基因總覽
SPATC1L 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 spermatogenesis and centriole associated 1 like。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 21q22.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000291672 ★ | 46,161,160–46,184,459 | 5 |
| ENST00000330205 | 46,161,148–46,184,476 | 4 |
| ENST00000872417 | 46,161,148–46,184,476 | 4 |
| ENST00000872418 | 46,161,148–46,184,467 | 4 |
| ENST00000872419 | 46,161,148–46,184,476 | 5 |
| ENST00000872420 | 46,161,148–46,184,476 | 5 |
| ENST00000967863 | 46,161,148–46,184,476 | 5 |
| ENST00000967864 | 46,161,148–46,184,476 | 4 |
| ENST00001131424 | 46,161,148–46,184,476 | 5 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SPATC1L ENST00000291672 GRCh38 chr21:46184359-46185459 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTAGTTCTAGATAGCTTCACAGATGAATTCTATCCGACGTTTAAGAAGGAACACCCAGAAAATGGCGCAG AATCTCTGCGGCTCATTTTAAAAGGCCAGTGTTCCAAAGCCAGACCGAGACATCACAAGAAAAGGAGATT CAGATCGACTTCCCCTGTGAGCATAAAAATACTTAAAATATTAATAAATTGAATCCAGCGCTATATTAAA AGGATAATGTGTCAAGACCAGAAAACTGTCAGAATGTTGATAGGTCCGTGGCTGGAGAGTACCTGACGTC AAGAGAAGGTTTCCTTGGAGCGGGAGGAAGACGGCATTTAAAATATGATGGGAGGAGCCAGGGCAGGAAA AGCCATTCAGGGCCCCGTCGGGCTCAGAGCGGGGGGCGCATCCGTGACTCATCCCTCGCTTCTCTCTCTG CCCTGCATCCTGGACGCCCTGCATGCCCTCGTCAGTGGGCTGTGGCTGGGCCCCCGTTGTCTTGATCTGA GGTGTGAGCCCTGTGGTGCAACACCAGGCTGGTTGGGTTGTGTCAGGAACGCTTGGGGTGTAGAAACCTC CTTTCTCCACAAAGCCTGACTCAAGACTTTCTCTCCTAGAAGCAACCTTCCCCTAATCTGGCCGCCCGGG CTGAATGAAGGTGGTGTTCTCCCAGGGGCATCTGCACCTGAGTGCCCTTGGTGGTCCTGAGTGCCCGTCA CAGGGCTGGAGGTGTGGCCGGCCCACTGGGATGGTGGTGGTGGTGGGTGCCCATCACAGGGCTGGAGGTG TGGCCGGCCCACTGGGTTGGTGGTGGTGGGTGCCCGTCACAGGGCTGGAGGTGTGGCCGGCCCACTGGGT TGGTGGTGGTGGGTGCCCGTCACAGGGCTGGAGGTGTGGCCGGCCCACTGGGTTGGTGGTGGTGGGTGCC CGTCACAGGGCTGGAGGTGTGGCCGGCCCACTGGGTTGGTGGTGGTGGGTGCCCGTCACAGGGCTGGAGG TGTGGCCGGCCCACTGGGTTGTGCTTTCTGCCGTACGTCCCTTCCCATGAGGATGAGATGACCCATCTGT TGCATCCCGGCTGCTGATAAAACAAGACCCTCGGAGCCAAGAAACAACACT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPATC1L_2 ↗ | 21:46,173,966 | 負股 | 46,173,956–46,174,015 |
| SPATC1L_1 ↗ | 21:46,184,450 | 負股 | 46,184,440–46,184,499 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR21_83CMRS · enhancer · 46180415–46180662 · regulatory
ENSR21_C6KPS · enhancer · 46182637–46184448 · regulatory
ENSR21_9NBXL · promoter · 46184449–46184771 · regulatory
ENSR21_BC6GT · enhancer · 46184772–46185477 · regulatory
ENSR21_C6KQ8 · enhancer · 46188356–46189924 · regulatory
ENSR21_5DTBX7 · CTCF_binding_site · 46189042–46189063 · regulatory
· motif · 46184074–46184089 · motif
· motif · 46184079–46184091 · motif
· motif · 46184082–46184089 · motif
· motif · 46184426–46184439 · motif
· motif · 46184426–46184439 · motif
· motif · 46184444–46184461 · motif
· motif · 46184474–46184484 · motif
· motif · 46184476–46184485 · motif
· motif · 46184527–46184537 · motif
· motif · 46184529–46184538 · motif
· motif · 46184580–46184590 · motif
· motif · 46184582–46184591 · motif
· motif · 46184633–46184643 · motif
· motif · 46184635–46184644 · motif
· motif · 46184686–46184696 · motif
· motif · 46184688–46184697 · motif
· motif · 46184742–46184752 · motif
