基因總覽
SPIB 是蛋白質編碼基因，產物名稱為 Spi-B transcription factor，屬於 ETS family。這種轉錄因子具有序列辨識能力，並含有與轉錄活化相關的區域；其蛋白質長度為 262 個胺基酸。來源所述的基本角色包括調控基因轉錄，以及參與特定免疫細胞的發育與 B 細胞相關訊號。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000595883 ★ | 50,418,938–50,431,314 | 6 |
| ENST00000597855 | 50,418,931–50,428,124 | 6 |
| ENST00000596074 | 50,418,931–50,428,587 | 5 |
| ENST00000270632 | 50,418,931–50,431,314 | 6 |
| ENST00000991055 | 50,418,931–50,431,314 | 6 |
| ENST00001143212 | 50,418,931–50,431,314 | 6 |
| ENST00000439922 | 50,418,938–50,431,314 | 5 |
| ENST00000594685 | 50,418,954–50,423,027 | 4 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Spi-B transcription factor 是序列特異性的轉錄活化因子，可辨識稱為 PU-box 的富含嘌呤 DNA 序列，其序列為 5'-GAGGAA-3'。PU-box 可作為淋巴系特異性增強子，因此 SPIB 能透過辨識這類 DNA 序列參與轉錄調控；來源未進一步界定其調控的特定目標基因或完整分子機制。
SPIB 也促進漿細胞樣樹突細胞（pDC）的發育。這類細胞亦稱為第二型樹突細胞前驅細胞（pre-DC2）或天然干擾素（IFN）產生細胞，具有大量產生 IFN 的能力，並能阻止病毒複製。這些描述指出 SPIB 與具抗病毒能力的免疫細胞形成相關，但來源未說明其促進 pDC 發育的具體步驟，也未將 SPIB 本身的作用等同於 IFN 產生或病毒複製抑制。
此外，SPIB 可能是 B 細胞受體（BCR）訊號所需的因子。BCR 訊號對正常 B 細胞發育及抗原刺激具有必要性；因此，SPIB 與此訊號的關聯，將其功能延伸至 B 細胞相關過程。不過，來源以「可能需要」描述這項作用，未提供其在 BCR 訊號中的直接分子步驟或作用條件，故不能據此推定其作用方式或影響範圍。
Promoter 與基因調控
>SPIB ENST00000595883 GRCh38 chr19:50417938-50419038 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGCCTGGTGACCTTGCAAGCATCCCATGGGGCGGGGGCGGGACCAGGGAGAATTAATAAAGTTCTGGACT TTTGCTATATGGTGCTTTGTGGTCTCTGGGGGACACTGTCTGGTTTCATAAGCCCTGGCCTTGGCTGGGA CCCTCCTGAGGCCCGCACCGCCCCTCATCCTCAGCAAAAGCCCCCGGACTCCCACCTGTGCTGCCTGGTT CATGTGGGCCAAGCCTGCCTCAGTTTCCTCTCTGGCCCTGAAGGAACCCTTATACCAGCGCTTCTCTGCC CTGCTTAGGGCCCCCAGGTGTCTGGCCCCGGCCCAGCCCTCCCTGGTGATGACCCTGGGGACCCTGGTGG CTGCCCCGCCCTCCAGGTGCTGACCTGTTTCCTCCAGGCCCTGGGGCAGCCCCAGGCGCACCGGGGCTTC CACTCCTCAGCCCGGCCAAGGGGACCCCCCCATCCCCCGCCGGACCACACACCCACGATGTTTCCACGTC GGGGTCCTGGCAATGGGCTTTGGGTCTGGGTTTCCCCCCAGCGACTCCCATCTCTATCCCCGCAGCCTCT AACTGCCGTCAGATGCCCTCGGCCCTCCCGTCACCTCACACATCCCCCGGGGAGAGTCTTGTGCTTGCCC CTCGGCCCCCAGCCCGCCCCTGCTGGAATTCGGCTCCTGGGTCCAGATCCTCCGTTTCCTGATTCTCCTC TTCAGTGAACCCCAGCCCTTCCTCGATGTTTTCAGGGTTCCCCCAAATCCAGCTCCTGTCCCATCTCCAG CCCTCAAGGTCAGCCCCCCAAACCCAGCCCCACGGGGATCCCCAAATCCAGACAGCCCCTGGCCCGCCAT CCCTGCCATGTGACAAAGGGGTTGTGCAATCCAGCCCCCTCCCCTGACCCCCTCCCTGAGGGGATTTTTG AGGAGGGCCGAGCTTGTGGCCAGCGGGCACCCTCCTCCCCCCGGCAGGGGCTGGGCCAAGATATAAATAG GGTTGGCGGCTGCAGCGGGCGGCAAACAGCCCGCCCGGCACCACCATGCTCGCCCTGGAGGCTGCACAGT AAGTGAGGGCCCCCAAACCTGCACCCGGGGTCCCCACCTGCACTGCCCCTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPIB_1 ↗ | 19:50,418,938 | 正股 | 50,418,889–50,418,948 |
| SPIB_3 ↗ | 19:50,428,029 | 正股 | 50,427,980–50,428,039 |
| SPIB_2 ↗ | 19:50,428,304 | 正股 | 50,428,255–50,428,314 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_5FT6JH · CTCF_binding_site · 50414931–50414952 · regulatory
ENSR19_5FT6T7 · CTCF_binding_site · 50416810–50416831 · regulatory
ENSR19_BD26D · promoter · 50418448–50418968 · regulatory
ENSR19_C7248 · enhancer · 50418969–50420211 · regulatory
· motif · 50414889–50414906 · motif
