基因總覽
SPAG7 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 sperm associated antigen 7。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 17p13.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000206020 ★ | 4,959,226–4,967,817 | 7 |
| ENST00000575142 | 4,959,226–4,967,835 | 6 |
| ENST00000573366 | 4,959,226–4,967,191 | 7 |
| ENST00000859822 | 4,959,226–4,967,835 | 7 |
| ENST00000918591 | 4,959,226–4,967,835 | 7 |
| ENST00000918592 | 4,959,226–4,967,835 | 5 |
| ENST00000918593 | 4,959,226–4,967,835 | 7 |
| ENST00000949752 | 4,959,226–4,967,835 | 7 |
| ENST00000949753 | 4,959,226–4,967,835 | 7 |
| ENST00001065715 | 4,959,226–4,967,835 | 4 |
| ENST00001065716 | 4,959,226–4,967,835 | 6 |
| ENST00001065717 | 4,959,226–4,967,835 | 7 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SPAG7 ENST00000206020 GRCh38 chr17:4967717-4968817 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGAGGGAACTGAAGCAGAACCAGGAGCTGGAAGGGCTTCCCCAGCCGGGACTGGCCACATGACCTGGCCA CCGCCTTTCTCACCACCCTGGGGGCGCCTCGTGCAGTCTTAACAGGGAGAGGGCTTTCTGGGGCAGGGGG AGCCCCTGTCGGCAGCTTTCCTGTTCACCTTTGTTGGAGCCCTCTGTAGGCCTCCTCCCTCCTCCCCACG CCTTGCTCCCACACCCCTCTCCTCGTCCCTCCTGGTCGTGCCCCGTCTCTTTTGGTCCTGGCTCCAGAAA ACCCGCGCCCCACATACCTGCATCTTCCGCTGTGACCTCCGGAGCCCTGCCTGCCCCTGCTCCCCAGCTC CTCCTGCCTGCACCCGACTCGGCCCCCTCCTGACTTGCCTTATTTATTTGTTCGACGCGTCTCTGAATGT ATCCGCCTCGGTTCCCACCACTGCCTTCGCTGCGCACGCCCCTCGTGTTTCAGGGCTGACCGTGTCCCCA CCCGACTCCGCATGTTTGCGTCTGTTTCCTCCCTCTCTGGCCCTGTCTTACCCCATCACCCGACTCTGGC CACTGACCTCAGGGCCGAAGGGGAGGTGGTGTACATAGGAACGCGTTGCGGAGTCCGCCCCGTCCCCCGA GGGGAGGGGTCTTGTACATACTGTAACATACAGAGTATAGTGAAGAATCTATTTAAGGCGCCGCGGGGAG GGCTGCACGGCCGGGCTTGTGGTTCTCTAGCGCGGCGGGGGCCTCCTGCCGGCTCCACGGGCACTTTCTA CTTGTGCATGGGCTTGGTTTATACGAATTGCCATTAAACATCGCTGCACCAGCCAGCCTCCGGCCTCTGT CTGCGGGGGCGGGGCGGGGCCTAGGCCAGCTGGAGGCCGCCATGCACCGCGGGCCTGGGATCTGCGCCCA GGCCAGGCGGGCCCAGGGTTTTCCGCCTCCGACGTGTTTCCGGCCTTAAAGGCATTCCGCCCTTCCCTTT AAGACGCACCGCCCCCTCTCAGTCACTCCCAAGATGGCGGACCTACTGGGCTCCATCCTGAGCTCCATGG AGAAGCCACCCAGCCTCGGTGACCAGGAGACTCGGCGCAAGGCCCGAGGTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPAG7_1 ↗ | 17:4,967,813 | 負股 | 4,967,803–4,967,862 |
| SPAG7_4 ↗ | 17:4,968,627 | 負股 | 4,968,617–4,968,676 |
| SPAG7_3 ↗ | 17:4,969,060 | 負股 | 4,969,050–4,969,109 |
| SPAG7_2 ↗ | 17:4,969,341 | 負股 | 4,969,331–4,969,390 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_BZLK · enhancer · 4966202–4967180 · regulatory
ENSR17_93Z8C · promoter · 4967181–4967681 · regulatory
ENSR17_536JPZ · CTCF_binding_site · 4967339–4967360 · regulatory
ENSR17_93Z8H · promoter · 4967780–4968260 · regulatory
