演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SPA17SP17

sperm autoantigenic protein 17

SPA17 編碼 sperm autoantigenic protein 17,來源描述其位於精子表面,並可能參與精子與透明帶的結合。

Homo sapiens11q24.2UniProt Q15506
OFFICIAL SYMBOL
SPA17
CHROMOSOME
11
UNIPROT
Q15506
PDB / ALPHAFOLD
8J07
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SPA17 是蛋白質編碼基因,其產物名稱為 sperm autoantigenic protein 17。來源將此蛋白描述為精子表面的透明帶結合蛋白,並指出它可能與醣類結合;這些功能資訊標示為依相似性推定,並非此處直接證實的結果。

Official symbol
SPA17
Gene name
sperm autoantigenic protein 17
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11210
UniProt
Q15506
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SP17CT22

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q24.2
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegSPA17pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:124,673,327–124,698,312
Gene span
24,986 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000227135 ★124,673,904–124,697,5185
ENST00001101221124,673,327–124,698,3125
ENST00000889322124,673,796–124,698,3125
ENST00000919291124,673,796–124,698,3125
ENST00000919292124,673,796–124,698,3124
ENST00001130091124,673,796–124,691,8623
ENST00001130092124,673,796–124,691,8624
ENST00001144176124,673,796–124,698,3125
ENST00000532692124,673,844–124,698,3124
ENST00000919293124,673,943–124,698,3125
ENST00000889323124,674,185–124,698,3125
ENST00001101223124,674,185–124,698,3125

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

sperm autoantigenic protein 17 被描述為精子表面的透明帶結合蛋白。來源指出,它有助於精子以高親和力結合透明帶,並可能參與對透明帶及醣類的結合;後兩項可能功能屬於依相似性推定,因此應視為推測性描述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 124673904 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SPA17 ENST00000227135 GRCh38 chr11:124672904-124674004 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GAAATCCAACATTATCACTTTAGTTTGCATTATCAGACAGATTGCACCTTCTGCTTTCTCCATACTGTGA
CCCAGTGTCCAGCCTAGGGTATTCGAATGGCAAGATCTGACCTGCGCAACAGCCAAAGGGAGCCACCAGC
CTCCCCTATGCCACTCACATTTTCCCACCACCAATATCTGTAAGCGGTACCAGAAATCAAAACTGAGCCT
TAAATAGTCAGAGCTAGTGAGGGGGTTGTATTTCTTAGCCCTGATAACCACTTAAACGAGTAAAATTTAA
TTCCCCTAAGGAACCCCGCCTGAAGCAAACCCTCCCCAAGGGCACCACTGAGGGGGTAGCGCTGAAATGT
TTTGGAAGATTCAGTCACCTGTTTCCAAATATTACCTAACTAGCTTCGCCTCCTTCCCTCCGAGCTCCCC
TGCAGTTACTCCAGGACCCCGAAGGCCTCTTTCTGGGCACATTTGGGCCTCCCCACTCAGACAAGCCGCA
CTTTCTCCCTGCTCACAGGCTGCATGTCAGGGATGGTAAGTGGGGGGTGGAGAAAGTGGAGAGGCCGGGG
TTCAACCCAGCAGACTCCTGCAGACCGGGCCTCGGTCGGAGACGCGAGCCCCTAGCCTAGCTAGGTTCCT
TCGTCGACCTTGAGAAAGGGGCGCGGATCCGTGTCCCGCAGAGGACACGGGGTCTCGGAGCCCGCACAGG
CTGAGGGGCAGGGGTCCGGCCGAGCCGGGCCGCCTCACCTGCACTTCTGTCGGCCCACAGGATTAATGGC
AGCACCAGCCCGAGTACAAGCCCCGGCGCGACCATGCTTGCAAGGATCTGACCGCCGCCTAGGACTGGGA
AAGTGGGTTCCCGGCAGGGGCGGGGCCTGGGCGGGGGCGAGGCCGACTCCACCCTTTTGCAGTCCTCGCA
GCCTCCCGCGACCTCAGGACTGGGCTGTACTCGCCCCTTCTCGGCCGCCGTAGTTTTTTTTTTTTTTTAA
AGAAAAAACGGTTACCCAGCAACTAGAAAAACAACCGGAACCGGCGGCACCAGCTCGGAGAGAAAGGAGG
TGAGGCCGCTTCCCCACTTCCTCTCCGATACCAAGACCTAGCCTTTTCCCT
SPA17 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SPA17_1 ↗11:124,673,916正股124,673,867–124,673,926

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_6JMTDD · CTCF_binding_site · 124669304–124669335 · regulatory

