基因總覽
SP5 是蛋白質編碼基因，其產物 Sp5 transcription factor 屬於轉錄因子。資料將其描述為可能的轉錄活化因子，並指出它可結合啟動子中的 GC boxes。其在胚胎發育期間的可能角色，是協調形成發育模式所需的轉錄變化；這項功能註記依相似性推定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000375281 ★ | 170,715,337–170,718,078 | 2 |
| ENST00001138569 | 170,715,287–170,718,078 | 2 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Sp5 transcription factor 可結合啟動子中的 GC boxes，這項結合特性與其調控轉錄的角色相符。資料將它描述為可能的轉錄活化因子，但此角色並非確定性結論，功能註記標示為依相似性推定。
在發育中的胚胎，Sp5 transcription factor 可能參與協調轉錄變化，使形成發育模式所需的基因轉錄調整得以配合。現有資料支持的功能範圍僅包括其與 GC boxes 的結合，以及可能的轉錄活化與胚胎發育相關角色；未提供更具體的作用機制或實驗條件。
Promoter 與基因調控
>SP5 ENST00000375281 GRCh38 chr2:170714337-170715437 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACCAGCAGCGCTGGGGCTTTCGGCCCCCCACAGCCCAGCCCGGGCCTCCTGGGTGGCCTGGGGAGAAGGG GGCGGGACAGCACAGCTTCTTCCCCTCGGGTGGGCATGACGGGTCGCCTTGGGTGTCCTGCCGAGCTCAG CTTTGAGGGTATGCGCGGCGCGGGTGTTTTTCCCAGGTCCACTCTGCAAAAGTTGTGGCCTGAGGAAAAC TTCCAGGTCGCCAGCAGGAACGTCACAGGAGAGCCCCGGTCGCTCGTCAGGCGGGCGGCCCTGGAGCGTG CGCGCCACCCAACGCCGCGCTGGGCGGCCGCCCGGCCCCGCCCCAGGTCACAGCCCTGCCCTCGGCCCCA CCGCGGCGGGCGGGGGACACGCGGCGGGCCGGGCGCTGTCGGTCCCACGCCCCACCGGGGATCTCGCTTG GGTCCGCTGTGTGCGCGGGCGGGTGCGTGTGCGGCGAGGGTGCAGGGTGTGCAAGTAAATACAGGGGAGA GTTACACTCTTTGCCGTCTCAAAGTCCGGCGCCTGGAAGCCGAAGGCAGATTTTTCCAGAGATAACAAAG ACACTTTGTCACTTTGGGCGCTGCGTCGGTGCAAATCTTTAATTGCAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT GTATGTTGGGGGGGGCGGGAAGAGTGTCTCGAGCAACCCAAGCGCGGGTCTCCAGGCGGCAAGGCCCCCT TTGATCAGGAAAATCCAATTATTTGTGTATATACATTTCCCACATAGTGATTACTTCATTAATTGTCCCG CCTTTATCTCCTCCCTTCCCATCCCCCCTAATAATCAGTTCTTTTATCCAGACCAACAAACACACCATAG GAGCTTTGTGGATTCAAAGGATTTGCTTTCGCTTCTGAAAGAGCCGCTATTCTTTGATGATTGGGTAGCG GCAAACTTCAAAGCCATAAATCTTCCCTCTGACTGGCTGGCGGCCCAGCAAAGTCCTTATCAAATTCTTG GAGGTGATCCTGAAGCGCTCAGACCGCGCGCGGGGCGAGCGAGCGGGGCGCGGCGAGGGGCAAGGGCGGG GAGGGCCCCGGCGCTCAGAGCAGGCGCCAGGGAGGCAGGCTGGGCGGCCCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SP5_2 ↗ | 2:170,713,945 | 正股 | 170,713,896–170,713,955 |
| SP5_1 ↗ | 2:170,715,337 | 正股 | 170,715,288–170,715,347 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_53H65GH · CTCF_binding_site · 170711163–170711184 · regulatory
ENSR2_B38TPT · enhancer · 170711267–170712268 · regulatory
ENSR2_94HQGZ · promoter · 170712269–170712709 · regulatory
ENSR2_CLXD4 · enhancer · 170713056–170714556 · regulatory
ENSR2_B38TQC · promoter · 170714557–170715347 · regulatory
ENSR2_53H66F9 · CTCF_binding_site · 170716728–170716749 · regulatory
ENSR2_53H66FF · CTCF_binding_site · 170716758–170716779 · regulatory
ENSR2_53H66GK · CTCF_binding_site · 170717006–170717027 · regulatory
