演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SPAM1HYAL5

sperm adhesion molecule 1

SPAM1 編碼 sperm adhesion molecule 1,屬於 glycosyl hydrolase 56 家族;其產物可協助精子穿越卵周圍含透明質酸的卵丘細胞層。

Homo sapiens7q31.32UniProt P38567
OFFICIAL SYMBOL
SPAM1
CHROMOSOME
7
UNIPROT
P38567
PDB / ALPHAFOLD
9JUB
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SPAM1 是蛋白質編碼基因,產物名稱為 sperm adhesion molecule 1。此蛋白質屬於 glycosyl hydrolase 56 家族,長度為 509 個胺基酸。序列註解標示其第 1 至 35 個胺基酸為訊號序列;蛋白質另以 GPI 錨定方式與細胞膜相關。其名稱與家族分類提供了辨識此蛋白質的基本線索,而其在精子與卵子接觸及受精過程中的具體作用,則與透明質酸的水解有關。

Official symbol
SPAM1
Gene name
sperm adhesion molecule 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11217
UniProt
P38567
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HYAL5PH-20SPAG15

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q31.32
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegSPAM1pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr7:123,925,237–123,971,414
Gene span
46,178 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000682466 ★123,925,241–123,960,0465
ENST00000413927123,925,237–123,953,8114
ENST00000340011123,925,241–123,971,4147
ENST00000460182123,925,303–123,960,0465
ENST00000439500123,925,855–123,960,0466
ENST00000223028123,947,700–123,960,0395
ENST00000402183123,949,866–123,970,2485

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SPAM1 參與精子與卵子的黏附。在受精過程中,精子須先穿過包圍卵子的卵丘細胞層,才能抵達透明帶。卵丘細胞嵌在含有透明質酸的基質中;該基質於排卵前形成。SPAM1 可藉由分解透明質酸,協助精子穿越這一層細胞。

其酵素活性是水解透明質酸中 N-acetyl-beta-D-glucosamine 與 D-glucuronate 殘基之間的 (1->4) 鍵,且水解位置並非特定單一鍵位。這項作用提供了來源所述的分子層級說明,連結透明質酸基質的分解與精子通過卵丘細胞層的過程。

因此,SPAM1 的功能重點在於受精時協助精子穿越卵周圍的細胞外基質,並參與精卵黏附相關過程。現有資料指出其作用與透明質酸水解有關,未提供其他受精階段或作用機制的細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 123925241 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SPAM1 ENST00000682466 GRCh38 chr7:123924241-123925341 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GAAGCTGAAGTGGAGGTTGGCCTGCAACCAATCAGAGGCTGAAGTGGAGGCTTGGGCCACAACCAGTCAG
AGGCATTTCTCGTTCGTGAGGTAGGGGAGGAGGGTTTTGTAGAGGTCAGGAACTCTGGTCCCTTTTCACC
TGGGCATGGAGAGGTGGGGTTTTCCTTTTGGTCCAATTCCAAGAAGTCAGCCAATTTGTCCTCAGGCTCC
CTGTCTCCCAACCCTATTCTCCTGCCTCATTATGACCTCCATGATGGGTTTGAGGATGTGGTGTATGGAG
TCAAACTACAGGGTTTGATTGCAATATTGTCTTGGATTGTTACTTGGGAAGAGATCAGTACCATATTTGT
TTTTAATTGGAAAAGTCTTTTTCTTCCAATGTCTTTATTTGAGCAAGGGACAATTCTTGAGCTTACATAG
AGGTTTTTCCTTGCCCAGTGAACTCACCAGAAGGAAAAGTAGAGTGACATTGTTTTTCTGACCATGGATA
CCATACTCTTTCATTCATTTATCTTCCATAGTTGGTCCACCTGGTACCCCATGGACAGGAATAAAAACTA
ATTCAGGTTTGTTCATGCTATCAGATGTTGACATAAGCAATAATTATATTGTTTAGCTGACATGACCAAG
GTTTGGGAAACTGGTGCAAGGGTGGTGTCAGGTTTGTGTTTAACCTATGAAGAAAAGAGTGAGGTTAATA
TGAAAGAGGCAGCATTTGAAAGAAAGCCCACAGTGGAGGATCAGAGAGAGAATAGGATAGATTGAGACAA
GTAATCTCCAGTCAGCTTCTCAATAAATGGGAGGTTTTGTTGAAAAAGATCCCCCCTCTACTCCCCTCCC
CACACCAGGGAGGAAAGAAACTTAAAGGGGGAAAATAGATGAAAGCAAAGTTTTTTATCTGTGATCTTGA
GGAAAGCTGTTTGCTTTGTGGTGTCATCTTGCTTCTAGAGCCTTGGCTCTGAAATCCTTACTATGAGGTC
ACCTGTAGGGATGGTCTTCCAGTTGTCCTGAGAGTGATGACTGGCTCCACCTTGATGTGGCTCACATAAA
TTCAGAAAGTATGATAGCAGTGTAGGTGGTTAGCAGCACCTCATAAGGTCC
SPAM1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SPAM1_1 ↗7:123,925,314正股123,925,265–123,925,324

