演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SPINT2Kop

serine peptidase inhibitor, Kunitz type 2

SPINT2 編碼 serine peptidase inhibitor, Kunitz type 2,屬 Kunitz 型蛋白酶抑制因子,可抑制多種絲胺酸蛋白酶,並與先天性分泌性鈉腹瀉相關。

Homo sapiens19q13.2UniProt O43291
OFFICIAL SYMBOL
SPINT2
CHROMOSOME
19
UNIPROT
O43291
PDB / ALPHAFOLD
4U32
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SPINT2 是蛋白質編碼基因,其正式名稱為 serine peptidase inhibitor, Kunitz type 2。基因產物為 252 個胺基酸的蛋白質,屬 Kunitz 型蛋白酶抑制因子,具有兩個 BPTI/Kunitz inhibitor 結構域。蛋白質包含訊號胜肽、細胞外區段、單次跨膜區段與細胞質區段;這些特徵構成其基本的膜蛋白架構。來源所列的功能涵蓋多種絲胺酸蛋白酶抑制作用。

Official symbol
SPINT2
Gene name
serine peptidase inhibitor, Kunitz type 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11247
UniProt
O43291
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KopHAI-2HAI2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.2
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25SPINT2pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:38,244,035–38,292,615
Gene span
48,581 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000301244 ★38,264,573–38,292,6157
ENST0000059051038,244,035–38,287,9053
ENST0000045458038,264,222–38,292,6156
ENST0000090257738,264,222–38,292,6155
ENST0000090257838,264,222–38,292,6155
ENST0000090257938,264,222–38,292,6157
ENST0000091843838,264,222–38,292,6157
ENST0000091843938,264,222–38,292,6156
ENST0000091844038,264,222–38,292,6157
ENST0000091844138,264,222–38,292,6157
ENST0000096470038,264,222–38,292,6156
ENST0000096470138,264,222–38,292,6156

顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SPINT2 的產物可抑制多種絲胺酸蛋白酶。來源指出,它是 HGFAC 的抑制因子,也能抑制 plasmin,以及血漿與組織 kallikrein。這些資料支持其作用範圍涉及不同蛋白酶,但未提供各靶點之間的相對抑制強度或共同作用條件。

對 TMPRSS13,SPINT2 可抑制其絲胺酸蛋白酶活性。SPINT2 也能在體外抑制 ST14/matriptase 與 PRSS8/prostasin 的絲胺酸蛋白酶活性;這項證據限定於體外條件,不宜直接視為已證實這些抑制作用在生理環境中的效果。

SPINT2 與 TMPRSS13 的互作另與 TMPRSS13 的磷酸化及其定位至細胞膜有關。這項互作所支持的是對 TMPRSS13 磷酸化和膜定位的促進作用,與 SPINT2 對蛋白酶活性的抑制是不同層面的功能描述;來源未進一步說明兩者如何在分子層級連結。

因此,來源所支持的 SPINT2 功能包括抑制多種蛋白酶,以及透過互作促進 TMPRSS13 的磷酸化與細胞膜定位。現有資料並未提供這些作用彼此如何協調或其下游生物學結果,故不宜據此延伸出未載明的機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 38264573 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SPINT2 ENST00000301244 GRCh38 chr19:38263573-38264673 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATAATCTAAAAGTGTT
TTCAATAATAATGCATTTATGTTGATTACCTTGTTGGCTATCCTCTACTCGTGTGCCTGCCCCACTCCAT
TCCCCTTTCTAGAGTCTGTTCACGTAACTCCTCTTCCAGGAAGCCCTCTTTGACTCCCAGGCTTGGTCAG
GTGTCTTCTCTGGGTTTCCCCAGGGGCTTCCTTCCTCTCAATTCTGATGCTGCCTGTGCTAAGTATTTGT
CTCCATATCTGTCCTGAGAACCTTGGAGCCAGGGCTCGGGGCTGTTTTTGCATGGGCCTATCACCTCCTC
CAGGAAGCCCTCCTTGGCCCTCTCTCAGGCTGGATGGGAAAGCTGTCTGGGCTCCCATCATGCCCTGGTT
TTCTAGCGACCCAGCCTCTGATCCCTAAGCTTGGCCTTCCCCATCACAGCTTTCATCACTTTGTGCTAAG
CTTCCGCTATCACTACTCTGGGCCGTTCCTGTTTGGTGACTCAGGGACCAGTCTGGCATGGCCACCGCTG
GGTCCCCAGCATTAAGCCCTGGAGCATGAGCCCAGTGAACTTTGAAATTCAGGAAGGAATTCACAGGAAA
GCTGCGGCGAGGCGGGCAGAAAACCACAGGCTTCCAAGAAACGCGTGTCTGCCGCCCCCTCCTCCCACCC
TGAGGCCAGTCCTAGAGCGAAGGCCCTCCTCCGACGTCGTCACCAAGCCCAAGGGAAGGGTGGCAGGTGC
TCAGCGGGCAGACGCCCCGCCCCGCCCCGCCAGGTTCTGTTGGGGGCGAGGCCCGCGCAAGCCCCGCCTC
TTCCCCGGCACCAGGGGCGGGCCCAGGTGCGCCCAGGGCCGGGGAGCGGCCGCGCAGGTGCCTGCCCTTT
GCGCCTGCGCCCAGCTCGCCCTGCCTAGCCAGGTGCGCCCCGCCCCCTGCCTGCCCGGCCACCTTCGGGA
GCCGCTTCCAATAGGCGTTCGCCATTGGCTCTGGCGACCTCCGCGCGTTGGGAGGTGTAGCGCGGCTCTG
AACGCGCTGAGGGCCGTTGAGTGTCGCAGGCGGCGAGGGCGCGAGTGAGGA
SPINT2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SPINT2_3 ↗19:38,244,042正股38,243,993–38,244,052
SPINT2_2 ↗19:38,264,437正股38,264,388–38,264,447
SPINT2_1 ↗19:38,264,573正股38,264,524–38,264,583

