演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SPAG11BHE2

sperm associated antigen 11B

SPAG11B(sperm associated antigen 11B)屬於 SPAG11 家族,是分泌型蛋白質;資料指出其可能參與男性生殖道的防禦,並與精子成熟、儲存及保護有關。

Homo sapiens8p23.1UniProt Q08648
OFFICIAL SYMBOL
SPAG11B
CHROMOSOME
8
UNIPROT
Q08648
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SPAG11B(sperm associated antigen 11B)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 SPAG11 家族。此蛋白質長 103 個胺基酸,序列註解在第 1 至 25 位標示一段訊號序列,且其定位資料記載為分泌型。這些資訊概述了它的家族歸屬與基本蛋白質特徵;至於其可能參與的生殖道防禦角色及相關功能,則依據功能資料另行說明。

Official symbol
SPAG11B
Gene name
sperm associated antigen 11B
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14534
UniProt
Q08648
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HE2EP2EP2CEP2DEDDM2B

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88p23.1
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegSPAG11Bpq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr8:7,442,684–7,463,674
Gene span
20,991 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000398462 ★7,450,603–7,463,5423
ENST000005289437,442,684–7,463,4524
ENST000003597587,447,753–7,463,6744
ENST000003611117,447,753–7,463,6743
ENST000002974987,450,563–7,463,6744
ENST000004586657,450,564–7,452,3652
ENST000005281687,450,603–7,452,3653
ENST000011369797,450,603–7,463,6743
ENST000003179007,461,114–7,463,6743

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SPAG11B 被註記具有對抗大腸桿菌(E. coli)的抗微生物活性,但此項功能標示為依相似性推定(By similarity),並非此處資料所列的直接實驗證實。因此,這項描述應視為功能推定,而非已確立的抗菌作用範圍或機制。

在男性生殖道中,SPAG11B 被認為參與防禦反應,並與精子成熟、儲存及保護相關;這些角色同樣標示為依相似性推定。資料並未進一步說明其如何作用於精子或生殖道環境,也沒有提供可據以描述具體分子機制或作用條件的細節。

依照現有註記,SPAG11B 的功能概念主要連結兩方面:一是可能的抗微生物活性,二是男性生殖道的防禦,以及與精子成熟、儲存和保護的關聯。這些資訊支持將它描述為可能參與生殖道防禦的蛋白質,但不足以據此推定其他微生物靶標、特定作用途徑,或上述精子相關功能之間的因果關係。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 7463542 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SPAG11B ENST00000398462 GRCh38 chr8:7463442-7464542 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTCTCTGTCTGGATTAAAATATACATGCAAATGAGACATATGAGATAAGCACTATCTTTTCCAGACATC
ACTGATGTTACATTGGATGCTATGTGAATACAAAACTCTTCAACCAAAGCCTTCTTCACTTTAGTTAAGT
CCAGAGCAGACTGTCTGGGTTACATGCATACCTGAGCTAATGCAGCCAAGTAAGAAACACACACTTGGTT
AAAATGCTTAAAAAGATGAAGGAGAAGGGAAGACAAGTCCTCTGCTTGGATATTACTAGAGGAGAAAACC
CAGACTCAAACACAGATTTTTTTTTTCTTTTTTAAAAGAATTGAATTGGACCCAGTGACATCAACAGGAG
GTGTCTGGGGGTAAAGAGAATGGAAAGGGGAGAGAAAAATCAAGACAACTCAAATAAGTTAAAATAGAAA
GGAGGGGGGTCCAAAGTGAGGAAGGAGAAGTGGAGGGGACCAAGAAACAGGGAGAGAGACTCAGAGAGGA
GAAGAAAAAGAAAAGAACATTTTGAGCAGCCTTGGAACTCTCTGTATAACTTCAGGAAGGGATAGTTTGT
AAAACCAGGTCCTACCTGTTATGTTGTGTGTCTTATGCATGATTTTTTAACACTAAAATAAAAACGCTCA
GCCAACAGGATAGAATCGACATGGCAGTTTATTTATGTCCCTGTTCTCATGAACATTAGGGGGCTTTTGA
GAAGCGTTTGAGGACATTGGCAACTTTATGATAGTTATGTTTGTTCTGCCCCTCCATGCCTTTCATCTTT
CTGTTTCTCTCTGTTCTTCCTTATTCACCAAACCCACCCAAGGCATTCAGGCGTATTATTTACTTCCTGA
AATATGTGTCTCAAGTGTTTGTTCCACCAGCAGTGGGATAGTAGCGTGTCCACATTGTCCTTTGAGAATG
AGAAGTCATCCTGGAGCACAGCTCTTCCCACGCTCCGGGCCCACACACCCAGCCTCACTCCATCAAAGGA
GCCCCGCTGCCTGCCCACCCACCCTGGGTGCTTTCTGGCTTGCAGTGCTCTTGGCAGACATGAGGCAACG
ATTGCTCCCGTCCGTCACCAGCCTTCTCCTTGTGGCCCTGCTGTTTCCAGG
SPAG11B 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SPAG11B_1 ↗8:7,463,542負股7,463,532–7,463,591

