演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SPAG8hSMP-1

sperm associated antigen 8

SPAG8(sperm associated antigen 8)是蛋白質編碼基因,其產物與纖毛及精子鞭毛的微管結構、精子生成,以及細胞週期調控有關。

Homo sapiens9p13.3UniProt Q99932
OFFICIAL SYMBOL
SPAG8
CHROMOSOME
9
UNIPROT
Q99932
PDB / ALPHAFOLD
7UNG
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SPAG8(sperm associated antigen 8)是位於人類第 9 號染色體的蛋白質編碼基因,產物屬於 SPAG8 family。其蛋白質可作為微管內蛋白(microtubule inner protein, MIP),是纖毛軸絲中帶有 dynein 的雙聯微管構造之一,也存在於精子鞭毛的雙聯微管。來源亦指出,SPAG8 與精子生成及細胞週期調控相關;這些功能的具體作用方式見功能說明。

Official symbol
SPAG8
Gene name
sperm associated antigen 8
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14105
UniProt
Q99932
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
hSMP-1HSD-1BS-84SPAG3CT142

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99p13.3
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegSPAG8pq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr9:35,808,045–35,812,272
Gene span
4,228 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000396638 ★35,809,795–35,812,2627
ENST0000034029135,808,045–35,812,2728
ENST0000097460635,808,045–35,812,2726
ENST0000048476435,809,795–35,812,1887
ENST0000113378635,809,795–35,812,2727
ENST0000087185035,809,813–35,812,2727
ENST0000087185135,809,814–35,812,2726
ENST0000105330135,809,814–35,812,2723
ENST0000049781035,809,836–35,812,1467
ENST0000113021135,811,148–35,812,2722

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SPAG8 的一項角色是作為微管內蛋白,參與纖毛軸絲中帶有 dynein 的雙聯微管。這項微管結構對可運動纖毛的擺動是必要的;SPAG8 也屬於精子鞭毛雙聯微管的組成部分,顯示其功能與微管構成的運動結構相關。

在精子生成方面,SPAG8 可增強 CREM isoform tau 與其共活化因子 FHL5 的結合,並提高 FHL5 所調控的 CREM isoform tau 轉錄活化。這些作用可能參與精子生成的轉錄調控。相關敘述標示為依相似性推定,應視為功能推論,而非此處直接確立的機制。

SPAG8 也與精子受精相關過程有關;來源指出它參與頂體反應及精子與透明帶的結合,這些敘述同樣依相似性推定。另有資料指出,SPAG8 可能透過與 RANBP9 互作,參與生育能力及微管形成;此功能以「可能」描述,不能視為已確定的因果作用。