· motif · 4965715–4965724 · motif
· motif · 4965909–4965918 · motif
· motif · 4966253–4966265 · motif
· motif · 4966427–4966435 · motif
· motif · 4966505–4966518 · motif
· motif · 4966524–4966537 · motif
· motif · 4966705–4966717 · motif
· motif · 4966859–4966872 · motif
· motif · 4966859–4966872 · motif
· motif · 4967341–4967357 · motif
· motif · 4967397–4967406 · motif
· motif · 4967564–4967574 · motif
· motif · 4967633–4967646 · motif
· motif · 4967796–4967806 · motif
· motif · 4967817–4967830 · motif
· motif · 4967822–4967832 · motif
· motif · 4967864–4967873 · motif
· motif · 4967958–4967968 · motif
· motif · 4967963–4967973 · motif
· motif · 4967965–4967978 · motif
· motif · 4968178–4968188 · motif
· motif · 4968246–4968258 · motif
· motif · 4968246–4968261 · motif
· motif · 4968248–4968255 · motif
· motif · 4968491–4968506 · motif
· motif · 4969723–4969736 · motif
· motif · 4969784–4969797 · motif
· motif · 4969867–4969876 · motif
· motif · 4970191–4970204 · motif
· motif · 4970191–4970206 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:227 aa
SPAG7 蛋白質長 227 個胺基酸,具有 R3H 結構域(第 46–109 位)。第 1–46 位及第 118–160 位區域被註記為無序區;第 35–51 位與第 122–139 位各有一個核定位訊號基序。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SPAG7 的定位註記為細胞核。 來源未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- LXNQ9BS40 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | SPAG7 的細胞內定位註記為細胞核;此紀錄未提供其他定位位置、定位變化條件或異構型差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGTCACTCCCAAGATGGCGGACCTACTGGGCTCCATCCTG40AGCTCCATGGAGAAGCCACCCAGCCTCGGTGACCAGGAGA80CTCGGCGCAAGGCCCGAGAACAGGCCGCCCGCCTGAAGAA120ACTACAAGAGCAAGAGAAACAACAGAAAGTGGAGTTTCGT160AAAAGGATGGAGAAGGAGGTGTCAGATTTCATTCAAGACA200GTGGGCAGATCAAGAAAAAGTTTCAGCCAATGAACAAGAT240CGAGAGGAGCATACTACATGATGTGGTGGAAGTGGCTGGC280CTGACATCCTTCTCCTTTGGGGAAGATGATGACTGTCGCT320ATGTCATGATCTTCAAAAAGGAGTTTGCACCCTCAGATGA360AGAGCTAGACTCTTACCGTCGTGGAGAGGAATGGGACCCC400CAGAAGGCTGAGGAGAAGCGGAAGCTGAAGGAGCTGGCCC440AGAGGCAAGAGGAGGAGGCAGCCCAGCAGGGGCCTGTGGT480GGTGAGCCCTGCCAGCGACTACAAGGACAAGTACAGCCAC520CTCATCGGCAAGGGAGCAGCCAAAGACGCAGCCCACATGC560TACAGGCCAATAAGACCTACGGCTGTGTGCCCGTGGCCAA600TAAGAGGGACACACGCTCCATTGAAGAGGCTATGAATGAG640ATCAGAGCCAAGAAGCGTCTGCGGCAGAGTGGGGAAGAGT680TGCCGCCAACCTCCTAGGCGCCCCGCCCAGCTCCCTTTGA720CCCCTGGGGCAGGGCAGGGGGCAGGGAGAGACAAGGCTGC760TGCTATTAGAGCCCATCCTGGAGCCCCACCTCTGAACCAC800CTCCTACCAGCTGTCCCTCAGGCTGGGGGAAAACAGGTGT840TTGATTTGTCACCGTTGGAGCTTGGATATGTGCGTGGCAT880GTGTGTGTGTGTGTGAGAGTGTGAATGCACAGGTGGGTAT920TTAATCTGTATTATTCCCCGTTCTTGGAATTTTCTTCCCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。