演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SPINK1Spink3

serine peptidase inhibitor Kazal type 1

SPINK1 編碼一種 Kazal 型絲胺酸蛋白酶抑制劑,具有抗胰蛋白酶活性;在胰臟中可防止酶原過早活化。

Homo sapiens5q32UniProt P00995
OFFICIAL SYMBOL
SPINK1
CHROMOSOME
5
UNIPROT
P00995
PDB / ALPHAFOLD
1CGI
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SPINK1(serine peptidase inhibitor Kazal type 1)是蛋白質編碼基因,產物屬於 Kazal 型絲胺酸蛋白酶抑制劑。來源描述其具有抗胰蛋白酶活性,並指出它在胰臟中可保護酶原,避免遭胰蛋白酶催化而過早活化。蛋白質長 79 個胺基酸,具有訊號序列及 Kazal-like 結構域;其作為分泌蛋白。

Official symbol
SPINK1
Gene name
serine peptidase inhibitor Kazal type 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11244
UniProt
P00995
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
Spink3PCTTPSTITATI

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q32
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegSPINK1pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr5:147,824,572–147,831,679
Gene span
7,108 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000296695 ★147,824,582–147,831,6714
ENST00001138392147,824,582–147,831,6794
ENST00000510027147,827,086–147,831,6793

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SPINK1 的產物是絲胺酸蛋白酶抑制劑,來源指出它具有抗胰蛋白酶活性。在胰臟中,這項抑制作用可防止胰蛋白酶催化酶原過早活化;此胰臟保護作用的註記屬於相似性推論(By similarity),因此應保留其推論性質,而非視為此來源直接證實的機制。

SPINK1 也與雄性生殖道中的精子功能相關。它會結合精子頭部,並藉由抑制鈣離子攝取及一氧化氮(NO)生成,調節精子獲能。來源將此作用描述為調節,而未提供其結合分子或更進一步的細胞機制;因此可確認的是這些抑制作用與精子獲能調節之間的關係,不宜延伸為其他未述明的功能。

這些資料呈現 SPINK1 在不同情境下的作用:胰臟中的抗胰蛋白酶活性涉及避免酶原過早活化,雄性生殖道中的作用則與精子頭部結合及獲能調節有關。現有來源未提供更廣泛的分子互作、作用調控或其他生物過程資訊。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 147831671 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SPINK1 ENST00000296695 GRCh38 chr5:147831571-147832671 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTCCACAGGCCAATTTAAGGGGCATCAAGTGATAGTTGCAGGGAAAGTACAGTGTGTTAAAGGAAAGAA
AGGCCAAGCTTTTAAAAACCCGAAATCTTTTGTAAAGGGCAATTAACATGGTCTTTGCCCTAGAAGGAGA
TATTAACTTTATTACACTAAACAGTAAACAAACCTGCCTTTTGGTGCAGAGGGAGACATTACGTATTTTC
TAAGGTCGTTTGTTATATAAACACCCTTAAAAAGATAGTCTGAAACAAAGGTTATCAGTACCTCTACTCA
TAAGACACACCAAAACATGAGAGAGGATGGAGAATTCTCTTCTAATAACACATGGTAGATATCCAGCACA
TATTCTCTTTTACCCAGCACATATTCTCAGATGAAAGAGTAACCCTTTGAATTAGGTGTTATTATTATTT
TAATTTCCAGATGAATACACAGAAGCACAGCAAAAGTGGCTCCAACAAGCACCCTCTAGCTCCAGAATAC
ACGCTTTAGGGAACTGAGTCCTCTCTCTCTCTTGCTTTCTCTTTCCCTCTCATCTGCCACTCCATCAGCT
ACTTTAGGTTTTGTGAATGAGTGAGGGAAAAATAGAGAAAAGAGAAAGAAGAATAAGAAAGGAAGAGTGG
AGGAAAGGAAAAAAGAATGGAGAGGTTTTACCCTACTTGGAATAAAATTCTTTCTAGTAGCTATCCATAC
CTGCTCATCTATCCAGAACTACAGAGTAGAAGGGATCTTTGAGTTCATCTTACAGGTGAGAAAACAGGCT
TGAGAAGGGAATGACTTTCCCACAACCACAGAGGGAGTTAGGGATCAAACTAACCACTAGAACTATTTTC
CTGACAGAATCTTTGCCTTGCATGTTTCAGGCCCACCTGGCTCCTTTCACCTTTCTTACACAGGTGACAT
TCCCAGAACCTGGAGGCCAGGCTATGACACAGAGTCAATCAATAACCAGGGAGATCTGTGATATAGCCCA
GTAGGTGGGGCCTTGCTGCCATCTGCCATATGACCCTTCCAGTCCCAGGCTTCTGAAGAGACGTGGTAAG
TGCGGTGCAGTTTTCAACTGACCTCTGGACGCAGAACTTCAGCCATGAAGG
SPINK1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SPINK1_2 ↗5:147,831,635負股147,831,625–147,831,684
SPINK1_1 ↗5:147,839,196負股147,839,186–147,839,245

