演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SPAG1SP75

sperm associated antigen 1

SPAG1 編碼 sperm associated antigen 1,可能參與纖毛動力蛋白臂的細胞質組裝,也與受精及 GTP 水解酶活性相關。

Homo sapiens8q22.2UniProt Q07617
OFFICIAL SYMBOL
SPAG1
CHROMOSOME
8
UNIPROT
Q07617
PDB / ALPHAFOLD
9HB4
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SPAG1 是人類的蛋白質編碼基因,產物名稱為 sperm associated antigen 1。其蛋白質長 926 個胺基酸,序列中含有多個 TPR 重複序列,另有預測為無序的區域。現有資料將其與纖毛動力蛋白臂的細胞質組裝及受精相關聯,並指出蛋白質可結合 GTP 且具有 GTPase 活性;其中纖毛組裝的角色標示為依相似性推定。

Official symbol
SPAG1
Gene name
sperm associated antigen 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11212
UniProt
Q07617
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SP75FLJ32920HSD-3.8TPISCT140CILD28DNAAF13

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q22.2
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegSPAG1pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr8:100,157,853–100,259,278
Gene span
101,426 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000388798 ★100,158,587–100,241,90419
ENST00000936429100,157,853–100,242,59218
ENST00000964470100,157,853–100,242,59219
ENST00001110701100,157,853–100,195,19110
ENST00000520643100,157,906–100,194,68010
ENST00000251809100,157,906–100,242,59219
ENST00000964471100,157,906–100,242,59218
ENST00000964472100,157,906–100,242,59218
ENST00001036426100,157,906–100,195,16411
ENST00000520508100,158,335–100,194,68410
ENST00001133458100,158,335–100,242,59219

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SPAG1 的功能資料涵蓋纖毛動力蛋白臂組裝、受精,以及 GTP 結合與水解酶活性。資料指出,它可能參與纖毛動力蛋白臂在細胞質中的組裝;此項角色是依相似性推定,因此應視為可能的功能,而非已確立的結論。

纖毛動力蛋白臂的細胞質組裝涉及纖毛相關結構形成前的組裝過程。現有註解將 SPAG1 與此過程相連,但未提供更具體的作用步驟、參與的分子夥伴或實驗系統細節,故不能據此推定它如何促進組裝或是否直接構成動力蛋白臂。

資料另指出 SPAG1 可能在受精中發揮作用,但未說明其作用環節、涉及的細胞或分子機制。這項記載支持受精相關的功能關聯,並不足以進一步判定其對受精的影響方式或重要程度。

