基因總覽
SPMAP2(sperm microtubule associated protein 2)是蛋白質編碼基因,產物為 379 個胺基酸的蛋白質。現有資料指出它可能參與精子生成,但此作用並非必要;資料未提供其家族歸屬或更詳細的基本功能描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000342640 ★ | 361,747–376,026 | 8 |
| ENST00000530711 | 361,747–374,620 | 3 |
| ENST00000346878 | 362,057–375,970 | 7 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SPMAP2 可能參與精子生成,但現有資料明確指出,它並非此過程不可或缺的因子。因此,資料支持的是一種可能的參與關係,而非 SPMAP2 對精子生成具有必要性;目前也沒有足夠資訊進一步說明它在此過程中的具體作用或分子機制。
Promoter 與基因調控
>SPMAP2 ENST00000342640 GRCh38 chr19:375926-377026 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGGAGAGGCTGGGTGGGGGCACAGAGGGGGAGAGGCTGGGTGGGGCACAGGGGGGAGAGGCTGGGTGGGG CACACGGGGGAGAGGCTGGGTGGGGCACAGAGGGGGAGAGGCTGGGTGGGGCACAGAGGGGGAGAGGCTG GGTGGGGGCACAGAGGGGGAGAGGCTGGGTGGAGGCACGGGGGGGGAGAGGCTGGGTGGGGCACGGAGGG GGAGAGGCTGGGTGGGGCACGGAGGGGGAGAGGCTGGGTGGGGGCACAGAGGGGGAGAGGCTGGGTGGGG CACAGAGGGGGAGAGGCTGGGTGGGGCACACAGGGGGAGAGGCTGGGTGGGGCACAGAGGGGGAGAGGCT GGAAATTCAGCTCCTTTGGCGACGTACGAGGAATTCCTGAAGGCAGCAGCCTGGGGAATACTCCAGTTAT AACCATTATTTTGTTGTGAGGGTTGGAACAGCCTATTTTGAAGTTATTTCTCATGAGAGGTTGGGGCTGG AAGCGTCTGTATCACCTAGGGTGCAGTTTTAGCTGCTAGGAATTGGAAACCAAGCCAAAACGACTTAGTA CTAAGGAAACTTACTGTTTCAAGTAACAAGAAGCCTGGACACAGAGTGGATTCCAAGGCTGCTAAGTTCA GAGGCTCGACAGCCACATCAAAGGCCCACCTTTCAGTTCATCTGCCCTCAGATGGCAGGCCTCATGGTCA CAAGAAGGCTGCCTGGGCTCTGGACATTACCGACGGGCCCCACAGGGACAGGAACAGGAGACGCGGTCTC TTCCTTGTGTCTCCTTTTGAGAGAGGGAATCCATAGCTAGATGCCCCTGCAGGTTCCCGTCAGGTCTCCT TCCTAAACCAATCCTGGGAGGTCCTGAGTGAGCCGTGACCACCAGGACTGAGTCCTGATCCCAGCGCAAG CCCAGGTGACCAGCATTGGAGACGGCGCACGGGTTAGAATGTGGACCGTGGGGAATGTGACGGACGCTCT CCTGTTGCCGCGGCCACCACAGACACATTTGGGTGCCGGGAGAGTGAGGCCGCGGGGGCTGGGAAGGGAC CGGTGTATGGGGGACAGCAGGCGAAGGTCACTCGGGAACCAGCCCAGCTCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:379 aa
SPMAP2 蛋白質長 379 個胺基酸,序列中註記有六段 THEG 重複區,分別位於第 118–137、184–203、222–241、258–277、290–309 與 326–345 個胺基酸。另有兩段被註記為無序區,位於第 1–82 與第 344–379 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SPMAP2 主要定位於單倍體圓形精子的細胞核。 資料未提供其他細胞狀態或條件下定位改變的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- DR1Q01658 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FHL3Q13643 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- GSNP06396 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HIP1O00291 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LAMP2P13473-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MDFIQ99750 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
資料記載 SPMAP2 與 CCT5 互作,但未說明兩者是否形成特定複合體,也未提供此互作的功能影響或實驗情境。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SPMAP2 可能參與精子生成,但並非此過程不可或缺的因子;資料未進一步說明其具體作用或參與機制。 | 推論支持 | |
| 交互作用 | SPMAP2 與 CCT5 有互作記載;現有敘述未說明互作形式、發生情境或對功能的影響。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | SPMAP2 定位於細胞核,且主要位於單倍體圓形精子的細胞核;資料未描述其他細胞狀態下的定位。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGACACATTTGGGTGCCGGGAGAGTGAGGCCGCGGGGGCT40GGGAAGGGACCGGTGTATGGGGGACAGCAGGCGAAGGTCA80CTCGGGAACCAGCCCAGCTCTGAGGCTGCGGGCAGGTCGG120AAAGGGAGCAGGACGGCGACCCCCGTGGCCTCCAGAGCTC160TGTGTACGAGAGCCGGCGGGTCACAGACCCCGAACGCCAG200GACCTGGACAATGCAGAGCTGGGACCAGAAGACCCAGAAG240AGGAGCTTCCCCCCGAGGAGGTGGCCGGGGAGGAGTTCCC280GGAGACCCTGGATCCCAAAGAGGCACTTTCTGAGTTGGAG320AGAGTCCTGGACAAGGACTTGGAAGAGGACATTCCTGAAA360TCAGCCGGCTGTCCATCAGCCAGAAGCTCCCCAGCACCAC400CATGACCAAAGCAAGGAAGAGGAGGAGGCGGAGGAGGCTC440ATGGAGCTGGCAGAGCCCAAGATAAACTGGCAAGTCCTGA480AAGACAGGAAGGGACGCTGTGGTAAGGGGTATGCCTGGAT520CTCCCCATGTAAGATGAGCTTGCACTTCTGTCTCTGCTGG560CCCTCTGTGTACTGGACCGAGCGGTTCCTTGAGGACACCA600CCCTCACCATCACAGTGCCCGCGGTGTCCCGCCGCGTGGA640GGAACTGTCTCGGCCCAAGAGATTCTACCTGGAATATTAC680AACAACAACAGGACGACTCCTGTCTGGCCCATTCCTCGGT720CCTCCCTGGAATACAGAGCGTCGAGTCGCCTGAAGGAACT760GGCCGCCCCGAAGATTCGTGATAACTTCTGGAGCATGCCC800ATGTCTGAGGTGTCCCAGGTATCCAGGGCAGCCCAAATGG840CAGTCCCCAGCTCGCGGATCCTCCAGTTGTCAAAGCCGAA880GGCCCCAGCCACCCTCTTGGAAGAGTGGGACCCCGTGCCA920AAACCCAAGCCACATGTGTCAGACCATAACCGCCTCCTTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。