基因總覽
SPAG11B(sperm associated antigen 11B)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 SPAG11 家族。此蛋白質長 103 個胺基酸,序列註解在第 1 至 25 位標示一段訊號序列,且其定位資料記載為分泌型。這些資訊概述了它的家族歸屬與基本蛋白質特徵;至於其可能參與的生殖道防禦角色及相關功能,則依據功能資料另行說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000398462 ★ | 7,450,603–7,463,542 | 3 |
| ENST00000528943 | 7,442,684–7,463,452 | 4 |
| ENST00000359758 | 7,447,753–7,463,674 | 4 |
| ENST00000361111 | 7,447,753–7,463,674 | 3 |
| ENST00000297498 | 7,450,563–7,463,674 | 4 |
| ENST00000458665 | 7,450,564–7,452,365 | 2 |
| ENST00000528168 | 7,450,603–7,452,365 | 3 |
| ENST00001136979 | 7,450,603–7,463,674 | 3 |
| ENST00000317900 | 7,461,114–7,463,674 | 3 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SPAG11B 被註記具有對抗大腸桿菌(E. coli)的抗微生物活性,但此項功能標示為依相似性推定(By similarity),並非此處資料所列的直接實驗證實。因此,這項描述應視為功能推定,而非已確立的抗菌作用範圍或機制。
在男性生殖道中,SPAG11B 被認為參與防禦反應,並與精子成熟、儲存及保護相關;這些角色同樣標示為依相似性推定。資料並未進一步說明其如何作用於精子或生殖道環境,也沒有提供可據以描述具體分子機制或作用條件的細節。
依照現有註記,SPAG11B 的功能概念主要連結兩方面:一是可能的抗微生物活性,二是男性生殖道的防禦,以及與精子成熟、儲存和保護的關聯。這些資訊支持將它描述為可能參與生殖道防禦的蛋白質,但不足以據此推定其他微生物靶標、特定作用途徑,或上述精子相關功能之間的因果關係。
Promoter 與基因調控
>SPAG11B ENST00000398462 GRCh38 chr8:7463442-7464542 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTTCTCTGTCTGGATTAAAATATACATGCAAATGAGACATATGAGATAAGCACTATCTTTTCCAGACATC ACTGATGTTACATTGGATGCTATGTGAATACAAAACTCTTCAACCAAAGCCTTCTTCACTTTAGTTAAGT CCAGAGCAGACTGTCTGGGTTACATGCATACCTGAGCTAATGCAGCCAAGTAAGAAACACACACTTGGTT AAAATGCTTAAAAAGATGAAGGAGAAGGGAAGACAAGTCCTCTGCTTGGATATTACTAGAGGAGAAAACC CAGACTCAAACACAGATTTTTTTTTTCTTTTTTAAAAGAATTGAATTGGACCCAGTGACATCAACAGGAG GTGTCTGGGGGTAAAGAGAATGGAAAGGGGAGAGAAAAATCAAGACAACTCAAATAAGTTAAAATAGAAA GGAGGGGGGTCCAAAGTGAGGAAGGAGAAGTGGAGGGGACCAAGAAACAGGGAGAGAGACTCAGAGAGGA GAAGAAAAAGAAAAGAACATTTTGAGCAGCCTTGGAACTCTCTGTATAACTTCAGGAAGGGATAGTTTGT AAAACCAGGTCCTACCTGTTATGTTGTGTGTCTTATGCATGATTTTTTAACACTAAAATAAAAACGCTCA GCCAACAGGATAGAATCGACATGGCAGTTTATTTATGTCCCTGTTCTCATGAACATTAGGGGGCTTTTGA GAAGCGTTTGAGGACATTGGCAACTTTATGATAGTTATGTTTGTTCTGCCCCTCCATGCCTTTCATCTTT CTGTTTCTCTCTGTTCTTCCTTATTCACCAAACCCACCCAAGGCATTCAGGCGTATTATTTACTTCCTGA AATATGTGTCTCAAGTGTTTGTTCCACCAGCAGTGGGATAGTAGCGTGTCCACATTGTCCTTTGAGAATG AGAAGTCATCCTGGAGCACAGCTCTTCCCACGCTCCGGGCCCACACACCCAGCCTCACTCCATCAAAGGA GCCCCGCTGCCTGCCCACCCACCCTGGGTGCTTTCTGGCTTGCAGTGCTCTTGGCAGACATGAGGCAACG ATTGCTCCCGTCCGTCACCAGCCTTCTCCTTGTGGCCCTGCTGTTTCCAGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPAG11B_1 ↗ | 8:7,463,542 | 負股 | 7,463,532–7,463,591 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR8_94Z2X · enhancer · 7468083–7468430 · regulatory
ENSR8_6TP9D · CTCF_binding_site · 7468141–7468172 · regulatory
ENSR8_53QFKL · CTCF_binding_site · 7468324–7468345 · regulatory
· motif · 7468101–7468112 · motif
· motif · 7468143–7468159 · motif
· motif · 7468153–7468169 · motif
· motif · 7468326–7468342 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:103 aa
SPAG11B 屬於 SPAG11 家族,蛋白質長 103 個胺基酸。序列註解將第 1 至 25 位標示為訊號序列;此區域註解提供序列特徵,但未列出其他功能區域或結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SPAG11B 的定位資料記載為分泌型;來源未提供定位變化的條件或異構型間差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- TTC23Q5W5X9-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SPAG11B 被註記具有對抗大腸桿菌(E. coli)的抗微生物活性,但該活性是依相似性推定。它也被認為參與男性生殖道的防禦反應,並與精子成熟、儲存及保護有關;這些功能同樣屬於依相似性推定,不能視為已直接證實。 | 推論支持 | 證據與來源Has antimicrobial activity against E.coli (By similarity). Plays a role in the defense response in the male reproductive tract, contributing to sperm maturation, storage and protection (By similarity) |
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACCCTGGGTGCTTTCTGGCTTGCAGTGCTCTTGGCAGACA40TGAGGCAACGATTGCTCCCGTCCGTCACCAGCCTTCTCCT80TGTGGCCCTGCTGTTTCCAGGATCGTCTCAAGCCAGACAT120GTGAACCACTCAGCCACTGAGGCTCTCGGAGAACTCAGGG160AAAGAGCCCCTGGGCAAGGCACAAACGGGTTTCAGCTGCT200ACGCCACGCAGTGAAACGGGACCTCTTACCACCGCGCACC240CCACCTTACCAAGGGGATGTTCCACCGGGAATTAGAAATA280CCATCTGCCATATGCAGCAAGGGATCTGCAGACTTTTTTT320CTGCCATTCTGGTGAGAAAAAGCGTGACATTTGCTCTGAT360CCCTGGAATAGGTGTTGCGTATCAAATACAGATGAAGAAG400GAAAAGAGAAACCAGAGATGGATGGCAGATCTGGGATCTA440AAATATAAGCTCCCGGAAGGCAGGGATGTTGAAGTATCCC480AAGGGCTTAAAGGAATGTGTGGCTTATAGTAGGTGTTCAA520TAAATATTTGTTGAATGAATTTAGCACCAAA551cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。