演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SPINT1HAI

serine peptidase inhibitor, Kunitz type 1

SPINT1 編碼一種 Kunitz 型絲胺酸肽酶抑制蛋白,可抑制多種絲胺酸蛋白酶的活性。

Homo sapiens15q15.1UniProt O43278
OFFICIAL SYMBOL
SPINT1
CHROMOSOME
15
UNIPROT
O43278
PDB / ALPHAFOLD
5H7V
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SPINT1(serine peptidase inhibitor, Kunitz type 1)是蛋白質編碼基因,其產物為 Kunitz 型絲胺酸肽酶抑制蛋白。蛋白質序列含有兩個 BPTI/Kunitz 抑制劑結構域;其中一個結構域與抑制 TMPRSS13 活性的作用有關。來源資料亦記載此蛋白質可抑制 HGFAC,以及在體外抑制 ST14/matriptase 的絲胺酸蛋白酶活性。

Official symbol
SPINT1
Gene name
serine peptidase inhibitor, Kunitz type 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11246
UniProt
O43278
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HAIHAI-1MANSC2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1515q15.1
chr15 · 101,991,189 bp · GRCh38chr15p13 · 1–4200000 · gvarchr15p12 · 4200001–9700000 · stalkchr15p11.2 · 9700001–17500000 · gvarchr15p11.1 · 17500001–19000000 · acenchr15q11.1 · 19000001–20500000 · acenchr15q11.2 · 20500001–25500000 · gnegchr15q12 · 25500001–27800000 · gpos50chr15q13.1 · 27800001–30000000 · gnegchr15q13.2 · 30000001–30900000 · gpos50chr15q13.3 · 30900001–33400000 · gnegchr15q14 · 33400001–39800000 · gpos75chr15q15.1 · 39800001–42500000 · gnegchr15q15.2 · 42500001–43300000 · gpos25chr15q15.3 · 43300001–44500000 · gnegchr15q21.1 · 44500001–49200000 · gpos75chr15q21.2 · 49200001–52600000 · gnegchr15q21.3 · 52600001–58800000 · gpos75chr15q22.1 · 58800001–59000000 · gnegchr15q22.2 · 59000001–63400000 · gpos25chr15q22.31 · 63400001–66900000 · gnegchr15q22.32 · 66900001–67000000 · gpos25chr15q22.33 · 67000001–67200000 · gnegchr15q23 · 67200001–72400000 · gpos25chr15q24.1 · 72400001–74900000 · gnegchr15q24.2 · 74900001–76300000 · gpos25chr15q24.3 · 76300001–78000000 · gnegchr15q25.1 · 78000001–81400000 · gpos50chr15q25.2 · 81400001–84700000 · gnegchr15q25.3 · 84700001–88500000 · gpos50chr15q26.1 · 88500001–93800000 · gnegchr15q26.2 · 93800001–98000000 · gpos50chr15q26.3 · 98000001–101991189 · gnegSPINT1pq1 bp101,991,189 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr15:40,843,513–40,860,274
Gene span
16,762 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000562057 ★40,844,048–40,858,20711
ENST0000090787240,843,513–40,860,27411
ENST0000090787340,843,755–40,860,27412
ENST0000034405140,843,992–40,860,27411
ENST0000090787440,843,992–40,860,2749
ENST0000090787740,843,992–40,860,2745
ENST0000094372540,843,992–40,860,2749
ENST0000107211840,843,992–40,860,27411
ENST0000107212040,843,992–40,857,65511
ENST0000113259940,843,992–40,860,27411
ENST0000056882340,844,067–40,853,7835
ENST0000092094240,844,156–40,860,27411

顯示 12/29 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SPINT1 的產物具有絲胺酸蛋白酶抑制作用。來源記載它是 HGFAC 的抑制因子,並可在體外抑制 ST14/matriptase 的絲胺酸蛋白酶活性;後者的證據限於體外實驗,不能據此擴大為其他情境下已確立的作用。

