基因總覽
SPARC（secreted protein acidic and cysteine rich）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 SPARC family。蛋白質全長 303 個胺基酸，具有訊號序列，以及 Follistatin-like、Kazal-like 與 EF-hand 結構域。其名稱反映酸性與富含半胱胺酸的特徵；來源資料也指出它能結合多種分子，並具有鈣結合區域。這些基本特性構成其作為分泌型、細胞外基質相關蛋白質的分子背景。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000231061 ★ | 151,661,096–151,686,915 | 10 |
| ENST00001138715 | 151,661,096–151,687,072 | 10 |
| ENST00000896427 | 151,661,447–151,687,325 | 11 |
| ENST00000896428 | 151,661,447–151,687,325 | 10 |
| ENST00000896429 | 151,661,447–151,687,072 | 10 |
| ENST00000896430 | 151,661,447–151,687,072 | 10 |
| ENST00000896442 | 151,661,447–151,685,866 | 10 |
| ENST00000896445 | 151,661,447–151,676,490 | 9 |
| ENST00000931462 | 151,661,447–151,687,072 | 8 |
| ENST00000931463 | 151,661,447–151,687,072 | 6 |
| ENST00000975160 | 151,661,447–151,687,072 | 10 |
| ENST00000896431 | 151,661,449–151,687,072 | 10 |
顯示 12/38 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SPARC 可能透過與細胞外基質及細胞激素的互作調節細胞生長。來源描述的是可能的調節角色，並未進一步界定這些互作如何在不同情境中改變細胞生長，因此不宜將其解讀為單一或已完整確立的作用途徑。
在分子結合方面，SPARC 可結合鈣與銅，也可與數種膠原蛋白、白蛋白、血小板反應蛋白（thrombospondin）、血小板衍生生長因子（PDGF）及細胞膜結合。這些結合對象涵蓋細胞外基質成分及其他分子；來源並未指出各種結合在細胞生長調節中的相對貢獻，也未提供結合發生的具體條件。
SPARC 有兩處鈣結合位點，兩者的結合特性不同：酸性結構域以低親和力結合 5 至 8 個 Ca(2+)，EF-hand loop 則以高親和力結合一個 Ca(2+)。因此，鈣結合不是單一位點、單一親和力的性質，而是由這兩類位點共同構成。現有資料未說明鈣或銅結合如何直接影響其與其他分子的互作，亦未提供由這些結合推導特定細胞反應的證據。
Promoter 與基因調控
>SPARC ENST00000231061 GRCh38 chr5:151686815-151687915 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAAACTTTTTGAGGACAAGGACCAGGTATTTATTAATTCTCATACCTCCCAGAGTGTTAGGCACAAAATA AACATTCAACCAAGACCTGTTGCACTGAGCAGTTCATATATAACAGGAGTGACCCAAGTTGAAACGTAGA ATCAGCCCTCTCATACCACTTTTTGCCAGGTGATCATAGGCAAGTTACTTAGCATCTATGTTTCCTTATT ATTAAAATGGTCATAATTACAATGCCTAAGATAAGGGGTTGCTGTGAAGATTATTAAATCCTCAGTAAAC TTTGGCTATTGTTACTCCTATGATTATCATCAATATCATCAATTACCTTATCTGTTCAATACTGGTGGCA CAGGTCCACCAGCTAGATGTCTAATCCCTTATGTGTCTATTAGTGGTACAAGTGGAGTTTGAGTGGGATT TTTTTTTTTAAGACCAGTTCCAAATCATCAAGGATGATACCACTAGTAGCAGCTTGTCTTGTCTGTACAG TGGTAAGTCCTGGCCTTGCCTTTGTGGCAAATACAACCCCCTTGAATTGCTTGGCCCTTCTCAGCATTGC CTAATATTAGGGAGGACTCCTGTAAAGCTCACTGGTTAGAAGATCAAGACACTTGGGCCTGGTTCTGCCC CTGGGGGCCATTGGGTAATTCCTTGCAGTCTCCAGGCCTCACTTGCCCTCTGAACAAGAAAGAGGCTGTT CTGGGTCATCCCTCCAGGCCTGTCCAGCCCTGGCACTCTGTGAGTCGGTTTAGGCAGCAGCCCCGGAACA GATGAGGCAGGCAGGGTTGGGACGTTTGGTCAGGACAGCCCACCGCAAAAAGAGGAGGAAAGAAATGAAA GACAGAGACAGCTTTGGCTATGGGAGAAGGAGGAGGCCGGGGGAAGGAGGAGACAGGAGGAGGAGGGACC ACGGGGTGGAGGGGAGATAGACCCAGCCCAGAGCTCTGAGTGGTTTCCTGTTGCCTGTCTCTAAACCCCT CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGCCTGCCTGCCACTGA GGTATGTGTGACCCCCGCCCAGCCTTTCCCTTCTATAGTTGCACCAACCCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPARC_1 ↗ | 5:151,686,915 | 負股 | 151,686,905–151,686,964 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_CK3DF · enhancer · 151682167–151683510 · regulatory
ENSR5_53BNB39 · CTCF_binding_site · 151684751–151684772 · regulatory
ENSR5_53BNBBC · CTCF_binding_site · 151686281–151686302 · regulatory
ENSR5_9487KX · promoter · 151686905–151687405 · regulatory
· motif · 151684618–151684629 · motif
· motif · 151684753–151684769 · motif
· motif · 151684978–151684988 · motif
· motif · 151685076–151685085 · motif
· motif · 151685118–151685128 · motif
· motif · 151685181–151685191 · motif
· motif · 151685255–151685265 · motif
· motif · 151686283–151686299 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：303 aa
