基因總覽
SP4 是蛋白質編碼基因，其產物 Sp4 transcription factor 屬於 Sp1 C2H2-type zinc-finger protein family。這類蛋白質具有鋅指結構；SP4 蛋白的序列註解包含三個 C2H2-type zinc finger。其主要角色與轉錄調控相關，來源將其描述為可能的轉錄活化因子，並指出它能辨識啟動子上的特定 DNA 元件。這些特徵構成 SP4 作為轉錄因子的基本分子性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000222584 ★ | 21,428,083–21,514,822 | 6 |
| ENST00000432066 | 21,428,043–21,477,239 | 2 |
| ENST00000959244 | 21,428,083–21,514,822 | 6 |
| ENST00000649633 | 21,428,201–21,514,822 | 6 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Sp4 transcription factor 可結合啟動子中的 GT box 與 GC box 元件。這項結合特性與轉錄調控相關，指出 SP4 能辨識特定啟動子序列；但來源未提供更細的結合機制、目標基因或作用條件，因此不宜據此推定其調控的具體基因或生物過程。
來源將 SP4 描述為可能的轉錄活化因子，表示其可能促進轉錄，但此功能屬於推測性描述，不能視為已確立的活化結果。現有資料僅支持其啟動子元件結合能力及可能的轉錄活化角色，未說明此作用發生的細胞情境、調控方向是否因條件而異，或其對下游生物學過程的具體影響。
Promoter 與基因調控
>SP4 ENST00000222584 GRCh38 chr7:21427083-21428183 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCGCCTCCCCACGCCGCCGCCCGCTCAATCGCCGAGCGCTCCGGGTGTGAGCTCGCCCCGCGGGGAGCGG CTTGGAGCCGAGGAGGCGGCGGCAGAGGTGGTTTGGGCAGCCCCGCGCGGCGGATAGGCCCAGGCAAACA ACACCCATTCCCCCTCCTCCTCGCTCAGTTCAACTCCCACTCGGCCCCGGCCACGCCCTGCCGCCACCGC CCCCTCGGGCAGCTTTCCGCTCGGCAGCCAGGCCTCGGTCGGGGGCGGGAGAGAGGCGGTGCCTCGAAGA AGGCACCGCGACCGCCGGAAACTACGAGTACCGACAGCCTTCGCGGTAGTGCCCCACCCCCTTTCTCCCA CCACTCAGCGCGCGTCACCCTGGGCTCAGCCAATGGAGACAGAGCCAGGGAAAAAGGGCGCCCGGGTCCG GATGCGCCTCAGGAAAGCCATGCTCCCTGCGCGGGGGCAGCGGGCAGTTCACCCAGCGCGCCGACCTGTT GGTGGTCCGCGCGCGCCCACGTCCGCCGCTCTCGCTTGCCTGGATCAAGGGCCCTACTTTTTTCTTTAGT GGCAATTGGAGGGATTGCTGGAGGGGGTTTTTGAGTGGAGGGCGCTGGGAAATGAGTAGGGGGCGGGATA TCCTGAGACAACAAGTTTGGCTGTATGGAGGGCCTACCGGCAGCGCTCCTGAGCTAGAACGCCGAGAGAA AGAGCGCCAGAGGAGCCAGGGAGGAGGAGAAGAGCTGCTAAAGGAATAACCCCGAGAAAGGGGGTGGAGA GGAGGCGGCCCCAGCGCCCCGGCCCCCGGCAGGTCGGCGGCCAATCCGCTGGGGGAAGGGGTGGAGAGTC GGAGGCTCCGGCGGAGAGAGGCCGAGGGGGGTGGGGAGTCGGCCAGGCTCGCACCGCCCTGGCCCCGCCC CCGACCCGCGCCGCCGCCCGCGCCGCGCGCCGCCGCTGTCAATCAAGGGCGAGTCAGCCGGGCTCGGGCG GAGAGAGGAGCTGCTACGCCACAGCCCAGCGGCGGCCATTCGCGGAAAAAGAGGCAGAGCCTGTGCCAGC TACAGCCTCCTCCGAGCCACCGCGGGCGGGCGGGACCGGCCTCTCCTCCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SP4_1 ↗ | 7:21,428,100 | 正股 | 21,428,051–21,428,110 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR7_9BHM2 · promoter · 21427058–21427558 · regulatory
ENSR7_9BHM5 · enhancer · 21427559–21427818 · regulatory
ENSR7_9BHM8 · promoter · 21427819–21428211 · regulatory
ENSR7_5734B7 · CTCF_binding_site · 21428530–21428551 · regulatory
· motif · 21427080–21427090 · motif
· motif · 21427140–21427155 · motif
· motif · 21427169–21427186 · motif
· motif · 21427226–21427236 · motif
· motif · 21427232–21427242 · motif
· motif · 21427254–21427267 · motif
· motif · 21427268–21427281 · motif
· motif · 21427286–21427296 · motif
· motif · 21427288–21427301 · motif
· motif · 21427328–21427341 · motif
· motif · 21427333–21427343 · motif
· motif · 21427413–21427423 · motif
· motif · 21427530–21427543 · motif
· motif · 21427584–21427597 · motif
· motif · 21427701–21427711 · motif
· motif · 21427869–21427879 · motif
· motif · 21427947–21427957 · motif
· motif · 21427949–21427959 · motif
· motif · 21428245–21428262 · motif
· motif · 21428532–21428548 · motif