SPINT1 也能抑制 TMPRSS13 的絲胺酸蛋白酶活性,這項抑制作用是透過其 BPTI/Kunitz inhibitor 1 結構域進行。此資訊指出特定結構域與 TMPRSS13 抑制相關,但來源未提供更詳細的分子作用機制或其他生物學過程,因此不宜延伸推論其影響。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 40844048 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SPINT1 ENST00000562057 GRCh38 chr15:40843048-40844148 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGGTTGGCCACAGGATCTGCTAGGCAAAGCTGCTCTGGATGAGAAACTGGGAAGAATGTTCCCATTGGTT
TGGGGGTTGTTAAGCCATCAGGAAAAGGTTTGGAATCTGTATTTTAAGAGAGCATGCTATGTGATTCCTT
CCTCCAGCCCTGCCTTCATCTGTCTTTCACCTGTTCAGACCCTTGCCGTAGAGAATGGTCTCTTAAGAGT
TTTTTACTCAGGAGGAGCAATGAGCTTGGCTTCAAGGAGTCCACTGTTTCGTGAAGGGCATTAACTCAGC
TACTTGGTGAACTGGAACCTCCAGGCTTCCAAGGATGACATTTCCCTGGAAGAAAGTAGCCAGCAGCGTC
CCCTTTGTGAAAGAGAGGAAGCCTGGGCTCCAGGGAAGGGGGCAACAGTCCAATGAGCCATAGCAGGGAA
TGGACCGAACTGTACATACAAGATGAGGAGGGGCCTCGAACAACAGGGAAGCCCCGTGGAGCACGCAGGG
GAGCCTGGACGCGGGGAATCGCCTCCGTTTCTCACCCTGACAGCAGGGAGGGCTTCCCGGAGCTGACAGT
GAGGCAGACATCCCGGATCCCTGTTATCACAGGTGCAGCCACGCAACTTTTGGGTTACCTTCCCGCCACG
AAATGGAAATGATTTCCTGAGGGCCGGAAAGATCATTTGCATCGGGCCTCAGGTCTGGGGCTGGGAAAGC
AGGCCCCGGCCGGAAAGGAAGACTGGAGGCCGCCGCCCCAGAGGCCGGACCCTCGCGTCCCGGCCGCATC
CCCTCCCGGCTGGGTATGCGCTTCGGGCGCGGGGCTCCCTCGCGAGGCTGGACTGGGTGGAGCCCGAGAG
CCCCTCCGGGGAGCTGGCTGCCGGGGAGGCACCGGGGCTGCGGGGCCGCGGGGCGGGCCGGGCCTGGAGC
TCCGCGCTAGAGGCGGCCGCAGCGCACCGGGCGTGGGCGGGGCCGGCAGCGCAAGGGTGAATGTCGGCCC
CGCCCCGACGGCGCTGACTCAGTTTCACCAGAAACCAGGGGGAGAAGGCGGCCGAGCCCCAGCTCTCCGA
GCACCGGGTCGGAAGCCGCGACCCGAGCCGCGCAGGAAGCTGGGACCGGAA
SPINT1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SPINT1_1 ↗15:40,844,048正股40,843,999–40,844,058
SPINT1_2 ↗15:40,844,477正股40,844,428–40,844,487

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR15_BB4T5 · promoter · 40843528–40844058 · regulatory

ENSR15_9L7PC · enhancer · 40844059–40844401 · regulatory

ENSR15_BB4T8 · promoter · 40844402–40845126 · regulatory

ENSR15_C63FP · enhancer · 40845401–40846543 · regulatory

ENSR15_C63FS · enhancer · 40846793–40848000 · regulatory

· motif · 40843985–40843998 · motif

· motif · 40843991–40844004 · motif

· motif · 40844337–40844350 · motif

· motif · 40844485–40844497 · motif

· motif · 40844531–40844538 · motif

· motif · 40844989–40845006 · motif

· motif · 40845713–40845725 · motif

· motif · 40845716–40845723 · motif

· motif · 40845717–40845730 · motif

· motif · 40846990–40847003 · motif

· motif · 40846990–40847003 · motif

· motif · 40847018–40847030 · motif

· motif · 40847269–40847284 · motif

· motif · 40847516–40847527 · motif

· motif · 40847516–40847527 · motif

· motif · 40847516–40847529 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:529 aa

1 aa529 aa結構域訊號胜肽
依 O43278 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SPINT1 蛋白質全長為 529 個胺基酸。其序列註解包含位於第 1–35 位的訊號序列,以及 MANSC 結構域(第 57–140 位)。另有兩個 BPTI/Kunitz 抑制劑結構域,分別位於第 250–300 位與第 391–441 位;第 334–370 位則註解為 LDL-receptor class A 結構域。

訊號胜肽1–35 aa
結構域MANSC57–140 aa
結構域BPTI/Kunitz inhibitor 1250–300 aa
結構域LDL-receptor class A334–370 aa
結構域BPTI/Kunitz inhibitor 2391–441 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 5H7V…

