演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SORDSDH

sorbitol dehydrogenase

SORD 編碼的 sorbitol dehydrogenase 是鋅依賴型多元醇去氫酶,可逆地氧化多種糖醇,並參與葡萄糖經 sorbitol 轉換為 fructose 的代謝途徑。

Homo sapiens15q21.1UniProt Q00796
OFFICIAL SYMBOL
SORD
CHROMOSOME
15
UNIPROT
Q00796
PDB / ALPHAFOLD
1PL6
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SORD 是蛋白質編碼基因,產物為 sorbitol dehydrogenase,屬於含鋅醇去氫酶家族。這種酵素具有可逆的氧化還原活性,能以 NAD(+) 為電子受體處理多種糖醇;其中以 D-sorbitol、L-threitol、xylitol 和 ribitol 為主要受質。它也是多元醇途徑中的酵素,該途徑提供葡萄糖代謝的另一條路徑。蛋白質每個次單元結合一個鋅離子,並以同源四聚體形式存在。

Official symbol
SORD
Gene name
sorbitol dehydrogenase
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11184
UniProt
Q00796
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SDHXDH

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1515q21.1
chr15 · 101,991,189 bp · GRCh38chr15p13 · 1–4200000 · gvarchr15p12 · 4200001–9700000 · stalkchr15p11.2 · 9700001–17500000 · gvarchr15p11.1 · 17500001–19000000 · acenchr15q11.1 · 19000001–20500000 · acenchr15q11.2 · 20500001–25500000 · gnegchr15q12 · 25500001–27800000 · gpos50chr15q13.1 · 27800001–30000000 · gnegchr15q13.2 · 30000001–30900000 · gpos50chr15q13.3 · 30900001–33400000 · gnegchr15q14 · 33400001–39800000 · gpos75chr15q15.1 · 39800001–42500000 · gnegchr15q15.2 · 42500001–43300000 · gpos25chr15q15.3 · 43300001–44500000 · gnegchr15q21.1 · 44500001–49200000 · gpos75chr15q21.2 · 49200001–52600000 · gnegchr15q21.3 · 52600001–58800000 · gpos75chr15q22.1 · 58800001–59000000 · gnegchr15q22.2 · 59000001–63400000 · gpos25chr15q22.31 · 63400001–66900000 · gnegchr15q22.32 · 66900001–67000000 · gpos25chr15q22.33 · 67000001–67200000 · gnegchr15q23 · 67200001–72400000 · gpos25chr15q24.1 · 72400001–74900000 · gnegchr15q24.2 · 74900001–76300000 · gpos25chr15q24.3 · 76300001–78000000 · gnegchr15q25.1 · 78000001–81400000 · gpos50chr15q25.2 · 81400001–84700000 · gnegchr15q25.3 · 84700001–88500000 · gpos50chr15q26.1 · 88500001–93800000 · gnegchr15q26.2 · 93800001–98000000 · gpos50chr15q26.3 · 98000001–101991189 · gnegSORDpq1 bp101,991,189 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr15:45,023,116–45,077,185
Gene span
54,070 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000267814 ★45,023,195–45,077,1859
ENST0000067421145,023,147–45,036,3632
ENST0000088981245,023,147–45,077,18510
ENST0000088981345,023,147–45,077,18510
ENST0000088981445,023,147–45,077,1859
ENST0000088981545,023,147–45,077,1859
ENST0000088981645,023,147–45,074,8399
ENST0000088981745,023,147–45,077,1857
ENST0000088981845,023,147–45,077,1858
ENST0000091590145,023,147–45,077,1857
ENST0000113107245,023,147–45,073,2899
ENST0000113107345,023,147–45,073,2899

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

sorbitol dehydrogenase 催化以 NAD(+) 為電子受體的可逆反應,主要將 D-sorbitol 氧化為 D-fructose;反向反應則可由 keto-D-fructose 與 NADH 生成 D-sorbitol 和 NAD(+)。這項轉換使它成為多元醇途徑的關鍵酵素,讓 glucose 可經 sorbitol 轉換為 fructose,構成葡萄糖代謝的替代路徑。