SPARC 蛋白質長 303 個胺基酸，N 端第 1–17 位為訊號序列。第 71–93 位為 Follistatin-like domain，第 89–151 位為 Kazal-like domain；兩者在第 89–93 位區段重疊。C 端第 261–296 位為 EF-hand domain。蛋白質屬於 SPARC family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SPARC 為分泌型蛋白質，定位於細胞外空間及細胞外基質，也見於基底膜內或周圍。 資料未提供不同條件或異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- COL3A1P02461-1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MYOCQ99972 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- fafQ2TV77 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
SPARC 基因相關變異會造成 Osteogenesis imperfecta 17（OI17），屬常染色體隱性遺傳的骨形成障礙。疾病表現由極輕微且無骨折，到子宮內骨折及周產期致死皆有；患者也可能出現 dentinogenesis imperfecta、聽力損失或藍鞏膜，這些骨骼外表現影響的患者比例不一。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SPARC 可能透過與細胞外基質及細胞激素互作調節細胞生長。它可結合鈣、銅、數種膠原蛋白、白蛋白、thrombospondin、PDGF 與細胞膜。蛋白質有兩處鈣結合位點：酸性結構域以低親和力結合 5 至 8 個 Ca(2+)，EF-hand loop 則以高親和力結合一個 Ca(2+)。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Appears to regulate cell growth through interactions with the extracellular matrix and cytokines. Binds calcium and copper, several types of collagen, albumin, thrombospondin, PDGF and cell membranes. There are two calcium binding sites; an acidic domain that binds 5 to 8 Ca(2+) with a low affinity and an EF-hand loop that binds a Ca(2+) ion with a high affinity |
| 細胞定位 | SPARC 為分泌型蛋白質，位於細胞外空間、細胞外基質及基底膜內或周圍。 | 含實驗來源 | 證據與來源Secreted, extracellular space, extracellular matrix, basement membrane; In or around the basement membrane PMID 2306517 ↗ · PMID 3400777 ↗ · PMID 7495300 ↗ · PMID 9457905 ↗ |
| 疾病關聯 | Osteogenesis imperfecta 17（OI17）是常染色體隱性遺傳的骨形成障礙，特徵包括骨量低、骨骼脆弱，以及輕微外力後容易骨折。嚴重程度可由非常輕微且無骨折，至子宮內骨折及周產期致死；部分患者有 dentinogenesis imperfecta、聽力損失或藍鞏膜等骨骼外表現。此病由影響本條目所代表基因的變異造成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Osteogenesis imperfecta 17 OI17 An autosomal recessive form of osteogenesis imperfecta, a disorder of bone formation characterized by low bone mass, bone fragility and susceptibility to fractures after minimal trauma. Disease severity ranges from very mild forms without fractures to intrauterine fractures and perinatal lethality. Extraskeletal manifestations, which affect a variable number of patients, are dentinogenesis imperfecta, hearing loss, and blue sclerae. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 616507 PMID 26027498 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGCCTGC40CTGCCACTGAGGGTTCCCAGCACCATGAGGGCCTGGATCT80TCTTTCTCCTTTGCCTGGCCGGGAGGGCCTTGGCAGCCCC120TCAGCAAGAAGCCCTGCCTGATGAGACAGAGGTGGTGGAA160GAAACTGTGGCAGAGGTGACTGAGGTATCTGTGGGAGCTA200ATCCTGTCCAGGTGGAAGTAGGAGAATTTGATGATGGTGC240AGAGGAAACCGAAGAGGAGGTGGTGGCGGAAAATCCCTGC280CAGAACCACCACTGCAAACACGGCAAGGTGTGCGAGCTGG320ATGAGAACAACACCCCCATGTGCGTGTGCCAGGACCCCAC360CAGCTGCCCAGCCCCCATTGGCGAGTTTGAGAAGGTGTGC400AGCAATGACAACAAGACCTTCGACTCTTCCTGCCACTTCT440TTGCCACAAAGTGCACCCTGGAGGGCACCAAGAAGGGCCA480CAAGCTCCACCTGGACTACATCGGGCCTTGCAAATACATC520CCCCCTTGCCTGGACTCTGAGCTGACCGAATTCCCCCTGC560GCATGCGGGACTGGCTCAAGAACGTCCTGGTCACCCTGTA600TGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGCAG640AAGCTGCGGGTGAAGAAGATCCATGAGAATGAGAAGCGCC680TGGAGGCAGGAGACCACCCCGTGGAGCTGCTGGCCCGGGA720CTTCGAGAAGAACTATAACATGTACATCTTCCCTGTACAC760TGGCAGTTCGGCCAGCTGGACCAGCACCCCATTGACGGGT800ACCTCTCCCACACCGAGCTGGCTCCACTGCGTGCTCCCCT840CATCCCCATGGAGCATTGCACCACCCGCTTTTTCGAGACC880TGTGACCTGGACAATGACAAGTACATCGCCCTGGATGAGT920GGGCCGGCTGCTTCGGCATCAAGCAGAAGGATATCGACAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。