基因總覽
SNRPB2 是由 SNRPB2 基因編碼的蛋白質，正式名稱為 small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B2。它屬於 RRM U1 A/B'' family，並是剪接體的組成成員。蛋白質全長 225 個胺基酸，具有兩個 RNA recognition motif（RRM）：第一個位於胺基酸 7–86，第二個位於 151–225；兩者之間的胺基酸 99–145 被註記為無序區。這些特徵構成其基本分子架構；其參與剪接體活動的具體方式見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000246071 ★ | 16,730,026–16,742,564 | 7 |
| ENST00000377943 | 16,729,958–16,742,564 | 7 |
| ENST00000872497 | 16,729,958–16,742,564 | 6 |
| ENST00000911316 | 16,729,958–16,742,564 | 7 |
| ENST00000911318 | 16,729,958–16,742,564 | 7 |
| ENST00000911320 | 16,729,958–16,741,393 | 3 |
| ENST00000911321 | 16,729,958–16,741,393 | 5 |
| ENST00000911323 | 16,729,958–16,742,564 | 8 |
| ENST00000872499 | 16,729,990–16,742,564 | 6 |
| ENST00000872500 | 16,729,990–16,742,564 | 6 |
| ENST00000872501 | 16,729,990–16,742,564 | 7 |
| ENST00000911315 | 16,729,990–16,742,564 | 7 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SNRPB2 參與 pre-mRNA 剪接，並以剪接體組成蛋白的身分出現在相關剪接過程中。來源將其與剪接體功能相連，但未進一步說明它對剪接反應各步驟的具體影響，因此不宜據此延伸出未獲支持的作用機制。
SNRPB2 也與 U2 small nuclear ribonucleoprotein（sn-RNP U2）相關。在這個脈絡下，它有助於結合 U2 small nuclear RNA（U2 snRNA）的 stem loop IV。此描述指出 SNRPB2 參與特定 RNA 結構的結合，但未提供更多關於結合方式或其後續效應的資訊。
Promoter 與基因調控
>SNRPB2 ENST00000246071 GRCh38 chr20:16729026-16730126 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGAAATAACATTTTTGAGCATTTATTGTGTCTGACAATGTGCCAATCACTTTACATTTATTTTAGCTCAT TTAATGCTTACAACAACTAGAAGGAGGTACTATTAGGATCCCTATTTTACAGATGAAAAAAGTGAAGGTC AGAGAGATTAGTTAAGCAGAGGGTACAAGATTAGGTTCCAGTTGACTCTTAACAACCATTTCATATTCCA GGTGATGCTTTACAGACATCTGATGAATGGATGGATGAATGAATGCATGCACTTTGGGAACTCCCATTCA GCTTGGCATAAATACTAACTCCTTAGAATACCCTAGAAAAATCTAGACCTTTTGTTGGAAGAAAAGAGTG GGAAGGGTGGTAGGGAATTATTTTTTCGAGTGAATTGAGGCAGATGATCTTACAGATGACTGGGTTCTAG TCAGCATGGTTGCCTTATCTGGTGAGAGATGAGAATTGGGCAGACACCAGTTCTGTCTGCCCTGGGCCCT CAAACTGAGTAGCCTCTGAGATTCAAGTTCATCAGCACAGTGTTGGAGGACAGTTCCTGCAGAGCCCCAT GAATCAGAGGAGACTCGGAGGCAGGAGGAACTGGCTATCCTAAAGGTGATTTTAAACCGGGGTAGCTAGA GCCCAAAGAAGGGCGAAACCAGGACTAACTGCCCCATAGCATGAGGGGCAGCGCCTGTAAAATTACATAG GATTTGTAAAGGTGGAAGGCACTGTTGCGCCGGGTAAAGCTTCGCAAGGTCGTGGTAGGGGAAATGATTC ACTCCCCTTCACTATTCCCTCGCAGCATGGTCCTCACAACCCCCTTCTCTTTCCCCATTTCCATTTCCGG ACTCTTCTCCTGCCCGCAGGGCAGACGCACGCGCAGAGAGATTGCCAGCCCTGGCTGCCAGAGACCCGGA AGCATCGATCGGCTCTGTGCTCGGCTTCTAGACTTGTCGGCGCTCGATTGAGGAGCGTGGCTACGTTGCT TCCGGTGCCTGGCTCCGTTTCCTGCTTTTGGTTCTTACAGTAGTCGGCGTAGGCCTTAGGTGGGTTCGTG CGCCTTCTACCTCGCTGTTTCGGTTTTCCTGGCTCCTCGGCCCTTTTCTCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SNRPB2_1 ↗ | 20:16,730,029 | 正股 | 16,729,980–16,730,039 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_98M9Q · enhancer · 16729423–16729869 · regulatory
ENSR20_8H9KN · promoter · 16729870–16730036 · regulatory
ENSR20_B5BMH · enhancer · 16730037–16730736 · regulatory
ENSR20_55X8MX · CTCF_binding_site · 16730038–16730059 · regulatory
· motif · 16729655–16729670 · motif
· motif · 16729850–16729870 · motif
· motif · 16729857–16729866 · motif
· motif · 16729857–16729868 · motif
· motif · 16729889–16729900 · motif
· motif · 16729889–16729900 · motif
· motif · 16729928–16729939 · motif
· motif · 16729928–16729939 · motif
· motif · 16729930–16729939 · motif
· motif · 16730002–16730011 · motif
· motif · 16730040–16730056 · motif
· motif · 16730090–16730104 · motif
· motif · 16730904–16730917 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：225 aa
SNRPB2 蛋白質長 225 個胺基酸，屬於 RRM U1 A/B'' family。其 RRM 1 位於胺基酸 7–86，RRM 2 位於 151–225；胺基酸 99–145 則註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供其在不同條件下的定位變化或異構型間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 18 個夥伴