ENSR11_534BPTF · CTCF_binding_site · 124669879–124669900 · regulatory

ENSR11_BWQ2T · enhancer · 124670681–124671233 · regulatory

ENSR11_CGD2L · enhancer · 124672664–124673728 · regulatory

ENSR11_85MZ77 · promoter · 124673729–124673914 · regulatory

ENSR11_BWQ3D · enhancer · 124673915–124674753 · regulatory

ENSR11_85MZ8R · enhancer · 124676460–124676679 · regulatory

· motif · 124669306–124669322 · motif

· motif · 124669316–124669332 · motif

· motif · 124669356–124669369 · motif

· motif · 124669391–124669403 · motif

· motif · 124669847–124669858 · motif

· motif · 124669881–124669897 · motif

· motif · 124670981–124670989 · motif

· motif · 124671659–124671668 · motif

· motif · 124671659–124671668 · motif

· motif · 124673574–124673589 · motif

· motif · 124673759–124673769 · motif

· motif · 124673771–124673784 · motif

· motif · 124674112–124674122 · motif

· motif · 124674780–124674789 · motif

· motif · 124674780–124674789 · motif

· motif · 124676627–124676636 · motif

· motif · 124676627–124676636 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:151 aa

1 aa151 aa結構域功能區域
依 Q15506 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

sperm autoantigenic protein 17 長 151 個胺基酸。序列註解標示第 114 至 143 位具有 IQ 結構域;第 56 至 115 位及第 127 至 151 位則被預測為無序區域。

結構域IQ114–143 aa
功能區域Disordered56–115 aa
功能區域Disordered127–151 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8J07…

PDB · 8J07

EM · 4.10 A · K/L/k/l=1-151

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

sperm autoantigenic protein 17 被註解為膜周邊蛋白。 來源未提供其定位改變條件或異構型間的定位差異。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SP17SPA17ACTN2AKAP7MYL6BROPN1ROPN1L
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

來源指出 sperm autoantigenic protein 17 可能形成同源二聚體,此項資訊為依相似性推定;它也可能與 ROPN1 互作,但來源未進一步說明互作證據或其功能關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能sperm autoantigenic protein 17 被描述為精子表面的透明帶結合蛋白,並有助於精子以高親和力結合透明帶。它也可能參與透明帶及醣類的結合;這些可能功能是依相似性推定。推論支持
證據與來源

Sperm surface zona pellucida binding protein. Helps to bind spermatozoa to the zona pellucida with high affinity. Might function in binding zona pellucida and carbohydrates (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用sperm autoantigenic protein 17 可能形成同源二聚體,此描述依相似性推定;來源另指出它可能與 ROPN1 互作,但未提供進一步的互作條件或功能說明。推論支持
證據與來源

Homodimer (By similarity). May interact with ROPN1

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位sperm autoantigenic protein 17 被註解為膜周邊蛋白;來源未說明其定位的條件變化或異構型差異。推論支持
證據與來源

Membrane / Peripheral membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000227135 · 3,604 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AACTAGAAAAACAACCGGAACCGGCGGCACCAGCTCGGAG40
41AGAAAGGAGGTTCCATAGGCAGTTCTTACCAAGAAGATGT80
81CGATTCCATTCTCCAACACCCACTACCGAATTCCACAAGG120
121ATTTGGGAATCTTCTTGAAGGGCTGACACGCGAGATTCTG160
161AGAGAGCAACCGGACAATATACCAGCTTTTGCAGCAGCCT200
201ATTTTGAGAGCCTTCTAGAGAAAAGAGAGAAAACCAACTT240
241TGATCCAGCAGAATGGGGGAGTAAGGTAGAAGACCGCTTC280
281TATAACAATCATGCATTCGAGGAGCAAGAACCACCTGAGA320
321AAAGTGATCCTAAACAAGAAGAGTCTCAGATATCTGGGAA360
361GGAGGAAGAGACATCAGTCACCATCTTAGACTCTTCTGAG400
401GAAGATAAGGAAAAAGAAGAGGTTGCTGCTGTCAAAATCC440
441AAGCTGCCTTCCGGGGACACATAGCCAGAGAGGAGGCAAA480
481GAAAATGAAAACAAATAGTCTTCAAAATGAGGAAAAAGAG520
521GAAAACAAGTGAGGACACTGGTTTTACCTCCAGGAAACAT560
561GAAAAATAATCCAAATCCATCAACCTTCTTATTAATGTCA600
601TTTCTTCCTGAGGAAGGAAGATTTGATGTTGTGAAATAAC640
641ATTCGTTACTGTTGTGAAAATCTGTCATGAGCATTTGTTT680
681AATAAGCATACCATTGAAACATGCCACTTGAAGATTTCTC720
721TGAGATCATGAGTTTGTTTACACTTGTCTCAAGCCTATCT760
761ATAGAGACCCTTGGATTTAGAATTATAGAACTAAAGTATC800
801TGAGATTACAGAGATCTCAGAGGTTATGTGTTCTAACTAT840
841TATCAAATGAATAAATCCTCTCTATCACATCCCCCAAAAA880
881TGTTCTTTAGCTCCTGTTTCACTCCTAGTGGTAAAGAATT920
921TCACTGCTTTTTAAGGATAGTCTATTTAATTTTGGAATTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。