· motif · 46184744–46184753 · motif
· motif · 46184799–46184812 · motif
· motif · 46184959–46184971 · motif
· motif · 46185058–46185066 · motif
· motif · 46186807–46186818 · motif
· motif · 46189044–46189060 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：340 aa
Speriolin-like protein 屬於 speriolin family，全長 340 個胺基酸。序列註解指出第 42–73 與第 94–135 位各有一段無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 42 個夥伴
- ARL4AP40617 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARMC7Q9H6L4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- FSD2A1L4K1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- IKZF1Q13422 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LZTS2Q9BRK4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PHC2Q8IXK0-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PNMA1Q8ND90 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- SIAH1Q8IUQ4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TCF4P15884 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM27P14373 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- ACOT7O00154-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATPAF2Q8N5M1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CABP2Q9NPB3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DISC1Q9NRI5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EXOSC8Q96B26 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FOXN1O15353 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA6AQ9NYA3 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GTF3C6Q969F1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOOK2Q96ED9-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KIFC3Q9BVG8-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MISPQ8IVT2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTUS2Q5JR59-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MYO15BQ96JP2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NCK2O43639 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | SPATC1L 的定位資料標示其位於細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTGCTTTCTGCCGTACGTCCCTTCCCATGAGGATGAGATG40ACCCATCTGTTGCATCCCGGCTGCTGATAAAACAAGACCC80TCGGAGCCAAGAAACAACACTGAGGCTGATCTCCCCGCCC120AGGCTGGTCTCCCCCGCAGGCTGGTCTCCCCCGCAAGCTG160GTCTCCTCCCCCAGGCTGGTCTCCTCACCAGGCTGGTCTC200CTCCCCCAGGCTGATCTCCCCGCCCAGGCTGGTCTCCCCC240GCAGGCTGGTCTCCCCCACAAGGCTGGTCTCCTCCCCCAG280GCTGGTCTCCTCACCAGGCTGGTCTCCTCCCCCAGGCTGA320TCTCCCCGCCCAGGCTGGTCTCCCCCGCAGGCTGGTCTCC360CCCGCAAGCTGGTCTCCCCTGCAGGCTGGTCTCCTCCCCA400GGCTGGTCTCCCCCGCAGACTGGTCTCCCCCACAAGCTGG440TCTCCCCACCAGGCTGGTCTCCCCCACATGCTGGTCTCCT480CCCACTGCCCTTGCCAGTCCCTCCCTCCTCAAGTGTGGGT520GCCAAGGACGGACCCTGATGAACACCTGCACATCAGTTGC560TGCCCTGGGTGCCAGGGTCCACAGGAAGCTGCACTGGGAA600CCCTGTGTCCTGGGCAGGTCCTATGGGAAGTGCAGCCCAC640ATGTTACTCGGGTGAAGGCAGCGTCCCCACCCAGCTTGAG680GACACCACACAGGGTGGACACCCGACCCTGGCTGGGCCGC720TCAATGGGGAGTGGCTTGGACGCCCCTCTTGGAGTACAGT760CGCTACATCCCGTAGCTGCCTAATGTCCTTGGCATTCTCG800GGCCCTGGTCATAATGTGGGAGTGGCTGCCTGTGCACGCC840ACGGGCCTCCAGCTTCACTGCCTCAACGGGGCCATGAGCC880ATCGCGGGGGCAGGCAGGGTGCTGGGCACCTCATCACTAG920GGCAGTGACATCACAAGGCGTGGAAGGCGGTGGTGGCTAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。