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_B34C68 · enhancer · 147835211–147835782 · regulatory

· motif · 147835499–147835508 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:79 aa

1 aa79 aa結構域訊號胜肽
依 P00995 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SPINK1 蛋白質長 79 個胺基酸。其第 1 至 23 位為訊號序列,第 26 至 79 位註記為 Kazal-like 結構域。

訊號胜肽1–23 aa
結構域Kazal-like26–79 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1CGI…

PDB · 1CGI

X-ray · 2.30 A · I=24-79

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

SPINK1 被註記為分泌蛋白;來源未提供其他定位位置或定位改變條件。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
Spink3SPINK1ASPH
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SPINK1 基因變異與遺傳性胰臟炎的疾病易感性相關;此病可有胰臟發炎、胰臟實質永久性破壞、消化不良及嚴重腹痛發作。基因變異也與熱帶鈣化性胰臟炎的易感性相關。該病是慢性胰臟炎的一種特發性、青少年及非酒精性形式,可伴隨纖維結石性胰臟糖尿病,且涉及環境與遺傳因素。這些資料描述的是易感性關聯,並未表示變異必然造成疾病。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SPINK1 產物是絲胺酸蛋白酶抑制劑,具有抗胰蛋白酶活性。在胰臟中,它可防止胰蛋白酶催化酶原過早活化;這項胰臟保護作用標示為依相似性推論,並非此處直接確認。含實驗來源
證據與來源

Serine protease inhibitor which exhibits anti-trypsin activity. In the pancreas, protects against trypsin-catalyzed premature activation of zymogens (By similarity)

PMID 7142173 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能在雄性生殖道中,SPINK1 會結合精子頭部,並透過抑制鈣離子攝取與一氧化氮(NO)生成,調節精子獲能。來源未提供其他作用條件或進一步機制。推論支持
證據與來源

In the male reproductive tract, binds to sperm heads where it modulates sperm capacitance by inhibiting calcium uptake and nitrogen oxide (NO) production

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted含實驗來源
證據與來源

Secreted

PMID 7142173 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯遺傳性胰臟炎的特徵包括胰臟發炎、胰臟實質永久性破壞、消化不良及嚴重腹痛發作。SPINK1 基因變異與此病的易感性相關,來源未將此關聯表述為必然因果。含實驗來源
證據與來源

Pancreatitis, hereditary PCTT A disease characterized by pancreas inflammation, permanent destruction of the pancreatic parenchyma, maldigestion, and severe abdominal pain attacks. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 167800

PMID 10691414 ↗ · PMID 10835640 ↗ · PMID 12974284 ↗ · PMID 18617776 ↗ · PMID 19888199 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯熱帶鈣化性胰臟炎是慢性胰臟炎的特發性、青少年及非酒精性形式,常見於若干熱帶國家。其可能伴隨纖維結石性胰臟糖尿病,並受環境與遺傳因素影響;SPINK1 變異與疾病易感性相關,而非必然造成疾病。含實驗來源
證據與來源

Tropical calcific pancreatitis TCP Idiopathic, juvenile, nonalcoholic form of chronic pancreatitis widely prevalent in several tropical countries. It can be associated with fibrocalculous pancreatic diabetes (FCPD) depending on both environmental and genetic factors. TCP differs from alcoholic pancreatitis by a much younger age of onset, pancreatic calcification, a high incidence of insulin dependent but ketosis resistant diabetes mellitus, and an exceptionally high incidence of pancreatic cancer. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 608189

PMID 12011155 ↗ · PMID 12187509 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000296695 · 413 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATCTGCCATATGACCCTTCCAGTCCCAGGCTTCTGAAGAG40
41ACGTGGTAAGTGCGGTGCAGTTTTCAACTGACCTCTGGAC80
81GCAGAACTTCAGCCATGAAGGTAACAGGCATCTTTCTTCT120
121CAGTGCCTTGGCCCTGTTGAGTCTATCTGGTAACACTGGA160
161GCTGACTCCCTGGGAAGAGAGGCCAAATGTTACAATGAAC200
201TTAATGGATGCACCAAGATATATGACCCTGTCTGTGGGAC240
241TGATGGAAATACTTATCCCAATGAATGCGTGTTATGTTTT280
281GAAAATCGGAAACGCCAGACTTCTATCCTCATTCAAAAAT320
321CTGGGCCTTGCTGAGAACCAAGGTTTTGAAATCCCATCAG360
361GTCACCGCGAGGCCTGACTGGCCTTATTGTTGAATAAATG400
401TATCTGAATATCC413

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。