此酵素也能氧化其他糖醇:L-threitol 生成 L-erythrulose,xylitol 生成 D-xylulose,ribitol 生成 D-ribulose;各反應均以 NAD(+) 為電子受體,並產生 NADH 和 H(+)。此外,它能立體專一性地氧化 (R,R)-butane-2,3-diol,生成 (R)-acetoin。體外也觀察到較弱的 L-arabinitol、galactitol、D-mannitol 和 glycerol 氧化活性;來源指出它不氧化 ethanol 或其他一級醇,且不能使用 NADP(+) 作為電子受體。另有 L-iditol 轉為 keto-L-sorbose 的反應註解,但其證據標示為與 UniProtKB 條目相似性推論。

多元醇途徑被認為可能與高血糖引起的糖尿病併發症形成有關,包括糖尿病神經病變與視網膜病變;這描述的是途徑可能涉及疾病形成,並不等同於單一酵素直接造成這些併發症。另有資料指出,sorbitol 可能作為精子運動的替代能量來源,因此 SORD 可能參與精子運動,但此功能以可能性表述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 45023195 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SORD ENST00000267814 GRCh38 chr15:45022195-45023295 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGTAGAGACGGGGTTTTCACCATATTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGC
CTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAAGAGCCACTGCGCCCGGCCTCATGTCTTTTTTATACTT
AAGCACCAGGCCCATGTAATGATGCACGAATTCATTTACTCCTACTCGTGCCAGGCCCTTTCCTGGGGGC
TGGAGACAAAGGGCCGACGTGGACGCTGCGTCATGGTAGCACCTGTCTCGCAAAGTGCACACCGTGCTCC
ACCCACAGCCTCAGCATTCTCGTTGCTAGGAATATGGACCCTCAGGCAGCACCTCAGACCTAGACCTACT
GTATCAGAATCTCTGTGCTGGTCCTGAGAATGTGCATTCTCAACAGCGCCTCACATTCCCCACCCCAATT
CTTCTGCAGCTAACGTTTGAGAGCGCTGGTCTGGTGCCTACTGCCTCTGCAGGCGGTTTTCAAGGCAGCC
GTGTGTGCTTGCATGTGAGGCGGCAAAAACAGCGCGCTGCAGGGCCGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAAT
CCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGATATCGAGACCATCCTGGCTAACACG
GTGAAACCCCGTCTCTACTAAACAAAAATACGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTATTCGGGAGGC
TGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGGGATCGCACCACTGTACTCC
AGCCTCGGCGACAAACAAACAAACAAACAAAAAAAACAGCGCGCTGCAGATGGAGCCAGCACCCGGGCTT
CTCGCTCCCAGCCCCCTCCCGAAGCCCCGCCCCGCCTCCGGGTCTGGAGGAGGCTGGGAAGCCCCGCCCC
TCCACGCTAGCGCCGCCCAGGCTGGCACAAAGGAGGAAGCCTAGTCCCGCCCCTGCGTGCGGCGCTTCTC
CCAGGCCCCACCTTCCATCCAGTGCCCTGGACCCTCGGCTGGGTAGCGCCACCAGAGCGACCAAACGTCC
CGCGCCTTCCAGGCCGCACTCCAGAGCCAAAAGAGCTCCATGGCGGCGGCG
SORD 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SORD_1 ↗15:45,023,195正股45,023,146–45,023,205

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR15_BBX8P · promoter · 45022657–45023205 · regulatory

ENSR15_C6GLW · enhancer · 45023206–45024266 · regulatory

ENSR15_83BQ4K · enhancer · 45027393–45027611 · regulatory

· motif · 45023568–45023584 · motif

· motif · 45023568–45023584 · motif

· motif · 45023577–45023586 · motif

· motif · 45023647–45023662 · motif

· motif · 45023839–45023850 · motif

· motif · 45024131–45024145 · motif

· motif · 45024131–45024145 · motif

· motif · 45025780–45025790 · motif

· motif · 45025865–45025880 · motif

· motif · 45025990–45026003 · motif

· motif · 45025990–45026003 · motif

· motif · 45026023–45026036 · motif

· motif · 45026291–45026302 · motif

· motif · 45026381–45026392 · motif

· motif · 45026382–45026393 · motif

· motif · 45026424–45026437 · motif

SORD 的表現受雄性素上調;去勢則與其下調相關。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:357 aa

sorbitol dehydrogenase 屬於含鋅醇去氫酶家族。每個蛋白質次單元結合一個鋅離子。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1PL6…