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9K73H · enhancer · 38262881–38263333 · regulatory

ENSR19_9K73T · promoter · 38264083–38264586 · regulatory

ENSR19_5C225L · CTCF_binding_site · 38264519–38264540 · regulatory

ENSR19_C5RJ3 · enhancer · 38264587–38266500 · regulatory

ENSR19_5C2275 · CTCF_binding_site · 38264848–38264869 · regulatory

ENSR19_D3W94 · enhancer · 38266642–38269040 · regulatory

· motif · 38264061–38264072 · motif

· motif · 38264223–38264231 · motif

· motif · 38264334–38264343 · motif

· motif · 38264356–38264366 · motif

· motif · 38264361–38264371 · motif

· motif · 38264403–38264413 · motif

· motif · 38264425–38264435 · motif

· motif · 38264434–38264443 · motif

· motif · 38264463–38264474 · motif

· motif · 38264482–38264493 · motif

· motif · 38264482–38264493 · motif

· motif · 38264510–38264519 · motif

· motif · 38264519–38264529 · motif

· motif · 38264521–38264537 · motif

· motif · 38264569–38264579 · motif

· motif · 38264736–38264745 · motif

· motif · 38264736–38264747 · motif

· motif · 38264805–38264816 · motif

· motif · 38264805–38264816 · motif

· motif · 38264850–38264866 · motif

· motif · 38265107–38265117 · motif

· motif · 38268913–38268922 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:252 aa

1 aa252 aa結構域功能區域訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 O43291 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SPINT2 蛋白長 252 個胺基酸,包含位於第 1–27 位的訊號胜肽、第 28–197 位的細胞外區段、第 198–218 位的螺旋跨膜區,以及第 219–252 位的細胞質區段。細胞外區段含兩個 BPTI/Kunitz inhibitor 結構域,分別位於第 38–88 位與第 133–183 位;第 100–122 位另註記為無序區。

訊號胜肽1–27 aa
拓樸區域Extracellular28–197 aa
跨膜區Helical198–218 aa
拓樸區域Cytoplasmic219–252 aa
結構域BPTI/Kunitz inhibitor 138–88 aa
結構域BPTI/Kunitz inhibitor 2133–183 aa
功能區域Disordered100–122 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 4U32…

PDB · 4U32

X-ray · 1.65 A · X=34-88

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Cytoplasm

SPINT2 被標註為單次跨膜的第一型膜蛋白,並位於細胞膜與細胞質。 此定位資料未指出特定條件下的定位變化或異構型差異。 TMPRSS13 的細胞膜定位則是互作資料所述的夥伴變化,不應視為 SPINT2 自身定位的改變。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KopSPINT2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SPINT2 與 TMPRSS13 互作;該互作促進 TMPRSS13 的磷酸化及其細胞膜定位。來源未將此描述為兩者形成特定複合體,也未提供其他實體結合夥伴。此互作效應不同於 SPINT2 對 TMPRSS13 蛋白酶活性的抑制描述。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

影響 SPINT2 的基因變異與先天性分泌性鈉腹瀉(DIAR3)相關。此疾病可伴有或不伴有其他先天異常,特徵包括可能危及生命的分泌性腹瀉、嚴重代謝性酸中毒與低血鈉;低血鈉與糞便鈉流失異常偏高有關,尿鈉排出量則偏低或正常。資料指出疾病成因為影響此基因的變異,並排除感染、自體免疫及內分泌原因。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SPINT2 可抑制 HGFAC、plasmin、血漿與組織 kallikrein,並抑制 TMPRSS13 的絲胺酸蛋白酶活性;對 ST14/matriptase 與 PRSS8/prostasin 的絲胺酸蛋白酶活性,則有體外抑制證據。含實驗來源
證據與來源