PDB · 5H7V

X-ray · 3.82 A · A=36-457

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted;Cytoplasm;Cell membrane

來源列出 SPINT1 位於分泌物、細胞質與細胞膜。 資料未說明這些位置之間的轉換條件、動態或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 18 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HAISPINT1HGFACADAM33AGR3CLDN11CLEC7AFAM3CKRTAP1-3MALSLC38A7SMCO4TFTMEM109TMEM190TMEM97TSPAN33UBQLN2UPK1BVAMP5
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 18 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SPINT1 與 HGFAC 及 TMPRSS13 有交互作用。對 TMPRSS13 而言,交互作用可促進其磷酸化及細胞膜定位;這項描述指出交互作用相關的功能結果,但未將其表述為兩者共同構成複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SPINT1 可抑制 HGFAC;在體外也能抑制 ST14/matriptase 的絲胺酸蛋白酶活性。此外,SPINT1 透過 BPTI/Kunitz inhibitor 1 結構域抑制 TMPRSS13 的絲胺酸蛋白酶活性。含實驗來源
證據與來源

Inhibitor of HGFAC. Inhibits serine protease activity of ST14/matriptase in vitro. Inhibits serine protease activity of TMPRSS13, via the BPTI/Kunitz inhibitor 1 domain

PMID 20977675 ↗ · PMID 28710277 ↗ · PMID 9045658 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SPINT1 與 HGFAC 及 TMPRSS13 交互作用。與 TMPRSS13 的交互作用可促進 TMPRSS13 的磷酸化,並促進其定位至細胞膜。含實驗來源
證據與來源

Interacts with HGFAC. Interacts with TMPRSS13; the interaction promotes the phosphorylation and cell membrane localization of TMPRSS13

PMID 15713485 ↗ · PMID 28710277 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SPINT1 的定位資料列出分泌物、細胞質及細胞膜,未提供各位置間轉換的條件或動態資訊。含實驗來源
證據與來源

Secreted; Cytoplasm; Cell membrane

PMID 9045658 ↗ · PMID 28710277 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000562057 · 2,978 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTTTCACCAGAAACCAGGGGGAGAAGGCGGCCGAGCCCC40
41AGCTCTCCGAGCACCGGGTCGGAAGCCGCGACCCGAGCCG80
81CGCAGGAAGCTGGGACCGGAACCTCGGCGGACCCGGCCCC120
121ACCCAACTCACCTGCGCAGGTCACCAGCACCCTCGGAACC160
161CAGAGGCCCGCGCTCTGAAGGTGACCCCCCTGGGGAGGAA200
201GGCGATGGCCCCTGCGAGGACGATGGCCCGCGCCCGCCTC240
241GCCCCGGCCGGCATCCCTGCCGTCGCCTTGTGGCTTCTGT280
281GCACGCTCGGCCTCCAGGGCACCCAGGCCGGGCCACCGCC320
321CGCGCCCCCTGGGCTGCCCGCGGGAGCCGACTGCCTGAAC360
361AGCTTTACCGCCGGGGTGCCTGGCTTCGTGCTGGACACCA400
401ACGCCTCGGTCAGCAACGGAGCTACCTTCCTGGAGTCCCC440
441CACCGTGCGCCGGGGCTGGGACTGCGTGCGCGCCTGCTGC480
481ACCACCCAGAACTGCAACTTGGCGCTAGTGGAGCTGCAGC520
521CCGACCGCGGGGAGGACGCCATCGCCGCCTGCTTCCTCAT560
561CAACTGCCTCTACGAGCAGAACTTCGTGTGCAAGTTCGCG600
601CCCAGGGAGGGCTTCATCAACTACCTCACGAGGGAAGTGT640
641ACCGCTCCTACCGCCAGCTGCGGACCCAGGGCTTTGGAGG680
681GTCTGGGATCCCCAAGGCCTGGGCAGGCATAGACTTGAAG720
721GTACAACCCCAGGAACCCCTGGTGCTGAAGGATGTGGAAA760
761ACACAGATTGGCGCCTACTGCGGGGTGACACGGATGTCAG800
801GGTAGAGAGGAAAGACCCAAACCAGGTGGAACTGTGGGGA840
841CTCAAGGAAGGCACCTACCTGTTCCAGCTGACAGTGACTA880
881GCTCAGACCACCCAGAGGACACGGCCAACGTCACAGTCAC920
921TGTGCTGTCCACCAAGCAGACAGAAGACTACTGCCTCGCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。