演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SOS2

SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2

SOS2(SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2)是蛋白質編碼基因,其產物可調節 RAS 蛋白活性,並參與 PI3K-AKT 訊號調控。

Homo sapiens14q21.3UniProt Q07890
OFFICIAL SYMBOL
SOS2
CHROMOSOME
14
UNIPROT
Q07890
PDB / ALPHAFOLD
6EIE
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SOS2 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2。其產物具有鳥嘌呤核苷酸交換因子(GEF)活性,作用對象包括 RAS 蛋白;資料亦指出它是 PI3K-AKT 訊號的重要調節因子。現有來源未提供更完整的家族分類或蛋白質整體結構描述。

Official symbol
SOS2
Gene name
SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11188
UniProt
Q07890
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1414q21.3
chr14 · 107,043,718 bp · GRCh38chr14p13 · 1–3600000 · gvarchr14p12 · 3600001–8000000 · stalkchr14p11.2 · 8000001–16100000 · gvarchr14p11.1 · 16100001–17200000 · acenchr14q11.1 · 17200001–18200000 · acenchr14q11.2 · 18200001–24100000 · gnegchr14q12 · 24100001–32900000 · gpos100chr14q13.1 · 32900001–34800000 · gnegchr14q13.2 · 34800001–36100000 · gpos50chr14q13.3 · 36100001–37400000 · gnegchr14q21.1 · 37400001–43000000 · gpos100chr14q21.2 · 43000001–46700000 · gnegchr14q21.3 · 46700001–50400000 · gpos100chr14q22.1 · 50400001–53600000 · gnegchr14q22.2 · 53600001–55000000 · gpos25chr14q22.3 · 55000001–57600000 · gnegchr14q23.1 · 57600001–61600000 · gpos75chr14q23.2 · 61600001–64300000 · gnegchr14q23.3 · 64300001–67400000 · gpos50chr14q24.1 · 67400001–69800000 · gnegchr14q24.2 · 69800001–73300000 · gpos50chr14q24.3 · 73300001–78800000 · gnegchr14q31.1 · 78800001–83100000 · gpos100chr14q31.2 · 83100001–84400000 · gnegchr14q31.3 · 84400001–89300000 · gpos100chr14q32.11 · 89300001–91400000 · gnegchr14q32.12 · 91400001–94200000 · gpos25chr14q32.13 · 94200001–95800000 · gnegchr14q32.2 · 95800001–100900000 · gpos50chr14q32.31 · 100900001–102700000 · gnegchr14q32.32 · 102700001–103500000 · gpos50chr14q32.33 · 103500001–107043718 · gnegSOS2pq1 bp107,043,718 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr14:50,116,801–50,231,930
Gene span
115,130 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000216373 ★50,117,130–50,231,57823
ENST0000054368050,116,801–50,231,93022
ENST0000093470850,116,801–50,231,93024
ENST0000093470950,116,801–50,231,93020
ENST0000095373150,116,801–50,231,93024
ENST0000095373250,116,801–50,231,93022
ENST0000095373350,116,801–50,231,93022
ENST0000095373450,116,801–50,231,93022
ENST0000095373550,116,801–50,231,93022
ENST0000113731050,116,801–50,231,93023
ENST0000111231250,129,828–50,231,93021
ENST0000111231350,142,969–50,231,93017

顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SOS2 可作為 RAS 蛋白的鳥嘌呤核苷酸交換因子(GEF)。這類作用的核心是促進 GDP 與 GTP 的交換;對 HRAS 而言,該交換會提高其結合 GTP 的活性型態。來源明確指出 SOS2 催化此核苷酸交換,並使活性 HRAS-GTP 的量增加。

