基因總覽
SPARCL1 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 SPARC like 1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 4q22.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000282470 ★ | 87,473,335–87,529,376 | 11 |
| ENST00000418378 | 87,473,329–87,529,890 | 12 |
| ENST00000503414 | 87,473,329–87,529,092 | 12 |
| ENST00000880787 | 87,473,329–87,531,118 | 11 |
| ENST00000880788 | 87,473,329–87,531,118 | 13 |
| ENST00000880789 | 87,473,329–87,531,118 | 14 |
| ENST00000880790 | 87,473,329–87,530,923 | 12 |
| ENST00000880791 | 87,473,329–87,530,923 | 11 |
| ENST00000880792 | 87,473,329–87,529,862 | 12 |
| ENST00000880793 | 87,473,329–87,529,890 | 11 |
| ENST00000880794 | 87,473,329–87,529,890 | 11 |
| ENST00000880795 | 87,473,329–87,529,890 | 12 |
顯示 12/50 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SPARCL1 ENST00000282470 GRCh38 chr4:87529276-87530376 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATAATAGCTAACATTTATTGAGTGTCTGCTACGTGGCAGGGGTGTTCTATGCAGTTTATCATGTTAACTA ACTTAAAACTCAGAACAATTGCAGAGATAGATATTATCATCATTTCCATATGTATATCCCTGTCTTATAG ATAAAAGCACTGATGCTTTAGAGAGGTTATATAACTTGTCCCGGGTCATAGTTAGGAAGTGGTGAAGATA GGATGCAAATCCAAGCTGGCTGGCCTCAAATTCTGCCAATCCAACCACTGTATGACACTACCCCTCAAAT GGGAACACAGTAAAACTTACCATGCGTAGTGAGGATCAACTGATAATAACGCATAAAAAGCTGTTAGCAC AGTGTCTGACACATAATAAATGTGTGATAAATGTAGAAGTAGCAGTAGAAGAGATTAGACACATACAAAC AACCAGAATCCCGGGCCAAAAATAAGTGCACACCTCCATTCTTTTTATGGGAAACCTCCTTCTTAGATAC CAACCATTATAACCATGGAGTTACAGTGGAGAGCTGTGTTGAGGGGAGAACTGCAACATTTCTGAATCAG CATACAAGTGATCTATAATATAAGGAGCAATCATTTTTATATATGTCCATTTCCAAATCTCATTCAAAGA AGGTTAAGGTATCTGAAGTACCCTTCTATTAAAATTCAGACTGTATTTGCTAGAACAATTTCCAATTGAG CAACGTAAAAATGCATCTGCTGCCATTTCTCTTCTTCCCTCCTTTAATCCCTACTCCCCAATTTCCTTTA GAAAGAAACAACAGCATGGAGTTTCTTTTCAAGGTCTTAAAATAAAAATCTCCAAAAAAGGGATGCTGCT TATAAAACCTTTCAGAGTTGTTTGAAAAAGAAAAAAAATGCATAAAGAGCCAAGTGCTTATATTCTGGCC AAGTTATGAGGCTCTGAGAACAAGAGCTTGAGGGGAAGACTGTTAACCCCATCCACGCCACCAGAATTAG CTCTTTCCCTTTTGGTTTGCAAGCACTGCCTGTAAAGCCCTCGCATGAGAGGCCAGCCTGCTAGGGAAAT CCAGGAATCTGCAACAAAAACGATGACAGTCTGAAATACTCTCTGGTGCCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPARCL1_1 ↗ | 4:87,529,209 | 負股 | 87,529,199–87,529,258 |
| SPARCL1_2 ↗ | 4:87,529,404 | 負股 | 87,529,394–87,529,453 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR4_939PZQ · enhancer · 87525623–87525963 · regulatory
ENSR4_BMD26 · enhancer · 87527404–87528004 · regulatory
ENSR4_BMD2D · promoter · 87529082–87529593 · regulatory
ENSR4_939Q39 · enhancer · 87530825–87531313 · regulatory
· motif · 87531092–87531101 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：664 aa
SPARC-like protein 1 長 664 個胺基酸，屬於 SPARC family。其序列包含第 1–16 位的訊號胜肽，以及 Follistatin-like、Kazal-like 和 EF-hand 結構域。另有兩段預測為無序區，分別位於第 28–360 位與第 388–426 位；第 25–34 位區域另註記一處 O-醣基化位點。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SPARCL1 為分泌蛋白，定位於細胞外空間及細胞外基質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- MYOCQ99972 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | SPARCL1 被註記為分泌蛋白，位於細胞外空間與細胞外基質。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AAGCACTGCCTGTAAAGCCCTCGCATGAGAGGCCAGCCTG40CTAGGGAAATCCAGGAATCTGCAACAAAAACGATGACAGT80CTGAAATACTCTCTGGTGCCAACCTCCAAATTCTCGTCTG120TCACTTCAGACCCCCACTAGTTGACAGAGCAGCAGAATTT160CAACTCCAGTAGACTTGAATATGCCTCTGGGCAAAGAAGC200AGAGCTAACGAGGAAAGGGATTTAAAGAGTTTTTCTTGGG240TGTTTGTCAAACTTTTATTCCCTGTCTGTGTGCAGAGGGG280ATTCAACTTCAATTTTTCTGCAGTGGCTCTGGGTCCAGCC320CCTTACTTAAAGATCTGGAAAGCATGAAGACTGGGCTTTT360TTTCCTATGTCTCTTGGGAACTGCAGCTGCAATCCCGACA400AATGCAAGATTATTATCTGATCATTCCAAACCAACTGCTG440AAACGGTAGCACCTGACAACACTGCAATCCCCAGTTTAAG480GGCTGAAGCTGAAGAAAATGAAAAAGAAACAGCAGTATCC520ACAGAAGACGATTCCCACCATAAGGCTGAAAAATCATCAG560TACTAAAGTCAAAAGAGGAAAGCCATGAACAGTCAGCAGA600ACAGGGCAAGAGTTCTAGCCAAGAGCTGGGATTGAAGGAT640CAAGAGGACAGTGATGGTCACTTAAGTGTGAATTTGGAGT680ATGCACCAACTGAAGGTACATTGGACATAAAAGAAGATAT720GAGTGAGCCTCAGGAGAAAAAACTCTCAGAGAACACTGAT760TTTTTGGCTCCTGGTGTTAGTTCCTTCACAGATTCTAACC800AACAAGAAAGTATCACAAAGAGAGAGGAAAACCAAGAACA840ACCTAGAAATTATTCACATCATCAGTTGAACAGGAGCAGT880AAACATAGCCAAGGCCTAAGGGATCAAGGAAACCAAGAGC920AGGATCCAAATATTTCCAATGGAGAAGAGGAAGAAGAAAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。