Inhibitor of HGFAC. Also inhibits plasmin, and plasma and tissue kallikrein. Inhibits serine protease activity of TMPRSS13. Inhibits serine protease activity of ST14/matriptase and PRSS8/prostasin in vitro

PMID 20977675 ↗ · PMID 28710277 ↗ · PMID 30445423 ↗ · PMID 9115294 ↗ · PMID 9346890 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SPINT2 與 TMPRSS13 互作;此互作會促進 TMPRSS13 的磷酸化,並促進其定位至細胞膜。此描述指向互作相關效應,未提供其他複合體資訊。含實驗來源
證據與來源

Interacts with TMPRSS13; the interaction promotes the phosphorylation and cell membrane localization of TMPRSS13

PMID 28710277 ↗ · PMID 34562451 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SPINT2 被標註為單次跨膜的第一型膜蛋白,定位於細胞膜及細胞質;此資料未提供定位改變的條件或異構型差異。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Single-pass type I membrane protein; Cytoplasm

PMID 28710277 ↗ · PMID 34562451 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 SPINT2 的基因變異會造成先天性分泌性鈉腹瀉,可伴有或不伴有其他先天異常。疾病可能危及生命,特徵包括嚴重代謝性酸中毒與低血鈉;低血鈉與糞便鈉流失極高有關,尿鈉排出量偏低或正常,且無感染、自體免疫或內分泌原因。含實驗來源
證據與來源

Diarrhea 3, secretory sodium, congenital, with or without other congenital anomalies DIAR3 A disease characterized by life-threatening secretory diarrhea, severe metabolic acidosis and hyponatremia. Hyponatremia is secondary to extraordinarily high fecal sodium loss, with low or normal excretion of urinary sodium, in the absence of infectious, autoimmune and endocrine causes. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 270420

PMID 19185281 ↗ · PMID 20009592 ↗ · PMID 24142340 ↗ · PMID 28716867 ↗ · PMID 29575628 ↗ · PMID 30445423 ↗ · PMID 38271183 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000301244 · 1,688 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCCATTGGCTCTGGCGACCTCCGCGCGTTGGGAGGTGTAG40
41CGCGGCTCTGAACGCGCTGAGGGCCGTTGAGTGTCGCAGG80
81CGGCGAGGGCGCGAGTGAGGAGCAGACCCAGGCATCGCGC120
121GCCGAGAAGGCCGGGCGTCCCCACACTGAAGGTCCGGAAA160
161GGCGACTTCCGGGGGCTTTGGCACCTGGCGGACCCTCCCG200
201GAGCGTCGGCACCTGAACGCGAGGCGCTCCATTGCGCGTG240
241CGCGTTGAGGGGCTTCCCGCACCTGATCGCGAGACCCCAA280
281CGGCTGGTGGCGTCGCCTGCGCGTCTCGGCTGAGCTGGCC320
321ATGGCGCAGCTGTGCGGGCTGAGGCGGAGCCGGGCGTTTC360
361TCGCCCTGCTGGGATCGCTGCTCCTCTCTGGGGTCCTGGC400
401GGCCGACCGAGAACGCAGCATCCACGACTTCTGCCTGGTG440
441TCGAAGGTGGTGGGCAGATGCCGGGCCTCCATGCCTAGGT480
481GGTGGTACAATGTCACTGACGGATCCTGCCAGCTGTTTGT520
521GTATGGGGGCTGTGACGGAAACAGCAATAATTACCTGACC560
561AAGGAGGAGTGCCTCAAGAAATGTGCCACTGTCACAGAGA600
601ATGCCACGGGTGACCTGGCCACCAGCAGGAATGCAGCGGA640
641TTCCTCTGTCCCAAGTGCTCCCAGAAGGCAGGATTCTGAA680
681GACCACTCCAGCGATATGTTCAACTATGAAGAATACTGCA720
721CCGCCAACGCAGTCACTGGGCCTTGCCGTGCATCCTTCCC760
761ACGCTGGTACTTTGACGTGGAGAGGAACTCCTGCAATAAC800
801TTCATCTATGGAGGCTGCCGGGGCAATAAGAACAGCTACC840
841GCTCTGAGGAGGCCTGCATGCTCCGCTGCTTCCGCCAGCA880
881GGAGAATCCTCCCCTGCCCCTTGGCTCAAAGGTGGTGGTT920
921CTGGCGGGGCTGTTCGTGATGGTGTTGATCCTCTTCCTGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。