PDB · 1PL6

X-ray · 2.00 A · A/B/C/D=2-357

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Mitochondrion membrane;Cell projection, cilium, flagellum

來源描述 SORD 位於粒線體膜,並與精子鞭毛中段的粒線體及主段附近的質膜相關;也見於附睪上皮分泌的 epididymosome,該囊泡可將附睪液中的蛋白質轉移至精子表面。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Cell projection, cilium, flagellum。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SDHSORD
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

sorbitol dehydrogenase 以同源四聚體形式存在;來源未提供其他特定的實體結合夥伴或複合體資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SORD 相關變異被報告與常染色體隱性遺傳的遠端遺傳性運動神經病變 8(HMNR8)有關。此疾病可表現為運動軸突神經病變、緩慢進展且以下肢為主的遠端肌無力、行走困難及血清 sorbitol 升高;其他可能特徵包括遠端感覺受損、上肢顫抖、脊柱側彎與輕度聽力損失。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

12 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 12 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能sorbitol dehydrogenase 以 NAD(+) 為電子受體,可逆地氧化多種糖醇,主要受質包括 D-sorbitol、L-threitol、xylitol 與 ribitol,分別生成相應的氧化產物。它參與 glucose 經 sorbitol 轉為 fructose 的多元醇途徑;該途徑被認為可能涉及高血糖相關糖尿病併發症。此酵素也可能以 sorbitol 作為精子運動的替代能量來源,並可氧化部分其他醇類;不氧化 ethanol 或其他一級醇,也不能使用 NADP(+)。含實驗來源
證據與來源

Polyol dehydrogenase that catalyzes the reversible NAD(+)-dependent oxidation of various sugar alcohols. Is mostly active with D-sorbitol (D-glucitol), L-threitol, xylitol and ribitol as substrates, leading to the C2-oxidized products D-fructose, L-erythrulose, D-xylulose, and D-ribulose, respectively. Is a key enzyme in the polyol pathway that interconverts glucose and fructose via sorbitol, which constitutes an important alternate route for glucose metabolism. The polyol pathway is believed to be involved in the etiology of diabetic complications, such as diabetic neuropathy and retinopathy, induced by hyperglycemia. May play a role in sperm motility by using sorbitol as an alternative energy source for sperm motility. May have a more general function in the metabolism of secondary alcohols since it also catalyzes the stereospecific oxidation of (2R,3R)-2,3-butanediol. To a lesser extent, can also oxidize L-arabinitol, galactitol and D-mannitol and glycerol in vitro. Oxidizes neither ethanol nor other primary alcohols. Cannot use NADP(+) as the electron acceptor

PMID 16278369 ↗ · PMID 3365415 ↗ · PMID 25105142 ↗ · PMID 29966615 ↗ · PMID 12962626 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性keto-D-fructose + NADH + H(+) = D-sorbitol + NAD(+)含實驗來源
證據與來源

keto-D-fructose + NADH + H(+) = D-sorbitol + NAD(+)

PMID 12962626 ↗ · PMID 3365415 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-threitol + NAD(+) = L-erythrulose + NADH + H(+)含實驗來源
證據與來源

L-threitol + NAD(+) = L-erythrulose + NADH + H(+)

PMID 3365415 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性xylitol + NAD(+) = D-xylulose + NADH + H(+)含實驗來源
證據與來源

xylitol + NAD(+) = D-xylulose + NADH + H(+)

PMID 3365415 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性ribitol + NAD(+) = D-ribulose + NADH + H(+)含實驗來源
證據與來源

ribitol + NAD(+) = D-ribulose + NADH + H(+)

PMID 3365415 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性(R,R)-butane-2,3-diol + NAD(+) = (R)-acetoin + NADH + H(+)含實驗來源
證據與來源

(R,R)-butane-2,3-diol + NAD(+) = (R)-acetoin + NADH + H(+)

PMID 3365415 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-iditol + NAD(+) = keto-L-sorbose + NADH + H(+)推論支持
證據與來源

L-iditol + NAD(+) = keto-L-sorbose + NADH + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性每個 sorbitol dehydrogenase 蛋白質次單元會結合一個鋅離子。資料庫紀錄
證據與來源

Binds 1 zinc ion per subunit.