除了對 RAS 蛋白的核苷酸交換作用,SOS2 也是 PI3K-AKT 訊號的重要調節因子。現有資料未進一步說明這項調節的分子步驟、作用方向或特定細胞情境,因此不宜據此延伸描述其對訊號的具體影響方式。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 50231578 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SOS2 ENST00000216373 GRCh38 chr14:50231478-50232578 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CACAATTTGGATGACACGATTAAGAAAACAATTCGAAAATATCTTGAAAGTTTTGTAAAAACGATATGAT
TTTGTGAACGCACAGGGGCCCGTGCAAGTGAAGGACCTTTCAATTCAAGCTTGATCAACGTCACTGTCAT
CTGCCCCTTCTGACCCTACCACCAGGCTAAGGGCTTTCCACGCCTCATCTCTCGGTCCCCACACCATCAC
CCTAAGAAATAGTTACTGTATCTCCTAACGATATATTATATATAGTACCTACTTTGTGTAAACATACGGT
ACTCATGAAAACAAGCCACGTAGAGCACAAATACGTTAAATATCCTGTCCAGCCCGAATGCCCCTTTCTC
TCCACGTCCCTATGCAGCCTCCCACGACGGTAGTCCTGGGGCTCCAGCGCTACAAGAGTGGCACCGAGTC
CGGATTGTCTTAAGCAGGTCGAGAGGAGGGAGCATATGGGTAAAAAGCAGTCAAACTGAAGAGTCTGGAG
CGGCCCCCAGCACAGTCTCGGGAAAAGCGGACTCCCCCGGGGCCCCAGGCCCCGCACCCCCGCGCCGGGC
TGGCGCCTGTGCCTGCTCCGCGGCGCGCATGCTCCGTGTTAGGCCTCTTGGGCTATTCGGGATAATGAGC
GCCGGGCCGAGGGGGCGGGCCGAGCCTCGGCTGCTGGGACTCAGGGCTCAGCGGCGACCCCAAGGCACTC
TGCGCTGCTGCTAAAGGGGCAGCAACGGCGGCCAGCGCTGTGCGCGCCATAGCGAGGCTCGCTCGCCCGA
CGCGCACTCCGGGTCGGTCCCCAGAGCTCTGTGGAGGTGACTCGAGTGGGCAGGGCCGGGCGGCGCTGTC
GGCTGGGAGGGCGGGGAGGAGGCGATGAGGAGACGAGCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGCTCACCGCC
CGCCGCGGCCGTAGCGGGAGTCGGGGCGGGGCTGGGCCAGCTGTACCCCTGACGGGCCGCGAACCCAGAC
AAAGGAGGAGGAGCCGCCCCAGAAGCGGGCCAGCGCCGCCGGGAAAGGAGGTCGCCGCCCGGGGTCGCCC
GGGCTTGCGGGTCGCCGCGCTTCCTCTGCGGGCGCTGCGGGAGGCGAGGGC
SOS2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SOS2_3 ↗14:50,180,570負股50,180,560–50,180,619
SOS2_4 ↗14:50,231,222負股50,231,212–50,231,271
SOS2_1 ↗14:50,231,578負股50,231,568–50,231,627
SOS2_2 ↗14:50,231,882負股50,231,872–50,231,931

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR14_BCZ67 · enhancer · 50230289–50231298 · regulatory

ENSR14_BCZ6B · promoter · 50231299–50232068 · regulatory

ENSR14_5FS24F · CTCF_binding_site · 50231528–50231549 · regulatory

ENSR14_83GTNB · enhancer · 50233395–50233643 · regulatory

· motif · 50226558–50226580 · motif

· motif · 50226558–50226580 · motif

· motif · 50230677–50230690 · motif

· motif · 50230713–50230728 · motif

· motif · 50230718–50230730 · motif

· motif · 50230930–50230941 · motif

· motif · 50230932–50230941 · motif

· motif · 50230996–50231005 · motif

· motif · 50230996–50231007 · motif

· motif · 50231095–50231108 · motif

· motif · 50231222–50231232 · motif

· motif · 50231486–50231503 · motif

· motif · 50231530–50231546 · motif

· motif · 50231984–50231995 · motif

· motif · 50231984–50231995 · motif

· motif · 50232045–50232058 · motif

· motif · 50232045–50232058 · motif

· motif · 50234057–50234072 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1332 aa

1 aa1332 aa結構域功能區域
依 Q07890 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SOS2 蛋白長 1332 個胺基酸。註解列出 DH 結構域(198–388)、PH 結構域(442–546)、N-terminal Ras-GEF 結構域(595–739)及 Ras-GEF 結構域(778–1017)。另有三段被註解為不定型區域,分別位於 1018–1061、1076–1096 及 1142–1332。

結構域DH198–388 aa
結構域PH442–546 aa
結構域N-terminal Ras-GEF595–739 aa
結構域Ras-GEF778–1017 aa
功能區域Disordered1018–1061 aa
功能區域Disordered1076–1096 aa
功能區域Disordered1142–1332 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6EIE…

PDB · 6EIE

X-ray · 2.72 A · A=562-1047

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 7 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SOS2SOS2ABL1CRKGRB2NCK1PACSIN3PLCG1SNX9
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

