基因總覽
SPA17 是蛋白質編碼基因,其產物名稱為 sperm autoantigenic protein 17。來源將此蛋白描述為精子表面的透明帶結合蛋白,並指出它可能與醣類結合;這些功能資訊標示為依相似性推定,並非此處直接證實的結果。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000227135 ★ | 124,673,904–124,697,518 | 5 |
| ENST00001101221 | 124,673,327–124,698,312 | 5 |
| ENST00000889322 | 124,673,796–124,698,312 | 5 |
| ENST00000919291 | 124,673,796–124,698,312 | 5 |
| ENST00000919292 | 124,673,796–124,698,312 | 4 |
| ENST00001130091 | 124,673,796–124,691,862 | 3 |
| ENST00001130092 | 124,673,796–124,691,862 | 4 |
| ENST00001144176 | 124,673,796–124,698,312 | 5 |
| ENST00000532692 | 124,673,844–124,698,312 | 4 |
| ENST00000919293 | 124,673,943–124,698,312 | 5 |
| ENST00000889323 | 124,674,185–124,698,312 | 5 |
| ENST00001101223 | 124,674,185–124,698,312 | 5 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
sperm autoantigenic protein 17 被描述為精子表面的透明帶結合蛋白。來源指出,它有助於精子以高親和力結合透明帶,並可能參與對透明帶及醣類的結合;後兩項可能功能屬於依相似性推定,因此應視為推測性描述。
Promoter 與基因調控
>SPA17 ENST00000227135 GRCh38 chr11:124672904-124674004 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GAAATCCAACATTATCACTTTAGTTTGCATTATCAGACAGATTGCACCTTCTGCTTTCTCCATACTGTGA CCCAGTGTCCAGCCTAGGGTATTCGAATGGCAAGATCTGACCTGCGCAACAGCCAAAGGGAGCCACCAGC CTCCCCTATGCCACTCACATTTTCCCACCACCAATATCTGTAAGCGGTACCAGAAATCAAAACTGAGCCT TAAATAGTCAGAGCTAGTGAGGGGGTTGTATTTCTTAGCCCTGATAACCACTTAAACGAGTAAAATTTAA TTCCCCTAAGGAACCCCGCCTGAAGCAAACCCTCCCCAAGGGCACCACTGAGGGGGTAGCGCTGAAATGT TTTGGAAGATTCAGTCACCTGTTTCCAAATATTACCTAACTAGCTTCGCCTCCTTCCCTCCGAGCTCCCC TGCAGTTACTCCAGGACCCCGAAGGCCTCTTTCTGGGCACATTTGGGCCTCCCCACTCAGACAAGCCGCA CTTTCTCCCTGCTCACAGGCTGCATGTCAGGGATGGTAAGTGGGGGGTGGAGAAAGTGGAGAGGCCGGGG TTCAACCCAGCAGACTCCTGCAGACCGGGCCTCGGTCGGAGACGCGAGCCCCTAGCCTAGCTAGGTTCCT TCGTCGACCTTGAGAAAGGGGCGCGGATCCGTGTCCCGCAGAGGACACGGGGTCTCGGAGCCCGCACAGG CTGAGGGGCAGGGGTCCGGCCGAGCCGGGCCGCCTCACCTGCACTTCTGTCGGCCCACAGGATTAATGGC AGCACCAGCCCGAGTACAAGCCCCGGCGCGACCATGCTTGCAAGGATCTGACCGCCGCCTAGGACTGGGA AAGTGGGTTCCCGGCAGGGGCGGGGCCTGGGCGGGGGCGAGGCCGACTCCACCCTTTTGCAGTCCTCGCA GCCTCCCGCGACCTCAGGACTGGGCTGTACTCGCCCCTTCTCGGCCGCCGTAGTTTTTTTTTTTTTTTAA AGAAAAAACGGTTACCCAGCAACTAGAAAAACAACCGGAACCGGCGGCACCAGCTCGGAGAGAAAGGAGG TGAGGCCGCTTCCCCACTTCCTCTCCGATACCAAGACCTAGCCTTTTCCCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SPA17_1 ↗ | 11:124,673,916 | 正股 | 124,673,867–124,673,926 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_6JMTDD · CTCF_binding_site · 124669304–124669335 · regulatory
ENSR11_534BPTF · CTCF_binding_site · 124669879–124669900 · regulatory
ENSR11_BWQ2T · enhancer · 124670681–124671233 · regulatory
ENSR11_CGD2L · enhancer · 124672664–124673728 · regulatory
ENSR11_85MZ77 · promoter · 124673729–124673914 · regulatory
ENSR11_BWQ3D · enhancer · 124673915–124674753 · regulatory
ENSR11_85MZ8R · enhancer · 124676460–124676679 · regulatory
· motif · 124669306–124669322 · motif
· motif · 124669316–124669332 · motif
· motif · 124669356–124669369 · motif
· motif · 124669391–124669403 · motif
