基因總覽
SP2 是蛋白質編碼基因，其產物 Sp2 transcription factor 歸屬於 Sp1 C2H2 型鋅指蛋白家族。這項家族資訊與蛋白質的鋅指結構特徵相符；Sp2 transcription factor 的序列註解包含三個 C2H2 型鋅指。其主要角色與基因轉錄相關，能辨識特定啟動子元件，並選擇性影響帶有相應功能性辨識位點基因的 mRNA 合成。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000376741 ★ | 47,896,236–47,928,957 | 7 |
| ENST00000642065 | 47,896,150–47,915,388 | 2 |
| ENST00000884861 | 47,896,150–47,928,957 | 6 |
| ENST00000884862 | 47,896,150–47,928,957 | 7 |
| ENST00000884863 | 47,896,150–47,928,957 | 7 |
| ENST00001111843 | 47,896,150–47,915,705 | 3 |
| ENST00001111844 | 47,896,150–47,915,707 | 3 |
| ENST00001140401 | 47,896,150–47,928,957 | 7 |
| ENST00000637314 | 47,896,182–47,916,384 | 4 |
| ENST00000637943 | 47,896,236–47,916,252 | 5 |
| ENST00000635868 | 47,896,262–47,916,223 | 5 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Sp2 transcription factor 可結合啟動子中的 GC box 元件，並選擇性活化含有功能性辨識位點基因的 mRNA 合成。這表示其轉錄作用具有選擇性，與目標基因是否具備可運作的辨識位點有關；來源並未進一步說明辨識位點的具體序列或其他調控條件。
Promoter 與基因調控
>SP2 ENST00000376741 GRCh38 chr17:47895236-47896336 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGAAGAGACTTGGGAGCAAAGATAAACCTACCCGCCTAGTGCCTACCAAGTGCTTTACCTCATCTCAAGA AGGTAAGGGTAAGTGGGGCAGAGGCCAAGCAGTACTTCTCAAACTCAAGCGTGCAATTCTGTCCACGCGA GGCCCTTGCTAAAATGCAGATTCTAGGCACGCCCCGTGAAGTACCGAGTCGGATTAGGAGAGGCGGCCAG GGGAGCCTGCCTTTAGAAAGAGCTTCGGATGATTCAGATGCACACGTTTGGGACCGTGGGCTATGGGGGT CGCCGCAATAACCATGTGAGGATTAACGGGGGCTTAACCGATTGTGAAAATCCCCTTAGAAGTGTCGCGT AAACAACCCCAACTCCCACTATGGTGCCGGACCCCAGTGCCTCACTGTACAAAGTCGCCCCTCCCCAGGC GACAACGAGAGAGGGACTAAATAAAAGGTTGATGGCTTTCCACTCACCAGGCATGGGGTTGAGTGGCAGC CGGCTACTGCCGAAGAGCAGGTAAAAGCTCCTGCCACACCTGGGCGAGACTGGACTTAGGGCGCAATGTA TATGCTATTTCTGGGGCATTTGTGGGCCTCACCCTAAGGACTTCTGATTGGCTTCAGGGCAGATCTATCA TTCATCCTCTGGGTTAGAGGTGGGTGGAAGGTCAACCTCGACCAATACAAAAGCACTCTTCGGCTAAGCC CCTCCCCTTCCAGCTTCCTGTTGCTGTACATCAACCACCCAGCGGGCGGGACTTTGCCTCCCTCCAATTG GCTGATGCACATGTCACTCATTATTCAATTGGCTTTCGGTTGGTGCGCTCTACCGTCCATCAGTGACATT GCACAGACCTATTGGTCAAATCAACGTCGCTCTAGACGCCTCTGGTTGATTGGTTAATAGTGCTGTCGGT CCCCAATGTTCCAAGCGCTTATTGGTGAAGGCTGCCGTCGCTCGGGCGGTGGCGGGCTCCGGGATTGGCG GTTGCTTGGCGGGCGGTGTCAGGCTCTCGGTGGCGGCGGAGGCGGCGGAGGCCAGGGAGGAAGATGTCGT AATGAGCGGTGGGTCCCGGCCGCTGCCGGCGGGGTCTTCCCGGCCCCCAAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SP2_1 ↗ | 17:47,896,236 | 正股 | 47,896,187–47,896,246 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_C6QBM · enhancer · 47894436–47895783 · regulatory
ENSR17_5F96D8 · CTCF_binding_site · 47894585–47894606 · regulatory
ENSR17_BCHMF · promoter · 47895784–47896558 · regulatory
ENSR17_5F96P3 · CTCF_binding_site · 47896491–47896512 · regulatory
ENSR17_C6QBR · enhancer · 47896559–47897619 · regulatory
· motif · 47891729–47891741 · motif
· motif · 47894173–47894185 · motif
· motif · 47894587–47894603 · motif
· motif · 47894818–47894833 · motif
· motif · 47894818–47894833 · motif
· motif · 47894823–47894835 · motif
· motif · 47895081–47895093 · motif
· motif · 47895515–47895532 · motif
· motif · 47895806–47895823 · motif
· motif · 47895875–47895888 · motif
· motif · 47895886–47895899 · motif
· motif · 47895933–47895943 · motif