· motif · 170710396–170710410 · motif
· motif · 170711165–170711181 · motif
· motif · 170713637–170713650 · motif
· motif · 170714073–170714080 · motif
· motif · 170714841–170714856 · motif
· motif · 170716730–170716746 · motif
· motif · 170716760–170716776 · motif
· motif · 170717008–170717024 · motif
· motif · 170717091–170717100 · motif
· motif · 170717091–170717100 · motif
· motif · 170717091–170717100 · motif
· motif · 170717091–170717100 · motif
· motif · 170717091–170717107 · motif
· motif · 170717091–170717107 · motif
· motif · 170717100–170717109 · motif
· motif · 170717100–170717109 · motif
· motif · 170717100–170717109 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：398 aa
Sp5 transcription factor 長 398 個胺基酸，屬於 Sp1 C2H2 型鋅指蛋白家族。其序列註解包括三個 C2H2 型鋅指區域，分別位於第 296–320、326–350 與 356–378 位胺基酸；第 160–204 位被註記為無序區域，第 187–195 位則有 9aaTAD motif。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Sp5 transcription factor 的定位註記為細胞核；此定位證據標示為依相似性推定。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Sp5 transcription factor 可結合啟動子中的 GC boxes，並可能作為轉錄活化因子；依相似性推定，它可能協調胚胎發育期間形成發育模式所需的轉錄變化。 | 推論支持 | 證據與來源Binds to GC boxes promoters elements. Probable transcriptional activator that has a role in the coordination of changes in transcription required to generate pattern in the developing embryo (By similarity) |
| 細胞定位 | Sp5 transcription factor 的細胞內定位註記為細胞核；此定位資訊依相似性推定，並非來源所述的確證結果。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGACCGCGCGCGGGGCGAGCGAGCGGGGCGCGGCGAGGGG40CAAGGGCGGGGAGGGCCCCGGCGCTCAGAGCAGGCGCCAG80GGAGGCAGGCTGGGCGGCCCTTCGTCCTCGCCTTCGGGTG120TCCATGCCTCGGCGGCGGCGTCCCGCTCCGCAGCCAGGGG160CCTGCAAGCCGTAGCCATGGCCGCGGTGGCCGTCCTCCGG200AACGACTCGCTGCAGGCCTTTCTCCAGGACCGCACCCCCA240GCGCCTCCCCGGACCTGGGCAAGCACTCGCCCCTGGCATT280GCTGGCCGCCACCTGTAGCCGCATCGGCCAGCCGGGCGCG320GCGGCGCCCCCGGACTTCCTGCAGGTGCCCTACGACCCCG360CGCTGGGCTCACCCTCCAGGCTCTTCCACCCGTGGACCGC400CGACATGCCGGCGCACTCGCCAGGCGCACTGCCGCCCCCG440CATCCCAGCTTGGGGCTGACGCCGCAGAAGACGCACCTGC480AGCCGTCCTTCGGGGCTGCGCACGAGCTTCCCCTTACACC520CCCCGCCGACCCCTCGTACCCCTACGAGTTCTCGCCGGTC560AAGATGCTGCCCTCGAGCATGGCGGCTCTGCCCGCCAGCT600GCGCGCCCGCCTACGTGCCCTACGCGGCGCAGGCCGCGCT640GCCGCCAGGCTACTCCAACCTGCTGCCTCCGCCGCCGCCA680CCGCCCCCGCCGCCCACCTGCCGCCAGTTGTCACCCAACC720CGGCCCCCGACGACCTCCCGTGGTGGAGCATCCCGCAGGC760GGGCGCCGGGCCGGGGGCCTCCGGGGTTCCGGGAAGCGGC800CTCTCCGGCGCCTGTGCCGGGGCCCCCCACGCGCCCCGCT840TCCCCGCCTCTGCGGCCGCTGCTGCTGCGGCCGCCGCCGC880CCTACAAAGAGGCCTGGTGTTGGGCCCGTCGGACTTTGCG920CAGTACCAGAGCCAGATCGCCGCGCTGCTGCAGACCAAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。