基因總覽
SPINT3 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 serine peptidase inhibitor, Kunitz type 3。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 20q13.12。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000217428 ★ | 45,512,461–45,515,622 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SPINT3 ENST00000217428 GRCh38 chr20:45515522-45516622 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTTACTGACTGTGCATTGTGTTTGCACCATCATAAAGTCAAACACTGTAAGTCAAACCATTGTAAATTGG GGACTGCCTTTATACAATTTTTATTTCTCAATTAAAAATAAATAATAATAAATATATGATAGAATGCTTC TTGAAAAAGAATAGCTGGACCCATCACAACCTCAAATTTTAAATCTGAGGCTCACTAAATCTCCCTAAAG CATGCTGGCTTTGTCTTTCAAAAAAAATGGATCTCTAGAGAGTCAAGGAAAGGAGACAGTTGGAATGTGC TGGATTCTGGGGGTGTGTCTCTAGAGACCATGACCCTCTGAAGCAAACAAAGCTGGGCCCTCCTTCTACA TGGTGCTTTTGATATTTCTATTAAAATATAATGAATCTGCTCCTCCTCCAAGTAGGTGACTGTTTCTGAC TTCCAATGTGTTTGTGTGTGTTGTTGCCATAATTTCCTGGGAGCACCCAGATGGGATGGAGGCAGCATCT AATACTTTGCCTGGTGCAGTGTGGGTACTTGATGAATGTTTGTTGAATGAATGAGTGATACGAGGGCACT GAAGCAGACAGACCGGGGTCTCAGTCTTGTCTCTGAAACTTGCTGTCCATGTAACAATGGTCAAAGTAGC ATAACCTCCTCTCATCTACAAAATGGGAGTGTTAGTGTTGTGGGATTCCCGTGTAGACTTAAGGGAAGCA ATGTGTGAAAACTATTTTGCATGGTGCCTGGAAAAGGAAAGGTACTCAAAAATGGCTGCTGTCTTTTTAT TATTGTGAAAAAGGCTTCCACCCTGAAGTGGTACTAAAGTAGCCTGGGTGGCCAGATCAGATAAGGCCAG GAGGAGAGAGGTGAAGCTGTGCTTTGGCTGAACACTCTGTTCCTGAGGCAGCCCAGCCCCATGAAAAGCC TGAGTTAAAGGTGAATGAGCTGGATGTGGGGCCAGGCTCCTCCCCTTGGTCCCTTTTCTCCCTAAAATGG CAACCCCAGGCTGAGCCACTGGCTGAGTGGCACCATGCAGCTTCAGGCCTCTCTCTCGTTTCTCCTGATT CTCACTCTCTGCCTAGAGCTTCGATCAGAACTAGCACGAGGTTGGTATGAA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPINT3_1 ↗ | 20:45,515,622 | 負股 | 45,515,612–45,515,671 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR20_9N3RT · enhancer · 45518340–45518656 · regulatory
· motif · 45510623–45510632 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:89 aa
SPINT3 的蛋白質長 89 個胺基酸。其 N 端第 1–24 位為訊號胜肽,第 36–86 位則為 BPTI/Kunitz inhibitor 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SPINT3 註記為分泌型蛋白質。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GGCTGAGTGGCACCATGCAGCTTCAGGCCTCTCTCTCGTT40TCTCCTGATTCTCACTCTCTGCCTAGAGCTTCGATCAGAA80CTAGCACGAGACACTATCAAGGATCTCCTCCCAAATGTAT120GCGCTTTTCCTATGGAAAAGGGCCCTTGTCAAACCTACAT160GACGCGATGGTTTTTCAACTTTGAAACTGGTGAATGTGAG200TTATTTGCTTACGGAGGCTGCGGAGGCAACAGCAACAACT240TTTTGAGGAAAGAAAAATGTGAGAAATTCTGCAAGTTCAC280CTGATTTTCTAACAAGAACACAGCCCTCCATGGATTCGGG320ATTGCTCTGAGGGCCATAGAAGGCATTTGCGTGTGTGTGT360GTGTGTGTGTGTGAACAAGAGGTTCATTCCTCTACCCCCA400CATTTATTCTCCCTGATGTGCTCCTACAAGTGCTTCATCT440CTGTGCCTGAAATTCTATAAATGTTGCAATCATG474cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。