在細胞週期調控中,SPAG8 參與控制細胞通過 G2/M 期的進程。它可能延緩 CDK1 活化;CDK1 活化是進入有絲分裂所需的條件,因此這項延遲可能影響細胞進入有絲分裂的時機。來源將此機制表述為可能性,並未將其描述為確定機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 35812262 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SPAG8 ENST00000396638 GRCh38 chr9:35812162-35813262 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGTGACTTTTGGCCCTTGGTCCCTCACCTATGAATTCTCATTCCTACTTCTCAATATGATCTTCATTCTT
CGACCTCTGCCATGATCCTGACTCCCTAACCCCAAGCTCAATTTCAGTGATCAACGATGGGAAGCTGGGT
GCACAATCTGTGTATCATCTGCACATTCATGTACTTGGGGGCCGGCAGCTCCAGTGGCCTCCAGGTTGAA
CCTGCCAACTGATTAAAGGACACCAGACTCTGGATGCTTGGATGGAAAGGGAAAAATGGACCCTGTGATG
CTAATAAAACTGTTCTCCCTTAATTATGCTCTCCTGTCTTTAATATAAAATTTTATACCACAAAGGGGAA
AGAAAACTGATTCAGGGCTATGATGCCCCTTGACTGGTCTGAGTGAAAGACACTGAGGAGGTCCAACCTG
TGGTTAAATGTTGCCTGCAGATATGTAAGTCTTCTTGACAAGTGGTCCACCCTAGGTCAAGCTTCTAGAA
AAGTAACAGTAGGAATGAGCCTAAATGAGTAGGAAGAAACTGAAAGCCAATCCTGGCCCTTCTTCAGAGG
TCAAACCAGGTTCTAAGGGCGCTTAGGAGGAGGGTGGTCAATATGAGGGTCTTTTATTAGAGGAGGAGTA
ATCACACCCAAACAAAAGCGGCTGCCTTTTCACTATTCTACGTCTCACCATTTTGCTCAAGCTAGTTTGT
TTATTTTCATCCTTAACATTTGTTAAAGACCCCACTCACTTTTGAGAATGAACTAAGCAAACTAAGGGGA
AGCTACTTGCCTCTCAGCAAACACCAAGTAGGCTGTAATCTAATGCCACAACCCTGTGCCTGTTTCCAAC
ATATCCCCATAAAGCATCATCTTAGAAAACCGCACGCAAAGACTGTTTGGACGTGGAGGGCGAGGTCTTA
AGCCAGCGGAACCCTAAAACCCCGTCTGAGGCGGAATGCCGCCGGGACCGGAAAGCGGACCTCCCTAACA
GCACTAGGCTGAAGACTTCCGCCCCGCAGAGGACTTGCCTCCACCGCCACCTGCAAGTCCGCCCAGCTGT
ACTTCTGCGCAGGCTCCAGGAGTTGTTTGCTGTCTCTATGGCAACCCAGTA
SPAG8 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SPAG8_1 ↗9:35,812,255負股35,812,245–35,812,304

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_B94W7 · promoter · 35812178–35812762 · regulatory

ENSR9_9J7RX · promoter · 35814170–35814461 · regulatory

ENSR9_5BFG3D · CTCF_binding_site · 35814601–35814622 · regulatory

ENSR9_9J7S7 · promoter · 35815032–35815532 · regulatory

ENSR9_5BFG75 · CTCF_binding_site · 35815408–35815429 · regulatory

ENSR9_5BFG7D · CTCF_binding_site · 35815462–35815483 · regulatory

ENSR9_833FND · enhancer · 35816808–35816998 · regulatory

· motif · 35810962–35810976 · motif

· motif · 35810962–35810976 · motif

· motif · 35811307–35811320 · motif

· motif · 35811307–35811320 · motif

· motif · 35811889–35811906 · motif

· motif · 35811898–35811906 · motif

· motif · 35812196–35812207 · motif

· motif · 35812258–35812269 · motif

· motif · 35812388–35812396 · motif

· motif · 35812536–35812558 · motif

· motif · 35812623–35812635 · motif

· motif · 35814301–35814313 · motif

· motif · 35814304–35814311 · motif

· motif · 35814313–35814329 · motif

· motif · 35814313–35814329 · motif

· motif · 35814369–35814382 · motif

· motif · 35814385–35814397 · motif

· motif · 35814388–35814402 · motif

· motif · 35814389–35814402 · motif

· motif · 35814487–35814499 · motif

· motif · 35814490–35814497 · motif

· motif · 35814603–35814619 · motif

· motif · 35814782–35814795 · motif

· motif · 35814840–35814856 · motif

· motif · 35814971–35814981 · motif

· motif · 35815037–35815047 · motif

· motif · 35815066–35815076 · motif

· motif · 35815410–35815426 · motif

· motif · 35815453–35815463 · motif

· motif · 35815464–35815480 · motif

· motif · 35815521–35815531 · motif

· motif · 35815571–35815581 · motif

· motif · 35815577–35815590 · motif

· motif · 35815577–35815591 · motif

· motif · 35815711–35815717 · motif

· motif · 35815780–35815788 · motif

· motif · 35815816–35815822 · motif

· motif · 35816341–35816356 · motif

· motif · 35816341–35816356 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:485 aa

