基因總覽
SRY-box transcription factor 15（SOX15）是由蛋白質編碼基因 SOX15 產生的轉錄因子。來源將其描述為具有轉錄活化與抑制作用，並指出它可與其他轉錄調節因子協同作用。現有資料所列的功能與分子關係均標示為相似性推論，因此應視為推測性描述，而非此處已直接證實的結論。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000250055 ★ | 7,588,178–7,590,094 | 2 |
| ENST00000538513 | 7,588,178–7,590,101 | 3 |
| ENST00001135077 | 7,588,178–7,590,101 | 2 |
| ENST00000570788 | 7,588,999–7,590,091 | 1 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SOX15 是一種轉錄因子，來源指出它可辨識 DNA 上的 5'-AACAATG-3' 共識序列，並可作為轉錄活化因子或抑制因子。這些功能註記均為相似性推論。它也被描述為可與 POU5F1（OCT3/4）協同結合基因啟動子，顯示其轉錄調節作用可與其他因子共同進行。
在肌肉相關功能中，SOX15 可結合 FOXK1 啟動子並招募 FHL3，促進 FOXK1 的轉錄活化；此調控與肌母細胞增殖相關。另一方面，SOX15 也可透過轉錄抑制降低肌肉特異性基因 MYOD 與 MYOG 的表現，進而抑制肌母細胞分化。來源亦將 SOX15 與肌肉前驅細胞發育及骨骼肌再生相連結，但未提供更具體的作用條件或機制；這些描述同樣屬相似性推論。
在滋養層細胞方面，SOX15 可增強 HAND1 的轉錄活性，並與滋養層巨細胞分化相關。此外，SOX15 被描述為可結合 HRC 的近端增強子區域，調節 HRC 的轉錄。上述資料呈現 SOX15 涉及不同細胞分化與基因調控過程，但各項功能皆以相似性推論為依據。
Promoter 與基因調控
>SOX15 ENST00000250055 GRCh38 chr17:7589994-7591094 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTCTTACTTCTGGGAATTCCTGACATTCCTAAACTCCCCAGGCCCAGGTTCTCCCTCCTGGTTCAGAGGA GGGGGGCTTGTGCCTTGTTGCTTCTCCCCTCCCCCAAGTTTGCTGGTAGAGGGAGTTGGGCCACTCCTAT ACCCTGAGTCACAGCACAGGCTAGGCAGGGCTGCTCAGAGCTGGAGCTGTTCCTGTAGAAGCTGAGAGCC AAGGCAGGCTGCTTAATCCGATTACCTGAGGCCTGGGGCTTGGGCTGGGCCGTTGGGCAGAGTGGGGAGC AGGGTTCCCTCACAGCAGCCTCTGGAGCCCGGGGTCCGGCCTTCTTGGTGGTGTTCTGTTCTGGCTCCAG GCTTTTTCTCCGGCATGCGCATCACAGACCTCTTAACTTGGGGAGTTGTCCTGGGTTTCCTGGCTCCCCC CTCATGACTTGGACGACTGAAGCTAAAACTTGCCATAATTCAATAGCAGTGGAGAAATATAGGTTTAGGG ACTGGAGTTGGGAGGGCTTAAGTTTTCTCACTTGGGAAAGGGGTTGAATCACGGCCCAAGCACCTGCTGG AATGACTCAGGAAACAAAAATGGTCTCCCTCCTCGGCCTTTCTTGCCCCAGGGGCAGTTCTGGGATTTGA GGAGCAACAGGCACCAGGAAAGGGGTTGGGGTGGTGGTCCGGGATGCTCCCAAGCTCCTCTCAGCACAAC TCGGGCCCTGAGGGCACTTCATCCCCCTGTGTTTGATCCCATTGTGGAAAGAATTGGCTTTAAATTGCCT GTGCTTCAGGGAGGGGAGGCAATCAGCAACGGGCTGGAAGGCCTGACATCAGGTCTTGGGTGGGGGGGGC GGGGGGCGTGGCACCCTGAGGGTGTTGGGGGCTGGGACAAACAGGACACCTGGGTTTACCTACGGGCTGA GGATGTTGGCGCCCTTAAGGAGGTGCAGTCTTATGGGAGGGACAGGGGCGGAGTCAGTCTTTAAAAGCTG TTCCCAGGTCTGGCCCGCCTGCCACAAACGCTGAGCCCAGGTGGGAGAGGTCTGGCCTATCCGCGCCTGG CAGCTGTCGGAACTCCGGAGACCACAAAGGGGTTTATGGTTTACCCCCTCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SOX15_1 ↗ | 17:7,590,094 | 負股 | 7,590,084–7,590,143 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_53R7CG · CTCF_binding_site · 7589469–7589490 · regulatory
ENSR17_53R7DH · CTCF_binding_site · 7589686–7589707 · regulatory
ENSR17_B3HN5 · promoter · 7590062–7590584 · regulatory
· motif · 7585806–7585812 · motif
· motif · 7589471–7589487 · motif
· motif · 7589688–7589704 · motif
· motif · 7590990–7591000 · motif
· motif · 7591013–7591023 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：233 aa