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Homotetramer含實驗來源
證據與來源

Homotetramer

PMID 12962626 ↗ · PMID 3365415 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位來源將 sorbitol dehydrogenase 定位於粒線體膜,並描述其與精子鞭毛中段的粒線體及主段附近的質膜相關。此蛋白質也見於附睪上皮分泌的 epididymosome;該囊泡可將附睪液中的蛋白質轉移至精子表面。推論支持
證據與來源

Mitochondrion membrane / Peripheral membrane protein; Cell projection, cilium, flagellum; Associated with mitochondria of the midpiece and near the plasma membrane in the principal piece of the flagellum. Also found in the epididymosome, secreted by the epididymal epithelium and that transfers proteins from the epididymal fluid to the sperm surface

開啟資料庫紀錄 ↗

調控SORD 受到雄性素上調;去勢則與 SORD 下調相關。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated by androgens and down-regulated by castration

PMID 20372835 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 SORD 的變異與常染色體隱性遺傳遠端遺傳性運動神經病變 8(HMNR8)相關。此疾病以運動軸突神經病變、緩慢進展的遠端肌無力(主要影響下肢)、行走困難及血清 sorbitol 升高為特徵;部分患者另有遠端感覺受損、上肢顫抖、脊柱側彎或輕度聽力損失。含實驗來源
證據與來源

Neuronopathy, distal hereditary motor, autosomal recessive 8 HMNR8 An autosomal recessive disorder characterized by motor axonal neuropathy, slowly progressive distal muscle weakness mainly affecting the lower limbs, difficulty walking, and increased serum sorbitol. Additional variable features are distal sensory impairment, upper limb tremor, scoliosis, and mild hearing loss. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618912

PMID 32367058 ↗ · PMID 33314640 ↗ · PMID 33397963 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 12 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000267814 · 4,818 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTGCCCTGGACCCTCGGCTGGGTAGCGCCACCAGAGCGA40
41CCAAACGTCCCGCGCCTTCCAGGCCGCACTCCAGAGCCAA80
81AAGAGCTCCATGGCGGCGGCGGCCAAGCCCAACAACCTTT120
121CCCTGGTGGTGCACGGACCGGGGGACTTGCGCCTGGAGAA160
161CTATCCTATCCCTGAACCAGGCCCAAATGAGGTCTTGCTG200
201AGGATGCATTCTGTTGGAATCTGTGGCTCAGATGTCCACT240
241ACTGGGAGTATGGTCGAATTGGGAATTTTATTGTGAAAAA280
281GCCCATGGTGCTGGGACATGAAGCTTCGGGAACAGTCGAA320
321AAAGTGGGATCATCGGTAAAGCACCTAAAACCAGGTGATC360
361GTGTTGCCATCGAGCCTGGTGCTCCCCGAGAAAATGATGA400
401ATTCTGCAAGATGGGCCGATACAATCTGTCACCTTCCATC440
441TTCTTCTGTGCCACGCCCCCCGATGACGGGAACCTCTGCC480
481GGTTCTATAAGCACAATGCAGCCTTTTGTTACAAGCTTCC520
521TGACAATGTCACCTTTGAGGAAGGCGCCCTGATCGAGCCA560
561CTTTCTGTGGGGATCCATGCCTGCAGGAGAGGCGGAGTTA600
601CCCTGGGACACAAGGTCCTTGTGTGTGGAGCTGGGCCAAT640
641CGGGATGGTCACTTTGCTCGTGGCCAAAGCAATGGGAGCA680
681GCTCAAGTAGTGGTGACTGATCTGTCTGCTACCCGATTGT720
721CCAAAGCCAAGGAGATTGGGGCTGATTTAGTCCTCCAGAT760
761CTCCAAGGAGAGCCCTCAGGAAATCGCCAGGAAAGTAGAA800
801GGTCAGCTGGGGTGCAAGCCGGAAGTCACCATCGAGTGCA840
841CGGGGGCAGAGGCCTCCATCCAGGCGGGCATCTACGCCAC880
881TCGCTCTGGTGGGAACCTCGTGCTTGTGGGGCTGGGCTCT920
921GAGATGACCACCGTACCCCTACTGCATGCAGCCATCCGGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。