1 aa485 aa功能區域
依 Q99932 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SPAG8 蛋白長 485 個胺基酸,屬於 SPAG8 family。序列註解預測其第 1–42、75–98 及 127–215 位胺基酸區段為無序區。另有兩段標示為 Mn 1(第 327–340 位)及 Mn 2(第 379–393 位);來源未進一步說明這些區段的功能。

功能區域Disordered1–42 aa
功能區域Disordered75–98 aa
功能區域Disordered127–215 aa
功能區域Mn 1327–340 aa
功能區域Mn 2379–393 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7UNG…

PDB · 7UNG

EM · 3.60 A · D=1-485

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus;Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, acrosome;Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center;Cytoplasm, cytoskeleton, spindle;Cytoplasm, cytoskeleton, cilium axoneme;Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme

SPAG8 在精子發育不同階段的核內分布有所變化:精母細胞與圓形精子細胞中可見於細胞核及細胞質,延長中的精子細胞則位於細胞質而不在細胞核。 成熟精子中,訊號見於頭部頂體區及尾部中段。 細胞分裂期間,其位置亦隨階段改變,從前期的微管組織中心移至中期紡錘體微管、後期的星狀微管與中區,並在胞質分裂後回到微管組織中心。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
hSMP-1SPAG8CSTF2DTX2KLHL32SNRPCACTMAPAPPARMC5ATXN1ATXN3B9D2BATF2BSCL2CCDC120CCNCCCT5CDC23CFPCISD2CSTF2TCTAG1BDCTN1DMRT3DMWDDOK3DYNLL2EGFL7FAM168BFAM222BFRS3GARS1GIGYF1GLYCTKGPSM3HEMK1HRHSPB1HTTINCA1INTS11KIF1BKRT34KRTAP10-8KRTAP11-1KRTAP13-3KRTAP15-1KRTAP19-2KRTAP19-6KRTAP19-7KRTAP21-2KRTAP26-1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 103 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SPAG8 是精子鞭毛雙聯微管的微管內蛋白成分。來源指出它與 FHL5 互作,並標示互作涉及 FHL5 的第二個 LIM domain;另有資料記載 SPAG8 與 RANBP9 互作。SPAG8 也被描述為纖毛軸絲雙聯微管的一部分,這是結構組成關係,不等同於已記載的特定蛋白質結合。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SPAG8 是纖毛軸絲中帶有 dynein 的雙聯微管之微管內蛋白,該結構是可運動纖毛擺動所需。它可能透過增強 CREM isoform tau 與共活化因子 FHL5 的結合,提高 FHL5 調控的轉錄活化;也與頂體反應及精子結合透明帶有關。SPAG8 參與 G2/M 期進程調控,可能延緩 CDK1 活化;並可能透過 RANBP9 參與生育能力及微管形成。含實驗來源
證據與來源

Microtubule inner protein (MIP) part of the dynein-decorated doublet microtubules (DMTs) in cilia axoneme, which is required for motile cilia beating. Plays a role in spermatogenesis by enhancing the binding of CREM isoform tau to its coactivator FHL5 and increasing the FHL5-regulated transcriptional activation of CREM isoform tau (By similarity). Involved in the acrosome reaction and in binding of sperm to the zona pellucida (By similarity). Plays a role in regulation of the cell cycle by controlling progression through the G2/M phase, possibly by delaying the activation of CDK1 which is required for entry into mitosis. May play a role in fertility and microtubule formation through interaction with RANBP9

PMID 10500252 ↗ · PMID 19548270 ↗ · PMID 36191189 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SPAG8 是精子鞭毛雙聯微管中的微管內蛋白,並與 FHL5 互作,所涉區域為 FHL5 的第二個 LIM domain。來源另記載 SPAG8 與 RANBP9 互作;此處提供的是互作關係,未補述其對細胞功能的影響。含實驗來源
證據與來源

