基因總覽
SPN 是蛋白質編碼基因，其產物 sialophorin 是白血球主要的細胞表面唾液酸蛋白，也稱為 Leukosialin。蛋白質長 400 個胺基酸，屬於單次穿膜的第一型膜蛋白：N 端含訊號胜肽，胞外區位於胺基酸 20–253，跨膜螺旋位於 254–276，C 端胞質區則涵蓋 277–400。胞外區與胞質區均有註解為無序的區段。作為白血球表面分子，sialophorin 與多種 T 細胞功能調節相關；其具體作用方式見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000652691 ★ | 29,663,247–29,670,876 | 2 |
| ENST00000395389 | 29,662,957–29,670,876 | 2 |
| ENST00000360121 | 29,662,957–29,670,876 | 2 |
| ENST00000858181 | 29,662,957–29,670,876 | 3 |
| ENST00000858182 | 29,662,957–29,665,156 | 2 |
| ENST00000436527 | 29,663,219–29,664,793 | 2 |
| ENST00000963399 | 29,663,278–29,670,876 | 2 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
sialophorin 參與調節多項 T 細胞功能，包括活化、增殖、分化、運輸與移動。其與 ERM 蛋白 EZR、RDX 和 MSN 的關聯，依相似性資料，被認為可正向調節 T 細胞前往淋巴結的運輸。這項關聯也與其在細胞突起處的定位相符，但來源未說明定位與運輸之間的詳細機制。
在 T 細胞分化方面，sialophorin 負向調節 Th2 細胞分化，並使 T 細胞較傾向走向 Th1 譜系。初始 T 細胞受到 T 細胞受體（TCR）活化時，它可促進 T 細胞表現 IFN-gamma；另有資料指出，它會誘導 CD4(+) T 細胞表現 IFN-gamma，對 CD8(+) T 細胞也有誘導作用，但程度較低。
sialophorin 也參與 T 細胞對細胞激素的感知及其分化為效應細胞的準備過程。它可誘導細胞激素受體 IFNGR 和 IL4R 的表現、促進這些受體的訊號傳遞，並介導 IFNGR 與 TCR 聚集。來源指出這些作用與 T 細胞後續的感知及分化準備有關，但未提供更進一步的作用細節。
在發炎情境中，sialophorin 是主要的 E-selectin 配體，與 Th17 細胞在活化血管上的滾動及募集相關；它介導 Th17 細胞黏附 E-selectin，但不介導 Th1 細胞的此種黏附。此外，依相似性資料，sialophorin 可作為 T 細胞的 SIGLEC1 對受體。另一筆資料指出，它能保護細胞免受凋亡訊號影響，促進細胞存活。
Promoter 與基因調控
>SPN ENST00000652691 GRCh38 chr16:29662247-29663347 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGAAGAAAATACCCCCACCTCCTACTCTCACCTATCCAAAGACAATTAGGTGAATCCCTTAGTAGATATC TTTCCAGACGGTTTTCCATATAGATTCCCATATCTGGCCAGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCTAGC GCTTGGGGAGGCTGAGGCGGATGGACCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGA AACCTCGTCTCTACGAAAAATACAAAATTAGCCGGGCACAGTGGTGCAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCA GGAGGCCGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTAGGAGGCAGACATTGTGCTGAGCCGAGCCAAGATCATGC CATTGCACTAAACTCCGCCTTAAAAAAAAAAAAAAAGATTCCCACATCTTTACTAGTTTGCAGAAATAAG ATCCTAGCATATGCAGTGTGTAGGAACCACCTTGGTTTAGCCACGTCTCTGTGACTGGGGGCCACTGTGG TGACCCCCAGCTCCCCGGACAGAGTCAAGAGCTCACCAGCCTGCAAAGGTTTTCACGGCCCCCAGCCAGA CTCGGGGGCTTCCTCTTGCCCTGCTACTTCCTGGGAGCTCTGAGGGCAGGAAATGGCGCCACTCAGCTCC TGGCCTAACAGCTTGGGGACCACAAATGCAAAGGAAACCACCCTCCCCTCCCACCTCCTCCTCTGCACCC TTGAGTTCTCAGGCTCACATTCCCACCACCCACCTCTGAGCCCAGCCCTCCCTAGCATCACCACTTCCAT CCCATTCCTCAGCCAAGAGCCAGGAATCCTGATTCCAGATCCCACGCTTCCCTGCCTCCCTCAGGTGAGC CCCAGACCCCCAGGCACCCCGCTGGCCCCTGAAGGAGCAGGTGATGGTGCTGTCTTCGCCCAGCAGCTGT GGGAGCAGGCGGGTGGGGCAGGATGGAGGGGTGGGTGGGGTGGGTGGAGCCAGGGCCCACTTCCTTTCCC CTTGGGGCCCTGTCCTTCCCAGTCTTGCCCCAGCCTCGGGAGGTGGTGGAGTGACCTGGCCCCAGTGCTG CGTCCTTATCAGCCGAGCCGGTAAGAGGGTGAGACTTGGTGGGGTAGGGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 7 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPN_1 ↗ | 16:29,662,963 | 正股 | 29,662,914–29,662,973 |
| SPN_5 ↗ | 16:29,663,244 | 正股 | 29,663,195–29,663,254 |
| SPN_6 ↗ | 16:29,663,823 | 正股 | 29,663,774–29,663,833 |
| SPN_4 ↗ | 16:29,664,764 | 正股 | 29,664,715–29,664,774 |
| SPN_2 ↗ | 16:29,665,032 | 正股 | 29,664,983–29,665,042 |
| SPN_3 ↗ | 16:29,668,270 | 正股 | 29,668,221–29,668,280 |