在分子活性方面,SPAG1 可結合 GTP,並具有 GTPase 活性。這表示其具備結合 GTP 並催化其水解的能力;來源沒有交代此活性是否直接調節纖毛動力蛋白臂組裝或受精,因此不應將這些功能與 GTPase 活性之間的因果關係視為已證實。整體資料支持的重點是:SPAG1 具有 GTP 結合及水解活性,並可能參與纖毛相關組裝與受精,但後兩者的具體機制仍未由這些註解說明。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 100158587 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SPAG1 ENST00000388798 GRCh38 chr8:100157587-100158687 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGTATTTAAATATATATATACATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATATATA
TACACACACACACACACACATATATATATGTATAGTGTAGAGGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTG
GTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGCCATCCTCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAG
CTCCCGCGCCCGGCTGATGCCAGCGTTTTAACTCTACAACAAACTGAAACTCAAACGAGAGGAAGTGGAC
CTCTCACACCAACTCTTATGCCCAATTGGTCCTCTGCCAGTGAAGGCGGGGAAGGTGAACCTGTGGCCGT
CGGCAGATCTGCAGATCTGCCGGACTGCGGGTCGGGGCGTGGCAGGGGCCTAGTCCCCGCCCCGGCCGTC
AGCCTGTCGCCTCTGGCTCGGGCCGGGCGACGAGACCCTCCCTCAGCACCTGCAGTGCAGCCAGAGCCGG
TGCGGCGGCCGCGACTTCCCCGACGCGGGGCGCTGAGAAGCAGTGAGTGCCTGTGTGTACCTGCCGGCCG
GGAATATAGGACTTGTCGCATCTCAGCCCTTCCCTCCCGGAGCGGGGGCGAGAGGTCGAGGCGGGGAGGC
GAAGGGGCGGTGGGCCGCGAGGGAGAAGGAGCGATGGGGTGGACGTCCTTCAAGGCCGGGGAACACGCGG
GGCTTTCCAGGCCGCGGGGGACGGTGGCGGGTGTCGGGGCGCGGTGGCAACGCTGGAGTTCCCGGGTCCA
CCGGCGCGGTCAGCCCTGGTGACCCAAGCCAGGGGCTGGGGAGCAATCTGAGACCATTGCGGCTGGGCTG
TGGGGCTCCCCAGTCCCGGCAGGTCCTGGCGCCGCTGTACATAGAAACCGTTGCCACGGCGGGAGGATGC
CGTTTCTTTTCGGTCTCCGACTGCAGGGGGCGGTCGGCCCTGTGGATGCAGGAAAGAGGGTGCCTCGGTG
GGAGAGACCCAGCTTTTCGCGTTAGTAGGCCCGAGCAGTTTGAACTGGAGGTATTACTAAGCTGGCTACG
AAATATGGGAGGTGGATGTGGATCAGGATGATGGAGAAATTAAATCCAGCT
SPAG1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SPAG1_1 ↗8:100,150,661正股100,150,612–100,150,671

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_BPTNG · promoter · 100157634–100158597 · regulatory

ENSR8_5TK3XT · CTCF_binding_site · 100158512–100158533 · regulatory

ENSR8_93GQD5 · enhancer · 100158598–100158963 · regulatory

· motif · 100155700–100155712 · motif

· motif · 100157760–100157782 · motif

· motif · 100157760–100157782 · motif

· motif · 100158051–100158060 · motif

· motif · 100158185–100158198 · motif

· motif · 100158190–100158205 · motif

· motif · 100158191–100158204 · motif

· motif · 100158514–100158530 · motif

· motif · 100158560–100158571 · motif

· motif · 100159165–100159176 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:926 aa

1 aa926 aa功能區域重複區
依 Q07617 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

sperm associated antigen 1 長 926 個胺基酸,序列包含九段註記為 TPR 的重複區,分布於第 209–309、445–554 及 623–724 位胺基酸。另有兩段被標註為無序區域,分別位於第 318–452 與 758–801 位胺基酸。

重複區TPR 1209–242 aa
重複區TPR 2244–275 aa
重複區TPR 3276–309 aa
重複區TPR 4445–478 aa
重複區TPR 5487–520 aa
重複區TPR 6522–554 aa
重複區TPR 7623–656 aa
重複區TPR 8657–690 aa
重複區TPR 9692–724 aa
功能區域Disordered318–452 aa
功能區域Disordered758–801 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9HB4…

PDB · 9HB4

EM · 3.56 A · G/H=1-926

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Dynein axonemal particle

SPAG1 被記錄於細胞質及軸絲動力蛋白顆粒,並與 tubulin 共定位。 這些資料描述的是 SPAG1 的定位與共定位情形;來源未提供不同條件下的定位變化或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Dynein axonemal particle。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SP75SPAG1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SPAG1 相關變異被記載可造成原發性纖毛運動障礙 28(CILD28)。此病影響運動纖毛,可反覆出現呼吸道感染,並導致慢性發炎與支氣管擴張;部分患者也可能因胚胎節點單纖毛功能異常而出現左右側身體不對稱隨機化及內臟反位。伴有內臟反位的原發性纖毛運動障礙稱為 Kartagener syndrome。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SPAG1 可能參與纖毛動力蛋白臂在細胞質中的組裝;此項功能是依相似性推定。資料亦指出它可能參與受精,並可結合 GTP、具有 GTPase 活性,但未說明這些活性與上述功能之間的關係。含實驗來源
證據與來源