Microtubule inner protein component of sperm flagellar doublet microtubules. Interacts with FHL5 (via second LIM domain) (By similarity). Interacts with RANBP9

PMID 15014887 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SPAG8 在精母細胞及圓形精子細胞中位於細胞核與細胞質,在延長中的精子細胞則見於細胞質而不在細胞核;成熟精子中可見於頭部頂體區及尾部中段。細胞週期期間,其位置由前期的微管組織中心轉至中期紡錘體微管、後期星狀微管與中區,於末期留在中區,胞質分裂後再回到微管組織中心;也屬纖毛軸絲雙聯微管的一部分。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, acrosome; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle; Cytoplasm, cytoskeleton, cilium axoneme; Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme; In mature sperm cells, detected in the acrosomal region of the head and in the middle piece of the tail (By similarity). Localized to the nucleus and cytoplasm of spermatocytes and round spermatids while, in elongating spermatids, expressed in the cytoplasm but not in the nucleus (By similarity). During the cell cycle, localized on the microtubule-organizing center (MTOC) during prophase. In metaphase, extends along spindle microtubules. In anaphase, detected on the astral microtubules and mid-zone. In telophase, remains at the mid-zone. After cytokinesis, returns to the MTOC. Microtubule inner protein (MIP) part of the dynein-decorated doublet microtubules (DMTs) in cilia axoneme (By similarity)

PMID 15014887 ↗ · PMID 17187156 ↗ · PMID 8788182 ↗ · PMID 19548270 ↗ · PMID 36191189 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000396638 · 1,716 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GCCCCGCAGAGGACTTGCCTCCACCGCCACCTGCAAGTCC40
41GCCCAGCTGTACTTCTGCGCAGGCTCCAGGAGTTGTTTGC80
81TGTCTCTATGGCAACCCAGTAGCTGGAGTCTGAAGATGGA120
121GACCAACGAGTCTACGGAGGGATCGCGGTCGCGGTCGCGA160
161TCTTTAGACATACAGCCCAGCTCCGAAGGACTGGGGCCCA200
201CTTCGGAACCGTTTCCTTCTTCAGATGACAGTCCCAGGTC240
241GGCCCTGGCAGCTGCAACCGCAGCAGCTGCAGCGGCTGCA280
281TCAGCTGCTGCAGCTACTGCAGCCTTCACCACTGCCAAAG320
321CAGCTGCATTATCTACAAAGACCCCAGCGCCCTGTTCTGA360
361GTTCATGGAGCCGTCCTCTGACCCCAGCCTTCTTGGGGAG400
401CCCTGTGCGGGACCCGGCTTTACCCACAATATAGCCCATG440
441GGAGTCTTGGCTTTGAGCCCGTCTATGTTTCCTGTATTGC480
481TCAGGACACTTGCACTACAACTGACCATAGTTCTAATCCT520
521GGCCCTGTTCCAGGCTCTAGCTCTGGGCCTGTTCTTGGTT560
561CCAGCTCAGGTGCTGGCCATGGCTCTGGCTCTGGCTCTGG600
601TCCTGGCTGTGGCTCTGTCCCTGGCTCTGGCTCTGGTCCT640
641GGTCCTGGCTCTGGTCCTGGCTCTGGTCCTGGTCATGGCT680
681CTGGCTCTCATCCTGGTCCTGCCTCTGGGCCTGGTCCAGA720
721CACTGGCCCTGACTCTGAGCTCAGCCCCTGTATTCCTCCA760
761GGGTTCAGAAACCTGGTGGCAGATCGGGTCCCTAACTATA800
801CCTCCTGGAGTCAGCACTGCCCCTGGGAGCCCCAGAAACA840
841ACCACCTTGGGAATTTTTGCAAGTCTTAGAACCGGGTGCC880
881CGAGGACTATGGAAACCCCCAGACATTAAAGGGAAGCTTA920
921TGGTTTGCTATGAAACTTTGCCGCGGGGCCAGTGCCTCCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。