· motif · 124669847–124669858 · motif
· motif · 124669881–124669897 · motif
· motif · 124670981–124670989 · motif
· motif · 124671659–124671668 · motif
· motif · 124671659–124671668 · motif
· motif · 124673574–124673589 · motif
· motif · 124673759–124673769 · motif
· motif · 124673771–124673784 · motif
· motif · 124674112–124674122 · motif
· motif · 124674780–124674789 · motif
· motif · 124674780–124674789 · motif
· motif · 124676627–124676636 · motif
· motif · 124676627–124676636 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:151 aa
sperm autoantigenic protein 17 長 151 個胺基酸。序列註解標示第 114 至 143 位具有 IQ 結構域;第 56 至 115 位及第 127 至 151 位則被預測為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
sperm autoantigenic protein 17 被註解為膜周邊蛋白。 來源未提供其定位改變條件或異構型間的定位差異。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- ACTN2P35609 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AKAP7O43687-2 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- MYL6BP14649 · UniProt INTERACTION · 14 experiments
- ROPN1Q9HAT0 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- ROPN1LQ96C74 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
來源指出 sperm autoantigenic protein 17 可能形成同源二聚體,此項資訊為依相似性推定;它也可能與 ROPN1 互作,但來源未進一步說明互作證據或其功能關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | sperm autoantigenic protein 17 被描述為精子表面的透明帶結合蛋白,並有助於精子以高親和力結合透明帶。它也可能參與透明帶及醣類的結合;這些可能功能是依相似性推定。 | 推論支持 | 證據與來源Sperm surface zona pellucida binding protein. Helps to bind spermatozoa to the zona pellucida with high affinity. Might function in binding zona pellucida and carbohydrates (By similarity) |
| 交互作用 | sperm autoantigenic protein 17 可能形成同源二聚體,此描述依相似性推定;來源另指出它可能與 ROPN1 互作,但未提供進一步的互作條件或功能說明。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | sperm autoantigenic protein 17 被註解為膜周邊蛋白;來源未說明其定位的條件變化或異構型差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AACTAGAAAAACAACCGGAACCGGCGGCACCAGCTCGGAG40AGAAAGGAGGTTCCATAGGCAGTTCTTACCAAGAAGATGT80CGATTCCATTCTCCAACACCCACTACCGAATTCCACAAGG120ATTTGGGAATCTTCTTGAAGGGCTGACACGCGAGATTCTG160AGAGAGCAACCGGACAATATACCAGCTTTTGCAGCAGCCT200ATTTTGAGAGCCTTCTAGAGAAAAGAGAGAAAACCAACTT240TGATCCAGCAGAATGGGGGAGTAAGGTAGAAGACCGCTTC280TATAACAATCATGCATTCGAGGAGCAAGAACCACCTGAGA320AAAGTGATCCTAAACAAGAAGAGTCTCAGATATCTGGGAA360GGAGGAAGAGACATCAGTCACCATCTTAGACTCTTCTGAG400GAAGATAAGGAAAAAGAAGAGGTTGCTGCTGTCAAAATCC440AAGCTGCCTTCCGGGGACACATAGCCAGAGAGGAGGCAAA480GAAAATGAAAACAAATAGTCTTCAAAATGAGGAAAAAGAG520GAAAACAAGTGAGGACACTGGTTTTACCTCCAGGAAACAT560GAAAAATAATCCAAATCCATCAACCTTCTTATTAATGTCA600TTTCTTCCTGAGGAAGGAAGATTTGATGTTGTGAAATAAC640ATTCGTTACTGTTGTGAAAATCTGTCATGAGCATTTGTTT680AATAAGCATACCATTGAAACATGCCACTTGAAGATTTCTC720TGAGATCATGAGTTTGTTTACACTTGTCTCAAGCCTATCT760ATAGAGACCCTTGGATTTAGAATTATAGAACTAAAGTATC800TGAGATTACAGAGATCTCAGAGGTTATGTGTTCTAACTAT840TATCAAATGAATAAATCCTCTCTATCACATCCCCCAAAAA880TGTTCTTTAGCTCCTGTTTCACTCCTAGTGGTAAAGAATT920TCACTGCTTTTTAAGGATAGTCTATTTAATTTTGGAATTT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。