SOX15 蛋白長 233 個胺基酸，含有位於第 49–117 位胺基酸的 HMG box，註記為 DNA 結合區域。第 1–48、113–153 與 208–233 位胺基酸區段被預測為無序區。第 1–47 位區段與促進 HAND1 轉錄活化因子活性的需求相關；第 138–183 位區段則註記為與 FHL3 互作。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SOX15 的細胞內定位註記為細胞核；來源未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- BHLHE40O14503 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSFY2Q96LI6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SOX15 與 HAND1 有互作，且此互作可增強 HAND1 誘導的滋養層巨細胞分化。SOX15 也與 POU5F1（OCT3/4）互作，並被描述為可與其協同結合 DNA。另與 FHL3 互作，這項關係可將轉錄共活化因子 FHL3 招募至 FOXK1 啟動子。以上關係均為相似性推論。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SOX15 是可結合 DNA 共識序列 5'-AACAATG-3' 的轉錄因子，並能活化或抑制轉錄。它可與 POU5F1 協同結合基因啟動子；在肌肉相關過程中，招募 FHL3 至 FOXK1 啟動子以促進轉錄及肌母細胞增殖，也可抑制 MYOD、MYOG 表現與肌母細胞分化。另與 HAND1 活性、HRC 轉錄、滋養層巨細胞分化、肌肉前驅細胞發育及骨骼肌再生相關；上述皆為相似性推論。 | 推論支持 | 證據與來源Transcription factor that binds to DNA at the 5'-AACAATG-3' consensus sequence (By similarity). Acts as a transcriptional activator and repressor (By similarity). Binds synergistically with POU5F1 (OCT3/4) to gene promoters (By similarity). Binds to the FOXK1 promoter and recruits FHL3, resulting in transcriptional activation of FOXK1 which leads to myoblast proliferation (By similarity). Acts as an inhibitor of myoblast differentiation via transcriptional repression which leads to down-regulation of the muscle-specific genes MYOD and MYOG (By similarity). Involved in trophoblast giant cell differentiation via enhancement of HAND1 transcriptional activity (By similarity). Regulates transcription of HRC via binding to it proximal enhancer region (By similarity). Involved in skeletal muscle regeneration (By similarity). Also plays a role in the development of myogenic precursor cells (By similarity) |
| 交互作用 | SOX15 與 HAND1 互作，並可增強 HAND1 誘導的滋養層巨細胞分化；與 POU5F1（OCT3/4）互作，且兩者可協同結合 DNA。SOX15 也與 FHL3 互作，將轉錄共活化因子 FHL3 招募至 FOXK1 啟動子。上述互作與作用關係均為相似性推論。 | 推論支持 | 證據與來源Interacts with HAND1; the interaction enhances HAND1-induced differentiation of trophoblast giant cells (By similarity). Interacts with POU5F1 (OCT3/4); binds synergistically with POU5F1 to DNA (By similarity). Interacts with FHL3; the interaction recruits the transcriptional coactivator FHL3 to the FOXK1 promoter (By similarity) |
| 細胞定位 | SOX15 的定位註記為細胞核。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GCCACAAACGCTGAGCCCAGGTGGGAGAGGTCTGGCCTAT40CCGCGCCTGGCAGCTGTCGGAACTCCGGAGACCACAAAGG80GGTTTATGGTTTACCCCCTCCACGGAAGGTCGGTCTGATC120GCAGCTGCGGGTCGGGGAGAGGGACCGGGGGTCCCCCAGT160CAGTAGGCCTCAGAACACCTCTTCAGTGCCGGGGCACCAG200ACAGCGGATTTTGCATTCGACTCTCCCCAAAGTGTGCCGA240ACAGGTTGGAAGCAAAGGCTCCGGTTTAAGCTCTGGGCTT280GGGGATAAAATACACTTTTTAAGGACCCAAGTTCCTCGGC320AACGACTCCAGACTGGGAAGACCTTTCCATTTTCAGGATC360GACGCTTCACGTTGAGGGGAGGGCATTCAGGACGCCCTCT400TAAGGCTTCTCCCAACCCATGGCGCTACCAGGCTCCTCAC440AGGACCAGGCCTGGAGCCTGGAGCCTCCGGCTGCCACGGC480TGCTGCCTCCTCATCTTCGGGACCCCAGGAGCGGGAGGGC520GCTGGGAGCCCCGCGGCCCCCGGGACGCTGCCCCTGGAGA560AGGTGAAGCGGCCGATGAACGCGTTCATGGTGTGGAGCTC600CGCTCAGCGCCGCCAGATGGCGCAGCAGAACCCCAAGATG640CACAACTCCGAGATCTCCAAGCGCCTGGGCGCGCAGTGGA680AGCTGCTGGACGAGGACGAGAAGCGGCCCTTCGTGGAGGA720GGCCAAGCGGCTCCGCGCCCGACACCTGCGCGACTACCCC760GACTACAAGTACCGGCCTCGGCGCAAGGCCAAGAGCTCGG800GCGCCGGACCTTCCCGCTGCGGACAGGGAAGAGGCAACCT840GGCCAGCGGCGGCCCGCTCTGGGGGCCGGGGTACGCGACC880ACCCAACCGAGCAGAGGCTTTGGGTACAGACCCCCCAGCT920ACTCGACAGCCTACCTGCCTGGCAGCTATGGCTCTTCCCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。