- ALAS1P13196 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CMTM6Q9NX76 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GABPB1Q06547 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GABPB2Q8TAK5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA2Q08379 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HMBOX1Q6NT76 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOMEZQ8IX15-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MCM6Q14566 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTUS2Q5JR59 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NAP1L5Q96NT1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PICK1Q9NRD5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PNMA1Q8ND90 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SF3A2Q15428 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- SNRPA1P09661 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- SNRPD3P62318 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM23P36406 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM27P14373 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- ZBTB14O43829 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
SNRPB2 曾被鑑定於剪接體 B 複合體與 C 複合體中。體外組裝的一種剪接體複合體包含 SNRPB2、HPRP8BP 和 CRNKL1。另有功能關係指出，SNRPB2 與 SNRPP1 共同參與 U2 snRNA stem loop IV 的結合；此描述不等同於證明兩者直接結合。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SNRPB2 是剪接體的組成蛋白，參與 pre-mRNA 剪接；它也與 U2 small nuclear ribonucleoprotein 相關，並有助於結合 U2 snRNA 的 stem loop IV。 | 含實驗來源 | 證據與來源Involved in pre-mRNA splicing as component of the spliceosome. Associated with sn-RNP U2, where it contributes to the binding of stem loop IV of U2 snRNA PMID 11991638 ↗ · PMID 28076346 ↗ · PMID 28502770 ↗ · PMID 28781166 ↗ · PMID 32494006 ↗ · PMID 9716128 ↗ |
| 交互作用 | SNRPB2 曾被鑑定於剪接體 B 複合體及 C 複合體，也出現在由 SNRPB2、HPRP8BP 與 CRNKL1 組成的體外組裝剪接體複合體中；另與 SNRPP1 共同參與 U2 snRNA stem loop IV 的結合。 | 含實驗來源 | 證據與來源Identified in the spliceosome B complex. Identified in the spliceosome C complex. Present in a spliceosome complex assembled in vitro, and composed of SNRPB2, HPRP8BP and CRNKL1. Contributes to the binding of stem loop IV of U2 snRNA with SNRPP1 PMID 11991638 ↗ · PMID 12084575 ↗ · PMID 28076346 ↗ · PMID 28502770 ↗ · PMID 28781166 ↗ · PMID 32494006 ↗ · PMID 36797247 ↗ · PMID 9716128 ↗ |
| 細胞定位 | SNRPB2 定位於細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CCTGCTTTTGGTTCTTACAGTAGTCGGCGTAGGCCTTAGG40TGGGTTCGTGCGCCTTCTACCTCGCTGTTTCGGTTTTCCT80GGCTCCTCGGCCCTTTTCTCCCCTGTTGCAGCTGGGAGCG120GACGAAGCGCGAAGCTGGGATTTTTTACTGTCTCCTGAAG160AATTTAACACAAACATGGATATCAGACCAAATCATACAAT200TTATATCAACAATATGAATGACAAAATTAAAAAGGAAGAA240TTGAAGAGATCCCTATATGCCCTGTTTTCTCAGTTTGGTC280ATGTGGTGGACATTGTGGCTTTAAAGACCATGAAGATGAG320GGGGCAGGCCTTTGTCATATTTAAGGAACTGGGCTCATCC360ACAAATGCCTTGAGACAGCTACAAGGATTTCCATTTTATG400GTAAACCAATGCGAATACAGTATGCAAAAACAGATTCGGA440TATAATATCAAAAATGCGTGGAACTTTTGCTGACAAAGAA480AAGAAAAAAGAAAAGAAAAAAGCCAAAACTGTGGAACAGA520CTGCAACAACCACAAACAAAAAGCCTGGCCAGGGAACTCC560AAATTCAGCTAATACCCAAGGAAATTCAACACCAAATCCT600CAGGTCCCTGATTACCCTCCAAACTATATTTTATTCCTTA640ATAACTTACCAGAAGAGACTAATGAGATGATGTTATCCAT680GCTGTTTAATCAGTTCCCTGGCTTCAAGGAAGTACGTCTG720GTACCAGGGAGGCATGACATTGCTTTTGTTGAATTTGAAA760ATGATGGGCAGGCTGGAGCTGCCAGGGATGCTTTACAGGG800ATTTAAGATCACACCGTCCCATGCTATGAAGATCACCTAT840GCCAAGAAATAACATTTGGGATAGTCGTCTTTAAAAGACT880TGGTGTTATTTACAGTGTTTGTTTTGATAACATTTGGCTG920GGTCATTTTAATAGTTAGAGATGAGGAGGAGTAAAAGTGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。