| SPN_7 ↗ | 16:29,668,773 | 正股 | 29,668,724–29,668,783 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_9FQTP · enhancer · 29661696–29662181 · regulatory
ENSR16_B7TXH · promoter · 29662526–29663289 · regulatory
ENSR16_9FQWL · promoter · 29664785–29665084 · regulatory
ENSR16_D3GQ2 · enhancer · 29665295–29667392 · regulatory
· motif · 29661526–29661541 · motif
· motif · 29661531–29661543 · motif
· motif · 29661534–29661541 · motif
· motif · 29661804–29661817 · motif
· motif · 29661804–29661817 · motif
· motif · 29661821–29661834 · motif
· motif · 29661947–29661960 · motif
· motif · 29662416–29662428 · motif
· motif · 29662418–29662425 · motif
· motif · 29662418–29662433 · motif
· motif · 29662722–29662739 · motif
· motif · 29662736–29662743 · motif
· motif · 29662757–29662772 · motif
· motif · 29662831–29662840 · motif
· motif · 29662831–29662842 · motif
· motif · 29663140–29663162 · motif
· motif · 29663140–29663162 · motif
· motif · 29663222–29663235 · motif
· motif · 29663222–29663235 · motif
· motif · 29663586–29663594 · motif
· motif · 29663684–29663693 · motif
· motif · 29663751–29663768 · motif
· motif · 29664239–29664252 · motif
· motif · 29664769–29664780 · motif
· motif · 29664769–29664780 · motif
· motif · 29665622–29665633 · motif
· motif · 29666007–29666015 · motif
· motif · 29667011–29667026 · motif
· motif · 29667012–29667025 · motif
· motif · 29667017–29667029 · motif
· motif · 29667474–29667486 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：400 aa
sialophorin 長 400 個胺基酸，含 1–19 的訊號胜肽、20–253 的胞外區、254–276 的跨膜螺旋，以及 277–400 的胞質區。胺基酸 21–224 與 320–400 被註解為無序區。胞質區 278–308 是與 EZR、MSN、RDX 互作及共同定位至微絨毛所需的區域；282–296 則含核定位訊號。
蛋白質三維結構
細胞內定位
sialophorin 是膜上的單次穿膜第一型膜蛋白，定位於微絨毛與 uropodium；依相似性資料，它透過與 ERM 蛋白 EZR、RDX 和 MSN 互作而定位至這些細胞突起。 另有資料指出，經 SUMO 修飾的形式會定位於 PML body。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Membrane；Cell projection, microvillus；Cell projection, uropodium。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- ARL13BQ3SXY8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYBC1Q9BQA9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERGIC3Q9Y282 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLP2Q04941 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PPGBQ59EV6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SGTAO43765 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
sialophorin 以單體形式存在（依相似性資料）。來源列出它與 SIGLEC1 互作，也指出它與 CTNNB1 互作；後者有文獻支持。它另與 RDX（透過 FERM domain）、EZR 和 MSN 互作，這些互作依相似性資料註記。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | sialophorin 是白血球主要的細胞表面唾液酸蛋白，調節 T 細胞活化、增殖、分化、運輸與移動；依相似性資料，與 EZR、RDX、MSN 的關聯可正向調節其前往淋巴結的運輸。它負向調節 Th2 分化並促進 Th1 譜系傾向，也促進 IFN-gamma 表現、IFNGR 與 IL4R 表現及訊號，並介導 IFNGR 與 TCR 聚集。