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_94Z2X · enhancer · 7468083–7468430 · regulatory

ENSR8_6TP9D · CTCF_binding_site · 7468141–7468172 · regulatory

ENSR8_53QFKL · CTCF_binding_site · 7468324–7468345 · regulatory

· motif · 7468101–7468112 · motif

· motif · 7468143–7468159 · motif

· motif · 7468153–7468169 · motif

· motif · 7468326–7468342 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:103 aa

1 aa103 aa訊號胜肽
依 Q08648 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SPAG11B 屬於 SPAG11 家族,蛋白質長 103 個胺基酸。序列註解將第 1 至 25 位標示為訊號序列;此區域註解提供序列特徵,但未列出其他功能區域或結構域。

訊號胜肽1–25 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q08648…

AlphaFold · Q08648

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

SPAG11B 的定位資料記載為分泌型;來源未提供定位變化的條件或異構型間差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HE2SPAG11BTTC23UBQLN2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SPAG11B 被註記具有對抗大腸桿菌(E. coli)的抗微生物活性,但該活性是依相似性推定。它也被認為參與男性生殖道的防禦反應,並與精子成熟、儲存及保護有關;這些功能同樣屬於依相似性推定,不能視為已直接證實。推論支持
證據與來源

Has antimicrobial activity against E.coli (By similarity). Plays a role in the defense response in the male reproductive tract, contributing to sperm maturation, storage and protection (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted推論支持
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000398462 · 551 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACCCTGGGTGCTTTCTGGCTTGCAGTGCTCTTGGCAGACA40
41TGAGGCAACGATTGCTCCCGTCCGTCACCAGCCTTCTCCT80
81TGTGGCCCTGCTGTTTCCAGGATCGTCTCAAGCCAGACAT120
121GTGAACCACTCAGCCACTGAGGCTCTCGGAGAACTCAGGG160
161AAAGAGCCCCTGGGCAAGGCACAAACGGGTTTCAGCTGCT200
201ACGCCACGCAGTGAAACGGGACCTCTTACCACCGCGCACC240
241CCACCTTACCAAGGGGATGTTCCACCGGGAATTAGAAATA280
281CCATCTGCCATATGCAGCAAGGGATCTGCAGACTTTTTTT320
321CTGCCATTCTGGTGAGAAAAAGCGTGACATTTGCTCTGAT360
361CCCTGGAATAGGTGTTGCGTATCAAATACAGATGAAGAAG400
401GAAAAGAGAAACCAGAGATGGATGGCAGATCTGGGATCTA440
441AAATATAAGCTCCCGGAAGGCAGGGATGTTGAAGTATCCC480
481AAGGGCTTAAAGGAATGTGTGGCTTATAGTAGGTGTTCAA520
521TAAATATTTGTTGAATGAATTTAGCACCAAA551

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。