演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SNTG1SYN4

syntrophin gamma 1

SNTG1 編碼 syntrophin gamma 1,屬於 syntrophin 家族的適配蛋白,可能協助組織多種蛋白質的細胞內定位,並參與受體訊號相關的調節。

Homo sapiens8q11.21UniProt Q9NSN8
OFFICIAL SYMBOL
SNTG1
CHROMOSOME
8
UNIPROT
Q9NSN8
PDB / ALPHAFOLD
7PC7
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SNTG1 是蛋白質編碼基因,產物 syntrophin gamma 1 屬於 syntrophin 家族。其蛋白質長 517 個胺基酸,具有 PDZ 與 PH 結構域,是一種適配蛋白。來源將它描述為可結合多種蛋白質,並可能協助安排這些蛋白質在細胞內的位置;相關作用包含受體與細胞骨架及 dystrophin glycoprotein complex 之間的連結。這些描述中部分功能標示為相似性推論,適用於理解其可能角色,而非所有作用均已在此來源中確立。

Official symbol
SNTG1
Gene name
syntrophin gamma 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13740
UniProt
Q9NSN8
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SYN4G1SYN

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q11.21
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegSNTG1pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr8:49,909,789–50,796,692
Gene span
886,904 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000642720 ★49,911,407–50,796,69219
ENST0000051886449,909,789–50,792,82920
ENST0000064216449,911,407–50,796,69218
ENST0000064409349,911,407–50,796,69215
ENST0000064399949,911,407–50,709,16016
ENST0000064707349,911,407–50,709,17117
ENST0000064688049,911,407–50,796,6926
ENST0000064380949,911,407–50,709,09111
ENST0000051747349,911,407–50,796,69217
ENST0000064282649,912,058–50,792,82916
ENST0000052308549,912,145–50,449,7257
ENST0000064374050,164,131–50,796,69216

顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

syntrophin gamma 1 是適配蛋白,可與多種蛋白質結合,並可能協助組織它們在細胞內的定位。這項定位調節角色被描述為可能性;來源並未指出所有相關蛋白質或受體都由它直接固定於特定位置。

它可能連結不同受體與 actin cytoskeleton,以及 dystrophin glycoprotein complex,藉此將受體和細胞骨架相關結構相連。這些連結作用依相似性推論提出,因此應視為可能功能,而非此資料所確立的普遍機制。

此外,syntrophin gamma 1 可能參與調節 diacylglycerol kinase-zeta(DGKZ)的細胞內位置。來源指出,這項調節可能有助於確保受體活化後,diacylglycerol 能迅速失活;但未提供更詳細的作用步驟或實驗條件。依據現有描述,其功能與受體活化後的訊號調節相關,具體而言可能透過影響 DGKZ 的定位,配合受體訊號後續處理。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 49911407 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SNTG1 ENST00000642720 GRCh38 chr8:49910407-49911507 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGCAAGGGCGGGCGGTGTTACAGTCTCGCTCTTTCCATTTTCCCCTTTTACTCCACATAGTTTCAAAGGT
CCACATGGCCCTGGTTTTGACCAGTTTTCCAACAGTTTCAACGTTATGTATTTCAACTTCCCGTCTCAGT
TCACTGGCGTCTGCACCCGTTGCCGAGTGTGGGTGGCTGAGCCCTGGGTGACAGCACTCGGGACCACGCA
CCCATACCCTTCTTTATGCTCGTTGTCAGCCAGTTGCCAAGAGCGGGAGTGAAGAGCCTGCAAGGCCCGG
GAGAGCGCGGATTCCGGAGTAGGGAGGCGAGGGGGCAGCGTGGGAGACCAGAGGGAAAATGGGCTGAAAA
GCCAACAAAAAAAACAACGTAAATTGGGCTTTGCTCTGGCTTTACAAAGGCAGAGATTGTCGAGCCCTCT
GACTGTCTTTGTGCCTTCTTTATCCCGTCCTTTGTGAAATAAGCCGTTTTCTGCCCCCACTGCAGGAGCC
TAGGCTGTGGGCGACTCGCTAGCACTGCCCTGGGCCTCCAAGCTGCCTGCTCGCTGAGCTCAGCGCTGAC
ACTCACAGGAGCTGCGTTCGCCGGATCCTCTGAGAGGCTCTGCAACGATCCCGATCCAATTCAGCAGCGT
TTTAAAAGGTAGCCGAGTGCAGATGCTTTTTCCTGTCTTTTTCATTCTTTCATTCTCTGTCTTTTAAAAT
TTTAACAATAACCTATCGTTTCCGCGTGGAGGGTCTAAGAATCTTCACTGGGTTTAATTTAGGAATTTCA
AATTGGGTTTCTCAAAATTTGAATGTGGTCCCCTTAATTGGTAATCAAGATTGCGGAGTTTTCCAAAATA
TTCCTTTTCATCTTATGTAATTAAAGATCCACGAGCTTTCCAAAGAAGCTCTGGATTTTCCACGGTACAA
ATCTATATATTTTTTCTCTCTCTTCCTCTCTCTCTCTCTCTGCCTCTCTCGTGCGTGTATGTGCGCGCCC
CTGTGCGTGCGTTTTCTTTCATTTCTGGCATTAGGAAACTCGTGCAGGGCCACTGAAAAGTCAGGGGAGG
CTCAGATGTTATTTCCCAGGGATTCCTGTTTTTCCAGAAACGTTGTCACCA
SNTG1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SNTG1_2 ↗8:49,909,847正股49,909,798–49,909,857
SNTG1_3 ↗8:49,911,750正股49,911,701–49,911,760
SNTG1_1 ↗8:50,068,824正股50,068,775–50,068,834