· motif · 47896039–47896056 · motif
· motif · 47896202–47896219 · motif
· motif · 47896248–47896261 · motif
· motif · 47896333–47896345 · motif
· motif · 47896430–47896440 · motif
· motif · 47896431–47896444 · motif
· motif · 47896436–47896446 · motif
· motif · 47896492–47896503 · motif
· motif · 47896493–47896509 · motif
· motif · 47896494–47896503 · motif
· motif · 47896514–47896524 · motif
· motif · 47896516–47896529 · motif
· motif · 47896551–47896560 · motif
· motif · 47896757–47896770 · motif
· motif · 47896757–47896770 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：613 aa
Sp2 transcription factor 長 613 個胺基酸，屬於 Sp1 C2H2 型鋅指蛋白家族。其序列註解標示三個 C2H2 型鋅指，分別位於第 525–549、555–579 與 585–607 位胺基酸；另有三段被註解為無序區，位於第 1–32、225–258 與 372–404 位。第 361–369 位另標示為失活的 9aaTAD motif。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Sp2 transcription factor 的細胞內定位為細胞核。 來源未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 10 個夥伴
- BANPQ8N9N5 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- FHL2Q14192 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- MCM7P33993 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CINPQ9BW66 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FGFR3P22607 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GSNP06396 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NFYCQ13952-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NRF1Q16656-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- QRICH1Q2TAL8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN1Q9UMX0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Sp2 transcription factor 可結合啟動子中的 GC box 元件，並選擇性活化含有功能性辨識位點基因的 mRNA 合成；此作用與目標基因是否具有可運作的辨識位點相關。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Binds to GC box promoters elements and selectively activates mRNA synthesis from genes that contain functional recognition sites |
| 細胞定位 | Sp2 transcription factor 定位於細胞核；此項資料未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGGCTCTCGGTGGCGGCGGAGGCGGCGGAGGCCAGGGAGG40AAGATGTCGTAATGAGCGATCCACAGACCAGCATGGCTGC80CACTGCTGCTGTGAGTCCCAGTGACTACCTGCAGCCTGCC120GCCTCCACCACCCAGGACTCCCAGCCATCTCCCTTAGCCC160TGCTTGCTGCAACATGTAGCAAAATTGGCCCTCCAGCAGT200TGAAGCTGCTGTGACACCTCCTGCTCCCCCACAGCCCACA240CCGCGGAAACTTGTCCCTATCAAACCTGCCCCTCTCCCTC280TCAGCCCCGGCAAGAATAGCTTTGGAATCTTGTCCTCCAA320AGGAAATATACTTCAGATTCAGGGGTCACAACTGAGCGCC360TCCTATCCTGGAGGGCAGCTGGTGTTCGCTATCCAGAATC400CCACCATGATCAACAAAGGGACCCGATCAAATGCCAATAT440CCAGTACCAGGCGGTCCCTCAGATTCAGGCAAGCAATTCC480CAAACCATCCAAGTACAGCCCAATCTCACCAACCAGATCC520AGATCATCCCTGGCACCAACCAAGCCATCATCACCCCCTC560ACCGTCCAGTCACAAGCCTGTCCCCATCAAGCCAGCCCCC600ATCCAGAAGTCGAGTACGACCACCACCCCCGTGCAGAGCG640GGGCCAATGTGGTGAAGCTGACAGGTGGGGGCGGCAATGT680GACGCTCACTCTGCCCGTCAACAACCTTGTGAACGCCAGT720GACACCGGGGCCCCTACTCAGCTCCTCACTGAAAGCCCCC760CAACCCCGCTGTCTAAGACTAACAAGAAAGCAAGGAAGAA800GAGCCTTCCTGCCTCCCAGCCCCCTGTGGCTGTGGCTGAG840CAGGTGGAGACGGTGCTGATCGAGACCACCGCGGACAACA880TCATCCAGGCAGGAAATAACCTGCTCATTGTTCAGAGCCC920TGGTGGGGGCCAGCCAGCTGTGGTCCAGCAGGTCCAGGTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。