基因總覽
SNRNP25 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 16p13.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000293861 ★ | 53,828–57,669 | 5 |
| ENST00000710415 | 53,817–60,009 | 5 |
| ENST00001133858 | 53,828–60,009 | 5 |
| ENST00000417493 | 53,899–56,613 | 4 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SNRNP25 ENST00000293861 GRCh38 chr16:52828-53928 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATTACATAATATATTAGAAGGTAATAAGCCCTATGGAAACAATTACAAAGGGAAGGAGAATAAATTGGAA GGAGGGGCTGAAATTTAAAATACGGTAAAGACAAGACCAATGAGTAAGGTGGCGATCTAGGGGAAGAGTG AACTGAGCAACAGCAAGTGCAAAGGCCCTGCTAGCACCATGAGCACGATGAGAGATCGTCCAGGAGGCGG TGTTGATGCGGCAAAGGGCAACAGGAAGGGCATTAGGACTTGAAATCGGAGACGCACGCAGGGGAGGGAG TCAGTGTCGGAACCTGGTAGGCCCTGGGAGAACTCCGGCTTTTCGTCTGCGTGAGCTGGAGAAGAGCCGA AGGTTTCTGCGCACAGCACGGACCTGCGTGCCTCAGCTTTAAGGAAATCACCGTGGCCGCCGCTGTGAAC GCAGAGAAGGGCGCGAGCGTGGGAGCAGGAACCCAAGGCGGTGGGAAACGGTGGGGCTTTCTGAGTGTAT TGGAAAGTAGAGCCCACAGATCTGCTGCAGACCAGAAAGGGGCGCGAGAAAGAGCGGACAGAGGCAGACG CCGGGGCTGGCGGCGATGGAGCAGCAGTCGGAGGACGCGGAAGGCCTGCGAGAGTCGCCCGCGCCCAGCG CCGGCCTTCGGGTCCCACCTTGCGGGTGATGTTGTGCACGTAGGGGCACGTGTTGCAGGCGAAGCGGTGG CAGCGTTGTCCCTCCTCCACGATCAGCCCGTTCCCGCAGCCGGGGCAGAACAGCAGCATGGTCTCGAACT CCGCAGGCTCCAACTCCCGGCAGCTCCCACTGCCGCTCAGCGCCGATGCGCCGCCCGCCTCGAGCTCACA TTGGTCCTGGCAGCCTTCCCGCCACACCAACCAACCAATAGACAGGGCGATTCTGCGCTCCCGGCCCTGC TGCAGGCTGTCTCGCACTTGTCATTGGTCACTGCAGCCGCCCCACCCCCCCCGGCGCGCCAGTGGCTGGG CGGCCTCGCTGGGGCGGGCCGCAGTTCCTGCGCGTGCGCGCTTGGCCTCCCTAGTGCGGGCTGGCAGTGC GGGCAGAGCCCGGCTGAGAGGGGCGGCCCTGGAGGAGACGGAGGCCGCGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SNRNP25_2 ↗ | 16:53,107 | 正股 | 53,058–53,117 |
| SNRNP25_1 ↗ | 16:53,841 | 正股 | 53,792–53,851 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_8364 · promoter · 53598–53838 · regulatory
· motif · 49913–49925 · motif
· motif · 50238–50253 · motif
· motif · 51444–51455 · motif
· motif · 51470–51483 · motif
· motif · 51470–51483 · motif
· motif · 53502–53511 · motif
· motif · 53502–53511 · motif
· motif · 53682–53693 · motif
· motif · 53776–53786 · motif
· motif · 53778–53788 · motif
· motif · 53836–53847 · motif
· motif · 53836–53847 · motif
· motif · 54054–54063 · motif
· motif · 54093–54106 · motif
· motif · 54093–54106 · motif
· motif · 54394–54409 · motif
· motif · 54524–54536 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：132 aa
small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25 長 132 個胺基酸；序列第 41 至 132 位註解為 Ubiquitin-like 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25 定位於細胞核。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 16 個夥伴
- BPIFA1Q9NP55 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CPSF7Q8N684 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- EFHC2Q5JST6 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- KRT31Q15323 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LHX3Q9UBR4-2 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- LHX4Q969G2 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NKAPD1Q6ZUT1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OIP5O43482 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PFDN5Q99471 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PICK1Q9NRD5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RELQ04864 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- TDRKHQ9Y2W6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TEPSINQ96N21 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRAF1Q13077 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRAF2Q12933 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25 是 U11/U12 snRNPs 的組成成分；這些核糖核蛋白複合體則屬於 U12-type spliceosome。此註解指出其複合體組成關係，未提供與其他分子的直接結合資訊。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25 是 U11/U12 snRNPs 的組成成分，而 U11/U12 snRNPs 又屬於 U12-type spliceosome。這項描述界定了該蛋白質與剪接體之間的複合體組成關係，並未指出其他直接結合對象或更進一步的作用機制。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25 的定位註解為細胞核，表示此蛋白質被記錄為位於核內。該資料未提供定位變化的條件、細胞狀態或異構型差異，因此不能據此推論其在其他情境中的分布或動態。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCAGTTCCTGCGCGTGCGCGCTTGGCCTCCCTAGTGCGGG40CTGGCAGTGCGGGCAGAGCCCGGCTGAGAGGGGCGGCCCT80GGAGGAGACGGAGGCCGCGGGTGGGCCCGAGGCGCAAGAG120GAAGATGAGGACGAAGAAGAGGCGCTGCCGCACTCCGAGG160CCATGGACGTGTTCCAGGAGGGTCTGGCTATGGTGGTGCA200GGACCCGCTGCTCTGCGATCTGCCGATCCAGGTTACTCTG240GAAGAAGTCAACTCCCAAATAGCCCTAGAATACGGCCAGG280CAATGACGGTCCGAGTGTGCAAGATGGATGGAGAAGTAAT320GCCCGTGGTTGTAGTGCAGAGTGCCACAGTCCTGGACCTG360AAGAAGGCCATCCAGAGATACGTGCAGCTCAAGCAGGAGC400GTGAAGGGGGCATTCAGCACATCAGCTGGTCCTACGTGTG440GAGGACGTACCATCTGACCTCTGCAGGAGAGAAACTCACG480GAAGACAGAAAGAAGCTCCGAGACTACGGCATCCGGAATC520GAGACGAGGTTTCCTTCATCAAAAAGCTGAGGCAAAAGTG560AGCCTCCAGACAGGACAACCCTCTTCATCACTGGTGGCTG600AGCTTTTTCCCAGCAGGAATGGGTCCTCGAATCATCGTGC640CTCTTTCACAGAAAGGACGTTGTGGTGGCCTCACCCCAGG680CATGCCCAACAGTAACTGTCAGCATAAACCTGGGGGCCCT720CAGGACTAGGACAGGGTGAGCCAGTGCTCCCTCCTTTCAT760GTACTTGGCCTGAGACTGACCTCTCCCTAGGTCCAAATGC800CCTAGTCACATGGCAGACCCACGGCCTGGCCCACTGTATA840AAATAAACCTGTTTGCTTCTTAGTTTGAAAAGTAGAAAGC880CACAGTAACCTGGGTAGCAAAGACTGAGATTGCCCCATCA920CAGAGGTGAGTTAAGGGGAGAGAATTGGTACAGGCGAGTC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。