此外，它參與 Th17 細胞在發炎時的 E-selectin 黏附與募集，且依相似性資料可作為 T 細胞的 SIGLEC1 對受體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Predominant cell surface sialoprotein of leukocytes which regulates multiple T-cell functions, including T-cell activation, proliferation, differentiation, trafficking and migration. Positively regulates T-cell trafficking to lymph-nodes via its association with ERM proteins (EZR, RDX and MSN) (By similarity). Negatively regulates Th2 cell differentiation and predisposes the differentiation of T-cells towards a Th1 lineage commitment. Promotes the expression of IFN-gamma by T-cells during T-cell receptor (TCR) activation of naive cells and induces the expression of IFN-gamma by CD4(+) T-cells and to a lesser extent by CD8(+) T-cells. Plays a role in preparing T-cells for cytokine sensing and differentiation into effector cells by inducing the expression of cytokine receptors IFNGR and IL4R, promoting IFNGR and IL4R signaling and by mediating the clustering of IFNGR with TCR. Acts as a major E-selectin ligand responsible for Th17 cell rolling on activated vasculature and recruitment during inflammation. Mediates Th17 cells, but not Th1 cells, adhesion to E-selectin. Acts as a T-cell counter-receptor for SIGLEC1 (By similarity) PMID 18036228 ↗ · PMID 24328034 ↗ |
| 功能 | sialophorin 可保護細胞免受凋亡訊號影響，並促進細胞存活；來源未進一步說明此作用的細胞情境或分子機制。 | 推論支持 | |
| 交互作用 | sialophorin 與 SIGLEC1 互作；此項資料只指出互作關係，未進一步描述其結合條件、作用機制或功能結果。 | 推論支持 | |
| 交互作用 | sialophorin 以單體形式存在，此項註記依相似性資料；另與 CTNNB1 互作，並依相似性資料與 RDX、EZR 和 MSN 互作，其中 RDX 的互作涉及其 FERM domain。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer (By similarity). Interacts with CTNNB1. Interacts with RDX (via FERM domain), EZR and MSN (By similarity) PMID 15003504 ↗ |
| 細胞定位 | sialophorin 是單次穿膜第一型膜蛋白，位於微絨毛與 uropodium；依相似性資料，它透過與 ERM 蛋白 EZR、RDX 和 MSN 的互作定位至這些細胞突起。 | 推論支持 | 證據與來源Membrane / Single-pass type I membrane protein; Cell projection, microvillus; Cell projection, uropodium; Localizes to the uropodium and microvilli via its interaction with ERM proteins (EZR, RDX and MSN) |
| 細胞定位 | 來源列出 sialophorin 的 CD43 胞質尾端、細胞核及 PML body 定位，並指出經 SUMO 修飾的形式會定位於 PML body；未進一步說明此定位變化的條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源CD43 cytoplasmic tail; Nucleus; Nucleus, PML body; The sumoylated form localizes to the PML body PMID 15003504 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTCTTGCCCCAGCCTCGGGAGGTGGTGGAGTGACCTGGC40CCCAGTGCTGCGTCCTTATCAGCCGAGCCGGTCCCAGCTC80TTGCTCCTGCCTGTTTGCCTGGAAATGGCCACGCTTCTCC120TTCTCCTTGGGGTGCTGGTGGTAAGCCCAGACGCTCTGGG160GAGCACAACAGCAGTGCAGACACCCACCTCCGGAGAGCCT200TTGGTCTCTACTAGCGAGCCCCTGAGCTCAAAGATGTACA240CCACTTCAATAACAAGTGACCCTAAGGCCGACAGCACTGG280GGACCAGACCTCAGCCCTACCTCCCTCAACTTCCATCAAT320GAGGGATCCCCTCTTTGGACTTCCATTGGTGCCAGCACTG360GTTCCCCTTTACCTGAGCCAACAACCTACCAGGAAGTTTC400CATCAAGATGTCATCAGTGCCCCAGGAAACCCCTCATGCA440ACCAGTCATCCTGCTGTTCCCATAACAGCAAACTCTCTAG480GATCCCACACCGTGACAGGTGGAACCATAACAACGAACTC520TCCAGAAACCTCCAGTAGGACCAGTGGAGCCCCTGTTACC560ACGGCAGCTAGCTCTCTGGAGACCTCCAGAGGCACCTCTG600GACCCCCTCTTACCATGGCAACTGTCTCTCTGGAGACTTC640CAAAGGCACCTCTGGACCCCCTGTTACCATGGCAACTGAC680TCTCTGGAGACCTCCACTGGGACCACTGGACCCCCTGTTA720CCATGACAACTGGCTCTCTGGAGCCCTCCAGCGGGGCCAG760TGGACCCCAGGTCTCTAGCGTAAAACTATCTACAATGATG800TCTCCAACGACCTCCACCAACGCAAGCACTGTGCCCTTCC840GGAACCCAGATGAGAACTCACGAGGCATGCTGCCAGTGGC880TGTGCTTGTGGCCCTGCTGGCGGTCATAGTCCTCGTGGCT920CTGCTCCTGCTGTGGCGCCGGCGGCAGAAGCGGCGGACTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。