· motif · 50414933–50414949 · motif
· motif · 50415129–50415136 · motif
· motif · 50415465–50415478 · motif
· motif · 50415465–50415478 · motif
· motif · 50415670–50415683 · motif
· motif · 50415817–50415830 · motif
· motif · 50415824–50415831 · motif
· motif · 50415872–50415885 · motif
· motif · 50416003–50416010 · motif
· motif · 50416130–50416145 · motif
· motif · 50416135–50416147 · motif
· motif · 50416139–50416152 · motif
· motif · 50416142–50416154 · motif
· motif · 50416145–50416152 · motif
· motif · 50416145–50416160 · motif
· motif · 50416150–50416162 · motif
· motif · 50416153–50416160 · motif
· motif · 50416172–50416185 · motif
· motif · 50416175–50416190 · motif
· motif · 50416184–50416197 · motif
· motif · 50416242–50416254 · motif
· motif · 50416246–50416259 · motif
· motif · 50416387–50416404 · motif
· motif · 50416812–50416828 · motif
· motif · 50416897–50416910 · motif
· motif · 50416897–50416910 · motif
· motif · 50416898–50416911 · motif
· motif · 50416898–50416911 · motif
· motif · 50416942–50416955 · motif
· motif · 50416942–50416955 · motif
· motif · 50417249–50417262 · motif
· motif · 50417249–50417262 · motif
· motif · 50417265–50417274 · motif
· motif · 50417339–50417352 · motif
· motif · 50417567–50417580 · motif
· motif · 50417567–50417580 · motif
· motif · 50417606–50417619 · motif
· motif · 50417609–50417622 · motif
· motif · 50417941–50417953 · motif
· motif · 50417957–50417970 · motif
· motif · 50417957–50417970 · motif
· motif · 50418017–50418032 · motif
· motif · 50418024–50418032 · motif
· motif · 50418267–50418280 · motif
· motif · 50418267–50418280 · motif
· motif · 50418299–50418308 · motif
· motif · 50418539–50418552 · motif
· motif · 50418539–50418552 · motif
· motif · 50418674–50418685 · motif
· motif · 50418733–50418746 · motif
· motif · 50418733–50418746 · motif
· motif · 50418798–50418807 · motif
· motif · 50418798–50418807 · motif
· motif · 50418818–50418830 · motif
· motif · 50418821–50418828 · motif
· motif · 50418861–50418876 · motif
· motif · 50418907–50418918 · motif
· motif · 50419020–50419029 · motif
· motif · 50419401–50419421 · motif
· motif · 50419618–50419635 · motif
· motif · 50419661–50419670 · motif
· motif · 50419720–50419733 · motif
· motif · 50419770–50419779 · motif
· motif · 50419802–50419819 · motif
· motif · 50419983–50419996 · motif
· motif · 50419983–50419996 · motif
· motif · 50420164–50420175 · motif
· motif · 50420381–50420393 · motif
· motif · 50420502–50420517 · motif
· motif · 50420799–50420810 · motif
· motif · 50421494–50421505 · motif
· motif · 50421541–50421556 · motif
· motif · 50421546–50421558 · motif
· motif · 50421549–50421556 · motif
· motif · 50421549–50421564 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：262 aa