資料記載 SOS2 與 TTC1、GNA15 互作;來源未進一步說明這些互作是否形成特定複合體,也未提供其功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SOS2 基因變異與 Noonan syndrome 9(NS9)相關;來源將此疾病歸因於影響該基因的變異。NS9 為 Noonan syndrome 的一型,可見身材矮小、特徵性臉部表現,以及先天性心臟缺陷和肥厚型心肌病的高發生率。其他可能特徵包括頸部短或蹼狀、聽力障礙、動作發展遲緩、不同程度的智能障礙、骨骼缺陷、隱睪及出血傾向;患者亦有幼年型骨髓單核球性白血病風險。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SOS2 是 RAS 蛋白的鳥嘌呤核苷酸交換因子,可催化 GDP 與 GTP 交換,使活性、結合 GTP 的 HRAS 增加;此外,SOS2 也是 PI3K-AKT 訊號的重要調節因子。含實驗來源
證據與來源

Acts as guanine nucleotide exchange factor (GEF) for RAS proteins. Catalyzes the GDP-to-GTP exchange, resulting in an increase of the active GTP-bound form of HRAS. Acts as a key modulator of PI3K-AKT signaling

PMID 20639119 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用資料記載 SOS2 分別與 TTC1 及 GNA15 互作;未提供這些互作的其他條件或功能結果。含實驗來源
證據與來源

Interacts with TTC1. Interacts with GNA15

PMID 20639119 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 SOS2 的基因變異可造成 Noonan syndrome 9。此型 Noonan syndrome 常見身材矮小、臉部特徵及先天性心臟缺陷,也可能伴隨多種發展、骨骼或其他異常;患者有幼年型骨髓單核球性白血病風險。含實驗來源
證據與來源

Noonan syndrome 9 NS9 A form of Noonan syndrome, a disease characterized by short stature, facial dysmorphic features such as hypertelorism, a downward eyeslant and low-set posteriorly rotated ears, and a high incidence of congenital heart defects and hypertrophic cardiomyopathy. Other features can include a short neck with webbing or redundancy of skin, deafness, motor delay, variable intellectual deficits, multiple skeletal defects, cryptorchidism, and bleeding diathesis. Individuals with Noonan syndrome are at risk of juvenile myelomonocytic leukemia, a myeloproliferative disorder characterized by excessive production of myelomonocytic cells. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 616559

PMID 25795793 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000216373 · 5,508 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAAGCGGGCCAGCGCCGCCGGGAAAGGAGGTCGCCGCCC40
41GGGGTCGCCCGGGCTTGCGGGTCGCCGCGCTTCCTCTGCG80
81GGCGCTGCGGGAGGCGAGGGCCGCCTCGGCGGAGGAAGCC120
121GACCCCGGGGTCTCCGCCAGCCCGCCGGCGCCGCCTCCGA160
161GCCGCCTCGGCCGTAGCCTCGGCCCGGGCGGGAGGCGGCG200
201GCCGCCGGCGAGGCGAGGCGGCCCGCGCCCTGCCTGTCAG240
241GCCACCGGCCCGGCCCGCGGGCTGCCCCCGATGCGGAGGC280
281GCTGTCGCCGGGGCCATGCAGCAGGCGCCGCAGCCTTACG320
321AGTTCTTCAGCGAGGAGAACAGTCCGAAATGGCGGGGACT360
361GTTGGTCTCGGCCCTGCGGAAGGTTCAGGAACAAGTGCAT400
401CCCACTCTCTCAGCTAATGAAGAGTCTCTCTATTATATTG440
441AAGAGCTGATTTTTCAGCTGCTTAATAAATTATGCATGGC480
481CCAGCCAAGGACTGTTCAAGATGTAGAGGAGCGAGTTCAG520
521AAGACCTTTCCTCACCCAATTGATAAATGGGCCATTGCTG560
561ATGCACAATCTGCTATAGAAAAACGAAAACGAAGAAATCC600
601TCTTTTACTGCCTGTGGACAAAATCCATCCTTCGTTGAAG640
641GAAGTATTAGGGTACAAAGTGGACTACCATGTATCCCTAT680
681ATATTGTGGCTGTACTAGAGTATATCTCAGCTGATATTTT720
721AAAATTGGCTGGTAATTATGTTTTTAATATCCGGCATTAT760
761GAAATATCTCAGCAGGACATTAAAGTGTCAATGTGTGCGG800
801ATAAGGTTTTGATGGACATGTTTGATCAGGATGACATAGG840
841TTTGGTTTCTCTCTGTGAAGATGAACCTAGTTCTTCTGGT880
881GAATTAAACTACTATGATCTTGTCAGAACTGAAATCGCAG920
921AAGAAAGACAGTATCTACGGGAATTAAATATGATCATAAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。