· motif · 21428580–21428591 · motif
· motif · 21430543–21430555 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：784 aa
Sp4 transcription factor 長 784 個胺基酸，屬於 Sp1 C2H2-type zinc-finger protein family。序列註解標示三個 C2H2-type zinc finger，分別位於胺基酸 647–671、677–701 與 707–729。另有數段區域被註記為無序區；467–475 位的 9aaTAD 則標示為 inactive。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Sp4 transcription factor 的定位資料標示為細胞核。 來源未提供其他定位狀態、條件依賴的變化或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 26 個夥伴
- ADAM15Q13444 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AP1M1Q9BXS5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATXN7L1Q9BTQ8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BANPA0A0S2Z5G4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BANPB4DE54 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BANPQ8N9N5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- CIB3Q96Q77 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- COL8A1P27658 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ELK3P41970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FOXP2Q75MZ5 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- GTF2A1P52655 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO3Q8TAP4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LOC730441Q4G0S1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MCRS1Q96EZ8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NFYCQ13952-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NRF1Q16656 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- PELI2Q9HAT8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PNKPQ96T60 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- POGZQ7Z3K3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- POU2F1P14859 · UniProt INTERACTION · 5 experiments · 2 筆來源紀錄
- PRR20CP86479 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- PRR20DP86480 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPANXN2Q5MJ10 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPANXN3Q5MJ09 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ACAGCCCAGCGGCGGCCATTCGCGGAAAAAGAGGCAGAGC40CTGTGCCAGCTACAGCCTCCTCCGAGCCACCGCGGGCGGG80CGGGACCGGCCTCTCCTCCCGCCTCGCCCCCACCCCCACC120CACCTCTATCCCAGTGTCTCCGTCTGAGGGTTTGTCCTGT160TAATGCGGGATGAGCGATCAGAAGAAGGAGGAGGAGGAGG200AGGCGGCAGCGGCAGCGGCGATGGCTACAGAAGGAGGGAA240AACCTCTGAGCCAGAGAATAACAATAAAAAACCCAAAACC280TCAGGCTCCCAGGACTCTCAGCCCTCTCCTCTGGCTTTAC320TGGCAGCTACTTGCAGCAAAATAGGGACTCCTGGTGAAAA360TCAAGCAACTGGACAACAACAAATTATTATAGATCCAAGT400CAAGGATTGGTGCAACTTCAAAATCAACCACAACAGCTAG440AACTGGTAACAACGCAACTTGCTGGAAACGCTTGGCAACT480TGTTGCCTCCACTCCTCCTGCTTCAAAAGAGAATAACGTT520TCTCAACCAGCCTCTAGTTCGTCTAGTTCTTCCAGCAGTA560ATAACGGGAGTGCATCTCCTACAAAAACTAAATCAGGTAA600TTCTTCCACCCCTGGTCAATTTCAAGTCATACAAGTACAA640AATCCAAGTGGTAGTGTACAGTACCAAGTAATTCCACAAC680TTCAGACAGTGGAAGGTCAACAAATTCAAATCAATCCAAC720TAGTAGTTCATCTCTACAGGATTTGCAGGGTCAAATTCAG760CTCATTTCTGCAGGTAATAATCAAGCTATACTCACAGCTG800CTAACAGGACAGCTTCTGGGAATATTCTTGCTCAAAACCT840GGCAAATCAGACAGTTCCGGTCCAAATTAGACCTGGTGTT880TCAATACCACTGCAGTTACAGACTCTTCCTGGTACTCAGG920CTCAAGTTGTAACAACCCTACCAATTAACATTGGAGGAGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。