May play a role in the cytoplasmic assembly of the ciliary dynein arms (By similarity). May play a role in fertilization. Binds GTP and has GTPase activity

PMID 11517287 ↗ · PMID 1299558 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SPAG1 的定位資料包括細胞質與軸絲動力蛋白顆粒,並記載其與 tubulin 共定位。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Dynein axonemal particle; Colocalizes with tubulin

PMID 11517287 ↗ · PMID 16983343 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯SPAG1 相關變異可造成原發性纖毛運動障礙 28(CILD28),其特徵為運動纖毛異常。患者可能反覆發生呼吸道感染,進而出現慢性發炎與支氣管擴張;胚胎節點單纖毛功能異常也可能造成左右側身體不對稱隨機化及內臟反位。合併內臟反位的原發性纖毛運動障礙稱為 Kartagener syndrome。含實驗來源
證據與來源

Ciliary dyskinesia, primary, 28 CILD28 A disorder characterized by abnormalities of motile cilia. Respiratory infections leading to chronic inflammation and bronchiectasis are recurrent, due to defects in the respiratory cilia. Patients may exhibit randomization of left-right body asymmetry and situs inversus, due to dysfunction of monocilia at the embryonic node. Primary ciliary dyskinesia associated with situs inversus is referred to as Kartagener syndrome. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 615505

PMID 24055112 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000388798 · 3,695 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTTAGTAGGCCCGAGCAGTTTGAACTGGAGCTATGACCAC40
41CAAAGATTATCCATCATTGTGGGGCTTTGGAACAACAAAA80
81ACATTCAAAATTCCCATTGAACATCTAGATTTCAAATACA120
121TTGAAAAATGTTCAGATGTTAAACATCTGGAAAAAATTCT160
161TTGCGTGCTCAGATCTGGTGAGGAAGGATATTATCCTGAA200
201CTTACAGAATTTTGTGAAAAGCATCTTCAAGCCTTGGCCC240
241CTGAAAGCAGAGCTTTGAGGAAAGATAAACCAGCAGCAAC280
281AGCAGCCAGTTTTACAGCTGAAGAATGGGAAAAAATTGAT320
321GGTGATATAAAGAGTTGGGTATCAGAAATTAAAAAAGAAG360
361AAGATAAAATGCACTTTCATGAAACTGAGACATTTCCAGC400
401AATGAAAGATAATTTGCCTCCAGTTCGTGGTTCAAACAGC440
441TGTCTTCATGTAGGCAAGGAAAAATATTCTAAAAGACCAA480
481CTAAAAAGAAAACTCCAAGGGATTACGCGGAATGGGATAA520
521ATTTGACGTGGAGAAGGAATGTTTAAAAATTGATGAAGAT560
561TACAAAGAAAAGACGGTAATAGACAAGTCACACTTGTCTA600
601AAATTGAGACAAGAATAGATACAGCAGGTCTAACTGAGAA640
641AGAAAAGGATTTTCTTGCCACTCGTGAAAAGGAGAAAGGA680
681AATGAAGCTTTCAACTCAGGAGATTATGAAGAAGCAGTGA720
721TGTATTATACCAGGAGCATATCAGCGCTTCCCACTGTAGT760
761TGCCTATAACAATCGAGCTCAAGCAGAAATCAAATTACAG800
801AACTGGAATAGTGCTTTTCAGGATTGTGAAAAGGTCTTGG840
841AGTTAGAACCTGGAAACGTAAAGGCTCTTCTGCGTCGTGC880
881TACTACATATAAACATCAAAACAAGCTCCGGGAAGCTACA920
921GAAGATTTGAGTAAAGTACTAGATGTTGAGCCTGATAATG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。