGCCTGCACAGACAAGGAGTTGCGG760AACCTTGCCTCCCGGCTGAAGGATTGGTTTGGAGCTCTCC800ACGAGGATGCGAACAGAGTCATCAAGCCCACCAGCTCCAA840CACAGCCCAAGGCAGGTTTGACACTAGCATCCTGCCCATC880TGCAAGGACTCCCTGGGCTGGATGTTCAACAAGTTGGACA920TGAACTATGACCTCCTGCTTGACCCTTCAGAGATCAATGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。