Spi-B transcription factor 長 262 個胺基酸，屬於 ETS family。其 ETS DNA 結合區位於第 169 至 252 個胺基酸；N 端另有酸性轉錄活化區 TAD1（第 1–31 位）及 TAD2（第 41–61 位）。第 140 至 163 位被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Isoform 1 定位於細胞核；Isoform 2 則位於細胞質。 來源分別描述兩種異構型的定位，未提供兩者之間的轉換條件或定位變化機制。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 18 experiments
Spi-B transcription factor 可形成同源交互作用，並與 IRF4/Pip、JUN 及 TBP 交互作用。來源另指出它可能與 CREBBP、EP300 交互作用；與 NONO/p54(nrb) 的交互作用則標示為依序列相似性推定。這些資料描述蛋白質交互作用，未進一步說明相關複合體的組成或功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Spi-B transcription factor 是序列特異性轉錄活化因子，可結合富含嘌呤的 PU-box DNA 序列（5'-GAGGAA-3'），該序列可作為淋巴系特異性增強子。它促進漿細胞樣樹突細胞（pDC）發育；此類細胞亦稱第二型樹突細胞前驅細胞（pre-DC2）或天然 IFN 產生細胞，能大量產生 IFN 並阻止病毒複製。此外，SPIB 可能是 BCR 訊號所需因子，而該訊號對正常 B 細胞發育及抗原刺激具有必要性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Sequence specific transcriptional activator which binds to the PU-box, a purine-rich DNA sequence (5'-GAGGAA-3') that can act as a lymphoid-specific enhancer. Promotes development of plasmacytoid dendritic cells (pDCs), also known as type 2 DC precursors (pre-DC2) or natural interferon (IFN)-producing cells. These cells have the capacity to produce large amounts of interferon and block viral replication. May be required for B-cell receptor (BCR) signaling, which is necessary for normal B-cell development and antigenic stimulation PMID 10196196 ↗ · PMID 12393575 ↗ · PMID 1406622 ↗ · PMID 15583020 ↗ |
| 交互作用 | SPIB 可形成同源交互作用，並與 IRF4/Pip、JUN 及 TBP 交互作用；它可能也與 CREBBP、EP300 交互作用。來源另依序列相似性推定 SPIB 與 NONO/p54(nrb) 交互作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Can form homotypic interactions. Interacts with IRF4/Pip. Interacts with JUN. Interacts with TBP. May also interact with CREBBP and EP300. Interacts with NONO/p54(nrb) (By similarity) PMID 10196196 ↗ · PMID 11864910 ↗ |
| 細胞定位 | Isoform 1 位於細胞核。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Isoform 2 位於細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GGCAAACAGCCCGCCCGGCACCACCATGCTCGCCCTGGAG40GCTGCACAGCTCGACGGGCCACACTTCAGCTGTCTGTACC80CAGATGGCGTCTTCTATGACCTGGACAGCTGCAAGCATTC120CAGCTACCCTGATTCAGAGGGGGCTCCTGACTCCCTGTGG160GACTGGACTGTGGCCCCACCTGTCCCAGCCACCCCCTATG200AAGCCTTCGACCCGGCAGCAGCCGCTTTTAGCCACCCCCA240GGCTGCCCAGCTCTGCTACGAACCCCCCACCTACAGCCCT280GCAGGGAACCTCGAACTGGCCCCCAGCCTGGAGGCCCCGG320GGCCTGGCCTCCCTGCATACCCCACGGAGAACTTCGCTAG360CCAGACCCTGGTTCCCCCGGCATATGCCCCGTACCCCAGC400CCTGTGCTATCAGAGGAGGAAGACTTACCGTTGGACAGCC440CTGCCCTGGAGGTCTCGGACAGCGAGTCGGATGAGGCCCT480CGTGGCTGGCCCCGAGGGGAAGGGATCCGAGGCAGGGACT520CGCAAGAAGCTGCGCCTGTACCAGTTCCTGCTGGGGCTAC560TGACGCGCGGGGACATGCGTGAGTGCGTGTGGTGGGTGGA600GCCAGGCGCCGGCGTCTTCCAGTTCTCCTCCAAGCACAAG640GAACTCCTGGCGCGCCGCTGGGGCCAGCAGAAGGGGAACC680GCAAGCGCATGACCTACCAGAAGCTGGCGCGCGCCCTCCG720AAACTACGCCAAGACCGGCGAGATCCGCAAGGTCAAGCGC760AAGCTCACCTACCAGTTCGACAGCGCGCTGCTGCCTGCAG800TCCGCCGGGCCTGAGCACACCCGAGGCTCCCACCTGCGGA840GCCGCTGGGGGACCTCACGTCCCAGCCAGGATCCCCCTGG880AAGAAAAAGGGCGTCCCCACACTCTAGGTGATAGGACTTA920CGCATCCCCACCTTTTGGGGTAAGGGGAGTGCTGCCCTGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。