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_93S757 · enhancer · 123929175–123929537 · regulatory

· motif · 123921201–123921212 · motif

· motif · 123923284–123923295 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:509 aa

1 aa509 aa訊號胜肽
依 P38567 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

sperm adhesion molecule 1 長 509 個胺基酸,屬於 glycosyl hydrolase 56 家族。序列註解將第 1 至 35 個胺基酸標示為訊號序列;此特徵的證據標記為 ECO:0000250。

訊號胜肽1–35 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9JUB…

PDB · 9JUB

EM · 3.10 A · A=37-442

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

資料將 sperm adhesion molecule 1 定位於細胞膜,並標示其透過脂質錨定及 GPI 錨定與膜相關;未提供定位變化或不同異構型的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HYAL5SPAM1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SPAM1 參與精子與卵子的黏附。受精時,精子須先穿過包圍卵子的卵丘細胞層,才能抵達透明帶;卵丘細胞嵌在排卵前形成、含有透明質酸的基質中。SPAM1 分解透明質酸,協助精子穿越該細胞層。含實驗來源
證據與來源

Involved in sperm-egg adhesion. Upon fertilization sperm must first penetrate a layer of cumulus cells that surrounds the egg before reaching the zona pellucida. The cumulus cells are embedded in a matrix containing hyaluronic acid which is formed prior to ovulation. This protein aids in penetrating the layer of cumulus cells by digesting hyaluronic acid

PMID 8282124 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性SPAM1 可水解透明質酸中 N-acetyl-beta-D-glucosamine 與 D-glucuronate 殘基之間的 (1->4) 鍵;此反應描述為隨機水解,未指出特定的鍵位。資料庫紀錄
證據與來源

Random hydrolysis of (1->4)-linkages between N-acetyl-beta-D-glucosamine and D-glucuronate residues in hyaluronate.

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位資料將 SPAM1 定位於細胞膜,並標示其與脂質錨定及 GPI 錨定相關;此項資訊未說明定位的條件或變化。資料庫紀錄
證據與來源

Cell membrane / Lipid-anchor, GPI-anchor

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000682466 · 2,037 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTTGTCCTGAGAGTGATGACTGGCTCCACCTTGATGTGG40
41CTCACATAAATTCAGAAAGTATGATAGCAGTGTAGGTGGT80
81TAGCAGCACCTCATAAGGTCCTTCCTAGCAAGGGATGCTA120
121ATGACTAGCCAATGCTCTAGGAAGACATTGAGACCAGCCA160
161ACTTCTTGCCTTGATAACTACTGAAGAGACATTGGGTGGC200
201TGGATTTTGAAAGCAGACTTCTGGTTATAGGTGATGCAAC240
241TTGAAAAACAATCCTGAAACATGAAACAAGAATAATAATA280
281TTTAAATGTAACTTAATCATTATACCTCTTTATCCATCAA320
321AGTGAATTCATTCCATTCCCTTTCATCTGTGCTCATACTT360
361TGCATCAGATATTGGGTAAACCAAAGTGTGTAGGAAGAAA400
401TAAATGTTTTCATAGTCATTACTCTTTACAATGGGAGTGC440
441TAAAATTCAAGCACATCTTTTTCAGAAGCTTTGTTAAATC480
481AAGTGGAGTATCCCAGATAGTTTTCACCTTCCTTCTGATT520
521CCATGTTGCTTGACTCTGAATTTCAGAGCACCTCCTGTTA560
561TTCCAAATGTGCCTTTCCTCTGGGCCTGGAATGCCCCAAG600
601TGAATTTTGTCTTGGAAAATTTGATGAGCCACTAGATATG640
641AGCCTCTTCTCTTTCATAGGAAGCCCCCGAATAAACGCCA680
681CCGGGCAAGGTGTTACAATATTTTATGTTGATAGACTTGG720
721CTACTATCCTTACATAGATTCAATCACAGGAGTAACTGTG760
761AATGGAGGAATCCCCCAGAAGATTTCCTTACAAGACCATC800
801TGGACAAAGCTAAGAAAGACATTACATTTTATATGCCAGT840
841AGACAATTTGGGAATGGCTGTTATTGACTGGGAAGAATGG880
881AGACCCACTTGGGCAAGAAACTGGAAACCTAAAGATGTTT920
921ACAAGAATAGGTCTATTGAATTGGTTCAGCAACAAAATGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。