基因總覽
SPANXA1 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 sperm protein associated with the nucleus, X-linked, family member A1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 Xq27.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000370519 ★ | 141,583,674–141,584,738 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SPANXA1 ENST00000370519 GRCh38 chrX:141584638-141585738 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGATTTACAATTTCTTCATAACCTATTTTATTGCCCTAGGCAATTGTCAGCTAGATAGCCCTAAATGTGC ATATTAAAGGAACCCTTAGGTAAAAAAAATCAGATAGTGAAATTTGCATCTCAAAGCACCGAGAGAAAGA GTCTGGTGATGTTAGAGGGAGATTGAAGATGGATGCCAAATCAAACACAAAATTGTAGAAATATAGGATT GTATAAGGAGACCAGTTGTATTTAGATAGGGACTACCTGTCTTTTAACTGGATCTCTGAGCTCTGGGCAG AGCCCACACTGAATCCTAGGTCTCCAAAAAGGGAGAATTACTATGAGGCTACACCAAGTGACGGTTTTAC AGTGTACTTTTTTTTTTTTTTTTAACAAAGACATTTCTAAGTGTCCAAGCTACTTTCTTCCTTAAAAATC CAAGAATACTCTCTGTTCTAATAACTGTTTTAGTCAAAAACTTAGAATTACCATTCATCTCAGCAGTAGC CCAAAAGTAAATGGTCTTCGAGGTGCATGTGAAGGAACTGTAGGAGGGAAATGGGATAATTCACATCTCC GCCAATAAATAAATGTAGCCACACTAGCGTGGGGGATTTGAGGTGAGACATCGAAAATACTAAGTCATGG TGAGGGCTGGAAGACAAAAGAATGAATCACTTAATAGGAATGGCTGTGGGGAAGGGCTTGAAGGAATCAT CCTCTGACTTCCATGTGAACCGTGAACATTAAACATGGAGAAATGAGGAGCGGCGGCAGATCGGTTTGGG ATGCATCTTCAGGGGATGCTGAAACAACAGCAGCATTTGGTTTGCTCTACACCCCTGTCACCCCTCGCCC GCAAGCCCAGGGAGTGGTCAGCAGTGGGGCTTTGTGATGTGAAGCCACCCTAGGGCTGCCATTGGCTGGG ACACTGCCTGTATGATCAAACAAAGCTCAAGGGTGTGGCTTTGCCTTGTCACCAGGAGGGTATACATAGG GAGGGCAAGAGCTCCGGGCCACTGAGAAGATTCAAAACCTACAAAAGCCTGCCACTGACATTGAAGAACC AATATATACAATGGACAAACAATCCAGTGCCGGCGGGGTGAAGAGGAGCGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPANXA1_2 ↗ | X:141,584,738 | 負股 | 141,584,728–141,584,787 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：97 aa
SPANXA1 屬於 SPAN-X family，蛋白質長 97 個胺基酸。序列第 1–49 位被註記為無序區域；第 37–45 位則包含核定位訊號。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SPANXA1 被註記位於細胞質與細胞核，並與核內凹陷結構（nuclear craters）相關。 來源未說明這些定位之間的變化條件。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- EML2A0A0C4DGQ7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SETBP1Q9Y6X0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | SPANXA1 被註記位於細胞質與細胞核，並與核內凹陷結構（nuclear craters）相關；此資料未進一步說明定位的變化條件。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACTGAGAAGATTCAAAACCTACAAAAGCCTGCCACTGACA40TTGAAGAACCAATATATACAATGGACAAACAATCCAGTGC80CGGCGGGGTGAAGAGGAGCGTCCCCTGTGATTCCAACGAG120GCCAACGAGATGATGCCGGAGACCCCAACTGGGGACTCAG160ACCCGCAACCTGCTCCTAAAAAAATGAAAACATCTGAGTC200CTCGACCATACTAGTGGTTCGCTACAGGAGGAACTTTAAA240AGAACATCTCCAGAGGAACTGCTGAATGACCACGCCCGAG280AGAACAGAATCAACCCCCTCCAAATGGAGGAGGAGGAATT320CATGGAAATAATGGTTGAAATACCTGCAAAGTAGCAAGAA360GCTACATCTCTCAACCTTGGGCAATGAAAATAAAGTTTGA400GAAGCTGATGGCTGTGTA418cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。