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_5FPXT3 · CTCF_binding_site · 49909396–49909417 · regulatory

ENSR8_83GLPW · promoter · 49909552–49909799 · regulatory

ENSR8_9PRTJ · enhancer · 49909800–49910186 · regulatory

ENSR8_83GLQ9 · promoter · 49910187–49910359 · regulatory

ENSR8_9PRTQ · promoter · 49910520–49911020 · regulatory

ENSR8_BCWG2 · promoter · 49911514–49912068 · regulatory

ENSR8_83GLSC · enhancer · 49913813–49914025 · regulatory

· motif · 49909398–49909414 · motif

· motif · 49909870–49909884 · motif

· motif · 49909870–49909885 · motif

· motif · 49909870–49909885 · motif

· motif · 49910014–49910024 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:517 aa

1 aa517 aa結構域
依 Q9NSN8 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

syntrophin gamma 1 長 517 個胺基酸,屬於 syntrophin 家族。蛋白質序列註解包含 PDZ 結構域(第 57–140 位)與 PH 結構域(第 283–390 位);來源未提供這些區域在本蛋白質中的個別功能說明。

結構域PDZ57–140 aa
結構域PH283–390 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7PC7…

PDB · 7PC7

X-ray · 2.10 A · A/B=54-143

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton;Nucleus

syntrophin gamma 1 主要位於細胞質,少量位於細胞核;來源亦將其定位列於細胞骨架相關區域。 此描述未提供不同異構型之間的定位差異或定位改變條件。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SYN4SNTG1LRRC4BPLEKHA2VTN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

異構型 1 可與 dystrophin(DMD)及相關蛋白 DTNA、DTNB 互作,異構型 2 則未見這些互作紀錄。syntrophin gamma 1 也與 DGKZ 互作;來源未進一步說明這些互作是否形成特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能syntrophin gamma 1 是可結合多種蛋白質的適配蛋白,可能協助安排它們在細胞內的位置。它可能連結受體與 actin cytoskeleton 及 dystrophin glycoprotein complex;這些連結功能屬相似性推論。此外,它可能調節 DGKZ 的細胞內位置,使受體活化後 diacylglycerol 得以迅速失活。推論支持
證據與來源

Adapter protein that binds to and probably organizes the subcellular localization of a variety of proteins. May link various receptors to the actin cytoskeleton and the dystrophin glycoprotein complex (By similarity). May participate in regulating the subcellular location of diacylglycerol kinase-zeta to ensure that diacylglycerol is rapidly inactivated following receptor activation

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用異構型 1 可與 dystrophin(DMD)及相關蛋白 DTNA、DTNB 互作,異構型 2 則沒有這些互作紀錄;此外,syntrophin gamma 1 也與 DGKZ 互作。含實驗來源
證據與來源

Isoform 1, but not isoform 2, interacts with the dystrophin protein DMD and related proteins DTNA and DTNB. Interacts with DGKZ

PMID 10747910 ↗ · PMID 11352924 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位syntrophin gamma 1 主要位於細胞質,少量位於細胞核;定位註解也列出細胞骨架相關區域。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton; Nucleus; Mainly cytoplasmic and weakly nuclear

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000642720 · 6,344 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ATTTCTGGCATTAGGAAACTCGTGCAGGGCCACTGAAAAG40
41TCAGGGGAGGCTCAGATGTTATTTCCCAGGGATTCCTGTT80
81TTTCCAGAAACGTTGTCACCAAATAAGTATGAGACTGTTA120
121ATTTGGAGAAACAATTAGCCCCTACAAAAAAAAAAAAGAA160
161AGAAAAAAGAAAAAAAAAAGAACCGGAGGGGAGAAGGCTA200
201GGGCGGAAGACAAGGAAGCTGCTGCTTGGATTCGCTGGTG240
241GAGGAAAGTGCGACCTGGACCTGCGCTTAGGGGCTCCCGT280
281CCCCTTACTTCAGCACCAGAGGGGATGGACAGCGTCTCCG320
321GACTGAGCTGCAGCCACAGGGACGGAACTACGCTGCCGCC360
361GCCGCTGTCCTTGCCGCCACTGTCGTCGCCACGGGCAGCT400
401GGGCTACTTGCTCCTCGCAGCTAAAAGGCGGTGCCTCCTA440
441TTACCCCCTCGCCTCCCGGCCCCCTTCCTTAATGGATGAA480
481AAGTACCCCTCCCTCTACACCTGCTGTACCTAAGGACAGG520
521ACTCTGAGGAGTACTCTTGCTCCACAGATTAAACTCTCAG560
561CAGCAACTTCAAGAATCATTTTTCTATAGGGGTCTGGGAG600
601GAATTCTGGAGGAGAGTAAAGTCGAAGTTCTTAGAAGCTC640
641TGAGAAATCATGGGCCGTGCGGTAGGGGTTGAAATGCTCA680
681AAGGTCCACACTTCTTGAAATAAACAGAATGGTCTTGAGT720
721GGATTGCAACTGTTTTGGAAATAGCTTTGTGAAAAGAGGG760
761TGGAGAGCTACTCAAAATTCTACGTTAGAGAGACTGAAAA800
801GACATCTAATTTCATTGCTCGGCAGACTGCTCTCCAGAAT840
841GTTGAGATTGCCCGAGAAGTGACCCCAGCAAAAGAAAAAT880
881ATTGCTGTACCTAAATTCAAACGACATCCTTTGTGGTGCC920
921ACAGCACATGGATTTCAGAACCGCCTGTGAGGAGACAAAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。