演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SPINT3HKIB9

serine peptidase inhibitor, Kunitz type 3

SPINT3 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens20q13.12UniProt P49223
OFFICIAL SYMBOL
SPINT3
CHROMOSOME
20
UNIPROT
P49223
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SPINT3 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 serine peptidase inhibitor, Kunitz type 3。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 20q13.12。

Official symbol
SPINT3
Gene name
serine peptidase inhibitor, Kunitz type 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11248
UniProt
P49223
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HKIB9

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2020q13.12
chr20 · 64,444,167 bp · GRCh38chr20p13 · 1–5100000 · gnegchr20p12.3 · 5100001–9200000 · gpos75chr20p12.2 · 9200001–12000000 · gnegchr20p12.1 · 12000001–17900000 · gpos75chr20p11.23 · 17900001–21300000 · gnegchr20p11.22 · 21300001–22300000 · gpos25chr20p11.21 · 22300001–25700000 · gnegchr20p11.1 · 25700001–28100000 · acenchr20q11.1 · 28100001–30400000 · acenchr20q11.21 · 30400001–33500000 · gnegchr20q11.22 · 33500001–35800000 · gpos25chr20q11.23 · 35800001–39000000 · gnegchr20q12 · 39000001–43100000 · gpos75chr20q13.11 · 43100001–43500000 · gnegchr20q13.12 · 43500001–47800000 · gpos25chr20q13.13 · 47800001–51200000 · gnegchr20q13.2 · 51200001–56400000 · gpos75chr20q13.31 · 56400001–57800000 · gnegchr20q13.32 · 57800001–59700000 · gpos50chr20q13.33 · 59700001–64444167 · gnegSPINT3pq1 bp64,444,167 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr20:45,512,461–45,515,622
Gene span
3,162 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000217428 ★45,512,461–45,515,6222

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 45515622 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SPINT3 ENST00000217428 GRCh38 chr20:45515522-45516622 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTACTGACTGTGCATTGTGTTTGCACCATCATAAAGTCAAACACTGTAAGTCAAACCATTGTAAATTGG
GGACTGCCTTTATACAATTTTTATTTCTCAATTAAAAATAAATAATAATAAATATATGATAGAATGCTTC
TTGAAAAAGAATAGCTGGACCCATCACAACCTCAAATTTTAAATCTGAGGCTCACTAAATCTCCCTAAAG
CATGCTGGCTTTGTCTTTCAAAAAAAATGGATCTCTAGAGAGTCAAGGAAAGGAGACAGTTGGAATGTGC
TGGATTCTGGGGGTGTGTCTCTAGAGACCATGACCCTCTGAAGCAAACAAAGCTGGGCCCTCCTTCTACA
TGGTGCTTTTGATATTTCTATTAAAATATAATGAATCTGCTCCTCCTCCAAGTAGGTGACTGTTTCTGAC
TTCCAATGTGTTTGTGTGTGTTGTTGCCATAATTTCCTGGGAGCACCCAGATGGGATGGAGGCAGCATCT
AATACTTTGCCTGGTGCAGTGTGGGTACTTGATGAATGTTTGTTGAATGAATGAGTGATACGAGGGCACT
GAAGCAGACAGACCGGGGTCTCAGTCTTGTCTCTGAAACTTGCTGTCCATGTAACAATGGTCAAAGTAGC
ATAACCTCCTCTCATCTACAAAATGGGAGTGTTAGTGTTGTGGGATTCCCGTGTAGACTTAAGGGAAGCA
ATGTGTGAAAACTATTTTGCATGGTGCCTGGAAAAGGAAAGGTACTCAAAAATGGCTGCTGTCTTTTTAT
TATTGTGAAAAAGGCTTCCACCCTGAAGTGGTACTAAAGTAGCCTGGGTGGCCAGATCAGATAAGGCCAG
GAGGAGAGAGGTGAAGCTGTGCTTTGGCTGAACACTCTGTTCCTGAGGCAGCCCAGCCCCATGAAAAGCC
TGAGTTAAAGGTGAATGAGCTGGATGTGGGGCCAGGCTCCTCCCCTTGGTCCCTTTTCTCCCTAAAATGG
CAACCCCAGGCTGAGCCACTGGCTGAGTGGCACCATGCAGCTTCAGGCCTCTCTCTCGTTTCTCCTGATT
CTCACTCTCTGCCTAGAGCTTCGATCAGAACTAGCACGAGGTTGGTATGAA
SPINT3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SPINT3_1 ↗20:45,515,622負股45,515,612–45,515,671

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR20_9N3RT · enhancer · 45518340–45518656 · regulatory

· motif · 45510623–45510632 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:89 aa

1 aa89 aa結構域訊號胜肽
依 P49223 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SPINT3 的蛋白質長 89 個胺基酸。其 N 端第 1–24 位為訊號胜肽,第 36–86 位則為 BPTI/Kunitz inhibitor 結構域。

訊號胜肽1–24 aa
結構域BPTI/Kunitz inhibitor36–86 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P49223…

AlphaFold · P49223

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

SPINT3 註記為分泌型蛋白質。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
細胞定位Secreted推論支持
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000217428 · 474 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGCTGAGTGGCACCATGCAGCTTCAGGCCTCTCTCTCGTT40
41TCTCCTGATTCTCACTCTCTGCCTAGAGCTTCGATCAGAA80
81CTAGCACGAGACACTATCAAGGATCTCCTCCCAAATGTAT120
121GCGCTTTTCCTATGGAAAAGGGCCCTTGTCAAACCTACAT160
161GACGCGATGGTTTTTCAACTTTGAAACTGGTGAATGTGAG200
201TTATTTGCTTACGGAGGCTGCGGAGGCAACAGCAACAACT240
241TTTTGAGGAAAGAAAAATGTGAGAAATTCTGCAAGTTCAC280
281CTGATTTTCTAACAAGAACACAGCCCTCCATGGATTCGGG320
321ATTGCTCTGAGGGCCATAGAAGGCATTTGCGTGTGTGTGT360
361GTGTGTGTGTGTGAACAAGAGGTTCATTCCTCTACCCCCA400
401CATTTATTCTCCCTGATGTGCTCCTACAAGTGCTTCATCT440
441CTGTGCCTGAAATTCTATAAATGTTGCAATCATG474

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。